We performed whole-genome sequencing with bait enrichment techniques to analyze Andes virus (ANDV), a cause of human hantavirus pulmonary syndrome. We used cryopreserved lung tissues from a naturally infected long-tailed colilargo, including early, intermediate, and late cell culture, passages of an ANDV isolate from that animal, and lung tissues from golden hamsters experimentally exposed to that ANDV isolate. The resulting complete genome sequences were subjected to detailed comparative genomic analysis against American orthohantaviruses. We identified four amino acid substitutions related t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Wilson's disease (WD) is an autosomal recessive disorder of copper metabolism caused by loss-of-function mutations in ATP7B, which encodes a copper-transporting protein. It is characterized by excessive copper deposition in tissues, predominantly in the liver and brain. We sought to investigate whether gene-corrected patient-specific induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived hepatocytes (iHeps) could serve as an autologous cell source for cellular transplantation therapy in WD.
METHODS: We first compared the in vitro phenotype and cellular function of ATP7B before and af
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have isolated a likely bacterial pathogen from cerebrospinal fluid from a Ugandan infant suffering from hydrocephalus. Whole-genome sequencing and assembly of the genome of the clinical isolate, as well as that of a previously deposited reference strain, identified the isolate as Paenibacillus thiaminolyticus, which has not been associated with widespread human infections.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Haemophilus Influenza leads to respiratory infections such as sinusitis, acute otitis media, pneumonia and bronchitis. In addition, it causes invasive infections such as cellulite, septic arthritis, and meningitis. Therefore, quick and sensitive detection of H. influenza is of great importance in medical microbiology. In this study, a novel DNA-based bioassay was developed to the monitoring of Haemophilus influenza genome in human plasma samples using binding of pDNA with cDNA. DNA hybridization strategy was used to investigation of DNAs binding. For this purpose, silver nanoparticle doped gra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We herein present a case of primary signet-ring cell carcinoma of the cervix. Pelvic magnetic resonance imaging revealed a 38-mm cervical tumor, and computed tomography revealed no findings suggestive of distal metastasis or other tumor origins. Gastrointestinal endoscopy showed no abnormal findings. Histopathology revealed signet-ring cell-type mucinous adenocarcinoma. By immunohistochemistry, tumor cells were negative for the mammary neoplasm marker, gross cystic disease fluid protein 15 and gastrointestinal neoplasm markers, MUC2, MUC6, and CDX2, but positive for p16. These findings suggest
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Legionella comprises 65 species, among which Legionella pneumophila is a human pathogen causing severe pneumonia. To understand the evolution of an environmental to an accidental human pathogen, we have functionally analyzed 80 Legionella genomes spanning 58 species. Uniquely, an immense repository of 18,000 secreted proteins encoding 137 different eukaryotic-like domains and over 200 eukaryotic-like proteins is paired with a highly conserved type IV secretion system (T4SS). Specifically, we show that eukaryotic Rho- and Rab-GTPase domains are found nearly exclusively in eukaryotes a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triploidy in cancer is associated with poor prognosis, but its origins remain unclear. Here, we attempted to differentiate between random chromosomal and whole-genome origins of cancer triploidy. In silico meta-analysis was performed on 15 male malignant and five benign tumor cohorts (2928 karyotypes) extracted from the Mitelman Database, comparing their ploidy and combinations of sex chromosomes. A distinct near-triploid fraction was observed in all malignant tumor types, and was especially high in seminoma. For all tumor types, X-chromosome doubling, predominantly observed as XXY, correlated
СтатьяМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurology research and clinical practice are transforming toward postgenomics integrative biology. One such example is the study of human brain metabolism that is highly sophisticated due to reactions occurring in and between the astrocytes and neurons. Because of the inherent difficulty of performing experimental studies in human brain, metabolic network modeling has grown in importance to decipher the contribution of brain metabolite kinetics to human health and disease. Multiomics system science-driven metabolic models, using genome-scale and transcriptomics Big Data, offer the promise of n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeriosis outbreaks are frequently multistate/multicountry outbreaks, underlining the importance of molecular typing data for several diverse and well-characterized isolates. Large-scale whole-genome sequencing studies on Listeria monocytogenes isolates from non-U.S. locations have been limited. Herein, we describe the draft genome sequences of 510 L. monocytogenes isolates from northern Italy from different sources.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To evaluate the utility of salivary gland ultrasound (SGUS) in the diagnosis of primary Sjögren's syndrome (pSS) singly or integrated with 2016 ACR/EULAR classification criteria.
METHODS: Patients with suspected pSS were enrolled in the study. SGUS semi-quantitative scoring was used to assess salivary gland. Clinical characteristics were recorded, including autoantibodies, ophthalmic tests, salivary glands scintigraphy (SGS) and labial biopsy. The diagnostic accuracy of SGUS score and complementary value of SGUS to 2016 ACR/EULAR criteria were analysed.
RESULTS: 282 patients were
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three outbreaks of acute respiratory disease occurred at military camps in 2016 at Tibet, Sichuan and Yunnan province, China. The pathogen induced these three outbreaks were all confirmed as HAdV-55 by genotype-specific PCR. The outbreak in Tibet was the first report that HAdV-55 occurred in the high altitude (HA, above sea level 3658 m). This study aims to determine the gene variation and evolution characteristics of these viral strains. Three strains of adenoviruses, LS89/Tibet/2016 (GenBank accession no. KY002683), SF04/SC/2016 (GenBank accession no. KY002684) and KM03/YN/2016 (GenBank acce
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To understand how differentially methylated genes (DMGs) might affect the pathogenesis of Kashin-Beck disease (KBD). Genome-wide methylation profiling of whole blood from 12 matched KBD and controls pairs was performed using a high-resolution Infinium 450 K methylation array. In total, 97 CpG sites were differentially methylated in KBD compared to the normal controls; of these sites, 36 sites were significantly hypermethylated (covering 22 genes) and 61 sites were significantly hypomethylated (covering 34 genes). Of these genes, 14 significant pathways were identified, the most significant P v
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella suis infection was diagnosed in a man from Tonga, Polynesia, who had butchered swine in Oregon, USA. Although the US commercial swine herd is designated brucellosis-free, exposure history suggested infection from commercial pigs. We used whole-genome sequencing to determine that the man was infected in Tonga, averting a field investigation.
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RT-SHIV is a chimera of simian immunodeficiency virus (SIV) containing the reverse transcriptase (RT)-encoding region of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) within the backbone of SIVmac239. It has been used in a non-human primate model for studies of non-nucleoside RT inhibitors (NNRTI) and highly active antiretroviral therapy (HAART). We and others have identified several mutations that arise in the "foreign" HIV-1 RT of RT-SHIV during in vivo replication. In this study we catalogued amino acid substitutions in the HIV-1 RT and in regions of the SIV backbone with which RT interacts t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As an obligatory parasite of humans, the body louse (Pediculus humanus humanus) is an important vector for human diseases, including epidemic typhus, relapsing fever, and trench fever. Here, we present genome sequences of the body louse and its primary bacterial endosymbiont Candidatus Riesia pediculicola. The body louse has the smallest known insect genome, spanning 108 Mb. Despite its status as an obligate parasite, it retains a remarkably complete basal insect repertoire of 10,773 protein-coding genes and 57 microRNAs. Representing hemimetabolous insects, the genome of the body louse thus p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) can be detected in saliva of carriers and epidemiological studies suggest human bite as a possible route of transmission. We report a case of acute hepatitis B that developed after an individual with learning difficulty was bitten by a fellow resident in a sheltered accommodation. The attacker was found to be a chronic carrier of HBV and virus was present in his saliva. The HBV in both men had identical genotype and sequence. Future studies are warranted to investigate the role of saliva as a vehicle of HBV transmission in the community.
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The appearance of Epstein-Barr virus (EBV)-associated nuclear antigen (EBNA) and induction of EBV-induced early antigen (EA) in human umbilical cord blood lymphocytes (HUCLs) and two EBV genome-negative Burkitt's lymphoma (BL) lines (BJAB and Ramos) were studied by infection with EBVs prepared from three different cell lines: marmoset cell line (B95-8) derived from infections mononucleosis, BL-derived cell line (P3HR-1) and human epithelial hybrid cell line (NPC-KT) derived from nasopharyngeal carcinoma. B95-8 virus can transform HUCLs but cannot superinfect Raji cells. P3HR-1 virus can transf
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Research on genetic variants affecting the gut microbiome and blood metabolites has mainly focused on single nucleotide variants (SNPs), leaving structural variants (SVs) largely unexplored. Here, we analyzed high-coverage (∼42×) whole-genome sequencing data from 2002 individuals and constructed a catalog of 138 859 high-confidence SVs, including 44.3% variants not represented in public SV resources. Genome-wide association analyses of 22 519 common SVs identified 30 microbiome-associated and 48 metabolite-associated SV loci, including 19 study-wide significant associations. Notable signals in
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A major challenge in genomics is deciphering the functional consequences of non-coding genetic variation. Here we present AlphaGenome Atlas, a comprehensive resource that enables the joint interpretation and prioritization of variant effects across the entire human genome. Using AlphaGenome, we predicted the regulatory effects across thousands of molecular phenotypes for every possible human single nucleotide variant and many observed indels. These predictions were then used to derive a unified and interpretable AlphaGenome Variant Impact (AVI) score and to map cis-regulatory motifs across the
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Focal cortical dysplasia (FCD) is a common cause of focal epilepsy that typically results from brain mosaic mutations in the mTOR cell signaling pathway. To identify new potential FCD genes, we developed an in vitro CRISPRi screen in human neurons and used FACS enrichment based on the FCD biomarker, phosphorylated S6 ribosomal protein (pS6). Using whole-genome (110,000 gRNAs) and candidate (129 gRNAs) libraries, we discovered 6 new genes in which loss of function significantly increases pS6 levels: LRRC4, EIF3A, TSN, HIP1, PIK3R3, and URI1. Further analysis of the mTOR pathway showed that only
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования