Malaria parasites inevitably develop drug resistance to anti-malarials over time. Hence the immediacy for discovering new chemical scaffolds to include in combination malaria drug therapy. The desirable attributes of new chemotherapeutic agents currently include activity against both liver and blood stage malaria parasites. One such recently discovered compound called cladosporin abrogates parasite growth via inhibition of Plasmodium falciparum lysyl-tRNA synthetase (PfKRS), an enzyme central to protein translation. Here, we present crystal structure of ternary PfKRS-lysine-cladosporin (PfKRS-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida glabrata has emerged as an important fungal pathogen with intrinsic resistance to azole drugs. The limited efficacy of and resistance to existing antifungals is driving the need to identify new drug targets. The enzyme 6,7-dimethyl-8-(D-ribityl)lumazine synthase is part of the riboflavin-biosynthesis pathway essential to fungi and bacteria and is a potential drug target for the development of broad-spectrum antifungal drugs. The X-ray crystal structure of recombinant lumazine synthase from C. glabrata was obtained at 2.24 Å resolution and revealed a dimer of homopentamers, with one in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An important function of steroidogenic cytochromes P450 is the transformation of cholesterol to produce androgens, estrogens, and the corticosteroids. The activities of cytochrome P450c17 (CYP17) are essential in sex hormone biosynthesis, with severe developmental defects being a consequence of deficiency or mutations. The first reaction catalyzed by this multifunctional P450 is the 17α-hydroxylation of pregnenolone (PREG) to 17α-hydroxypregnenolone (17-OH PREG) and progesterone (PROG) to 17α-hydroxyprogesterone (17-OH PROG). The hydroxylated products then either are used for production of cor
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combined molecular dynamics (MD) and quantum mechanical/molecular mechanical (QM/MM) calculations were performed on the crystal structure of the reduced membrane-bound [NiFe] hydrogenase (MBH) from Ralstonia eutropha to determine the absolute configuration of the CO and the two CN(-) ligands bound to the active-site iron of the enzyme. For three models that include the CO ligand at different positions, often indistinguishable on the basis of the crystallographic data, we optimized the structures and calculated the ligand stretching frequencies. Comparison with the experimental IR data reveals
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Culture supernatants of leptospiral pathogens have long been known to haemolyse erythrocytes. This property is due, at least in part, to sphingomyelinase activity. Indeed, genome sequencing reveals that pathogenic Leptospira species are richly endowed with sphingomyelinase homologues: five genes have been annotated to encode sphingomyelinases in Leptospira interrogans. Such redundancy suggests that this class of genes is likely to benefit leptospiral pathogens in their interactions with the mammalian host. Surprisingly, sequence comparison with bacterial sphingomyelinases for which the crystal
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Snake venom disintegrins are present in a variety of species and are functionally divided into three families: RGD, MLD and R/KTS. The RGD family of disintegrins, which bind and inhibit the physiological functions of RGD-dependent integrins, constitute the largest and most investigated family. This review will be focused on characterization of two relatively new families of snake venom disintegrins, expressing in their active site MLD and R/KTS motifs. The MLD motif, present only in heterodimeric disintegrins, mediates binding of these disintegrins to α4β1, α4β7 and α9β1 integrins, whereas the
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, we employ density functional theory to assign vibrational signatures of [FeFe]-hydrogenase intermediates to molecular structures. For this purpose, we perform an exhaustive analysis of structures and harmonic vibrations of a series of CN and CO containing model clusters of the [FeFe]-hydrogenase enzyme active site considering also different charges, counterions, and solvents. The pure density functional BP86 in combination with a triple-ζ polarized basis set produce reliable molecular structures as well as harmonic vibrations. Calculated CN and CO stretching vibrations are analyz
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tyrosine aminomutase SgTAM produces (S)-ss-tyrosine from L-tyrosine in the biosynthesis of the enediyne antitumor antibiotic C-1027. This conversion is promoted by the methylideneimidazole-5-one (MIO) prosthetic group. MIO was first identified in the homologous family of ammonia lyases, which deaminate aromatic amino acids to form alpha,ss-unsaturated carboxylates. Studies of substrate specificity have been described for lyases but there have been limited reports in altering the substrate specificity of aminomutases. Furthermore, it remains unclear as to what structural properties are resp
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We performed homozygosity mapping in two recently reported pedigrees from Portugal and Mexico with an autosomal-recessive autoinflammatory syndrome characterized by joint contractures, muscle atrophy, microcytic anemia, and panniculitis-induced lipodystrophy (JMP). This revealed only one homozygous region spanning 2.4 Mb (5818 SNPs) on chromosome 6p21 shared by all three affected individuals from both families. We directly sequenced genes involved in immune response located in this critical region, excluding the HLA complex genes. We found a homozygous missense mutation c.224C>T (p.Thr75Met) i
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dihydrouridine synthases (DUSs) are flavin-dependent enzymes that catalyze site-specific reduction of uracils in tRNAs. The mechanism of DUS 2 from Saccharomyces cerevisiae was studied. Previously published turnover rates for this DUS were very low. Our studies show that the catalytic cycle consists of reductive and oxidative half-reactions. The enzyme is reduced by NADPH rapidly but has a very slow oxidative half-reaction using in vitro transcribed tRNA substrates. Using tRNA(Leu) purified from a DUS 2 knockout strain of yeast we obtained reaction rate enhancements of 600-fold over in vitro t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We identified a homozygous missense mutation in the noncatalytic subunit (RAB3GAP2) of RAB3GAP that results in abnormal splicing in a family with congenital cataracts, hypogonadism, and mild mental retardation (Martsolf syndrome). Recently, mutations in the catalytic subunit of RAB3GAP (RAB3GAP1), a key regulator of calcium-mediated hormone and neurotransmitter exocytosis, were reported in Warburg micro syndrome, a severe neurodevelopmental condition with overlapping clinical features. RAB3GAP is a heterodimeric protein that consists of a catalytic subunit and a noncatalytic subunit encoded by
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biocatalysis offers sustainable routes to complex molecules, yet translating enzymatic activity into robust, reusable materials remains a major challenge. Here, we report the modular assembly of a self-supporting biocatalytic material for stereoselective C─Si bond formation using an engineered Rhodothermus marinus cytochrome c (CC). The material was constructed by site-specific covalent coupling of CC fused with two SpyCatcher domains (SC-CC-SC) with streptavidin variants bearing SpyTag domains (STV-ST), yielding a red, porous enzyme foam with defined hexagonal architecture. The modular STV-me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metal-free nanozymes (MFNs), composed of heteroatom-doped carbon frameworks, conductive polymers, and π-conjugated networks, have emerged as versatile enzyme mimics that obviate the toxicity and instability associated with metal-based counterparts. Through the strategic incorporation of nitrogen (N), oxygen (O), sulfur (S), phosphorus (P), iodine (I), and selenium (Se) dopants, alongside the deliberate defect engineering of sp² domains and vacancy sites, these materials replicates superoxide dismutase, glutathione peroxidase, catalase, oxidase, and peroxidase activities under physiological and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The papain-like protease (PLpro) of SARS-CoV-2 is part of the multi-domain nonstructural protein 3 (NSP3) and consists of two domains: a ubi … in the Protein Data Bank show the Ubl2 domain in a highly similar, closed conformation against the catalytic domain. Here, we present a crystal structure of PLpro exhibiting Ubl2 in two distinct conformations: the well characterized closed state, where Ubl2 is positioned near the PLpro domain, and an as yet uncharacterized open state, where Ubl2 is displaced by 4 …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ABL protein-tyrosine kinase regulates intracellular signaling pathways controlling diverse cellular processes and contributes to several forms of cancer. The kinase activity of ABL is repressed by intramolecular interactions involving its regulatory Ncap, SH3 and SH2 domains. Small molecules that allosterically regulate ABL kinase activity through its non-catalytic domains may represent selective probes of ABL function. Here we report a screening assay for chemical modulators of ABL kinase activity that target the regulatory interaction of the SH3 domain with the SH2-kinase linker. This fl…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To clone and express recombinant calpain of Schistosoma japonicum (Sjcalpain), observe the distribution of Sjcalpain in S. japonicum cercariae and analyze its role in skin invasion.
METHODS: The primers were designed according to the full-length sequence of calpain (GenBank accession No. AB016726). The genes encoding catalytic domain and Ca2+ binding domain of Sjcalpain were amplified by PCR, and the target fragments were subcloned into pET-28a. The recombinant proteins were expressed in E. coli BL21 (DE3) and purified by Ni-NTA resin. The rabbit polyclonal antibodies were prepared…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In response to increasing concern over antibiotic-resistant Staphylococcus aureus, the development of novel antimicrobials has been called for, with bacteriophage endolysins having received considerable attention as alternatives to antibiotics. Most staphylococcal phage endolysins have a modular structure consisting of an N-terminal cysteine, histidine-dependent amidohydrolases/peptidase domain (CHAP), a central amidase domain, and a C-terminal cell wall binding domain (CBD). Despite extensive studies using truncated staphylococcal endolysins, the precise function of the amidase domain has not
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The substrate selectivities of an anti-phosphonate and an anti-phosphate kinetically homogeneous polyclonal catalytic antibody preparation and two hydrolytic enzymes were compared by using hapten-analogous and truncated carbonate and ester substrates each containing a 4-nitrophenolate leaving group. Syntheses of the truncated substrates devoid of recognition features in the non-leaving group parts of the substrates are reported. The relatively high kinetic selectivity of the more active anti-phosphonate antibody preparation is considered to depend on a relatively rigid catalytic site with subs
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The phosphoenolpyruvate transferase system (PTS) is the major pathway by which bacteria import hexose sugars across the plasma membrane. The PTS transfers a phosphoryl group sequentially via several components from the glycolytic intermediate phosphoenolpyruvate (PEP) to the translocated sugar. It is comprised of the two general proteins enzyme I and HPr, and a sugar-specific enzyme II complex. Sugar translocation is through the membrane domain of the enzyme II complex. The enzyme II complex can belong to one of six families based upon sequence similarity, with the sorbose transporter from Kle
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования