Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (PCSK9) is a key regulator of serum cholesterol. The possibility that PCSK9 also functions in other pathways needs to be addressed. We have transfected HepG2 cells with mutant D374Y-PCSK9 or control vector. Gene expression signatures were determined using the Affymetrix GeneChip technology, and the expression pattern of selected genes was confirmed by quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR). Data was normalized and analyzed using a model-based background adjustment for oligonucleotide expression arrays, then filtered based upon e
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Striking individual differences in severity of group A streptococcal (GAS) sepsis have been noted, even among patients infected with the same bacterial strain. We had provided evidence that HLA class II allelic variation contributes significantly to differences in systemic disease severity by modulating host responses to streptococcal superantigens. Inasmuch as the bacteria produce additional virulence factors that participate in the pathogenesis of this complex disease, we sought to identify additional gene networks modulating GAS sepsis. Accordingly, we applied a systems genetics approach us
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rubinstein-Taybi syndrome (RSTS) is a rare multisystem developmental disorder with moderate to severe intellectual disability caused by heterozygous mutations of either CREBBP or EP300 genes encoding CBP/p300 chromatin regulators. We explored the gene programs and processes underlying the morphological and functional alterations shown by iPSC-derived neurons modeling RSTS to bridge the molecular changes resulting from defective CBP/p300 to cognitive impairment. By global transcriptome analysis, we compared the differentially expressed genes (DEGs) marking the transition from iPSC-derived neura
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have demonstrated the safety and efficacy of a live-attenuated glycoprotein G (gG) deletion mutant vaccine strain of ILTV (∆gG-ILTV). In the current study, transcriptional profiles of chicken tracheal organ cultures (TOCs), 24 h post inoculation with ∆gG-ILTV or the gG-expressing parent wild-type strain, CSW-1 ILTV were explored and compared with the mock-infected TOCs using RNA-seq analysis. Transcriptomes of the vaccine and wild-type ILTV were also compared with each other. Although no viral genes (except for gG) were differentially regulated between the two ILTV-infected TO
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The predictive potential of functional annotation requires that regulatory data be interpreted in the contexts of genes, expression, variants and traits. FAANGMine (https://faangmine.elsiklab.missouri.edu/) is a data warehouse that brings them into a single framework, facilitating the exploration of regulatory elements, variants, QTL, genes and gene annotations in farm animal species. It was designed to highlight reference functional annotation datasets generated by members of the Functional Annotation of Animal Genomes (FAANG) Consortium. FAANGMine was developed using the InterMine biological
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diethyl phthalate (DEP) is a known disruptor of craniofacial chondrogenesis, and dimethyl sulfoxide (DMSO) is widely used as a co-solvent. However, whether there is an interaction between DMSO and DEP in the toxicological experiments warrants further investigation. The present study investigated the transgenerational effects on females (F0) exposed to aerated water (blank), DMSO (control), and DEP dissolved in DMSO (treatment) and employed RNA-Seq to analyze transcriptional changes in the F0 ovaries and in 24-hour post-fertilization (hpf) embryos from the F1 and F2 generations. In the ovar
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Primary ovarian insufficiency (POI) is a highly heterogeneous condition characterized by the cessation of ovarian function before age 40. While genetic factors play a substantial role, the contribution of structural variants remains incompletely mapped. We conducted a systematic review and in silico genomic re-analysis of published copy number variations (CNVs) in individuals with POI. Following PRISMA guidelines, we aggregated 382 CNVs from 25 studies, standardized genomic coordinates, and filtered variants against population databases. Pathogenicity was reevaluated using ACMG/ClinGen guideli
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hypothesized toxicity and potential molecular mechanism of gastric cancer induced by exposure of two plasticizers (DBP and DEP) were studied by network toxicology. Potential relevant targets were predicted through PharmMapper, SwissTargetPrediction, GeneCards, OMIM, DrugBank, and TTD databases. 143 relevant targets were identified and a network diagram was drawn. The study utilized Gene Ontology (GO) functional annotations, Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis, protein-protein interaction (PPI) networks with cytoHubba plugin integration, ten relevant b
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate the molecular mechanisms by which melatonin (MLT) mitigates ovarian damage in mice exposed to abnormal light cycles. Female C57BL/6 mice from the same batch were randomly assigned to five experimental groups: normal light cycle (LD), reversed light cycle (DL), reversed light cycle with MLT supplementation (MDL), constant light (LL), and constant light with MLT supplementation (MLL). Models of reversed and constant light exposure were established, and exogenous MLT was administered. The results indicated that MLT significantly alleviated ovarian developmental imp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neoadjuvant chemotherapy (NAT) is increasingly used in the treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). However, the actual molecular impact of NAT on the tumor remains unknown, particularly on the cancer-associated fibroblasts (CAFs) remains largely unknown. Here, mass-spectrometry (MS)-based proteomic profiling of primary CAFs derived from treatment-naïve (TN) and NAT-treated resected PDAC (n = 10 in each group) was conducted to explore potential NAT-associated changes. Differentially abundant proteins (DAPs; p < 0.05) in NAT versus TN CAFs accounted for 10.6% of all 5438 proteins m
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene Ontology (GO) enrichment analysis has been widely adopted for interpretating omics data, including in ecological research. Although valuable for summarizing large gene lists into functional categories, it is often treated as the final interpretive step. In ecological omics, where functional annotations are frequently incomplete and experimental validation is often difficult, this reliance can lead to repetitive, generic conclusions that lack environmental and mechanistic specificity. Although previous literature has addressed the statistical and annotation-related limitations of GO enrich
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This review explores the hypothesis that schizophrenic symptoms may be understood not as isolated deficits, but as interconnected manifestations of a structural reorganization of consciousness. The premises of this work are grounded in a comparative matrix that suggests an underlying "consanguinity" between the philosopher's voluntary epoché-the suspension of the natural attitude performed to study the inner workings of consciousness-and the involuntary "unworlding" passively experienced in schizophrenia. By exploring this shared ontological ground, the text suggests how specific phenomenologi
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In vivo evaluation of biomaterials largely relies on histology to assess biocompatibility and foreign body responses. While effective for capturing end-stage outcomes, these methods offer limited insight into the cellular mechanisms driving tissue remodeling, hindering efforts to rationally design better biomaterials. Transcriptomics has revolutionized our understanding of gene activity driving cellular function, yet remains underutilized in biomaterial evaluation. Recent advances in high-resolution spatial transcriptomics now enable precise mapping of gene expression within tissue, offering d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder characterized by both motor and non-motor symptoms. Oxidative stress is involved in disease pathogenesis, with the consequent damage to DNA. Nowadays, phytocompounds attract much interest for their capacity to modulate some of the pathogenic mechanisms of PD. Glucosinolates (GLs) and their derivatives, isothiocyanate (ITC), obtained by GLs hydrolysis by myrosinase (MYR), showed neuroprotective properties. In this study, we evaluated the protective effects of pre- and post-treatment with the GL glucoraphanin (GRA) bioactivated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
African swine fever (ASF) is an acute infectious disease that significantly threats the global pig farming industry. At present, there is no efficient vaccine or targeted therapy for this virus, primarily because of the unclear pathogenesis of ASF virus (ASFV) infection and its interactions with host responses. Here, we established an oral infection model of ASFV in Landrace pigs and identified gene expression and metabolic changes in the pig spleen following ASFV infection using transcriptomic and metabolomic analyses. After ASFV SY-1 infection, 5556 differentially expressed genes (DEGs) were
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thin endometrium, leading cause of recurrent implantation failure and infertility, has been found to respond to exosomes.
AIM: To investigate the efficacy of exosomes in addressing the issue of thin endometrium.
METHODS: RNA sequencing and reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction were employed to identify differentially expressed microRNAs (miRNAs) in human umbilical cord mesenchymal stem cell (hucMSC) treated with exosomes enriched with endometrial cell-derived components. Additionally, Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analyses were c
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exosomes, small extracellular vesicles originating from endocytic processes, have garnered increasing attention due to their roles in both physiological functions and pathological conditions. Initially identified in the 1980 s, exosomes are formed within multivesicular bodies (MVBs) through the invagination of the endosomal membrane, leading to the creation of intraluminal vesicles (ILVs). These ILVs can either be degraded by lysosomes or released into the extracellular space as exosomes, facilitating intercellular communication. In the nervous system, exosomes are implicated in various functi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Relatively little is known about the microbial variations within the human appendix niche. To overcome this knowledge gap, we employed endoscopic retrograde appendicitis treatment (ERAT) technology to collect microbial samples from the appendix lumen, followed by shotgun metagenomic sequencing on participants with acute appendicitis without antibiotic treatment. Compared to the cecum and terminal ileum, the appendix had a higher abundance at the genus level of Sphingobium, Leptotrichia and Oribacterium, as well as a significant increase in species-level abundance of oral bacteria, including St
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To analyze the effects of platelet extracellular vesicles (PLT-EVs) on coagulation function in severe burns patients using in vitro coagulation assays, and to explore the proteins involved in coagulation reaction in PLT-EVs by proteomics technology, laying the foundation for the diagnosis and treatment of coagulation dysfunction in patients with severe burns.
METHODS: Six healthy volunteers and six patients with severe burns were selected. The coagulation function was compared by thromboelastography and conventional coagulation tests, and the differentially expressed proteins of P
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To determine candidate key proteins involved in synaptic transmission in the thalamus in tinnitus, we used bioinformatic methods by analyzing protein-protein interaction networks under different conditions of acoustic activity. The motor system was used to analyze the specificity of the response reaction in the auditory system. The databases GeneCard, STRING-, DAVID-, and Cytoscape version 3.9.1 were applied to identify the top three high-degree proteins, their high-score interaction proteins and the gene ontology-biological processes (GO-BPs) associated in the thalamus with synaptic transmiss
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования