INTRODUCTION: The aim of the study was the evaluation of panfungal PCR protocols with subsequent sequence analysis for the diagnostic identification of invasive mycoses in formalin-fixed, paraffin-embedded tissue samples with rare tropical mycoses.
MATERIALS AND METHODS: Five different previously described panfungal PCR/sequencing protocols targeting 18S and 28S ribosomal RNA gene fragments as well as internal transcribed spacer 1 and 2 fragments were evaluated with a collection of 17 formalin-fixed, paraffin-embedded tissue samples of patients with rare and/or tropical invasive mycoses, comp…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A best evidence topic in cardiothoracic surgery was written according to a structured protocol. The question addressed was 'Are frozen sections of mediastinoscopy samples as effective as formal paraffin assessment of mediastinoscopy samples for a decision on a same-day lobectomy?'. Five papers were found using the reported search that represented the best evidence to answer the clinical question. The authors, journal, date and country of publication, patient group studied, study type, relevant outcomes and results of these papers are tabulated. These studies compared the efficacy and accuracy …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Shared Pathology Informatics Network (SPIN) is a tissue resource initiative that utilizes clinical reports of the vast amount of paraffin-embedded tissues routinely stored by medical centers. SPIN has an informatics component (sending tissue-related queries to multiple institutions via the internet) and a service component (providing histopathologically annotated tissue specimens for medical research). This paper examines if tissue blocks, identified by localized computer searches at participating institutions, can be retrieved in adequate quantity and quality to support medical re…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association between human papillomavirus (HPV) infection and carcinogenesis has long been established in literature, with the strongest … available for association of HPV DNA and expression of P16 in benign renal tumors. Formalin-fixed, paraffin-embedded tissues from 62 renal tumors (40 clear cell, 9 papillary, and 3 chromophobe renal cell carcinomas, 1 collecting duct carcinoma, 2 urothelial carcinoma of renal pelvis and 7 oncocytomas) were immunostained with low-risk and high-risk HPV DNA …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To further assess the reliability of the Shtrasburg method for detection of amyloid A in formalin-fixed, paraffin-embedded tissues and to expand the spectrum of the amyloid proteins analyzed by this method, we studied formalin-fixed, paraffin-embedded amyloid-containing tissues obtained from patients with the following types of amyloidosis: amyloid A, light chain, transthyretin, calcitonin, beta2 microglobulin, and senile seminal vesicle. The tissue samples were deparaffinized, processed, and subjected to sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis and the Western blot technique.…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To investigate the reaction of antibodies OV 632 and MOC 31 in paraffin wax sections as opposed to frozen sections and cytological preparations; to evaluate their usefulness in the differential diagnosis of malignant mesothelioma and secondary adenocarcinoma of the pleura; and to assess the efficacy of microwave pretreatment of sections in unmasking their associated epitopes.
METHODS: Immunohistochemistry, using a standard avidin-biotin technique, with microwave pretreatment and trypsinisation in a certain proportion of cases. The material comprised 43 mesotheliomas, 44 adenocarcinomas …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One hundred and thirty seven cases of paraffin-embedded tissue specimens biopsied each from condylomata and pseudo-condylomata of vulva and vagina were examined. Type 6b 11 human papillomavirus (HPV) DNA was detected in condylomata by in situ hybridization using digoxigeninlabelled probes and polymerase chain reaction (PCR). The positive rate was 82.5%, 83.9% respectively. It was negative in the 137 cases of pseudo-condylomata by in situ hybridization, but positive in 3 cases by PCR. For a correct diagnosis, the necessity of combining the data of clinical finding, microscopic examination and i…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A study comparing in situ hybridization using nonradioactive DNA probes directly conjugated with horseradish peroxidase (HRP), and 35S-labeled antisense RNA probes for human papillomavirus (HPV) types 6/11, 16, and 18 was performed on formalin-fixed, paraffin-embedded tissue from 34 lesions of the cervix and vulva. These lesions included exophytic condylomas and intraepithelial and invasive neoplasms. HPV 6/11 was detected in two of four condylomata acuminata by both in situ techniques. HPV 16 was detected in 13 of 30 cases of intraepithelial and invasive neoplasms by both methods. Discordance…
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The avidin-biotin-peroxidase complex (ABC) immunocytochemical procedure was used to locate Rift Valley fever (RVF) virus antigen in infected Aedes albopictus C6/36 cultured cells and in serial paraffin sections of intrathoracically-injected Egyptian Culex pipiens. Fixation of the cultured cells in formaldehyde or periodate-lysine-paraformaldehyde, and fixation of whole mosquitoes with formaldehyde resulted in good preservation of morphology and excellent differential staining between uninfected and infected specimens. Two primary antibodies against RVF virus were tested on the cultured cells: …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Simulium damnosum is known to be a sibling species complex with at least 24 cytotaxonomically distinct forms in Africa. Of these, six occur in the area of West Africa covered by the World Health Organization Onchocerciasis Control Programme. They are all vectors of Onchocerca volvulus, and several are capable of migrating great distances. We report here a comparatively simple chemical method of species identification using individual adult females of pooled samples that have been collected and stored dry in glass vials. Females of two species, S. sirbanum and S. squamosum, were identified by e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paraffins are attractive as phase-change materials (PCMs) due to their high latent heat capacity and adjustable phase transition temperatures. However, the individual high-purity paraffins, especially the long-chain ones, are labor-intensive and costly to produce and capable of storing and releasing latent heat only within a limited temperature range. Herein, we demonstrate the feasibility of a high-purity paraffin wax fraction (C13-C49) obtained via the Fischer-Tropsch (FT) process as a versatile latent heat storage additive within a wide range of phase transition temperatures (8.1-98.2 °C). …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The catalytic pyrolysis of low-density polyethylene (LDPE) waste into high value hydrocarbons offers a sustainable route for circular polymer economy implementation. This study applies multivariate statistical analysis and mechanistic evaluation to compare the selectivity of H3PO4, steam, and ZnCl2 treated oat husk biochar catalysts in steering LDPE pyrolysis towards olefin rich or paraffin rich products. Gas chromatograph equipped mass spectrometer (GC-MS) data was analyzed using principal component analysis (PCA) to identify compositional clustering and catalyst specific signatures. PCA reve…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVE: Accurate detection of Mycobacterium tuberculosis (MTB) in formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues remains a significant challenge in routine pathological practice. This study aimed to evaluate the performance of the first National Medical Products Administration (NMPA)-approved quantitative polymerase chain reaction (qPCR) kit specifically optimized for FFPE tissues. We compared its efficacy with acid-fast bacilli (AFB) staining for MTB detection, while simultaneously assessing its utility for drug resistance profiling and non-tuberculous mycobacteria (NTM) id…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paraffin wax is applied to scar tissue for its proposed benefits of increasing skin pliability and relieving pain. However, limited studies have objectively assessed hypertrophic scar (HSc) response. This study examined immediate HSc changes after paraffin treatment compared with intra-individual controls. A quasi-experimental, within-subject, evaluator-blinded, pre-post design was used. Two homogeneous HSc were identified per participant: one treated with paraffin wax and one with mineral oil for 20 minutes. Normal skin also received paraffin to assess scar-specific effects. Objective measure…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Cystic echinococcosis (CE), caused by the Echinococcus granulosus larval stage, poses health problems in the world, including Ir … o time and financial constraints, a total of 74 samples were evaluated. DNA of FFPE (formalin-fixed paraffin-embedded) hydatid cyst samples was extracted, and PCR was performed using mitochondrial genes cox1 and nad1. PCR products were electrophoresed and sequenced, and sequence analysis was performed using BioEdit and BLAST software.
RESULTS: Among 295 c …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Extrapulmonary tuberculosis (TB) and non-tuberculous mycobacterial (NTM) disease remain a diagnostic challenge and conventional methods such as mycobacterial culture or molecular methods (e.g. GeneXpert) performed on formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) specimens are often unsuccessful. In this study, we assessed the diagnostic accuracy of chip hybridization from FFPE specimens in a cohort with predominantly extrapulmonary mycobacterial disease. METHODS: FFPE specimens from patients with presumed mycobacterial disease underwent chip hybridization with two different assays (MYC…
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: This study evaluated performance of pan-fungal polymerase chain reaction (PCR) for identification of fungi from histopathology-positive formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues.
METHODS: We selected FFPE tissue biopsies with histopathologically proven fungal elements and simultaneous culture requests from 2020 to 2023. DNA extraction from blocks was performed using the QIAamp DNA FFPE Kit (QIAGEN). Conventional PCR with ITS1 and ITS4 primers was conducted, followed by gel electrophoresis and sequencing using the Basic Local Alignment Search Tool. Fisher exact and Mann-Wh…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Choosing the appropriate treatment regimen for Helicobacter pylori (Hp) depends on knowing or predicting regional antibiotic resistance rates. In this study, we aimed to determine the frequency of Hp and clarithromycin (Cla) resistance rates by PCR analysis in formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) gastric biopsies of patients diagnosed with gastritis. Hp DNA and Hp Cla resistance (ClaR) were analyzed by PCR method. Diagnostic examination of gastric biopsy samples was evaluated according to the Updated Sydney System. Hp positivity was detected in 68 of 149 samples (45.6%). ClaR was detected i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue specimens are routinely used in pathological diagnosis, but their large number of artifactual mutations complicate the evaluation of companion diagnostics and analysis of next-generation sequencing data. Identification of variants with low allele frequencies is challenging because existing FFPE filtering tools label all low-frequency variants as artifacts. To address this problem, we aimed to develop DEEPOMICS FFPE, an AI model that can classify a true variant from an artifact. Paired whole exome sequencing data from fresh frozen and FFPE samples…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования