Adoptive cell therapy with tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) induces durable responses in metastatic melanoma, yet the clonal and transcriptional dynamics governing tumor-reactive T cell fate during ex vivo expansion and after transfer remain poorly understood. Here, we perform longitudinal single-cell RNA and T cell receptor sequencing across five time points, from baseline tumors through two-phase ex vivo expansion to post-infusion blood and tumor biopsies, in seven melanoma patients, resolving both the CD8+ and CD4+ compartments. Tumor-reactive CD8+ T cells are reinvigorated from exhaus
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious cell entry by non-enveloped viruses requires delivery of the viral genome -- in many cases enclosed within a large, subviral particle -- across the membrane of an intracellular compartment. Rotaviruses and other double-strand RNA (dsRNA) viruses introduce into their target cells an inner capsid particle, roughly 700 Å in diameter, that does not uncoat further but instead extrudes capped viral mRNA by virtue of RNA-dependent RNA polymerase and capping activities within it. The delivery agent is an outer protein layer of the virion. We describe here use of cryogenic electron tomograph
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidial infection causes dysregulated transcription of host genes key to intestinal epithelial homeostasis, but the underlying mechanisms remain obscure. Previous studies demonstrate that several Cryptosporidium parvum (C. parvum) RNA transcripts are selectively delivered into epithelial cells during host cell invasion and may modulate gene transcription in infected cells. We report here that C. parvum infection suppresses the transcription of LRP5, SLC7A8, and IL33 genes in infected intestinal epithelium. Trans-suppression of these genes in infected host cells is associated with promo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to determine whether a mitochondrial DNA mutation and defective oxidative phosphorylation are present in a pedigree with maternally inherited sensorineural deafness, levodopa-responsive parkinsonism, and neuropathy. We sequenced the mitochondrial-encoded ribosomal RNA, cytochrome c oxidase, and transfer RNA genes by cycle sequencing. A polymerase chain reaction-based restriction enzyme assay with mismatched primers was employed to show heteroplasmy of a novel 12SrRNA mutation in the proband and to screen control subjects. Spectrophotometric mitochondrial respira
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to clarify whether keratinocytes and/or fibroblasts express genes encoding basement membrane zone macromolecules, we examined laminin, type IV collagen and 230 kDa bullous pemphigoid antigen (BPAG1) gene expression in keratinocytes and fibroblasts in culture. Northern transfer analysis revealed the presence of specific mRNA transcripts for alpha 1(IV) and alpha 2(IV) chains of type IV collagen as well as B1 and B2 chains of laminin in both fibroblast and keratinocyte RNA. Laminin A mRNA, however, was detected in fibroblasts but not in keratinocytes. In contrast, BPAG1 mRNA was detecte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N⁴-acetylcytidine (ac⁴C) is an evolutionarily conserved RNA modification that was initially identified in transfer RNA (tRNA) and ribosomal RNA (rRNA). Increasing evidence has subsequently expanded its functional landscape to messenger RNA (mRNA) and multiple classes of non-coding RNAs (ncRNAs). As the best-characterized ac⁴C writer in mammals, N-acetyltransferase 10 (NAT10) orchestrates RNA structure, stability, processing, and translation, thereby governing fundamental physiological processes, including ribosome biogenesis, translational fidelity, proteostasis, cell fate determination, hemat
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic cells rely on a highly coordinated organelle network to maintain metabolism, signaling, stress adaptation and cell survival. Membrane contact sites (MCSs) provide essential platforms for inter-organelle communication. As obligate intracellular parasites, less attention has been given to how viral perturbation of MCSs may reshape the broader organelle communication network. In this review, we focus on positive-sense RNA viruses and virus-induced membrane contact sites (vMCSs), focusing on ER-associated tethering factors, lipid transfer pathways, calcium signaling modules, and replica
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Maternal immune activation (MIA) induced by lipopolysaccharides or polyinosinic:polycytidylic acid injections can induce behavioral abnormalities in adult mouse offspring. Here, we used the soluble tachyzoite antigen from Toxoplasma gondii, a parasite that infects approximately two billion people, to induce MIA in mice. The adult male offspring showed autism-relevant behaviors and abnormal brain microstructure, along with a pro-inflammatory T-cell immune profile in the periphery and upregulation of interleukin-6 in brain astrocytes. We show that adoptive transfer of regulatory T (Treg) cells l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis (OA) is a prevalent aging-related joint disease lacking disease-modifying therapies. Here, we identified an upregulation of circulating exosomal osteoclast (OC)-derived microRNAs (OC-miRNAs) during the progression of surgery-induced OA in mice. We found that reducing OC-miRNAs by Cre-mediated excision of the key miRNA-processing enzyme Dicer or blocking the secretion of OC-originated exosomes by short interfering RNA-mediated silencing of Rab27a substantially delayed the progression of surgery-induced OA in mice. Mechanistically, the exosomal transfer of OC-miRNAs to chondrocyte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic cell nuclear transfer embryos exhibit extensive epigenetic abnormalities, including aberrant methylation and abnormal imprinted gene expression. In this study, a thorough analysis of X chromosome inactivation (XCI) was performed in both preimplantation and postimplantation nuclear transfer embryos. Cloned blastocysts reactivated the inactive somatic X chromosome, possibly in a gradient fashion. Analysis of XCI by Xist RNA and Eed protein localization revealed heterogeneity within cloned embryos, with some cells successfully inactivating an X chromosome and others failing to do so. Addi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Baylisascaris species parasitizing skunks have received limited attention compared to the well-characterized raccoon roundworm (B. procyonis). We present the first complete mitochondrial genome of a Baylisascaris sp. collected in Kansas, United States, from a striped skunk (Mephitis mephitis). We morphologically identified the nematode as Baylisascaris sp., extracted DNA, sequenced it on the Illumina platform, and de novo assembled the complete mitochondrial genome. The complete mitochondrial genome was 14,752 bp, consisting of 12 protein-coding genes, 2 rRNAs, and 22 tRNAs. The genome had a s
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycystic ovary syndrome is a common clinical condition often linked to insulin resistance (IR) and primarily affects women at reproductive age. Previous research has indicated a close association between mitochondrial tRNA (mt-tRNA) mutations and this syndrome; however, the range of mt-tRNA mutations in PCOS-IR remains largely unclear. In this study, we examined mt-tRNA mutations in 302 Han Chinese women with PCOS-IR and 589 control subjects, identifying a novel m.7544C>T mutation potentially related to this syndrome. At the molecular level, the m.7544C>T mutation occurs at a highly conserve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite the substantial progress in multiple myeloma (MM) therapy nowadays, treatment resistance and disease relapse remain major clinical hindrances. Herein, we have investigated tRNA-derived fragment (tRF) profiles in MM and precursor stages (smoldering MM/sMM; monoclonal gammopathy of undetermined significance/MGUS), aiming to unveil potential MM-related tRFs in ameliorating MM prognosis and risk stratification. Small RNA-seq was performed to profile tRFs in bone marrow CD138+ plasma cells, revealing the significant deregulation of the mitochondrial internal tRFHisGTG (mt-i-tRFHisGTG) in MM
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The past decade has seen a wealth of 3D structural information about complex structured RNAs and identification of functional intermediates. Nevertheless, developing a complete and predictive understanding of the folding and function of these RNAs in biology will require connection of individual rate and equilibrium constants to structural changes that occur in individual folding steps and further relating these steps to the properties and behavior of isolated, simplified systems. To accomplish these goals we used the considerable structural knowledge of the folded, unfolded, and intermediate
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aspergillus ustus is among the most ubiquitous soil species and has been implicated in human infections. The complete mitochondrial genome of A. ustus has been determined by high-throughput sequencing technology in this work. Our study revealed that the mitochondrial genome of A. ustus is 33,007 bp long, with AT content of 74.84%, which consists of a usual set of mitochondrial proteins and RNA genes, including large and small ribosomal RNAs, 15 proteins and 20 tRNA genes and contains two introns. Notably, it also contains three hypothetical proteins without obvious homology to any known protei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Catalysis of tRNA(Tyr) aminoacylation by tyrosyl-tRNA synthetase can be divided into two steps. In the first step, tyrosine is activated by ATP to form the tyrosyl-adenylate intermediate. In the second step, the tyrosyl moiety is transferred to the 3' end of tRNA. To investigate the roles that enthalpic and entropic contributions play in catalysis by Bacillus stearothermophilus tyrosyl-tRNA synthetase (TyrRS), the temperature dependence for the activation of tyrosine and subsequent transfer to tRNA(Tyr) has been determined using single turnover kinetic methods. A van't Hoff plot for binding of
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interactions of 4-thiouridine and 5-[(methylamino)methyl]-2-thiouridine in tRNA and of phosphorothioate esters in nucleic acids with an organomercurial have been investigated. For this purpose, an affinity electrophoretic system has been developed in which the mercury derivative has been covalently immobilized in a standard polyacrylamide gel. The retardation of thiolated macromolecules was found to be sensitive to the chemical environment of the sulfur atom, giving characteristic interaction constants dependent on the nature of the modification and its accessibility to binding. The intera
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transfer RNA-derived small RNAs (tsRNAs) are a novel class of small non-coding RNAs abundant in the bloodstream of cancer patients and involved in various physiological and pathological processes. However, the regulatory mechanisms and clinical significance of tsRNAs in colorectal cancer (CRC) remain unclear. In this study, PANDORA-seq was used as an exploratory screen of CRC tissues, paired adjacent tissues, and CRC plasma samples, followed by validation in larger independent cohorts. Quantitative real-time PCR quantified mt-5'-tiRNA-Tyr levels in tissues, plasma, and cells. Functional assays
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV), a single-stranded RNA virus transmitted by Aedes mosquitoes, poses a significant global health threat, with severe complications observed in vulnerable populations. The only licensed vaccine, IXCHIQ, approved by the US FDA, is insufficient to address the growing disease burden, particularly in endemic regions lacking herd immunity. Monoclonal antibodies (mAbs), explicitly targeting structural proteins E1/E2, demonstrate promise in passive transfer studies, with mouse and human-derived mAbs showing protective efficacy. This article explores various vaccine candidates,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Arthropods harbor a largely undocumented diversity of RNA viruses. Some arthropods, like mosquitoes, can transmit viruses to vertebrates but are themselves parasitized by other arthropod species, such as mites. Very little is known about the viruses of these ectoparasites and how they move through the host-parasite relationship. To address this, we determined the virome of both mosquitoes and the mites that feed on them. The mosquito Aedes communis is an abundant and widely distributed species in Sweden, in northern Europe. These dipterans are commonly parasitized by water mite larvae (Trombid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.