Giardia lamblia is recognized as one of the most prevalent parasites in dogs. The present study aimed to establish a loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay for rapid and specific detection of G. lamblia from dogs. The fecal samples were collected and prepared for microscopic analysis, and then the genomic DNA was extracted directly from purified cysts. The concentration of DNA samples of G. lamblia were diluted by 10-fold serially ranging from 10(-1) to 10(-5) ng/µl for LAMP and PCR assays. The LAMP assay allows the amplification to be finished within 60 min under isothermal condi
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a novel, rapid nucleic acid amplification method with high specificity and sensitivity under isothermal conditions. In this study a LAMP assay for diagnosing Pneumocystis pneumonia (PCP) was developed. Oligonucleotide primers specific for Pneumocystis species were designed corresponding to 18S rRNA gene sequences. The assay, performed for 30 min at 61 degrees C, was capable of detecting 50 copies per tube (2 x 10(3) copies ml(-1)) in 30 min and did not show cross-reactivity to other species of fungi, including the genera Candida, Aspergillus and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Winnie mice are a widely used in vivo model of inflammatory bowel disease and carry a missense mutation in the Muc2 gene. Here, we present a protocol for genotyping Winnie mice using TaqMan allelic discrimination quantitative PCR. We describe tissue collection, rapid crude DNA extraction, probe-based amplification with dual-labeled fluorophores, and fluorescence-based genotype calling in a single reaction. This protocol enables qualitative SNP genotyping without post-amplification processing and can be readily adapted to other defined point mutations.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) is widely used to screen genes of interest for deletions and duplications. Since MLPA is usually based on size-separation of the amplification products, the maximum number of target sequences that can be screened in parallel is usually limited to approximately 40. We report the design of a robust array-based MLPA format that uses amplification products of essentially uniform size (100-120 bp) and distinguishes between them by virtue of incorporated tag sequences. We were thus able to increase probe complexity to 124, with very uniform pro
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have developed a rapid, nonradioactive large scale method for the detection of ras oncogenes in human tumors. DNA is amplified by the polymerase chain reaction (PCR), and then digested with specific restriction enzymes to detect either endogenous or primer-mediated Restriction Fragment Length Polymorphisms (RFLPs). We report here that three of 15 colon tumors tested contain K-ras codon 12 aspartic acid mutations and one, along with the HCT 116 colon carcinoma cell line, contains a K-ras codon 13 aspartic acid mutation. On the other hand, we did not detect H- or K-ras codon 12 mutations or t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus aureus is a major foodborne pathogen associated with dairy products; however, rapid and reliable detection remains challenging due to complex food matrices. Herein, we developed a one-step isothermal biosensing strategy based on an artificial nucleic acid circuit-assisted Argonaute system (PfAgo-ANCA) for rapid and sensitive detection of S. aureus. By targeting the species-specific nuc gene, the platform utilizes the high-temperature endonuclease activity of Pyrococcus furiosus Argonaute (PfAgo). The strategy integrates programmable PfAgo-mediated target recognition with downstr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Xeroderma pigmentosum (XP) patients are clinically characterized by a very high incidence of skin cancers on exposed skin, at an early age. … ystems. This high mutation frequency in XP was accompanied by a very high level of Ha-ras and c-myc gene amplification and rearrangement. All these data are consistent with a fundamental role of unrepaired UV-induced DNA lesions as an initiating event in human skin tumors on exposed parts of the body.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Equine piroplasmosis (EP) is a severe disease of horses caused by the tick-borne protozoa Theileria equi (T. equi) and Babesia caballi (B. caballi). Infectious carriers are not always symptomatic, meaning there is a risk to non-enzootic areas. Regulatory tests for EP include sero-epidemiological methods for equine babesiosis, but these lack specificity due to cross-reactivity with other Babesia species. In this study, we present a real-time quantitative recombinase polymerase amplification (qRPA) method for fast simultaneous detection of both T. equi and B. caballi. In this method, primers and
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the feasibility of detecting lymphoma with the application of BIOMED-2 standardized immunoglobulin/T cell receptor (IG/TCR) gene rearrangement system in formalin fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue samples, and to discuss the relationship between the longest amplification fragment of extracted DNA and positive detection rate of different IGH V-J primers.
METHODS: DNA was extracted from 50 cases of FFPE tissue samples. Multiplex-PCR amplifications were performed and then the IG/TCR gene rearrangements were analyzed using BIOMED-2 standardized clonality analysis system.
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clinical isolates of Coccidioides spp. and Blastomyces dermatitidis can be identified by chemiluminescent DNA probes and PCR assays targeting multicopy genes. In fixed tissue samples, cells of the two fungi are specified by in situ hybridization and PCR assays targeting 18S rDNA but sequencing of the products is mandatory. Nested PCR assays targeting genes encoding species- or genus-specific proteins like proline rich antigen of Coccidioides spp. and B. dermatitidis adhesin facilitate amplification of specific DNA from fixed tissue samples. The value of DNA amplification from native specimens
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Development and standardization of reliable methods for detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples is an important goal in laboratories throughout the world. In this work, lung and spleen fragments from a patient who died with the diagnosis of miliary tuberculosis were used to evaluate the influence of the type of fixative as well as the fixation and paraffin inclusion protocols on PCR performance in paraffin embedded specimens. Tissue fragments were fixed for four h to 48 h, using either 10% non-buffered or 10% buffered formalin, and embedded in pure paraffin or paraffin mixe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragile X syndrome is caused by a dynamic mutation in the FMR1 gene. Normal individuals have <55 CGG repeats in the 5 untranslated region, premutation carriers have 55-200 repeats and a full mutation has >200 repeats. Female carriers are at risk of having affected offspring. A multiplex nested polymerase chain reaction protocol is described for preimplantation genetic diagnosis (PGD) of fragile X syndrome with simultaneous amplification of the CGG-repeat region, the Sry gene and several flanking polymorphic markers. The amplification efficiency was > or =96% for all loci. The allele dropout ra
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The citrate synthase gene (gltA) of Bartonella henselae was cloned and sequenced to compare genetic divergence among alpha and gamma branches of the class Proteobacteria and to develop enhanced genotypic reagents for B. henselae identification. B. henselae gltA is 1,293 nucleotides in length and 63 to 66% homologous with corresponding gene sequences of Rickettsia prowazekii, Escherichia coli, and Coxiella burnetii. The observed genetic variability suggests that gltA sequences can provide a useful means for studying moderate divergence among related bacteria. Oligonucleotides specific for B. he
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study was designed to characterize phenotypically and genotypically a Trueperella pyogenes strain isolated from a brain abscess of an adult roebuck (Capreolus capreolus). The species identity could be confirmed by phenotypical investigations, by MALDI-TOF MS analysis, and by sequencing the 16S ribosomal RNA (rRNA) gene, the 16S-23S rRNA intergenic spacer region (ISR); by sequencing the target genes rpoB, gap, and tuf; and by detection of T. pyogenes chaperonin-encoding gene cpn60 with a previously developed loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay. The T. pyogenes strain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human preimplantation embryos at various stages of development have been analysed using the polymerase chain reaction to amplify a 680 base pair fragment of the beta-globin gene. Successful amplification was achieved more frequently with DNA from intact embryos containing between one and 11 cells, single cumulus cells, oocytes which had failed to fertilize and polar bodies than from single blastomeres disaggregated from intact embryos and treated in an identical manner. The distribution of nuclei demonstrated using the nuclear chromophore diamino-phenyl-indole showed considerable inter-blastom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacterial pathogens resistant to antibiotics have become a serious health threat. Those species which have developed resistance against multiple drugs such as the carbapenems, are more lethal as these are last line therapy antibiotics. Current diagnostic tests for these resistance traits are based on singleplex target amplification techniques which can be time consuming and prone to errors. Here, we demonstrate a chip based optofluidic system with single molecule sensitivity for amplification-free, multiplexed detection of plasmids with genes corresponding to antibiotic resistance, within one
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herein we report two cases of advanced and/or metastatic salivary duct carcinoma that relapsed after standard first-line chemotherapy. As ov … ridization was performed after the initiation of chemotherapy; the first case was positive for HER2 gene amplification, while the second case was negative. Our experiences suggest that therapy with HER2 blockers should be considered as options for treatment of HER2-positive salivary duct carcinoma. However, HER2 protein overexpression and gene amplification should b …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The giant fibrovascular polyp of the esophagus is a rare, benign and typical entity described in 1957. This lesion is easily identifiable in its macroscopic and microscopic aspects. However, recent studies question the existence of the giant fibrovascular polyp of the esophagus. The demonstration of an amplification of the MDM2 gene poses the diagnosis of well-differentiated liposarcoma. We describe here a case of an esophagus polyp in a 67-year-old man. The diagnosis of giant fibrovascular polyp of the esophagus was initially retained. Secondly, the immunohistochemical and fluorescence in sit
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lymphoblastic lymphoma is the second most common type of non-Hodgkin lymphoma seen in children. Approximately, 90% of lymphoblastic lymphomas arise from T cells, with the remaining 10% being B-cell-lineage derived. Although T-cell lymphoblastic lymphoma most frequently occurs in the anterior mediastinum (thymus), B-cell lymphoblastic lymphoma (B-LBL) predominates in extranodal sites such as skin and bone. Here, we describe a pediatric B-LBL patient who presented with extensive abdominal involvement and whose lymphoma cells displayed segmental duplication of the mixed lineage leukemia (MLL) gen
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования