UNLABELLED: SXT-R391 Integrative conjugative elements (ICEs) are self-transmissible mobile genetic elements able to confer multidrug resistance and other adaptive features to bacterial hosts, including Vibrio cholerae, the causative agent of cholera. ICEs are arranged in a mosaic genetic structure composed of a conserved backbone interspersed with variable DNA clusters located in conserved hot spots. In this study, we investigated ICE acquisition and subsequent microevolution in pandemic V. cholerae. Ninety-six ICEs were retrieved from publicly available sequence databases from V. cholerae cli
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Avian infectious bronchitis virus (IBV) is endemic in poultry flocks worldwide, posing a significant threat to the global poultry industry. Frequent mixing of free-range local chickens with introduced chickens in Yunnan Province, China, facilitates the transmission, recombination, and mutation of avian IBV, thereby complicating disease prevention and control. In this study, we aimed to investigate the presence of IBV in poultry populations in Yunnan Province. Samples were collected from live poultry markets (LPMs) and breeding farms, comprising 725 randomly sampled cloacal/fecal swabs and 55 t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic manipulation of clinical Fusobacterium isolates is severely limited by strain-specific restriction-modification (RM) systems that recognize and degrade foreign DNA. This chapter describes strategies to evade RM defenses and improve transformation efficiencies across diverse Fusobacterium lineages. We employ a sequence-based "RM-silencing" method: in silico removal of nonessential regions and introduction of synonymous or GC-preserving nucleotide substitutions to disrupt RM recognition sites within coding and noncoding regions, respectively. Detailed protocols for high-molecular-weight
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we introduce a multilocus sequence typing (MLST) scheme, comprised of seven single-copy housekeeping genes, to genetically characterize Trichomonas vaginalis. Sixty-eight historical and recent isolates of T. vaginalis were sampled from the American Type Culture Collection and female patients at area health care facilities, respectively, to assess the usefulness of this typing method. Forty-three polymorphic nucleotide sites, 51 different alleles, and 60 sequence types were distinguished among the 68 isolates, revealing a diverse T. vaginalis population. Moreover, this discrimina
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The spermatogenesis locus azoospermia factor (AZF) in Yq11 has been mapped to three microdeletion intervals designated as AZFa, AZFb, and AZFc. They are caused by intrachromosomal recombination events between large homologous repetitive sequence blocks, and AZFc microdeletions are now recognised as the most frequent known genetic lesion causing male infertility. However, in the same Y-region, large genomic heterogeneities are also observed in fertile men, and only complete AZFa and AZFb deletions are associated with a specific testicular pathology. Partial AZF deletions are associated with var
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The most common inherited form of hydrocephalus, X linked hydrocephalus (HSAS), is characterised by mental retardation, adducted thumbs, and spastic paraplegia. Genetic analysis has mapped the locus for HSAS to subchromosomal band Xq28 within a region of approximately 2 megabases of DNA. In order to refine the location of the disease gene we have conducted genetic linkage analysis with Xq28 marker loci in four additional HSAS families. A lod score of 4.26 with polymorphic marker DXS52 (St14) confirms the linkage of HSAS to Xq28. Identification of a recombination event between the HSAS gene and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have analyzed the segregation of restriction fragment length polymorphisms (RFLPs) associated with 9 anonymous probes detecting loci DXS10, DXS15, DXS19, DXS37, DXS51, DXS52, DXS98, DXS99, and DXS100 and probes for HPRT and F9 in a set of 40 families segregating fragile X (fra(X]. Using two-point and multipoint analysis, we have established their relative genetic locations. The results indicate that DXS99 and DXS10, unlike previous reports, are not tightly linked to F9. A new locus was found to map within the F9 - fra(X) region. DXS98 showed 6% recombination with fra(X) and appeared to be t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The third variable (V3) loop of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) envelope glycoprotein has been intensively studied for AIDS vaccine development. Bacille Calmette-Guérin (BCG) is widely used to immunize against tuberculosis and has many advantages as a vaccine vehicle, such as low toxicity, adjuvant potential, low cost, and long-lasting immune-inducing capacity. This work was initiated to investigate the immunogenicity of recombinant BCG (rBCG-mV3) designed to express trimeric HIV-1 V3 loop (mV3) in rBCG-mV3-immunized animals.
MATERIALS AND METHODS: HIV-1 V3-concatamer
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modules consisting of antibiotic resistance genes (ARGs) flanked by inverted repeat Xer-specific recombination sites were thought to be mobile genetic elements that promote horizontal transmission. Less frequently, the presence of mobile modules in plasmids, which facilitate a pdif-mediated ARGs transfer, has been reported. Here, numerous ARGs and toxin-antitoxin genes have been found in pdif site pairs. However, the mechanisms underlying this apparent genetic mobility is currently not understood, and the studies relating to pdif-mediated ARGs transfer onto most bacterial genera are lacking. W
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To characterize the genome of an Escherichia coli harbouring both mcr-1 and mcr-3.19 on a hybrid plasmid and the underlying transmission mechanisms.
METHODS: Broth microdilution was used to perform antimicrobial susceptibility testing. Conjugation assays and S1-PFGE were used to assess the transferability of mcr genes. Resistance genotypes and genetic contexts were investigated, based on WGS data from the Illumina and MinION platforms. Inverse PCR was performed to test the mcr-3.19-bearing circular intermediate. Bioinformatic tools were used to further characterize the hybrid plas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benznidazole (BZ) is one of the two drugs for Chagas disease treatment. In a previous study we showed that the Trypanosoma cruzi ABCG-like transporter gene, named TcABCG1, is over-expressed in parasite strains naturally resistant to BZ and that the gene of TcI BZ-resistant strains exhibited several single nucleotide polymorphisms (SNPs) as compared to the gene of CL Brener BZ-susceptible strain. Here we report the sequence of TcABCG1 gene of fourteen T. cruzi strains, with diverse degrees of BZ sensitivity and belonging to different discrete typing units (DTUs) and Tcbat group. Although DTU-sp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ataxia-telangiectasia (AT) is a complex, autosomal recessive disorder characterized by cerebellar ataxia, believed to result from progressive neurodegeneration, and telangiectasia, dilation of blood vessels within the eyes and parts of the facial region. AT patients suffer from recurrent infections caused by both cellular and humoral immune deficiencies and as a population, are significantly predisposed to cancer, particularly lymphomas and leukemias. Early attempts at treating these malignancies with radiotherapy revealed another hallmark of AT, a profound hypersensitivity to the cytotoxic ef
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mycoplasma pneumoniae (MP) is a common respiratory pathogen affecting the longevity of the elderly and the health of children. However, the human vaccine against MP has not been successfully developed till now due to the poor immunogenicity and side effects of MP inactivated or attenuated vaccine. Therefore, it is necessary to develop a MP genetic engineering vaccine with influenza virus strain as vector.
METHODS: In this study, the major antigen genes P1a of MP adhesion factor P1(3862-4554 bases) and P30a of P30(49-822 bases) were inserted into the nonstructural protein (NS) gene
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the large outbreak of Ebola virus disease that occurred in Western Africa from late 2013 to early 2016, several hundred Ebola virus (EBOV) genomes have been sequenced and the virus genetic drift analyzed. In a previous report, we described an efficient reverse genetics system designed to generate recombinant EBOV based on a Makona variant isolate obtained in 2014. Using this system, we characterized the replication and fitness of 2 isolates of the Makona variant. These virus isolates are nearly identical at the genetic level, but have single amino acid differences in the VP30 and L prot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lignin is a major constituent of lignocellulose and the most abundant aromatic biopolymer on earth. It provides plants with rigidity and protection, but its recalcitrant nature also presents a significant barrier to lignocellulose valorization. The white-rot fungus Phanerochaete chrysosporium is among nature's most efficient lignin degraders, and its ligninolytic capabilities have been subjected to intensive investigations. Genome editing with precision is crucial for elucidating the in vivo mechanisms of its ligninolytic actions, but genetic manipulations of P. chrysosporium are often plagued
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rabies, a lethal viral zoonotic disease, remains a significant global public health concern. In northeastern Brazil, in particular, its epidemiology is complex and dynamic, characterized by the presence of several reservoirs associated with human rabies infection.
METHODS: This study, conducted from June 2022 to July 2023, was part of a passive epidemiological surveillance initiative under Brazil's National Rabies Surveillance Program. It investigated the presence of Rhabdovirus (RhabV) in 356 postmortem chiropteran brain samples using three diagnostic techniques for rabies and co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lateral gene transfer (LGT) among Chlamydia trachomatis strains is common, in both isolates generated in the laboratory and those examined directly from patients. In contrast, there are very few examples of recent acquisition of DNA by any Chlamydia spp. from any other species. Interspecies LGT in this system was analyzed using crosses of tetracycline (Tc)-resistant C. trachomatis L2/434 and chloramphenicol (Cam)-resistant C. muridarum VR-123. Parental C. muridarum strains were created using a plasmid-based Himar transposition system, which led to integration of the Camr marker randomly across
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malaria remains a persistent health challenge in southern Saudi Arabia, particularly along the border with Yemen. Understanding the genetic diversity and population structure of Plasmodium falciparum antigens is essential for tracking transmission dynamics and informing vaccine design. This study characterises population genetics of the Cell-Traversal Protein for Ookinetes and Sporozoites (CelTOS) gene in Jazan Province, a region of active transmission and frequent cross-border movement.
METHODS: We analysed 202 high-quality P. falciparum CelTOS coding sequences from 201 patients
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bifidobacterium plays a vital role in gut health, immunity, and metabolism, yet natural strains show limited native functional capabilities and genetic manipulability. Recent advances in genome editing, especially CRISPR-based systems, have provided novel approaches for engineering Bifidobacterium, though strain-specific variability and restriction-modification barriers remain substantial constraints. This review outlines the evolution from traditional homologous recombination to CRISPR/Cas technologies, highlighting applications of endogenous and exogenous systems, including CRISPRi/a and bas
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-obstructive azoospermia (NOA) is often associated with genetic variants. Whole-exome sequencing (WES) has emerged as a powerful tool in studying the genetic diagnosis of NOA and to help identify novel causal gene variants. Minichromosome maintenance domain-containing 2 (MCMDC2), an atypical yet conserved MCM protein, plays a key role in meiotic recombination and the maintenance of fertility. To date, only a limited number of MCMDC2 variants have been reported. The current study identified a novel deleterious variant (c.G226T/p.Val76Phe) of MCMDC2 by WES in a patient with NOA from a consang
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.