A 33-year-old brown bear (Ursus arctos) was evaluated for chronic cough, partial anorexia, and lethargy in early fall of 2009. Radiographs revealed a generalized increase in interstitial density with focal lung field consolidation and air bronchograms more prevalent in the cranial lung lobes. Tracheal sputum and wash fluid grew mixed bacteria and 2 species of Candida on bacterial and fungal cultures, respectively. Serum was negative for antibodies to Aspergillus, Blastomyces, Coccidioides, and Histoplasma by semiquantitative radial immunodiffusion. Antimicrobial and antifungal treatment was ad
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An in-house quantitative real-time PCR (qPCR) assay using TaqMan chemistry has been developed to detect NDM-1 carbapenemase genes from bacterial isolates and directly from stool samples. The qPCR amplification of bla(NDM-1) DNA was linear over 10 log dilutions (r(2) = 0.99), and the amplification efficiency was 1.03. The qPCR detection limit was reproducibly 1 CFU, or 10 plasmid molecules, and there was no cross-reaction with DNA extracted from several multidrug-resistant bacteria harboring other β-lactam resistance genes. Feces spiked with decreasing amounts of enterobacterial isolates produc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral aerosols can have a major impact on public health and on the dynamics of infection. Once aerosolized, viruses are subjected to various stress factors and their integrity and potential of infectivity can be altered. Empirical characterization is needed in order to predict more accurately the fate of these bioaerosols both for short term and long term suspension in the air. Here the susceptibility to aerosolization of the monkeypox virus (MPXV), associated with emerging zoonotic diseases, was studied using a 10.7 L rotating chamber. This chamber was built to fit inside a Class three biolog
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the study was to improve the diagnosis of pleural tuberculosis (TB) based on formalin-fixed biopsies from patients living in high TB and human immunodeficiency virus (HIV) endemic areas. A real-time polymerase chain reaction (real-time PCR) assay targeting a segment of the gene for mycobacterial 65-kd heat shock protein was developed and evaluated on pleural biopsies from 25 patients clinically diagnosed as having TB, on the basis of the good response to treatment, and from 11 controls. A nested polymerase chain reaction (N-PCR) assay for the repetitive genetic sequence insert IS611…
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpesviruses are associated with disease in many chelonian species, resulting in pathology such as respiratory tract infection, stomatitis, conjunctivitis, hepatitis, and papillomatosis. Herpesvirus-associated fibropapillomas cause significant morbidity and mortality in marine turtles, and have been identified in an eastern box turtle (Terrapene carolina carolina) infected with Terrapene herpesvirus 2 (TerHV2). Further investigation is necessary to understand the impact of carcinogenic herpesviruses on chelonian health; however, reliable and specific methods for detection and quantitation of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian influenza A virus (AIV) and Newcastle disease virus (NDV) are among the most damaging pathogens of poultry, and AIV also carries zoonotic potential that places it within the One Health agenda. The two infections frequently produce overlapping clinical signs, so a method that detects both in a single reaction has clear practical value for surveillance. We developed a duplex one-step real-time reverse-transcription PCR (RT-qPCR) that detects AIV in the FAM channel and NDV in the ROX channel. Primers and hydrolysis probes were designed against conserved regions of the AIV nucleoprotein and
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In recent years, Madagascar and the Comoros archipelago have been affected by epidemics of Rift Valley fever (RVF), however detection of Rift Valley fever virus (RVFV) in zebu, sheep and goats during the post epidemic periods was frequently unsuccessful. Thus, a highly sensitive real-time RT-PCR assay was developed for the detection of RVFV at low viral loads. A new RVF SYBR Green RT-PCR targeting the M segment was tested on serum from different RVF seronegative ruminant species collected from May 2010 to August 2011 in Madagascar and the Comoros archipelago and compared with a RVF specific qu
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kyasanur forest disease (KFD) is a zoonotic viral disease caused by infection by a Flavivirus, a member of the family Flaviviridae. KFD is a public health concern in the Karnataka State in southern India. Available conventional diagnostic tests such as virus isolation and serological tests, such as haemagglutination inhibition and complement fixation tests are time consuming. This study reports the development of a nested RT-PCR [nRT-PCR] and a TaqMan-based real-time RT-PCR and IgM antibodies capture ELISA [MAC-ELISA] for rapid and accurate diagnosis of suspected KFD cases. The nRT-PCR and the
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: The protein p16(Ink4a) is overexpressed in cervical lesions associated with high-risk human papillomavirus (HPV) subtypes 16 and 18 … plasia 1 lesions not reactive for p16(Ink4a) were investigated for the presence of high-risk HPV by real-time polymerase chain reaction.
RESULTS: No p16(Ink4a) reactivity was detected in the cervical lesions associated with atypical non-HPV change. Eleven of the cervical intraepithelial neoplasia 1 lesions showed focal/scattered reactivity expression for p16(Ink4a), and 19 of the C …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study investigated the role of interleukin-17 (IL-17) in giant cell arteritis (GCA), which has remained uncertain despite previous research suggesting a contribution of Th17 cells to the disease.
METHODS: Temporal artery biopsies (TABs) were cultured ex vivo in MATRIGEL with IL-17, secukinumab, or control IgG and subsequently analyzed using bulk RNA-sequencing and real-time quantitative polymerase chain reaction. Positive TABs with GCA features were compared to negative TABs or used to obtain in vitro cultures of myofibroblasts (MFs). Confocal microscopy analyzed IL-17 recepto
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: A feature of vulnerable atherosclerotic plaques of the carotid artery is high activity and abundance of lesion macrophages. There is consensus that this is of importance for plaque vulnerability, which may lead to clinical events, such as stroke and transient ischemic attack. We used positron emission tomography (PET) and the novel PET ligand [(64)Cu] [1,4,7,10-tetraazacyclododecane-N,N',N″,N‴-tetraacetic acid]-d-Phe1,Tyr3-octreotate ((64)Cu-DOTATATE) to specifically target macrophages via the somatostatin receptor subtype-2 in vivo.
APPROACH AND RESULTS: Ten patients underwent sim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Affordable molecular tools for SARS-CoV-2 surveillance are crucial, particularly in settings where access to advanced technologies is limited. This study aimed to validate a dual-purpose strategy based on conventional PCR and polyacrylamide gel electrophoresis for both diagnosis and lineage screening.
METHODS: Fifty-five nasopharyngeal swab samples were analyzed through RNA extraction, reverse transcription, and conventional PCR targeting the SARS-CoV-2 spike (S) gene. Amplicons were visualized on 6% polyacrylamide gels, and the diagnostic results were compared with those of RT‒qPCR.
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the prevalence of viral agents causing reproductive failure in pigs in Korea. In addition, two types of multiplex real-time PCR (mqPCR) were developed for the simultaneous detection of Aujeszky's disease virus (ADV) and porcine parvovirus (PPV) in mqPCR and encephalomyocarditis virus (EMCV) and Japanese encephalitis virus (JEV) in reverse transcription mqPCR (mRT-qPCR). A total of 150 aborted fetus samples collected from 2020 to 2022 were analyzed. Porcine reproductive and respiratory syndrome virus was the most prevalent (49/150 32.7%), followed by porcine circ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Immune-mediated platelet transfusion refractoriness (IPTR) remains a major clinical challenge, with immune alloimmunization against HLA and HPA as the predominant causes. Although HLA cross-reactive groups (CREGs) provide a practical alternative to allele-level matching, methods for simultaneous HLA-CREG and HPA genotyping remain limited despite their potential to improve platelet matching.
METHODS: Specific U-anchoring primers (UAPs) and amplification refractory mutation system (ARMS) primers were designed and optimized based on one or more SNPs within HLA-CREG subgroups and HPA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The COVID-19 pandemic, caused by SARS-CoV-2, highlighted the need for accurate and scalable diagnostic tools such as RT-qPCR. However, false-negative results may occur due to viral mutations and RNA secondary structures within target regions.
METHODS: High-performance computing (HPC) was used to compile SARS-CoV-2 genomic sequences from GenBank and GISAID and generate consensus sequences for primer and probe design. A region within the ORF8 gene was selected and evaluated alongside targets from the E and N genes and the RNase P control. Nasopharyngeal swab samples were collected f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bovine coronavirus (BCoV) is an economically significant pathogen that causes respiratory and enteric infections in cattle and wild ruminants. Although multiple diagnostic methods are available, there is still an urgent need for a sensitive real-time reverse transcription quantitative PCR (RT-qPCR) assay capable of detecting continuously emerging novel strains of BCoV.
OBJECTIVE: This study aimed to develop a sensitive and broad-spectrum RT-qPCR assay for the efficient detection of BCoV.
METHODS: Following optimization and comparison of two primer-probe sets targeting the M gene,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Piscine orthoreoviruses (PRV) are often associated with pathologies affecting various salmonid species, especially farmed species. Both surveillance and research purposes require diagnostic molecular-based tools able to detect the most frequent genotypes, namely PRV-1 and PRV-3. A new one-step reverse-transcription real-time PCR (RT-qPCR) was set up targeting a conserved region of the L1 segment. Based on the French standard NF U47-600, this PCR method proved to be specific to PRV, excluding other salmonid viruses. The assay can detect 1000 copies of a synthetic transcript of PRV-3, pure or mi
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since May 2022, a wave of several thousand cases of monkeypox Virus (MPXV) infections has been reported across Europe. In the beginning of this outbreak, reference material (RM) and reference measurement procedure (RMP) were lacking. We developed a measurement procedure using digital PCR (dPCR) for the absolute quantification of the viral genome of MPXV. This study investigated dPCR as potential reference method for MPXV quantification and evaluated performance in the External quality assessment (EQA) and clinical samples. This included DNA extraction performance using two commercial kits, MPX
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid and accurate laboratory identification of targetable therapeutic genes, together with the implementation of measurable residual disease (MRD) based decision is essential for optimal clinical management in acute myeloid leukemia (AML). The PETHEMA (Programa Español de Tratamientos en Hematología) cooperative group comprises nine laboratories that perform centralized molecular studies by conventional PCR and Real-time quantitative PCR (RT-qPCR) for AML patients. With the aim to validate laboratories performances, we conducted three rounds of interlaboratory cross validation (ICV) for t
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Goose astrovirus (GAstV) is an important pathogen causing joint and visceral gout in goslings. Its high incidence and mortality had caused enormous economic losses to the goose farming industry. The study aimed to develop a method for the simultaneous and differential detection of goose astrovirus genotype 1 (GAstV-1) and genotype 2 (GAstV-2). Specific primers and TaqMan probes were designed and synthesized based on the ORF1b gene. Through optimizing the concentrations of primers and probes, annealing temperature, and evaluating the specificity, sensitivity and repeatability, a dual real-time
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.