Gynecological conditions including endometriosis, polyendocrine metabolic ovarian syndrome and malignancies cause widespread chronic morbidi … ling hormonal microenvironments. Together, this framework offers a roadmap for advancing functional genomics and precision medicine across gynecological diseases.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tiers of gene regulation govern cellular life. The intrinsic activities of RNA polymerase (RNAP) constitute a primary tier, while direct mod … pathogens, commensals, and environmental species-at the genome scale. Here, we introduce cell-free genomics (CFG), an empirical approach that identifies the direct targets of RNAP and TFs and systematizes their transcriptional effects. We demonstrate the efficacy of CFG by characterizing global and essential transcription initiation (CRP and holo-WhiB1) a …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We reviewed the epidemiologic and genomic literature and performed genomic analyses to identify population burdens (Eating Disorders, ED and Parkinson's Disease, PD) and shared genetic risk (Anorexia Nervosa, AN and PD), after we previously demonstrated two-to four-fold relative risks of a family history of Parkinson's Disease in families of individuals with ED.
METHOD: We reviewed the epidemiology of both disorders and published genome-wide association studies (GWAS), searched PD GWAS findings with AN associated genome-wide significant SNPs and associated genes and regions, and pe
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Melanoma is an aggressive skin cancer with limited durable responses despite therapeutic advances. Comprehensive characterizatio … were identified in MEDLINE and Embase up to October 2024 using the search algorithm ((Mutation) OR "Genomics"[Mesh]) AND ("Melanoma"[Mesh]). Data were synthesized using random-effects meta-analyses to estimate the pooled prevalence of gene mutations and copy number variations, with heterogeneity assessed using I2 statistics. This study was reported in acco …
Систематический обзорСтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To dissect parasite determinants of clinical disease severity in Plasmodium knowlesi, we performed the first integrative genome-wide association (GWAS), transcriptomic, and expression quantitative trait locus (eQTL) analysis from clinical malaria isolates. We identify distinct parasite programs associated with WHO-defined severe disease, characterized by transcriptional activation of stress-response and host-interaction pathways. In contrast, invasion-linked programs were more strongly associated with parasite burden, while immune-evasion pathways showed overlapping but distinct associations w
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Streptococcus pneumoniae is the leading cause of sight-threatening ocular infection. However, comprehensive molecular epidemiological analyses that focus on ocular pneumococci are limited. We performed a high-resolution whole-genome analysis (WGS) of ocular pneumococcal isolates from the Zhejiang province of China and a global data set (n = 58). Using latex agglutination and the Quellung reaction, nine serotypes were identified, with PCV13 covering 54.5% of the Chinese isolates, and no non-typeable (NT) strains were found in conjunctivitis. Illumina short-read data were assembled d
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shigella spp., and Escherichia coli exhibit notable genomic and phenotypic similarities, including serologically and genetically related somatic antigens. For example, the relationship among pathogenic strains E. coli 64474, O179, O188, and S. boydii O16 suggests a shared clonal origin. To evaluate their genomic proximity, a comparative genomics study was conducted using whole-genome sequencing. Comparative genomics involved rfb gene cluster regions and whole-genome comparisons. Phylogenomic inferences were performed using the virtual genome fingerprint (VGF) method with bootstrap support. The…
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
How did Homo sapiens thrive in extreme environments during their dispersal across Eurasia? Unraveling adaptations that enabled human survival during the Last Glacial Maximum (LGM) remains critical. Here, we analyze 42 genomes from Holocene hunter-gatherers (Jomon) in the Japanese archipelago, revealing their deep ancestry from an isolated Upper Paleolithic (UP) East Eurasian lineage. We detect gene flow from northern UP Siberians into Jomon, reconciling long-standing debates between bioanthropology and archaeology regarding East Asian peopling. We find no Jomon-specific Denisovan ancestry, sug
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) is a major pathogen because of its adaptability. It shows rapid evolution of multidrug resistance (MDR). Phenotype-based diagnostics often fail to detect silent resistance determinants and early adaptive changes. This study integrates phenotypic profiling with whole-genome sequencing (WGS) to examine resistance architecture in clinical isolates from eastern India.
METHODS: From 1295 culture-positive P. aeruginosa specimens collected at a tertiary care hospital in eastern India. Using predefined criteria, representative MDR and non-MDR isolate
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Viroporins are small multifunctional proteins that modify cellular membranes facilitating processes such as viral nucleic acid entry and the release of virions from infected cells. We are interested in studying the evolutionary relationships among these proteins, in particular their organization into families and superfamilies.
METHODS: We applied a variety of computational strategies to perform comparative genomics analyses of 120 viral genomes, using the phylogenetic profile method. This allowed the identification of 12 families, organized into four functionally related groups…
СтатьяСравнительное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Horseshoe bats are natural hosts of zoonotic viruses, yet the genetic basis of their antiviral immunity is poorly understood. Here we generated two new chromosomal-level genome assemblies for horseshoe bat species (Rhinolophus) and three close relatives, and show that, during their diversification, horseshoe bats underwent extensive chromosomal rearrangements and gene expansions linked to segmental duplications. These expansions have generated new adaptive variations in type I interferons and the interferon-stimulated gene ANXA2R, which potentially enhance antiviral states, as suggested by our
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Discovery of novel bioactive natural products from Actinomycetota has decreased, motivating the exploration of rare ecosystems. In this work, we integrated genomics and untargeted metabolomics to profile the biosynthetic capacity of Streptomyces and Nocardia strains isolated from two contrasting, Ramsar-listed Mexican biomes with well-defined ecological features: Cuatro Ciénegas, a semi-arid, oligotrophic karst basin with high microbial endemism, and Calakmul, a tropical rainforest characterized by high biodiversity, seasonal wetlands and limestone-derived alkaline soils. We hypothesized that …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immunotherapy is now standard of care for multiple myeloma (MM), where the most common targets are B cell maturation antigen, CD38, and G protein-coupled receptor class C group 5 member D (GPRC5D). However, additional novel targets are needed to counter tumor heterogeneity, therefore new strategies to identify additional targets are also required.
METHODS: We utilized multi-omics data from two large datasets A framework that utilized prior knowledge of cell surface potential, expression in healthy organs, and expression level in MM cells was established to define novel immunothera
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dystonia is a rare disease trait for which large-scale genomic investigations are still underrepresented. Genetic heterogeneity among patients with unexplained dystonia warrants interrogation of entire genome sequences, but this has not yet been systematically evaluated. To significantly enhance our understanding of the genetic contribution to dystonia, we (re)analysed 2874 whole-exome sequencing (WES), 564 whole-genome sequencing (WGS), as well as 80 fibroblast-derived proteomics datasets, representing the output of high-throughput analyses in 1990 patients and 973 unaffected relatives from 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: We report here on an imported case of Haplorchis taichui infection in a Western country. Given their rarity in these countries, such diagnoses of heterophyid flukes can be particularly difficult.
METHODS: The stool of a 70-year-old Laotian woman with eosinophilia was sent to the laboratory for examination. Microscopic observations based on direct examination and two concentration methods were performed on the fecal sample. After extraction of DNA from the sample, Sanger sequencing of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) region and the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Generating parasite genomes is challenging when little of the DNA in infected host tissue is from the parasite. We used selectiv … ing variation among samples and years.
CONCLUSIONS: SWGA facilitates dual host-parasite population genomics in this system and will greatly expand our understanding of host-parasite interactions over space and time.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella enterica serovar Paratyphi A (S. Paratyphi A) has emerged as a significant global health concern due to the progressive development of antimicrobial resistance and its broader geographic distribution. In Taiwan, paratyphoid fever was historically rare and predominantly associated with imported cases. Since 2022, however, a marked increase in domestically acquired infections has been observed, prompting investigations into their origin and likely route of introduction.
METHODS: We analyzed surveillance data on 223 patients with paratyphoid fever reported in Taiwan betwee
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with chronic lymphocytic leukemia (CLL) have differing clinical outcomes. Recent advances integrating multi-omic data have uncovered molecular subtypes in CLL with different prognostic implications and may allow better prediction of therapy response. While finite-duration chemoimmunotherapy (CIT) has enabled deep responses and prolonged duration of responses in the past, the advent of novel targeted therapy for the treatment of CLL has dramatically changed the therapeutic landscape. In this review, we discuss the latest genomic, transcriptomic, and epigenetic alterations regarded as m
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Single-cell RNA sequencing experiments commonly use 10x Genomics (10x) kits due to their high-throughput capacity and standardized protocols. Recently, Parse Biosciences (Parse) introduced an alternative technology that uses multiple in-situ barcoding rounds within standard 96-well plates. Parse enables the analysis of more cells from multiple samples in a single run without the need for additional reagents or specialized microfluidics equipment. To evaluate the performance of both platforms, we conducted a benchmark study using biological and technical replicates of mouse thymus a…
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Autism is a common neurodevelopmental condition with a complex genetic aetiology that includes contributions from monogenic and polygenic factors. Many autistic people have unmet healthcare needs that could be served by genomics-informed research and clinical trials. The primary aim of the European Autism GEnomics Registry (EAGER) is to establish a registry of participants with a diagnosis of autism or an associated rare genetic condition who have undergone whole-genome sequencing. The registry can facilitate recruitment for future clinical trials and research studies, based on g…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования