TbFKBP12 is a putative peptidyl prolyl cis-trans isomerase from Trypanosoma brucei, causative agent of the African trypanosomiasis or sleeping sickness. It interacts with the immunosuppressive drug rapamycin inhibiting the formation of TORC2 complex leading to parasite death by inhibiting cell proliferation through cytokinesis blockade. Moreover, RNAi silencing of TbFKBP12 revealed essential function in both procyclic and bloodstream forms. Both facts make TbFKBP12 an attractive target for ligand development and thus structural data is desirable. In this work we report the NMR resonance assign
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amylin is an endocrine hormone that accumulates in amyloid plaques in patients with advanced type 2 diabetes. The amyloid plaques have been implicated in the destruction of pancreatic β-cells, which synthesize amylin and insulin. To better characterize the secondary structure of amylin in amyloid fibrils we assigned the NMR spectrum of the unfolded state in 95% DMSO and used a quenched hydrogen-deuterium exchange technique to look at amide proton solvent protection in the fibrils. In this technique, partially exchanged fibrils are dissolved in 95% DMSO and information about amide proton occupa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Membrane proteins participate in nearly all cellular processes; however, because of experimental limitations, their characterization lags far behind that of soluble proteins. Peripheral membrane proteins are particularly challenging to study because of their inherent propensity to adopt multiple and/or transient conformations in solution and upon membrane association. In this review, we summarize useful biophysical techniques for the study of peripheral membrane proteins and their application in the characterization of the membrane interactions of the natively unfolded and Parkinson's disease
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation and fibrillation of alpha-synuclein has been implicated as a causative factor in the Parkinson's disease. The hexamer motif KTKEGV is found in each of the seven imperfect repeat sequences in the N-terminal half of alpha-synuclein. The motif is not fully conserved in the sixth and seventh repeats. We created mutants in which the motif was repaired to be fully conserved in either (Rep6 and Rep7) or both (Rep67) of these two repeats. The Rep6 and Rep67 mutants showed a greatly reduced propensity to aggregate and fibrillate while all three mutants showed greater resistance to HFIP-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helical polymers of isocyanopeptides derived from beta-amino acids have been synthesized and their architectures have been studied in detail. Similar to their alpha-amino acid analogues, the helical conformation in these macromolecules is stabilized by internal hydrogen-bonding arrays along the polymeric backbone. Unexpectedly, the flexibility of the beta-peptide side arms results in a rearrangement of the initial macromolecular architecture, leading to a more stable helical structure possessing a better defined hydrogen-bonding pattern, as was concluded from IR and temperature-dependent circu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Primary biliary cirrhosis (PBC) is a chronic cholestatic liver disease characterized by the presence of antimitochondrial autoantibodies in patients' serum. The major autoantigen, recognized by antibodies from > 95% of patients with PBC, has been identified as the E2 component (E2p) of the pyruvate dehydrogenase multienzyme complex. Immunodominant sites on E2p have been localized to the inner of the two lipoyl domains, where the essential cofactor lipoic acid is attached covalently. The aim of this study was to determine the three-dimensional structure of the inner lipoyl do
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A conformational study by circular-dichroism spectroscopy of calcitonin-gene-related peptide (CGRP) and related fragments and analogs was carried out in structure-promoting solvent mixtures. The structural characterization of rat CGRP alpha and the two isoforms of human CGRP, alpha and beta, revealed that these peptides possess very similar conformational features. The far-ultraviolet circular-dichroism spectra, in pure water, of human CGRP alpha, (hCGRP alpha), [Acm-Cys2,7]hCGRP alpha, various fragments and analogs indicated that these peptides exhibited predominantly a random-coil conformati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Huntington's Disease (HD) originates from the expansion of a polyglutamine (PolyQ) tract in the huntingtin protein (Htt), which can assume a coiled-coil fold (Cc). We previously found that Cc structures mediate the aggregation and toxicity of polyQ Htt. Since polyQ Htt aggregates were previously found to be internalized by cells, here we hypothesize that Cc structures might be implicated in the intercellular propagation of Htt aggregates. To test this hypothesis, we performed experiments using human cell lines expressing Htt proteins with different probabilities to acquire a Cc fold. We found
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein aggregation into amyloid fibrils is linked to multiple neurodegenerative disorders, such as Alzheimer's, Parkinson's or Creutzfeldt-Jakob disease. A better understanding of the way these aggregates form is vital for the development of drugs. A large detriment to amyloid research is the ability of amyloidogenic proteins to spontaneously aggregate into multiple structurally distinct fibrils (strains) with different stability and seeding properties. In this work we show that prion proteins are capable of forming more than one type of fibril under the exact same conditions by assessing the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation of α-synuclein (αS), which is implicated in the pathology of Parkinson's disease, produces fibrils in which layers of parallel, in-register β-sheet-loop-β-sheets are formed. The effects of sequence variation in the loop-forming region (referred to as the linker region) on αS aggregation have yet to be systematically studied. In the study described here, we created and characterized αS variants containing mutations in the linker regions. Our results indicate that although the physicochemical properties of the linker region, evaluated based on an intrinsic property of a single am
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vibriolysin is among several zinc metalloproteases produced by Vibrio cholerae. It is involved in the molecular pathogenicity of cholera. Here, we cloned and expressed full-length vibriolysin gene from V. cholerae. Electrophoretic and mass spectrometric data showed that the N-terminal pro-peptide was removed from pro-vibriolysin generating a 45-kDa segment containing the metalloprotease plus the C-terminal domains, and the 35 kDa metalloprotease. The 35 kDa metalloprotease segment of vibriolysin was purified to homogeneity using ion-exchange and gel filtration chromatography. Circular dichrois
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In bacteria, fungi, plants, and apicomplexan parasites, the aromatics compounds, such as aromatics amino acids, are synthesized through seven enzymes from the shikimate pathway, which are absent in mammals. The absence of this pathway in mammals make them potential targets for development of new therapy against infectious diseases, such as tuberculosis, which is the world's second commonest cause of death from infectious disease. The last enzyme of shikimate pathway is the chorismate synthase (CS), which is responsible for conversion of the 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate to chorismate. Her
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Niemann-Pick type C (NPC) is a lysosomal storage disorder, characterized by intracellular accumulation of low-density lipoprotein (LDL)-derived cholesterol and neurodegeneration leading to premature death. The most common form of the disease, NPC1, results from mutations in the NPC1 gene. Thus, the NPC1 protein is the focus of intense investigation to elucidate the function of this protein and its role in the disease pathogenesis. Recent studies have revealed the NPC1 subcellular location, topology and potential functions of the NPC1 protein. In lieu of direct experimental evidence, certain hy
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary elliptocytosis (HE) and hereditary pyropoikilocytosis (HPP) are common disorders of erythrocyte shape primarily because of mutations in spectrin. The most common HE/HPP mutations are located distant from the critical αβ-spectrin tetramerization site, yet still interfere with formation of spectrin tetramers and destabilize the membrane by unknown mechanisms. To address this question, we studied the common HE-associated mutation, αL260P, in the context of a fully functional mini-spectrin. The mutation exhibited wild-type tetramer binding in univalent binding assays, but reduced bindin
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The factors that stabilize the folding and oligomerization of membrane proteins are still not well understood. In particular, it remains unclear how the tight and complementary packing between apolar side chains observed in the core of membrane proteins contributes to their stability. Complementary packing is a necessary feature since packing defects are generally destabilizing for membrane proteins. The question is the extent by which packing of apolar side chains-and the resulting van der Waals interactions-is a sufficient driving force for stabilizing the interaction between transmembrane h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phylogenetically divergent spirochete bacterium Treponema pallidum subsp. pallidum is the causative agent of syphilis. Central to the capacity of T. pallidum to establish infection is the ability of the pathogen to attach to a diversity of host cells. Many pathogenic bacteria employ leucine-rich repeat (LRR) domain-containing proteins to mediate protein-protein interactions, including attachment to host components and establishment of infection. Intriguingly, T. pallidum expresses only one putative LRR domain-containing protein (Tp0225) with an unknown function. In an effort to ascribe a f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Members of the voltage-gated ion channel superfamily (VGIC) regulate ion flux and generate electrical signals in excitable cells by opening and closing pore gates. The location of the gate in voltage-gated sodium channels, a founding member of this superfamily, remains unresolved. Here we explore the chemical modification rates of introduced cysteines along the S6 helix of domain IV in an inactivation-removed background. We find that state-dependent accessibility is demarcated by an S6 hydrophobic residue; substituted cysteines above this site are not modified by charged thiol reagents when th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The carboxyl-terminal domains of von Willebrand factor, D4-CK, are cysteine-rich implying that they are structurally important. In this study we characterized the impact of five cysteine missense mutations residing in D4-CK domains on the conformation and biosynthesis of von Willebrand factor. These variants were identified as heterozygous in type 1 (p.Cys2619Tyr and p.Cys2676Phe), type 2A (p.Cys2085Tyr and p.Cys2327Trp) and as compound heterozygous in type 3 (p.Cys2283Arg) von Willebrand disease. Transient expression of human cell lines with wild-type or mutant von Willebrand factor construct
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Selective therapeutics for nuclear receptors would revolutionize treatment for endocrine disease. Specific control of nuclear receptor activity is challenging because the internal cavities that bind hormones can be virtually identical. Only one highly selective hormone analog is known for the thyroid receptor, GC-24, an agonist for human thyroid hormone receptor beta. The compound differs from natural hormone in benzyl, substituting for an iodine atom in the 3' position. The benzyl is too large to fit into the enclosed pocket of the receptor. The crystal structure of human thyroid hormone rece
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The conformational features of Pam-Lys(0)-Arg(1)-Pro(2)-Pro(3)-Gly(4)-Phe(5)-Ser(6)-Pro(7)-Phe(8)-Arg(9)-OH (PKD) and Pam-Gly(-1)-Lys(0)-Arg(1)-Pro(2)-Pro(3)-Gly(4)-Phe(5)-Ser(6)-Pro(7)-Phe(8)-Arg(9)-OH (PGKD), the Pam-Lys and Pam-Gly-Lys analogues of bradykinin, have been determined by high-resolution NMR in a zwitterionic lipoid environment. Radical-induced relaxation of the (1)H NMR signals was used to probe the topological orientation of the peptides with respect to the zwitterionic lipid interface. The radical-induced relaxation and molecular dynamics (MD) data indicated that the palmitic
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования