The nucleosome remodeling and deacetylase (NuRD) complex is essential for gene expression and cell fate determination, and missense mutations of NuRD caused neurodevelopmental diseases. However, the molecular pathogenesis of clinic NuRD variants is unknown. Here, we introduced a clinic CHD3 (L915F) variant into Caenorhabditis elegans homologue LET-418, impairing germline and vulva development and ultimately causing animal sterility. Our ATAC-seq and RNA-seq analyses revealed that this variant generated an abnormal open chromatin structure and disrupted the expression of developmental genes. Th…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin, a protein-DNA complex, is a dynamic structure that stores genetic information within the nucleus and responds to molecular/cellular changes in its structure, providing conditional access to the genetic machinery. ATP-dependent chromatin modifiers regulate access of transcription factors and RNA polymerases to DNA by either "opening" or "closing" the structure of chromatin, and its aberrant regulation leads to a variety of neurodevelopmental disorders. The chromodomain helicase DNA-binding (CHD) proteins are ATP-dependent chromatin modifiers involved in the organization of chromatin …
ОбзорСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-Methyladenosine (m6A) modification is the most prevalent RNA modification in mammals. We have recently demonstrated that inhibition of m6 … e nuclear receptors regulating the transcription of CYP2B6, were not influenced by siMETTL3/14. The chromatin immunoprecipitation and formaldehyde-assisted enrichment of regulatory elements assays revealed that H3K9me2, a repressive histone marker, was enriched in the vicinity of the upstream region of CYP2B6, and knockdown of METTL3/14 induced the condensa …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Invariant natural killer T cells (iNKT cells) differentiate into thymic and peripheral NKT1, NKT2 and NKT17 subsets. Here we use RNA-seq and ATAC-seq analyses and show iNKT subsets are similar, regardless of tissue location. Lung iNKT cell subsets possess the most distinct location-specific features, shared with other innate lymphocytes in the lung, possibly consistent with increased activation. Following antigenic stimulation, iNKT cells undergo chromatin and transcriptional changes delineating two populations: one similar to follicular helper T cells and the other NK or effector like. Phenot…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lamins and transmembrane proteins within the nuclear envelope regulate nuclear structure and chromatin organization. Nuclear envelope transmembrane protein 39 (Net39) is a muscle nuclear envelope protein whose functions in vivo have not been explored. We show that mice lacking Net39 succumb to severe myopathy and juvenile lethality, with concomitant disruption in nuclear integrity, chromatin accessibility, gene expression, and metabolism. These abnormalities resemble those of Emery-Dreifuss muscular dystrophy (EDMD), caused by mutations in A-type lamins (LMNA) and other genes, like Emerin (EMD…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is expected that the subnuclear localization of a protein in a fixed cell, detected by microscopy, reflects its position in the living cell. We demonstrate, however, that some dynamic nuclear proteins can change their localization upon fixation by either crosslinking or non-crosslinking methods. We examined the subnuclear localization of the chromatin architectural protein HMGB1, linker histone H1, and core histone H2B in cells fixed by formaldehyde, glutaraldehyde, glyoxal, ethanol, or zinc salts. We demonstrate that some dynamic, weakly binding nuclear proteins, like HMGB1 and H1, may not…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetics refers to all the changes in phenotype and gene expression which are not due to alterations in the DNA sequence. These mechanism … in response to external stimuli. In this review, we provide an overview of all the major classes of chromatin remodellers, providing examples of how their disregulation in the adult heart alters specific gene programs with subsequent development of major cardiomyopathies. Understanding the functional significance of the different epigenetic marks as points …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The constitutive androstane receptor (CAR) is a xenobiotic sensor expressed in hepatocytes that activates genes involved in drug metabolism, lipid homeostasis, and cell proliferation. Much progress has been made in understanding the mechanism of activation of human CAR by drugs and xenobiotics. However, many aspects of the activation pathway remain to be elucidated. In this report, we have used viral constructs to express human CAR, its splice variants, and mutant CAR forms in hepatocytes from Car-/- mice in vitro and in vivo. We demonstrate CAR expression rescued the ability of Car-/- hepatoc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cryopreserved human sperm are used in assisted reproductive technology. However, the effect of cryopreservation on sperm DNA integrity is unclear.
OBJECTIVES: The objectives of this study were to: (i) determine the impact of semen cryopreservation on human sperm DNA integrity and chromatin structure; (ii) test if parameters obtained from TUNEL and SCSA® correlate; and (iii) verify correlation between sperm motility, morphology and viability with TUNEL and SCSA® parameters.
MATERIALS AND METHODS: Men attending a fertility clinic were recruited and grouped according to their sperm …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Rett syndrome (RTT) is a neurodevelopmental disorder caused primarily by de novo mutations in MECP2 and sometimes in CDKL5 and FOXG … eby providing a potential diagnostic yield of 68.4%. These mutations were significantly enriched in chromatin regulators (corrected P = 0.0068) and moderately enriched in postsynaptic cell membrane molecules (corrected P = 0.076), implicating glutamate receptor signaling.
CONCLUSION: The genetic etiology of RTT without MECP2, CDKL5, and FOXG1 mutations is …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cockayne syndrome is a premature aging disease associated with numerous developmental and neurological abnormalities, and elevated levels of reactive oxygen species have been found in cells derived from Cockayne syndrome patients. The majority of Cockayne syndrome cases contain mutations in the ATP-dependent chromatin remodeler CSB; however, how CSB protects cells from oxidative stress remains largely unclear. Here, we demonstrate that oxidative stress alters the genomic occupancy of the CSB protein and increases CSB occupancy at promoters. Additionally, we found that the long-range chromatin-…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CHARGE syndrome is caused by spontaneous loss-of-function mutations to the ATP-dependant chromatin remodeller chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7 (CHD7). It is characterised by a distinct pattern of congenital anomalies, including cardiovascular malformations. Disruption to the neural crest lineage has previously been emphasised in the aetiology of this developmental disorder. We present evidence for an additional requirement for CHD7 activity in the Mesp1-expressing anterior mesoderm during heart development. Conditional ablation of Chd7 in this lineage results in major structural car…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin has been introduced as a tool for studying heavy metals action in nuclei. Chromium oxide is highly soluble and toxic with chronic exposure leading to mutagenesis and carcinogenesis. In the present study, for the first time, the binding affinity of chromium oxide to rat liver chromatin and histone proteins was investigated. Reduction of chromatin absorbencies at 210 and 260 nm (hypochromicity) and fluorescence emission intensity upon metal binding represented quenching of the metal with chromatin chromophores. Binding isotherms demonstrated a positive cooperative binding pattern revea…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Transcription Factor (TF) p63 is a master regulator of epidermal development and differentiation as evident from the remarka … in human keratinocytes less than 12,000 of these sites are bound in vivo suggesting that underlying chromatin architecture and cooperating TFs mediate p63-genome interactions.
RESULTS: We find that the chromatin architecture at p63-bound targets possess distinctive features and can be used to categorize p63 targets into proximal promoters (1%), enhancers ( …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A nonrandom radial nuclear organization of genes has been well documented. This study provides further evidence that radial positioning depends on features of corresponding ∼1 Mbp chromatin domains (CDs), which represent the basic units of higher-order chromatin organization. We performed a quantitative three-dimensional analysis of the radial nuclear organization of three genes located on chromosome 1 in a DG75 Burkitt lymphoma-derived cell line. Quantitative real-time polymerase chain reaction revealed similar transcription levels for the three selected genes, whereas the total expression st…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the Forkhead box G1 (FOXG1) gene, a brain specific transcriptional factor, are responsible for the congenital variant of Rett s … sharing a distinctive facial appearance. Although FoxG1 action depends critically on its binding to chromatin, very little is known about the dynamics of this process. Using fluorescence recovery after photobleaching, we showed that most of the GFP-FoxG1 fusion protein associates reversibly to chromatin whereas the remaining fraction is bound irreversibly. …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alcohol abuse is considered as one of the problems associated with poor semen production and sperm quality. Both acute and chronic alcohol consumption may affect spermatozoal chromatin disorders through apoptosis. Therefore, for the first time, this experimental study was performed to evaluate the effect of ethanol consumption on sperm parameters and chromatin integrity of spermatozoa aspirated from cauda epididymis of rats. Twenty adult Wistar rats were divided into ethanol consumption and control groups. Access to ethanol and water was provided ad libitum for experimental and control animals…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Artificial insemination is not as widely used in horses as in other domestic species, such as dairy cattle and pigs, partly because of the wide variation in sperm quality between stallion ejaculates and partly due to decreased fertility following the use of cooled transported spermatozoa. Furthermore, predictive tests for sperm fertilising ability are lacking. The objective of the present study was to assess sperm morphology and chromatin integrity in ejaculates obtained from 11 warmblood breeding stallions in Sweden, and to evaluate the relationship of these parameters to pregnanc…
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In Caenorhabditis elegans, numerous 'synMuv' (synthetic multivulval) genes encode for chromatin-associated proteins involved in transcriptional repression, including an orthologue of Rb and components of the NuRD histone deacetylase complex. These genes antagonize Ras signalling to prevent erroneous adoption of vulval fate. To identify new components of this mechanism, we performed a genome-wide RNA interference (RNAi) screen. After RNAi of 16 757 genes, we found nine new synMuv genes. Based on predicted functions and genetic epistasis experiments, we propose that at least four post-translatio…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin remodeling complexes play critical roles in development. Here we describe a transcription factor, CECR2, which is involved in neurulation and chromatin remodeling. CECR2 shows complex alternative splicing, but all variants contain DDT and bromodomain motifs. A mutant mouse line was generated from an embryonic stem cell line containing a genetrap within Cecr2. Reporter gene expression demonstrated Cecr2 expression to be predominantly neural in the embryo. Mice homozygous for the Cecr2 genetrap-induced mutation show a high penetrance of the neural tube defect exencephaly, the human equ…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования