The routine diagnostic method used for clinical samples suspected of filarial infection in our laboratory is the Filaria-real time-PCR (F-RT-PCR). The drawback of this method is the need for melting temperature analysis and PCR products' electrophoresis to identify the filarial species. Therefore, the aim of this study was to design a quantitative real-time PCR (qPCR) assay using filarial-specific hydrolysis probes, targeting 18S rRNA and ITS1 genes, allowing the simultaneous diagnosis of loiasis, mansonellosis and other human filariasis without the need of electrophoresis or melting temperatu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Comparing the in vitro fitness of dengue virus (DENV) isolates is a pivotal approach to assess the contribution of DENV strains' replicative fitness to epidemiological contexts, including serotype replacements. Competition assays are the gold standard to compare the in vitro replicative fitness of viral strains. Implementing competition assays between DENV serotypes requires an experimental setup and an appropriate read-out to quantify the viral progeny of strains belonging to different serotypes.
METHODS: In the current study, we optimized an existing serotyping qRT-PCR by adapti
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The BioFire® Global Fever Panel (GFP; BioFire Diagnostics, Salt Lake City, UT) is an assay designed for detecting multiple pathogens, including dengue virus (DENV; Orthoflavivirus denguei). Although its performance has been primarily assessed using composite reference standards (CRS) or through direct comparisons with other tests, its real-world accuracy remains uncertain. The performance of the GFP in combination with real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (qRT-PCR) testing is evaluated in the present study using dengue surveillance data from 224 individuals with acute feve
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute respiratory infections are widespread in vulnerable populations of all ages and are characterized by a variety of symptoms. The underlying infection can be caused by a multitude of microorganisms, including viruses and bacteria. Early detection of respiratory infections through rapid pathogen screening is vital in averting infectious respiratory disease epidemics. This study utilized a multiplex real-time PCR system to develop a three-tube reverse transcription-PCR (RT-PCR) assay, enabling simultaneously detect nine respiratory pathogens, including: influenza A and B, adenovirus, respira
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Equine piroplasmosis (EP) is a disease of equids caused by Theileria equi and Babesia caballi, members of the order Piroplasmida, transmitted by several species of ticks. As the disease is endemic in many countries, a clinical examination or a serological test are required prior to movement of horses to prove freedom from infection and to avoid the introduction of EP with its sanitary and economic impact, especially in areas where it is absent. Currently, numerous diagnostic PCR protocols are available, some of which are recommended by the World Organisation for Animal Health (OIE). In order t
Сравнительное исследованиеСтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Laboratory diagnosis of histoplasmosis is based on various methods, including microscopy, culture, antigen, and DNA detection of Histoplasma capsulatum var. capsulatum or Histoplasma capsulatum var. duboisii. To improve sensitivity of existing real-time quantitative PCR (qPCR) assays, we developed a new RT-qPCR assay that allows amplification of whole nucleic acids of Histoplasma spp. validated on suspected cases. The limit of detection was 20 copies, and the specificity against 114 fungal isolates/species was restricted to Histoplasma spp. Whole nucleic acids of 1319 prospectively collected c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pea3 transcription factor belongs to the PEA3 subfamily within the ETS domain transcription factor superfamily, and has been largely studied in relation to its role in breast cancer metastasis. Nonetheless, Pea3 plays a role not only in breast tumor, but also in other tissues with branching morphogenesis, including kidneys, blood vasculature, bronchi and the developing nervous system. Identification of Pea3 target promoters in these systems are important for a thorough understanding of how Pea3 functions. Present study particularly focuses on the identification of novel neuronal targets of Pea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Genital tract infections are globally a major cause of morbidity in sexually active individuals. The aim of this study was to investigate the prevalence and associations of co-infections of Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Trichomonas vaginalis, Mycoplasma hominis (MH), Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum (UU) and Ureaplasma parvum (UP) in specimens collected from female (SF) and male (SM) patients.
METHODS: 1575 samples from 1575 individuals from the geographical area around Bari, Apulia region in Southern Italy, were collected and analyzed by a multiplex Real
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Efforts have been made to establish sensitive diagnostic tools for malaria screening in blood banks in order to detect malaria asymptomatic carriers. Microscopy, the malaria reference test in Brazil, is time consuming and its sensitivity depends on microscopist experience. Although molecular tools are available, some aspects need to be considered for large-scale screening: accuracy and robustness for detecting low parasitemia, affordability for application to large number of samples and flexibility to perform on individual or pooled samples.
METHODOLOGY: In this retrospective stud
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A one-tube real-time qRT-PCR assay was developed, for the detection and quantification of Eggplant mottled dwarf virus (EMDV), a pathogen affecting cultivated and ornamental plants. The amplification efficiency of the assay was 98% and the linear range of quantification was from 20 to 2×10(8) RNA transcripts. Total RNA extraction methods (three developed methods and one commercially available RNA extraction kit) were evaluated using tissues from seven different plant species and synthetic EMDV RNA transcripts of known concentration. The recovery rates of RNA and the effect of co-extracted inhi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent studies showed that serum microRNAs were aberrantly expressed in cancers, including hepatocellular carcinoma (HCC). Serum microRNA (miRNA) profiles in HCC have been filtered in our previous studies. In this research, some serum miRNAs were further validated and their clinical significances were analyzed.
METHODS: Sera from 90 HCC patients, the subjects, and 60 non-HCC normal, the controls, were used. The expression of serum microRNAs was measured using real-time reverse transcription-polymerase chain reaction. AFP, as well as other clinical materials, were summarized from t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel SYBR® green-real time polymerase chain reaction (qPCR) was developed to detect two Bartonella species, B. henselae and B. clarridgeiae, directly from blood samples. The test was used in blood samples obtained from cats living in animal shelters in Southern Brazil. Results were compared with those obtained by conventional PCR targeting Bartonella spp. Among the 47 samples analyzed, eight were positive using the conventional PCR and 12 were positive using qPCR. Importantly, the new qPCR detected the presence of both B. henselae and B. clarridgeiae in two samples. The results show that th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Group C rotavirus (GCRV), astrovirus (AstV), and adenovirus (subgenus F AdenoV) are etiologic agents of acute nonbacterial gastroenteritis, which often represents community outbreaks. For the efficient detection of GCRV, AstV, and subgenus F AdenoV in stool specimens, a multiplex real-time PCR assay was developed to detect these three viruses simultaneously, with high sensitivity and specificity. In total, 8404 clinical specimens were collected between April 2008 and March 2011 and tested for GCRV, AstV, and subgenus F AdenoV by the multiplex real-time PCR, as well as for norovirus (NoV), sapo
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus 71 and Coxsackievirus A16 are the main pathogens causing hand-foot-mouth disease. In this paper, microchip capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence combined with one-step duplex reverse transcript-polymerase chain reaction has been developed for the detection of Enterovirus 71 and Coxsackievirus A16 in throat swab specimens. The specific reverse transcription-polymerase chain reaction amplicons labeled with SYBR Orange were separated by microchip capillary electrophoresis and detected by laser induced fluorescence detector within 7 min. The intraday and interday re
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dengue fever is currently the most prevalent disease caused by mosquito-borne flaviviruses. Despite being potentially fatal, there are no specific antiviral therapies for Dengue virus (DENV) infections. Therefore, early, accurate, and rapid diagnosis plays an important role in proper patient management. In this study, we evaluated the performance of a probe-based real-time RT-PCR (rRT-PCR) assay against that of a conventional RT-PCR assay in three sample cohorts from Pakistan (n = 94) and Singapore (first cohort; n = 559, second cohort; n = 123). The Pakistan cohort also included a comparison
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dengue is one of the leading causes of morbidity in tropical and subtropical regions and infection with any of the four dengue virus serotypes (DENV1-4) result in a wide range of clinical manifestations. Given the geographic expansion of DENV1-4, assays for serotyping are needed to be able to perform surveillance and epidemiological studies. In this study, we describe the design and validation of one-step real-time serotype-specific DENV RT-PCR assays.
METHODS: The DENV1, DENV2, DENV3, and DENV4 RT-PCR assays were designed using all available whole genome DENV sequences in the NCB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND OBJECTIVES: Orthohantaviruses are negative-sense RNA viruses that persistently infect rodents and can cause severe human disease. Orthohantavirus diversity complicates comprehensive surveillance strategies and diagnostic tools. Currently, serological assays and nested PCR with degenerate primers are used for hantavirus diagnosis and rodent surveillance, but these assays have long turnaround-times. Here, a broadly reactive Orthohantavirus real-time PCR assay is presented that can be incorporated into public health and research laboratories across the Americas.
STUDY DESIGN: Star
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Animal rabies diagnosis traditionally relies on direct fluorescent antigen (DFA) test on post-mortem brain tissue, but its use is limited by infrastructure and accessibility. Saliva offers a simple, non-invasive alternative suitable for field testing. This study evaluates saliva-based rabies detection using lateral flow assay (LFA) and LN34 real-time RT-PCR, with the aim of developing practical, decentralized diagnostic tools with reliable sensitivity and specificity for resource-limited settings.
METHODS: The study included paired post-mortem animal brain and saliva samples. LF
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningitidis is an important pathogen that can cause invasive meningococcal diseases, especially with serogroups A, B, C, W and Y, which can be seen endemic or sporadic. Early diagnosis and treatment of invasive meningococcal disease is life-saving. Delay in diagnosis of meningitis infection, especially in the adolescent age group, which initially presents with atypical symptoms, can further increase the risk of morbidity and mortality. In this case report the clinical evaluation and diagnostic process of a 15-year-old female patient who admitted to the emergency department with abdo
СтатьяКлинический случайАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmaniasis is one of the most important zoonotic diseases. Recently, Leishmania (Mundinia) martiniquensis, Leishmania (Mundinia) orientalis, and Leishmania (Mundinia) chancei have been reported as new human pathogens. Trypanosomatids, apart from Leishmania spp., such as Crithidia spp., are also occasionally capable of infecting humans. Here, a one-step multiplex qPCR assay for the simultaneous identification and quantification of L. martiniquensis and L. orientalis/L. chancei and detection and quantification of trypanosomatids was developed using ITS1 as the molecular target and human RNase
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования