Complex biological processes, such as organogenesis and homeostasis, are stringently regulated by genetic programs that are fine-tuned by epigenetic factors to establish cell fates and/or to respond to the microenvironment. Gene regulatory networks that guide cell differentiation and function are modulated and stabilized by modifications to DNA, RNA and proteins. In this review, we focus on two key epigenetic changes - DNA methylation and histone modifications - and discuss their contribution to retinal development, aging and disease, especially in the context of age-related macular degenerati
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Preclinical and clinical studies have demonstrated that the kappa opioid receptor (KOR) regulates reward, hedonic tone and emotions. At therapeutic level, on-going clinical trials are assessing the potential of targeting the KOR for the management of depression, anxiety disorders and substance use disorders. However, genetic polymorphisms in the KOR gene that potentially contribute to its implication in these phenotypes have been poorly studied. Here we investigated an insertion-deletion in the promoter region of KOR (rs35566036), recently associated with alcohol addiction, in a cohort of depr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peroxisome proliferator-activated receptor-γ (PPARγ), is a transcription factor that governs pathways, such as lipid metabolism and immune response, that have been implicated in the etiology of LOAD. Previously, we established HepG2-derived cell-lines with stable knockdown of PPARγ gene, and showed an increase in mRNA levels of genes mapped in the APOE linkage disequilibrium (LD) region on chromosome 19q13.32, with the greatest effect observed for APOE-mRNA. Here, we extended the analysis using our PPARγ knockdown model system and investigated the broader effect on expression changes of genes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microorganisms shape the composition of the medium they are growing in, which in turn has profound consequences on the reprogramming of the population gene-expression profile. In this paper, we investigate the progressive changes in pH and sugar availability in the medium of a growing Escherichia coli (E. coli) culture. We show how these changes have an effect on both the cellular heterogeneity within the microbial community and the gene-expression profile of the microbial population. We measure the changes in gene-expression as E. coli moves from lag, to exponential, and finally into stationa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Adult central nervous system (CNS) neurons are unable to regenerate their axons after injury. Krüppel-like transcription factor (KLF) family members regulate intrinsic axon growth ability in vitro and in vivo, but mechanisms downstream of these transcription factors are not known.
METHODS: Purified retinal ganglion cells (RGCs) were transduced to express exogenous KLF9, KLF16, KLF7, or KLF11; microarray analysis was used to identify downstream genes, which were screened for effects on axon growth. Dual-specificity phosphatase 14 (Dusp14) was further studied using genetic (siRNA, shRN
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the causal genes for holoprosencephaly (HPE) is ZIC2 (HPE5). It belongs to the zinc finger protein of the cerebellum (Zic) family of genes that share a C2H2-type zinc finger domain, similar to the GLI family of genes. In order to clarify the role of Zic2 in gene regulation, we searched for its direct target genes using chromatin immunoprecipitation (ChIP). We identified TGIF1 (HPE4), another holoprosencephaly-causative gene in humans. We identified Zic2-binding sites (ZBS) on the 5' flanking region of Tgif1 by in vitro DNA binding assays. ZBS were essential for Zic2-dependent transcript
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chondroitin sulfate (CS)/dermatan sulfate (DS) proteoglycans are abundant on the cell surface and in the extracellular matrix and have important functions in matrix structure, cell-matrix interaction and signaling. The DS epimerases 1 and 2, encoded by Dse and Dsel, respectively, convert CS to a CS/DS hybrid chain, which is structurally and conformationally richer than CS, favouring interaction with matrix proteins and growth factors. We recently showed that Xenopus Dse is essential for the migration of neural crest cells by allowing cell surface CS/DS proteoglycans to adhere to fibronectin. H
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathological erythropoiesis with consequent anemia is a leading cause of symptomatic morbidity in internal medicine. The etiologies of anemia are complex and include reactive as well as neoplastic conditions. Clonal expansion of erythroid cells in the bone marrow may result in peripheral erythrocytosis and polycythemia but can also result in anemia when clonal cells are dysplastic and have a maturation arrest that leads to apoptosis and hinders migration, a constellation typically seen in the myelodysplastic syndromes. Rarely, clonal expansion of immature erythroid blasts results in a clinical
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is an emerging zoonotic disease with more than 1 million cases annually. Currently there is lack of evidence for signaling pathways involved during the infection process of Leptospira. In our comprehensive genomic analysis of 20 Leptospira spp. we identified seven pathogen-specific Two-Component System (TCS) proteins. Disruption of two these TCS genes in pathogenic Leptospira strain resulted in loss-of-virulence in a hamster model of leptospirosis. Corresponding genes lvrA and lvrB (leptospira virulence regulator) are juxtaposed in an operon and are predicted to encode a hybrid h
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cranial neural crest cells are multipotent cells that provide head skeletogenic mesenchyme and are crucial for craniofacial patterning. We analyzed the chromatin landscapes of mouse cranial neural crest subpopulations in vivo. Early postmigratory subpopulations contributing to distinct mouse craniofacial structures displayed similar chromatin accessibility patterns yet differed transcriptionally. Accessible promoters and enhancers of differentially silenced genes carried H3K27me3/H3K4me2 bivalent chromatin marks embedded in large enhancer of zeste homolog 2-dependent Polycomb domains, indi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the association between IL18RAP and body mass index (BMI) and obesity and to verify the effect of a polymorphism in the microRNA136 (MIR136) IL18RAP binding region.
DESIGN: We analysed samples from two Spanish cross-sectional studies, VALCAR (Spanish Mediterranean coast) and Hortega (Spanish centre). These studies aimed at analysing cardiovascular risk and development of cardiovascular disease in the general population. Both populations correspond to regions with different characteristics.
SETTING: Five IL18RAP single nucleotide polymorphisms were selected using th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The southern house mosquito, Culex quinquefasciatus, is one of the most prevalent vectors of lymphatic filariasis and flavivirus-induced encephalitis. Its vectorial capacity is directly affected by its reproductive feeding behaviors, such as host seeking, blood feeding, resting, and egg laying. In mosquitoes, these gonotrophic behaviors are odor-mediated and regulated following blood feeding. Immediately after a blood meal, female mosquitoes show reduced olfactory responsiveness and flight activity, as they enter a resting state. Insights into antennal chemosensory gene regulation
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The pathophysiology of inflammatory bowel disease (IBD) reflects a balance between mucosal injury and reparative mechanisms. Some regenerating gene (Reg) family members have been reported to be expressed in Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC) and to be involved as proliferative mucosal factors in IBD. However, expression of all REG family genes in IBD is still unclear. Here, we analyzed expression of all REG family genes (REG Iα, REG Iβ, REG III, HIP/PAP, and REG IV) in biopsy specimens of UC and CD by real-time RT-PCR. REG Iα, REG Iβ, and REG IV genes were overexpressed in CD sam
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Articular chondrocytes reside in lacunae distributed in cartilage responsible for the remodelling of the tissue with limited ability of damage repairing. The in vitro expanded chondrocytes enhanced by factors/agents to obtain large numbers of cells with strengthened phenotype are essential for successful repair of cartilage lesions by clinical cell implantation therapies. Because the salvianolic acid B (Sal B), a major hydrophilic therapeutic agent isolated from Salvia miltiorrhiza, has been widely used to treat diseases and able to stimulate activity of cells, this study examines the effects
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Programmed cell death (PCD) is critical for development and responses to environmental stimuli in many organisms. FUZZY ONIONS (FZO) proteins in yeast, flies, and mammals are known to affect mitochondrial fusion and function. Arabidopsis FZO-LIKE (FZL) was shown as a chloroplast protein that regulates chloroplast morphology and cell death. We cloned the FZL gene based on the lesion mimic phenotype conferred by an fzl mutation. Here we provide evidence to support that FZL has evolved new function different from its homologs from other organisms. We found that fzl mutants showed enhanced disease
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late onset Alzheimer's disease (LOAD) is a genetically complex and clinically heterogeneous disease. Recent large-scale genome wide association studies (GWAS) have identified more than twenty loci that modify risk for AD. Despite the identification of these loci, little progress has been made in identifying the functional variants that explain the association with AD risk. Thus, we sought to determine whether the novel LOAD GWAS single nucleotide polymorphisms (SNPs) alter expression of LOAD GWAS genes and whether expression of these genes is altered in AD brains. The majority of LOAD GWAS SNP
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although originally identified for its function in Drosophila melanogaster eye specification, the Retinal Determination Gene Network (RDGN) is essential for the development of multiple organs in mammals. The RDGN regulates proliferation, differentiation and autocrine signaling, and interacts with other key signaling pathways. Aberrant expression of RDGN members such as DACH, EYA and SIX contributes to tumor initiation and progression; indeed, the levels of RDGN members are clinically prognostic factors in various cancer types. Stimulation or suppression of the activities of these crucial compo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exposure to serious or traumatic events early in life can lead to persistent alterations in physiological stress response systems, including enhanced cross talk between the neuroendocrine and immune system. These programming effects may be mechanistically involved in mediating the effects of adverse childhood experience on disease risk in adulthood. We investigated hormonal and genome-wide mRNA expression responses in monocytes to acute stress exposure, in a sample of healthy adults (n=30) with a history of early childhood adversity, and a control group (n=30) without trauma experience. The ea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.