Streptococcus agalactiae is the leading cause of early-onset neonatal sepsis. Culture-based screening methods lack the sensitivity of molecular assays and do not indicate serotype; a potentially important virulence marker. We aimed to develop a multiplex PCR to detect S. agalactiae while simultaneously identifying serotypes Ia, Ib, and III; commonly associated with infant disease. Primers were designed to target S. agalactiae serotype-specific cps genes and the dltS gene. The assay was validated with 512 vaginal specimens from pregnant women. 112 (21.9%) were dltS positive, with 14.3%, 0.9%, a
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The FilmArray respiratory panel (FARP) reliably and rapidly identifies 17 viruses and 3 bacterial pathogens. A nasopharyngeal swab FARP (NP FARP) is performed for many patients with respiratory symptoms. For patients who are acutely ill or immunocompromised or fail to improve, a bronchoalveolar lavage sample FARP (BAL FARP) is performed in addition to the NP FARP. To date, no studies have compared the yield of a BAL FARP with that of an NP FARP. We retrospectively studied all patients who had a BAL FARP within 7 days after an NP FARP between June 2013 and May 2014. Demographic information, com
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malaria is a vector borne-parasitic disease transmitted through the bite of the infective female Anopheles mosquitoes. Five Plasmodium species have been recognized by World Health Organization (WHO) as the causative agents of human malaria. Generally, microscopic examination is the gold standard for routine malaria diagnosis. However, molecular PCR assays in many cases have shown improvement on the sensitivity and specificity over microscopic or other immunochromatographic assays.
METHODS: The present study attempts to screen 207 suspected malaria samples from patients seeking tre
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Germline heterozygous mutations in the tumor suppresser NF1 gene cause a cancer predisposition syndrome known as neurofibromatosis type 1 (NF1). This disease is one of the most common multisystem disorders with an estimated incidence of 1 in 3,000 to 1 in 4,000 births. Clinically, NF1 patients are prone to develop "café au lait" spots, neurofibromas, Lisch nodules, freckling of the axillary, or inguinal region and optic nerve gliomas.
MATERIALS AND METHODS: In the present study, we report clinical and molecular findings of five unrelated patients and seven cases from four famili
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Between July 2012 and March 2013, a total of 133 clinical specimens from 47 patients suspected of having measles were collected for virological surveillance in Aichi Prefecture, Japan. Facing the rubella epidemic, the reverse transcription (RT)-PCR protocol for measles virus (MeV) was modified to simultaneously detect rubella virus (RUBV) in these clinical specimens. As a result, 30 specimens from 15 patients were positive for RUBV and 8 specimens from 3 patients were positive for MeV. The RUBV genotype analysis for the samples from 13 patients revealed 12 samples as 2B and 1 sample as 1E. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Different polymerase chain reaction (PCR) techniques for human neutrophil antigens (HNA) genotyping have been implemented to diagnose the clinical conditions of patients with alloimmune neutropenia, febrile non-hemolytic transfusion reactions, and transfusion-related acute lung injury and to provide effective HNAmatched granulocyte transfusions. The present study aimed to develop an in-house multiplex-PCR for HNA-1, -3, -4, and -5 genotyping in the Thai population.
METHODS: Altogether, 500 DNA samples obtained from unrelated, healthy Thai blood donors at the National Blood Centre,
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
By means of a multiplex polymerase chain reaction (PCR) we amplified rearranged T-cell receptor gamma chain genes to detect monoclonality in 370 formalin-fixed skin biopsy specimens, showing histological features of parapsoriasis or mycosis fungoides. PCr products were analyzed by temperature gradient gel electrophoresis (TGGE). We selected 20 positive cases for use in a comparison of this technique with conventional agarose and polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE). With TGGE the T-cells had shown monoclonality in 272 of the 370 cases; with agarose electrophoresis they did so in only 5 of…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Accurate diagnosis of existing and emerging respiratory pathogens is important. We evaluated the capability of unbiased metagenomic next generation sequencing (mNGS) to identify pathogenic RNA viruses from two cohorts of nasopharyngeal (NP) swabs previously tested by commercial multiplex respiratory diagnostics.
METHODS: NP swabs (N = 100) in viral transport media (VTM) were assessed using mNGS for this study. Cohort 1 (N = 52) consisted of symptomatic individuals who tested negative for SARS-CoV-2, influenza A/B, and RSV by the Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV Plus multiplex respirator
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomes are parasitic trematode worms of the genus Schistosoma, responsible for causing urogenital and intestinal schistosomiasis. Six primary species infect humans: S. mansoni, S. japonicum, S. mekongi, S. intercalatum, S. guineensis, and S. haematobium. In addition, several species including S. bovis, S. curassoni, and S. mattheei primarily infect animals, particularly cattle. Hybridization events have been documented both between human-infecting species and between human- and animal-infecting species of Schistosoma. Current methods for detecting hybrids rely on genotyping mitochondrial
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Urinary tract infections (UTIs) represent a major global healthcare burden, as both their detection and management remain challenging. Altho … t, paper-based lateral flow assays (LFAs) offer a promising alternative. In this work, we develop a multiplex polymerase chain reaction (PCR) integrated with a paper-based LFA for the detection of UTI-causing pathogens. For the first time, the assay integrates threshold-guided PCR amplification in accordance with established clinical guidelines, enabling the selective detection of p …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: An NGS-based assay was developed to determine the presence or absence of paternally inherited genetic variants in cfDNA derived from the fetus in the plasma of pregnant women. This assay can be used in connection with NGS-based prenatal prediction of fetal blood groups in immunised pregnant women. The purpose of the assay is to minimise the risk of a false-negative outcome in the situation with a prediction of the absence of a blood group allele from the fetus.
METHODS: The underlying principle was to examine genetic markers, with each single marker giving a small contribution to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fowl adenovirus (FAdV) is non-enveloped, icosahedral DNA virus that cause significant economic losses in poultry by inducing inclusion body hepatitis (IBH), hepatitis-hydropericardium syndrome (HHS), and gizzard erosion (GE) via both horizontal and vertical transmission. FAdV comprises five species (A-E) and twelve serotypes (1-7, 8a, 8b, and 9-11 ) that frequently co-circulate within flocks, making early and accurate detection essential for effective control. Here, we have developed a single-tube multiplex PCR assay targeting conserved regions of the fiber and penton base genes, capable of si
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Identifying the pathogens of bacterial meningitis (BM) is crucial for its diagnosis and treatment. The aim of this study is to develop and validate a novel method for detecting pathogens in cerebrospinal fluid (CSF) of children with BM using a digital polymerase chain reaction (dPCR) assay.
MATERIALS AND METHODS: A novel multiplex dPCR assay method has been developed and validated. The diagnostic performance of the dPCR assay was compared with that of synchronous CSF culture, and the factors affecting its performance were analyzed.
RESULTS: A total of 69 children with BM
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epidemiological picture of Taenia saginata infections in Kenya is fragmented with limited available data. Although Sarcocystis species a … l RNA gene and restricted fragment length polymorphism. Sarcocystis species were identified using a multiplex polymerase chain reaction method targeting the 18S ribosomal RNA gene sequences and the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene. Of the 31 cystic lesions tested, 26/31 (83.9%) were confirmed to be T. saginata.Sarcocystis cruzi and S. hominis were detected in 8/31 ( …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Echinococcosis and taeniasis are important helminth diseases that carry considerable impact on human and animal health. Domestic dogs and other canids are definitive hosts for several parasites of this group, including Echinococcus granulosus, Taenia multiceps, T. ovis, T. hydatigena and E. multilocularis. Detection of infection in dog populations is imperative for estimating the risk to susceptible humans and animals, and for its mitigation through prevention measures in dogs, other animals and humans. To date, identification of taeniid eggs, antigens or DNA in fecal samples are the most prac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Currently, malaria is still one of the major public health problems commonly caused by the four Plasmodium species. The similar symptoms of malaria and the COVID-19 epidemic of fever or fatigue lead to frequent misdiagnosis. The disadvantages of existing detection methods, such as time-consuming, costly, complicated operation, need for experienced technicians, and indistinguishable typing, lead to difficulties in meeting the clinical requirements of rapid, easy, and accurate typing of common Plasmodium species. In this study, we developed and optimized a universal two-dimensional labelled prob
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diarrhea in hematopoietic stem-cell transplantation (HSCT) remains a multifactorial challenge that demands a nuanced diagnostic approach. The causes of infectious diarrhea in HSCT recipients are diverse and influenced by patient-specific risk factors, the post-transplant timeline, and local epidemiology. During the past decade, our understanding of diarrhea in HSCT has witnessed a transformative shift through the incorporation of gastrointestinal (GI) multiplex polymerase chain reaction (PCR) panels. However, the judicious application of these panels is imperative to avoid overtesting and prev…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Respiratory infections among children, particularly community-acquired pneumonia (CAP), is a major disease with a high frequency among outpatient and inpatient visits. The causes of CAP vary depending on individual susceptibility, the epidemiological characteristics of the community, and the season. We performed this study to establish a nationwide surveillance network system and identify the causative agents for CAP and antibiotic resistance in Korean children with CAP.
METHODS: The monitoring network was composed of 28 secondary and tertiary medical institutions. Upper and lower
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated the concordance between the Unyvero Hospitalized Pneumonia (HPN) application and quantitative culture for detection of bacterial pathogens from serial lower respiratory tract (LRT) specimens collected from the same subject. Comparison of results from HPN application and culture was evaluated using 69 LRT samples from 27 subjects, using two evaluation approaches. False positive detections by the HPN application was 29% (20/69) in Evaluation I vs 10% (7/68) in Evaluation II. Additional pathogens detected by the HPN application could be confirmed in many instances by culture posit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori cagA + genotype is a leading risk factor for gastric cancer development making accurate identification and timely eradication of H. pylori critical to deadly gastric cancer prevention. Traditional clinical diagnostic methods, including conventional in vitro culture, histological examination, and (13/14)C-urea breath test methods, could only identify the presence of H. pylori, but these means are not capable of identification of cagA + strains. Herein, we firstly built a multiplex detection system based on novel accelerated PCR that could realize one-step detection of as low
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования