PURPOSE: This proof-of-concept study investigates gene expression in core needle biopsies (CNB) to predict whether individuals diagnosed with ductal carcinoma in situ (DCIS) on CNB were affected by invasion at the time of diagnosis.
METHODS: Using a QuantiGene Plex 2.0 assay, 14 gene expression profiling was performed in 303 breast tissue samples. Preoperative diagnostic performance of a gene was measured by area under receiver-operating characteristic curve (AUC) with 95% confidence interval (CI). The gene mRNA positivity cutoff was computed using Gaussian mixture model (GMM); protein expres
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how silent genes can be competent for activation provides insight into development as well as cellular reprogramming and pathogenesis. We performed genomic location analysis of the pioneer transcription factor FoxA in the adult mouse liver and found that about one-third of the FoxA bound sites are near silent genes, including genes without detectable RNA polymerase II. Virtually all of the FoxA-bound silent sites are within conserved sequences, suggesting possible function. Such sites are enriched in motifs for transcriptional repressors, including for Rfx1 and type II nuclear ho
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate the antitumor effect of the chicken anemia virus (CAV) VP3 gene in canine mammary tumor (CMT) cells. SAMPLE POPULATIONS: Established primary canine cell lines that originated from epithelial cells of resected CMTs and nonneoplastic mammary gland epithelial (MGE) cells.
PROCEDURES: Expression vectors and lentiviral vectors encoding the VP3 gene from a Taiwan-Ilan isolate of CAV were used to deliver the VP3 gene into CMT cells and nonneoplastic MGE cells. Ectopic gene expression and the pro-apoptotic effect of the VP3 gene on CMT and nonneoplastic MGE cells by either t…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Argininosuccinate synthetase 1 (ASS1) is a rate-limiting enzyme in arginine biosynthesis, and its stability is regulated by TRAF2-mediated ubiquitination. Here, we report OTUB2 as a major deubiquitinase to stabilize ASS1, resulting increased arginine biosynthesis in colorectal cancer (CRC) cells; OTUB2 expression is elevated in CRC tissue, and patients with high OTUB2 expression exhibit shorter overall survival. As such, ectopic expression of OTUB2 promotes growth of CRC cells and xenograted tumors and accelerates cell migration and lung metastasis. Moreover, arginine deprivation induces marke
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Estrogen receptor a (ERa) signaling in the ventromedial hypothalamus (VMH) contributes to energy homeostasis by modulating physical activity and thermogenesis. However, the precise neuronal populations involved remain undefined. Here, we describe six neuronal populations in the mouse VMH by using single-cell RNA transcriptomics and in situ hybridization. ERa is enriched in populations showing sex biased expression of reprimo (Rprm), tachykinin 1 (Tac1), and prodynorphin (Pdyn). Female biased expression of Tac1 and Rprm is patterned by ERa-dependent repression during male development, whereas m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During mammalian heart development, restricted myocardial Bmp2 expression is a key patterning signal for atrioventricular canal specification and the epithelial-mesenchyme transition that gives rise to the valves. Using a mouse transgenic line conditionally expressing Bmp2, we show that widespread Bmp2 expression in the myocardium leads to valve and chamber dysmorphogenesis and embryonic death by E15.5. Transgenic embryos show thickened valves, ventricular septal defect, enlarged trabeculae and dilated ventricles, with an endocardium able to undergo EMT both in vivo and in vitro. Gene profilin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inositol 1,4,5'-triphosphate receptor II (IP(3)RII) calcium channel expression is increased in both hypertrophic failing human myocardium and experimentally induced models of the disease. The ectopic calcium released from these receptors induces pro-hypertrophic gene expression and may promote arrhythmias. Here, we show that IP(3)RII expression was constitutively restrained by the muscle-specific miRNA, miR-133a. During the hypertrophic response to pressure overload or neurohormonal stimuli, miR-133a down-regulation permitted IP(3)RII levels to increase, instigating pro-hypertrophic calcium si
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudoxanthoma elasticum (PXE) is a heritable disorder characterized by ectopic mineralization of connective tissues, with considerable intra- and interfamiliar phenotypic variability. PXE is caused by mutations in the ABCC6 gene, which encodes a transporter protein, MRP6, and targeted ablation of Abcc6 in mice recapitulates the manifestations of PXE. In this study, we examined the hypothesis that the expression of other members of the Abcc family may be altered in Abcc6 null mice, possibly explaining the phenotypic variability because of the functional overlap of these transporters. Analysis
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) is one of the most economically important viral pathogens for the swine industry. PRRSV has evolved diverse strategies to modulate the type I interferon (IFN-I) response during infections. Recently, it has become increasingly recognized that microRNAs (miRNAs) can contribute to immune evasion and promote viral replication. In this study, we found that PRRSV upregulated the expression of miR-378b-3p by activating STAT1 in porcine alveolar macrophages. Furthermore, ectopic expression of miR-378b-3p promoted PRRSV replication, while miR-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To examine the role of CD40-CD154 costimulation and effects of therapeutic pathway blockade in the non-obese diabetic (NOD/ShiLtJ) model of Sjögren's syndrome (SS).
METHODS: We assessed leucocyte infiltration in salivary glands (SGs) from NOD/ShiLtJ mice by immunohistochemistry and examined transcriptomics data of SG tissue from these animals for evidence of a CD40 pathway gene signature. Additionally, we dosed MR1 (anti-CD154 antibody) in NOD mice after the onset of SS-like disease and examined the effects of MR1 treatment on sialadenitis, autoantibody production, SG leucocyte inf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cartilage engineering is one challenging issue in regenerative medicine. Low oxygen tension or hypoxia inducible factor-1 (HIF-1α) gene therapy are promising strategies in the field of cartilage repair. Previously, we showed that hypoxia and its mediator HIF-1 regulate matrix genes expression (collagens and aggrecan). Here, we investigated the molecular mechanism involved in the regulation of type I collagen (COL1A1) by HIF-1 in human articular chondrocytes. We show that HIF-1α reduces COL1A1 transcription, through a distal promoter (-2300 to -1816 bp upstream transcription initiation site), c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuroserpin is a serine protease inhibitor expressed in the developing and the adult nervous system. Studies with genetically modified mice indicate a role of neuroserpin in the regulation of anxiety. Mutations in the neuroserpin gene cause protein polymerization and formation of inclusion bodies leading to progressive myoclonic epilepsy and neurodegeneration. Here we demonstrate that neuroserpin expression is regulated by thyroid hormone (T3). Neuroserpin RNA levels are down-regulated in cortical layers II/III and VIa, the hippocampus, the retrosplenial cortex and the medial habenular nucleus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hyperexcitability and ectopic spontaneous discharge (ESD) of primary sensory neurons may be important for the generation or maintenance of neuropathic pain. To investigate the relationship between the electrical abnormalities of injured neurons and voltage-gated potassium (Kv) channel gene expression, the expression of the Kv channel alpha genes in the dorsal root ganglion (DRG) was monitored by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) in a chronic constriction injury (CCI) model of neuropathic pain. Electrophoresis of the RT-PCR products showed the presence of several Kv a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Comparison of the transcriptomes and proteomes of the decidualization-specific genes that express high vs low levels of the eutopic and ectopic endometrium of women with endometriosis compared with controls, could be useful in understanding the pathogenesis of endometriosis. Genome-wide comparison between decidual tissue and non-decidual tissue identified many genes significantly modulated in the process of decidualization. Comparison of eutopic endometrium and endometriotic sites also revealed up- and down-regulated genes. A combined analysis of the experimental data showed specific genes up-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Polycomb (Pc) gene of Drosophila melanogaster is a member of a large class of genes (Pc group) required for the segment-specific repression of homeotic selector genes. Mutations in Pc-group genes show strong posterior transformations in homozygous embryos resulting from an ectopic expression of homeotic genes in segments where they are not supposed to be active. Genetic evidence suggests that Pc is part of a cellular memory mechanism responsible for the transmission of the homeotic expression pattern through developmental time. We have determined the nucleotide sequence for the genomic DNA
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extracellular matrix protein 1 (ECM1) is a glycoprotein that may be a key player in tumorigenesis and tumor progression. However, knowledge regarding the role of ECM1 in endometriosis (EM) is still lacking. Microarray analyses were performed to compare the mRNA expression patterns between paired EU tissues and ectopic endometrial (EC) tissues (n = 4) from EM patients. ECM1 expression was significantly increased in the eutopic endometrial (EU) tissues than paired EC tissues of endometriotic patients and normal endometrial (NE) tissues of controls without EM. Blocking ECM1 with siRNA attenuated
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying and targeting oncogenic fusion genes have revolutionized the treatment of leukemia, such as PML-RARα fusion gene in acute promyelocytic leukemia. Here we identified an intrachromosomal fusion gene located on chromosome 19q.13 between UBA2 and WTIP gene in a case of acute myeloid leukemia. The UBA2-WTIP fusion gene contains the N-terminal E1_enzyme_family, VAE_Ubl domains of UBA2, and the C-terminal LIM domains of WTIP. The UBA2-WTIP fusion was detected by reverse transcriptase polymerase chain reaction and Sanger sequencing in 19 of 56 acute myeloid leukemia samples (33.9%). Ectopi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mechanism of Chlamydia trachomatis causing tubal ectopic pregnancy (EP) is not well understood. Tetraspanins (tspans), activin-A, and inhibin-A might play a role in the development of pathological conditions leading to EP. The study aimed to elucidate the expression of tspans, activin-A, and inhibin-A with a role of associated cytokines in C. trachomatis-associated EP and analyze interacting partners of DEGs, with an expression of a few important interacting genes. Fallopian tissue and serum were collected from 100 EP (Group I) and 100 controls (Group II) from SJH, New Delhi, India. Detection
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: YABBY genes play important roles in the growth and polar establishment of lateral organs such as leaves and floral organs in angiosperms. However, the functions of YABBY homologous genes are largely unknown in soybean.
RESULTS: In this study, we identified GmFILa encoding a YABBY transcription factor belonging to FIL subfamily. In situ mRNA hybridization analysis indicated that GmFILa had specific expression patterns in leaf as well as in flower bud primordia. Ectopic expression of GmFILa in Arabidopsis thaliana altered the partial abaxialization of the adaxial epidermises of leav
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 11-zinc finger protein CCTC-binding factor (CTCF) employs different sets of zinc fingers to form distinct complexes with varying CTCF- target sequences (CTSs) that mediate the repression or activation of gene expression and the creation of hormone-responsive gene silencers and of diverse vertebrate enhancer-blocking elements (chromatin insulators). To determine how these varying effects would integrate in vivo, we engineered a variety of expression systems to study effects of CTCF on cell growth. Here we show that ectopic expression of CTCF in many cell types inhibits cell clonogenicity by
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования