BACKGROUND: While expression-based signatures inform adjuvant therapy in breast cancer (BC), no approved molecular biomarkers exist for the neoadjuvant setting, where early response prediction could inform treatment decisions. This challenge is compounded by intratumoral heterogeneity, as multiple malignant subtypes may coexist within a tumor and influence therapy sensitivity.
METHODS: We developed BRIDGE (BReast Intra-tumoral Deconvolution of Gene Expression), a computational framework that deconvolves the pretreatment bulk tumor transcriptome to estimate molecular subtype composition and pr
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Osteoporosis is a metabolic bone disease characterized by reduced bone mass and microarchitectural deterioration, with complex involvement of molecular networks and immune-associated transcriptional dysregulation.
OBJECTIVE: This study aimed to elucidate the immune-associated regulatory features of ATP-binding cassette subfamily A member 8 (ABCA8) in osteoporosis.
METHODS: Differential gene expression analysis was performed using the GSE35958 dataset, and 384 up-regulated genes and 1143 down-regulated genes were identified. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AI is emerging as a promising tool for diagnosing COVID-19 based on chest CT scans. The aim of this study was the comparison of AI models for COVID-19 diagnosis. Therefore, we: (1) trained three distinct AI models for classifying COVID-19 and non-COVID-19 pneumonia (nCP) using a large, clinically relevant CT dataset, (2) evaluated the models' performance using an independent test set, and (3) compared the models both algorithmically and experimentally.In this multicenter multi-vendor study, we collected n=1591 chest CT scans of COVID-19 (n=762) and nCP (n=829) patients from China and Germany.
СтатьяМногоцентровое исследованиеСравнительное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given the increasing incidence of endometrial cancer (EC) and the lack of improvement in survival rates, it is imperative to explore possible prevention methods. Studies on aspirin's effect on EC risk have been controversial; research on ibuprofen remains limited. We therefore aimed to investigate the relationship between aspirin and ibuprofen use and risk of EC through a cohort study. This analysis was based on the Prostate, Lung, Colorectal, and Ovarian Cancer Screening Trial, which recruited participants aged 55-74 years from 1993 to 2001, with follow-up for cancer incidence continuing unti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aims: We aimed to explore the crucial miRNA-mRNA axis through bioinformatics analysis and provide evidences for the development of pathophysiological mechanisms and new therapies for HBV-related HCC. Methods: MiRNA (GSE76903) and mRNA (GSE77509) dataset were used to screen differentially expressed miRNAs (DE-miRNAs) and differentially expressed mRNAs (DE-mRNAs) using R software. Overlapping genes between DE-mRNAs and target genes of DE-miRNAs were identified as candidate genes. Hub genes were obtained via cytohubba analysis. The expression at protein and mRNA levels and prognostic value of hub
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD molecules are surface molecules expressed on cells of the immune system that play key roles in immune cell-cell communication and sensing the microenvironment. These molecules are essential markers for the identification and isolation of leukocytes and lymphocyte subsets. Here, we present the results of the first phase of the CD Maps study, mapping the expression of CD1-CD100 (n = 110) on 47 immune cell subsets from blood, thymus, and tonsil using an eight-color standardized EuroFlow approach and quantification of expression. The resulting dataset included median antibody binding capacities
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To introduce and clinically validate a new method of estimating intraocular pressure (IOP) in patients with keratoconus and soft corneas with the aim of significantly reducing dependence on corneal biomechanics.
SETTING: Vincieye Clinic, Milan, Italy, and Rio de Janeiro Corneal Tomography and Biomechanics Study Group, Brazil.
DESIGN: Retrospective case series.
METHOD: This study comprised participants enrolled at two hospitals on two continents. Numerical analysis based on the finite element method was performed to simulate the effect of tonometric air pressure of the Corvis ST dyn
СтатьяМногоцентровое исследованиеВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The analysis of insulin-like growth factor I (IGF-I) is an important tool for pediatricians in the diagnosis and treatment of growth hormone deficiency in children. However, significant differences exist in IGF-I assays and normative datasets, which can have important clinical consequences.
METHODS: IGF-I analyses were performed using the IDS-iSYS platform on 1,897 samples from pediatric patients (0.5-18 years old). Z-scores were calculated based on normative IGF-I data from Bidlingmaier et al. (SD-BM) [J Clin Endocrinol Metab. 2014 May; 99(5): 1712-21] and normative IGF-I data fr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To evaluate our proposed multivariate approach to identify patients who will develop sight-threatening diabetic retinopathy (STDR) within a 1-year screen interval, and explore the impact of simple stratification rules on prediction.
MATERIALS AND METHODS: A 7-year dataset (2009-2016) from people with diabetes (PWD) was analysed using a novel multivariate longitudinal discriminant approach. Level of diabetic retinopathy, assessed from routine digital screening photographs of both eyes, was jointly modelled using clinical data collected over time. Simple stratification rules based on reti
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonclustered protocadherins (PCDH) family is a group of cell-cell adhesion molecules. We have found differentially methylated genes in the nonclustered PCDHs family associated with Helicobacter pylori (H. pylori) infection in prior genome-wide methylation analysis. To further investigate the methylation and expression of nonclustered PCDHs encoding genes in H. pylori--related gastric carcinogenesis process, four candidate genes including PCDH7, PCDH10, PCDH17, and PCDH20 were selected, which were reported to be tumor suppressors for digestive cancers. A total of 747 participants with a spectru
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C virus (HCV) is a major public health concern, with over 70 million people infected worldwide, who are at risk for developing life-threatening liver disease. No vaccine is available, and immunity against the virus is not well-understood. Following the acute stage, HCV usually causes chronic infections. However, ~30% of infected individuals spontaneously clear the virus. Therefore, using HCV as a model for comparing immune responses between spontaneous clearer (SC) and chronically infected (CI) individuals may empower the identification of mechanisms governing viral infection outcome
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is heritable with complex genetic underpinnings. Based on previous results from large-scale genome-wide association studies, recent studies found an association between the polygenic risk score (PGRS) of AD and the structure of some preselected brain regions, but the effects of AD PGRS on all voxels of the brain have not been fully investigated. In the present study, we examined the voxel-wise effect of AD PGRS on the entire brain and the influence of AD PGRS on cognitive function in 2 independent healthy young cohorts. In both cohorts, an elevated AD PGRS was associat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Longitudinal monitoring of breast tumor volume over the course of chemotherapy is informative of pathologic response. This study aims to determine whether axillary lymph node (aLN) volume by magnetic resonance imaging (MRI) could augment the prediction accuracy of treatment response to neoadjuvant chemotherapy (NAC).
MATERIALS AND METHODS: Level-2a curated data from the I-SPY-1 TRIAL (2002-2006) were used. Patients had stage 2 or 3 breast cancer. MRI was acquired pre-, during, and post-NAC. A subset with visible aLNs on MRI was identified (N = 132). Prediction of pathologic comp
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Blunt cerebrovascular injuries (BCVI) are uncommon but potentially devastating. The epidemiology, outcomes, and screening criteria are well described in adults, but data in pediatric patients are extremely limited. The purpose of this study was to characterize pediatric BCVI in a large nationwide sample. We hypothesized that outcomes of BCVI in the pediatric blunt trauma population will vary by age.
METHODS: We conducted a retrospective cohort study of the Kids' Inpatient Database for pediatric BCVI from 2000 to 2012. Epidemiology, associated injuries, outcomes (including stroke a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The WHO declared the novel COVID-19 outbreak a pandemic in March 2020. While the COVID-19 pandemic was unprecedented, prior experiences with diseases such as Middle East respiratory syndrome, severe acute respiratory syndrome and Ebola shaped many countries' preparedness and response strategies. Although lessons learnt from outbreak responses have been documented from a variety of sources, news media play a special role through their dissemination of news to the general public. This study investigated news media to explore how lessons learnt from the West African Ebola outbreak in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent increased use of medical images induces further burden of their interpretation for physicians. A plain X-ray is a low-cost examination that has low-dose radiation exposure and high availability, although diagnosing urolithiasis using this method is not always easy. Since the advent of a convolutional neural network via deep learning in the 2000s, computer-aided diagnosis (CAD) has had a great impact on automatic image analysis in the urological field. The objective of our study was to develop a CAD system with deep learning architecture to detect urinary tract stones on a pl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosome parasites are complex trematode blood flukes responsible for the disease schistosomiasis; a global health concern prevalent in many tropical and sub-tropical countries. While established transcriptomic databases are accessed ad hoc to facilitate studies characterising specific genes or gene families, a more comprehensive systematic updating of gene annotation and survey of the literature to aid in annotation and context is rarely addressed. We have reanalysed an online transcriptomic dataset originally published in 2009, where seven life cycle stages of Schistosoma japonicum were e
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Animal models have expanded our understanding of temporal lobe epilepsy (TLE). However, translating these to cell-specific druggable hypotheses is not explored. Herein, we conducted an integrative insilico-analysis of an available transcriptomics dataset obtained from animals with pilocarpine-induced-TLE. A set of 119 genes with subtle-to-moderate impact predicted most forms of epilepsy with ~ 97% accuracy and characteristically mapped to upregulated homeostatic and downregulated synaptic pathways. The deconvolution of cellular proportions revealed opposing changes in diverse cell types. The p
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The detection and diagnosis of caries at the earliest opportunity is fundamental to the preservation of tooth tissue and maintenance of oral health. Radiographs have traditionally been used to supplement the conventional visual-tactile clinical examination. Accurate, timely detection and diagnosis of early signs of disease could afford patients the opportunity of less invasive treatment with less destruction of tooth tissue, reduce the need for treatment with aerosol-generating procedures, and potentially result in a reduced cost of care to the patient and to healthcare services.
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autism spectrum disorder has long been associated with a variety of organizational and developmental abnormalities in the brain. An increase in extra-axial cerebrospinal fluid volume in autistic individuals between the ages of 6 months and 4 years has been reported in recent studies. Increased extra-axial cerebrospinal fluid volume was predictive of the diagnosis and severity of the autistic symptoms in all of them, irrespective of genetic risk for developing the disorder. In the present study, we explored the trajectory of extra-axial cerebrospinal fluid volume from childhood to adulthood in
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.