To find out if polymerase chain reaction could be used as a diagnostic tool for detecting neurosyphilis, we have applied the PCR for the detection of Treponema pallidum DNA in the cerebrospinal fluid (CSF) of syphilis patients. The results of the PCR of the CSF in 26 patients with at various stages of illness were compared with the results of other conventional tests used in the WHO criteria. T. pallidum was detected in the CSF of patients at all stages of syphilis, which indicates that they invade the central nervous system from the early stages of infection. However, the presence of T. palli…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Three pairs of oligonucleotide primers, complementary to nucleotide sequences of Yersinia pestis plasmids (pPst, 9.5 kb; pCad, 70 kb; pFra, 95 kb), were used in polymerase chain reaction for high-sensitive specific detection of plague pathogen. Primer pairs P1,P2,C1,C2, and F1,F2 were used to amplify fragments of pla gene (plasmid pPst), yop1 gene (plasmid pCad of plague microbe), and caf1 gene (plasmid pFra), respectively. The method developed enables specific detection of strains from all natural loci in Russia and contiguous states as well as strains of oceanic origin. Sensitivity of method…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A polymerase chain reaction (PCR)-based test was developed for the detection of Salmonella typhi in the blood specimens from patients with typhoid fever. Two pairs of oligonucleotide primers were designed to amplify a 343-bp fragment of the flagellin gene of S. typhi. Amplified products were analyzed by agarose gel electrophoresis and Southern blot hybridization by using a 32P-labeled 40-base probe internal to the amplified DNA. The nested PCR with two pairs of primers could detect 10 organisms of S. typhi as determined by serial dilutions of DNA from S. typhi. The peripheral mononuclear cells…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To assess the feasibility of detecting Chlamydia trachomatis in cryopreserved donor semen by a specific, direct polymerase chain reaction (PCR).
DESIGN: Cryopreserved donor semen was tested for the presence of C. trachomatis by a specific PCR, directly applied to semen without prior DNA purification.
SETTING: Tertiary care fertility center in a teaching hospital and university-based laboratory for molecular pathology.
PARTICIPANTS: Cryopreserved semen from 30 donors was investigated. These semen samples had previously given negative results in cell culture for C. trachomatis. Two…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We recently developed an assay using the polymerase chain reaction (PCR) for the specific detection of St. Louis encephalitis (SLE) virus RNA. This assay was tested in a blind study on 7 samples of pooled mosquitoes (50 mosquitoes/pool) which were also characterized for SLE virus by plaque assay in Vero cell culture. One sample was positive for the SLE virus as determined by both the PCR assay and a combination of the plaque assay and the indirect fluorescent antibody assay. The remaining 6 samples were negative for the presence of SLE virus as determined by both methods. These data indicate t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have demonstrated that the genome of Onchocerca volvulus contains a variable tandemly repeated DNA sequence family with a u … been shown to support the amplification of the 150-bp repeat family from Onchocerca DNA, using the polymerase chain reaction. Both strain and species specific members of the repeat family are faithfully amplified, allowing characterization of a parasite on the basis of hybridization of the PCR amplification products to the previously developed DNA probes. This method is s …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A nonradiometric method has been developed for distinguishing between the sibling species Anopheles gambiae Giles and An. arabiensis Patton, two important Afrotropical vectors of malaria. DNA fragments of species diagnostic length are amplified by polymerase chain reaction (PCR) from a small amount of unknown DNA and three different PCR primers. All three PCR primers are based on ribosomal DNA (rDNA) sequences. A universal plus-strand primer (A0) is derived from a conserved region at the 3' end of the 28S rDNA coding region. Two species-specific minus-strand primers (Aa0.5 and Ag1.3) are deriv…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The extended single-reaction multiplex PCR (esr-mPCR) developed in this study to detect staphylococcal enterotoxins (SEs), including SEA, SEB, SEC, SED, SEE, SEH, SEI, and SEJ, requires fewer sets of primers than other conventional multiplex PCRs and can be used to detect newly identified staphylococcal enterotoxins SEs more readily. Esr-mPCR analysis of 141 isolates of Staphylococcus aureus obtained from abattoir and livestock product samples revealed that 27 of the S. aureus isolates were toxigenic, and two were 2 multitoxigenic isolates. The most prevalent SE type was SEI followed by SEA an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fasciola hepatica is the most widely distributed trematode infection in the world. Control efforts may be hindered by the lack of diagnostic capacity especially in remote endemic areas. Polymerase chain reaction (PCR)-based methods offer high sensitivity and specificity but require expensive technology. However, the recombinase polymerase amplification (RPA) is an efficient isothermal method that eliminates the need for a thermal cycler and has a high deployment potential to resource-limited settings. We report on the characterization of RPA and PCR tests to detect Fasciola infection in clinic…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Three forms of cutaneous leishmaniasis (CL) are endemic in Tunisia. The identification of the causative species is useful to complete epidemiological data and to manage the cases. The aim of this study is to assess PCR-RFLP technique in the identification of Leishmania species responsible of CL in Tunisia and to compare the results of this technique to those of isoenzyme analysis.
PATIENTS AND METHODS: Sixty-one CL lesions were sampled. Dermal samples were tested by culture on NNN medium and analyzed by PCR-RFLP assay targeting the ITS1 region of ribosomal DNA. Species identification was
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunoglobulin heavy chain (IgH) and T-cell receptor (TcR) genes can be monitored as markers of clonality by polymerase chain reaction (PCR) analysis in acute lymphoblastic leukaemia (ALL). We report the short clinical course of a 16-year-old patient with ALL and a t(4;11) who relapsed early following treatment and subsequently received reinduction chemotherapy followed by peripheral blood stem cell transplantation with interleukin 2 therapy. Despite this, the patient relapsed and died 8 months after presentation. The leukaemic cells were analysed by PCR and showed rearrangements of TcR V delt…
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A close relationship between Hashimoto thyroiditis (HT) and low-grade B-cell lymphoma of mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) has been shown. We used immunohistochemistry to study paraffin sections from 40 unselected cases of HT and scored cases according to the lymphoid infiltrate and presence of lymphoepithelial lesions (LELs). Clonality was assessed by kappa/lambda immunohistochemistry and polymerase chain reaction for immunoglobulin heavy chain gene rearrangement (IgH PCR). Histologic findings were compared with 2 cases of primary thyroid MALT-type lymphoma. In HT, the lymphoid infiltr…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Tuberculous pleural effusion (TPE) remains a diagnostic challenge. We aimed to evaluate droplet digital polymerase chain reaction (ddPCR) for detecting Mycobacterium tuberculosis (Mtb)-derived cell-free deoxyribonucleic acid (cfDNA) in pleural effusion.
METHODS: Pleural effusion samples were prospectively collected from two hospitals in Taiwan. ddPCR targeting the IS6110 sequence of Mtb was performed to quantify cfDNA levels. Diagnostic performance was compared with Xpert Ultra.
RESULTS: Of 91 participants, 29 were diagnosed with TPE and 62 with non-TPE causes. ddPCR showed signi…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The considerable abundance and remarkable stability of sEVs provide substantial benefits for diagnosing Alzheimer's disease. Therefore, prec … ch integrates proximity ligation of the three probes to specifically bind to surface biomarkers and polymerase chain reaction (PCR) for signal amplification, enabling "AND" logic analysis of three essential components on sEVs. This method can be utilized for both sEVs quantification and subtype tracing. The proposed approach demonstrated a low limit of detection for neuron …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bacterial lower respiratory tract infection, particularly ventilator-associated pneumonia (VAP), is a significant cause of morbidity and mortality in children who require mechanical ventilation (MV). Microbiologic diagnosis has relied on bacterial culture, but reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) with bacterial targets is now available for clinical use. We compared the diagnostic performance of tracheal aspirate (TA) multiplex RT-PCR to culture in children requiring MV with suspected lower respiratory tract infection.
METHODS: This is a secondary analysis of a …
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Digital polymerase chain reaction (dPCR) is a DNA quantification technology that offers absolute quantification of DNA templates. In this study, we optimized and validated a chip-based dPCR EvaGreen assay with commonly used 16S rRNA gene primer pairs and compared its performance to quantitative real-time PCR (qPCR). We compared measurements of low amounts of template DNA using a newly designed synthetic DNA standard to assess precision, accuracy, and sensitivity. Optimization approaches were tested to minimize partitions with intermediate fluorescence levels between true positive and true nega…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Streptococcus salivarius (S. salivarius) group, which produces the enzyme urease has been identified as a potential contributor to ammonia production in the gut. Researchers have reported that patients with minimal HE had an increased abundance of the S. salivarius group, which is a specific change in the gut microbiota that distinguishes them from healthy individuals. The correlation between the aggregation of specific bacterial species and fibrosis progression in chronic liver disease (CLD) is yet to be fully elucidated.
AIM: To quantify S. salivarius using digital PCR (dPCR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The aim of this study was to investigate the prevalence of Group B Streptococcus (GBS) colonization in pregnancies between 35 and 37 weeks of gestation and to compare the effectiveness of polymerase chain reaction (PCR) method with gold standard technique of culture in antenatal GBS screening.
MATERIAL AND METHODS: Vaginal and rectal swabs of a total of 106 pregnant women between 35th and 37th weeks of gestation, who were admitted to our clinic between January 2022 and August 2022, were evaluated using culture and PCR method. The prevalence of GBS was estimated. The sensitivity, s…
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viral nucleic acid testing of intraocular fluid using polymerase chain reaction (PCR) is a major laboratory examination in the diagnosis of acute retinal necrosis (ARN). Importantly, false negative PCR results may occur in several special situations. We reported a case of ARN with a negative PCR result in the aqueous humour in the very early stages of disease.
CASE PRESENTATION: A female patient presented to the ophthalmologist with complaints of blurred vision and redness in her left eye. Her medical history included ARN in her right eye 10 years prior. Although the result of the…
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the 2022 monkeypox (MPX) outbreak, testing has been limited and results delayed, allowing ongoing transmission. Gold-standard quantitative polymerase chain reaction (qPCR) diagnostics are difficult to obtain. This research adapted the June 2022 CDC MPX qPCR assay for broad implementation. Validated using MPX stocks in a matrix with multiple sample types, MPX was detected with cycle threshold (Ct) values 17.46-35.59 and titer equivalents 8.01 × 106 to 2.45 × 100 plaque-forming unit (PFU)/mL. The detection limit was 3.59 PFU/mL. Sensitivity and specificity were both 100%. This qPCR assay …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.