Radon, the primary source of natural ionizing radiation and one of the leading causes of lung cancer, is a critical yet often neglected comp … lecular pathways like oxidative stress and DNA damage are implicated, but requiring high-throughput multiomics approaches to define precise interaction networks and identify robust biomarkers. Therefore, we propose a roadmap prioritizing refined exposure assessment techniques, systematic evaluation of nonlung cancer health effects, and multiomics-driven biom …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Host cell proteins are process-related impurities in biotherapeutics and can potentially pose risks to patient safety and product quality. Specifically, certain host cell-derived enzymes, including lipases, can degrade the formulation excipient polysorbate (PS) in biopharmaceutical formulations, affecting drug product stability in liquid formulations. We leveraged multiomics approaches, including transcriptomics, proteomics, and activity-based protein profiling (ABPP), to identify mechanisms that regulate PS-degradative enzyme (PSDE) abundance and to develop strategies for their control. Compa…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
More than 1 in 4 men will undergo surgery for inguinal hernia, which is commonly associated with fibrotic degeneration of the lower abdomina … and large hernias in wild-type mice, which was averted by a progesterone antagonist. Single-nuclei multiomics sequencing of herniated LAM revealed a unique population of Pgr-expressing fibroblasts that promotes fibrosis and myofiber atrophy through TGF-β2 signaling. Multiomics findings were validated in vivo in herniated LAM tissues of both mice and adult m …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of artificial intelligence (AI) in inborn errors of immunity offers transformative potential in diagnostics and disease management but faces multiple challenges that were discussed at the second Artificial Intelligence in Primary Immunodeficiency conference, held in New York City (March 19-22, 2025). The conference addressed 7 themes: predictive diagnostic algorithms, health equity, industry collaboration, advanced computational tools like large language models, patient-led AI initiatives, multiomics integration, and implementation science. Discussions highlighted the growing impact of…
Conference ProceedingsПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lung cancer is a deadly disease with the highest rates of mortality. Over recent decades, a better understanding of the biological mechanisms implicated in its pathogenesis has led to the development of targeted therapies and immunotherapy, resulting in improvements in patient outcomes. To better understand lung cancer tumor biology and advance towards precision oncology, a comprehensive tumor profile is necessary. In recent years, novel in situ spatial multiomics approaches have emerged offering a more detailed view of the spatial location of tumor and tumor microenvironment cells, identifyin…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metastatic brain tumors, also called brain metastasis (BM), represent a challenging complication of advanced tumors. Tumors that commonly metastasize to the brain include lung cancer and breast cancer. In recent years, the prognosis for BM patients has improved, and significant advancements have been made in both clinical and preclinical research. This review focuses on BM originating from lung cancer and breast cancer. We briefly overview the history and epidemiology of BM, as well as the current diagnostic and treatment paradigms. Additionally, we summarize multiomics evidence on the mechani…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peripheral artery disease (PAD), a highly prevalent global disease, associates with significant morbidity and mortality in affected patients. Despite progress in endovascular and open revascularization techniques for advanced PAD, these interventions grapple with elevated rates of arterial restenosis and vein graft failure attributed to intimal hyperplasia (IH). Novel multiomics technologies, coupled with sophisticated analyses tools recently powered by advances in artificial intelligence, have enabled the study of atherosclerosis and IH with unprecedented single-cell and spatial precision. Nu…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The impacts of interferon (IFN) signaling on COVID-19 pathology are multiple, with both protective and harmful effects being documented. We report here a multiomics investigation of systemic IFN signaling in hospitalized COVID-19 patients, defining the multiomics biosignatures associated with varying levels of 12 different type I, II, and III IFNs. The antiviral transcriptional response in circulating immune cells is strongly associated with a specific subset of IFNs, most prominently IFNA2 and IFNG. In contrast, proteomics signatures indicative of endothelial damage and platelet activation as…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, there is no therapy targeting septic cardiomyopathy (SC), a key contributor to organ dysfunction in sepsis. In this study, we used a machine learning (ML) pipeline to explore transcriptomic, proteomic, and metabolomic data from patients with septic shock, and prospectively collected measurements of high-sensitive cardiac troponin and echocardiography. The purposes of the study were to suggest an exploratory methodology to identify and characterise the multiOMICs profile of (i) myocardial injury in patients with septic shock, and of (ii) cardiac dysfunction in patients with myocardia…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Pulmonary fibrosis can result from autoimmune, inflammatory, or idiopathic conditions, including systemic sclerosis-associated i … ctor binding dynamics at single base-pair resolution. Hierarchical causal modelling for single-cell multiomics data (HALO), a novel algorithm developed to derive low-dimensional representations of sparse multiomics data, revealed transcription factor-regulatory element-gene networks.
RESULTS: ChromBPNet inferred increased transcription factor binding to pro …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA modifications represent a dynamic layer of gene expression regulation, RNA stability, and translation with profound implications for cellular function and disease. However, the critical regulation and functions of RNA-modifying proteins (RMPs) remain poorly understood. Here, we present a large-scale characterization of RMPs through 378 multiomics datasets encompassing genomics, bulk and single-cell transcriptomics, epitranscriptomics, proteomics, and posttranslational modifications (PTMs) across 63 human tissues. Our analysis of experimental perturbations of RMPs revealed dynamic different…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer-associated fibroblasts (CAFs) are functionally diverse stromal regulators that orchestrate tumor progression, metastasis, and therapy resistance through dynamic crosstalk within the tumor microenvironment (TME). Recent advances in single-cell multiomics and spatial transcriptomics have identified conserved CAF subtypes with distinct molecular signatures, spatial distributions, and context-dependent roles, highlighting their dual capacity to promote immunosuppression or restrain tumor growth. However, therapeutic strategies struggle to reconcile this functional duality, hindering clinica…
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bone tissue poses significant challenges for proteomic analysis due to its dense, mineral-rich matrix and predominance of collagen, overshad … traction only led to a minimal reduction in quantifiable proteins, making the protocol suitable for multiomics applications. In conclusion, this protocol facilitates comprehensive coverage of proteins after metabolite extraction, enabling comprehensive multiomics analyses and aiding in the assessment of bone diseases and therapeutic developments.
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatic stellate cells (HSCs) transdifferentiate into myofibroblasts during liver fibrosis and exhibit increased glycolysis. Phosphorylated focal adhesion kinase (FAK) (pY397-FAK) promotes monocarboxylate transporter 1 (MCT-1) expression in HSCs to increase aerobic glycolysis and cause liver fibrosis. A combined multiomics analysis of C57BL/6 mice with tetrachloromethane (CCl4)-induced liver fibrosis was performed to identify the downstream FAK signaling pathway. The effect of the FAK inhibitor PF562271 on CCl4-induced liver fibrosis was explored by immunofluorescence of liver tissues. The mig…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Meningioma is the most prevalent primary brain tumor. The aggressive forms of the tumor pose a major challenge to clinicians, as it becomes difficult to eradicate them surgically. This has necessitated a concerted effort to explore novel therapeutic candidates. A multiomics-based pathway analysis, followed by drug repurposing, was undertaken to identify a suitable drug candidate that could potentially be used to control proliferation. Multiomics analysis indicates that IOMM-Lee (high-grade meningioma) cells show enhanced oxidative phosphorylation and ROS-mediated cell-death upon treatment with…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Pharmacological treatment is the mainstay in the acute and long-term management of severe mental disorders such as major depressive disorder, schizophrenia, and bipolar disorder. However, there is large interindividual variability in clinical response, with around one-third of patients presenting treatment-resistance.
AREAS COVERED: This review provides a comprehensive overview of genes that modulate the efficacy or safety of antidepressants, antipsychotics, or mood stabilizers based on a high or moderate level of evidence and for which clinical recommendations are available. Ne
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biochemical network visualization is one of the essential technologies for mechanistic interpretation of omics data. In particular, recent advances in multi-omics measurement and analysis require the development of visualization methods that encompass multiple omics data. Visualization in 2.5 dimension (2.5D visualization), which is an isometric view of stacked X-Y planes, is a convenient way to interpret multi-omics/trans-omics data in the context of the conventional layouts of biochemical networks drawn on each of the stacked omics layers. However, 2.5D visualization of trans-omics networks
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We are just over a decade into the single-cell revolution in biology, which has been coupled to the growing use of artificial intelligence (AI) in single-cell genomics. Most early single-cell RNA embedding models and subsequent "foundation models"-representational models pretrained on large single-cell datasets-did not gain wide traction among experimental biologists. However, as massive single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) atlas efforts ramp up, there is a clear rationale for exploiting AI models to interpret new datasets in the context of vast existing data resources. Meanwhile, the advent
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Min, Schweizer, and colleagues use artificial intelligence-powered deep visual proteomics to generate a spatial proteomic atlas of pancreatic cancer precursor evolution, revealing that major metabolic and inflammatory reprogramming occurs long before overt histologic transformation. More broadly, the study highlights the emerging potential of spatial proteomics and multiomics to bridge histopathology with molecular pathology and precision oncology. See related article by Min et al., p. 1323.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age is a key risk factor for morbidity in coronavirus disease 2019 (COVID-19). This study investigates how "inflammaging" predisposes older hosts to severe SARS-CoV-2 outcomes through systemic and localized metabolic shifts. SARS-CoV-2 infection experiments were conducted respectively on 8 week-old mice and 16 week-old mice. An integrated multiomics approach was employed to delineate age-dependent molecular signatures and metabolic-immune crosstalk. 16 week-old mice exhibited significantly exacerbated weight loss and pulmonary pathology, successfully recapitulating age-related susceptibility. …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования