Sterol 14α-Demethylase Cytochrome P450 (CYP51) protein involved in ergosterol biosynthesis pathways turn out to be a crucial target for the fungicidal compound. However, the recognition mechanism and dynamic behavior of CYP51 in wheat leaf rust pathogen, Puccinia triticina, is still obscure. Previously, a mutation at position 134 (Y134F) was reported in five European isolates of P. triticina, conversely, structural basis of this mutation remains unclear. To address this problem, three-dimensional structure of CYP51 protein from P. triticina was successfully built using homology modeling approa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As precision medicine becomes an integral part of clinical practice, medical curricula would benefit from the inclusion of accessible training in bioinformatics and computational biology. This project provides a scalable, stepwise pedagogical framework for introducing medical students to the drug discovery pipeline using high-impact, small-scale computational projects. Each research project involves using online genomic databases to identify and characterize genes of importance to pathogenesis using Plasmodium falciparum as a model organism. The methodology changes from sequence to structure a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interferons (IFNs) play a critical role as a first line of defence against viral infection. Activation of the Janus kinase/signal transducer and activation of transcription (JAK/STAT) pathway by IFNs leads to the production of IFN stimulated genes (ISGs) that block viral replication. The Parapoxvirus, Orf virus (ORFV) induces acute pustular skin lesions of sheep and goats and is transmissible to man. The virus replicates in keratinocytes that are the immune sentinels of skin. We investigated whether or not ORFV could block the expression of ISGs. The human gene GBP1 is stimulated exclusively b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iroquois Homeobox 4 (IRX4) belongs to a family of homeobox TFs having roles in embryogenesis, cell specification, and organ development. Recently, large scale genome-wide association studies and epigenetic studies have highlighted the role of IRX4 and its associated variants in prostate cancer. No studies have investigated and characterized the structural aspect of the IRX4 homeodomain and its potential to bind to DNA. The current study uses sequence analysis, homology modeling, and molecular dynamics simulations to explore IRX4 homeodomain-DNA recognition mechanisms and the role of somatic mu
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed at constructing a draft genome of the adult female worm Toxocara canis using next-generation sequencing (NGS) and de novo assembly, as well as to find new genes after annotation using functional genomics tools. Using an NGS machine, we produced DNA read data of T. canis. The de novo assembly of the read data was performed using SOAPdenovo. RNA read data were assembled using Trinity. Structural annotation, homology search, functional annotation, classification of protein domains, and KEGG pathway analysis were carried out. Besides them, recently developed tools such as MAKER, P
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An elevated level of homocysteine, a thiol-containing amino acid is associated with a wide spectrum of disease conditions. A majority (>80 %) of the circulating homocysteine exist in protein-bound form. Homocysteine can bind to free cysteine residues in the protein or could cleave accessible cysteine disulfide bonds via thiol disulfide exchange reaction. Binding of homocysteine to proteins could potentially alter the structure and/or function of the protein. To date only 21 proteins have been experimentally shown to bind homocysteine. In this study we attempted to identify other proteins that
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Apoptosis is regulated by interaction of viral and cellular BCL-2 family antiapoptotic proteins with various pro-apoptotic proteins, several of which are also members of the BCL-2 family. Cellular protein BNIP3 is a BCL-2 family proapoptotic protein that interacts with viral antiapoptosis proteins such as adenoviruses E1B-19K and EBV-BHRF1 and cellular antiapoptosis proteins such as BCL-2 and BCL-xL. Database searches indicate that the human genome encodes an open reading frame for a protein, BNIP3alpha, that shares substantial homology with BNIP3. The BNIP3alpha open reading frame encodes a p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cloned phoE genes from Enterobacter cloacae and Klebsiella pneumoniae are normally expressed and regulated in Escherichia coli K-12, and their products are correctly assembled into the outer membrane. Differences between the three PhoE proteins were found with binding of two out of ten monoclonal antibodies directed against the cell-surface-exposed part and in pore characteristics, but not in phage receptor function. The DNA sequences of the E. cloacae and K. pneumoniae phoE genes were determined and used to predict the primary structures of the encoded proteins. In the upstream non-coding
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The formation of the nacre pearl in marine invertebrates represents an on-demand production of mineralization in response to an irritant or parasite threat to the mantle organ. In the Japanese pearl oyster (Pinctada fucata), this process is mediated by a 12-member protein family known as PFMG (Pinctada fucata mantle gene). One of these proteins, PFGM1, has been implicated in modulating calcium carbonate crystal growth and has been reported to possess an EF-hand-like domain. In this report, we establish that the recombinant PFMG1 (rPFMG1) is an intrinsically disordered "imitator" EF-hand protei
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The PIII class of the snake venom metalloproteinases (SVMPS) are acknowledged to be one of the major hemorrhage producing toxins in crotalid venoms. This class of SVMPS are structurally distinguished by the presence of disintegrin-like and cysteine-rich domains carboxy to the metalloproteinase domain and thus share structural homology with many of the ADAMs proteins. It has been suggested that the presence of the carboxy domain are the key structural determinants for potent hemorrhagic activity in that they may serve to target the proteinases to specific key extracellular matrix and cell surfa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enhancer of zeste homolog 2 (EZH2), the catalytic subunit of the Polycomb Repressive Complex 2 (PRC2), plays a pivotal role in epigenetic regulation by catalyzing the trimethylation of histone H3 at lysine 27 (H3K27me3), leading to transcriptional repression of target genes. Dysregulation of EZH2 has been implicated in various cancers, including lymphomas, prostate, and breast cancers, by promoting oncogenic transformation and tumor progression. Targeting EZH2 has been regarded as a promising strategy for cancer therapy. Over the past decade, significant progress has been made in the developme
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transfusion and apheresis science : official journal of the World Apheresis Association : official journal of the European Society for Haemapheresis2007eng
Human chorionic gonadotropin bears structural homology to pituitary thyrotropin. The extremely elevated levels of human chorionic gonadotropin in patients with molar pregnancy or other trophoblastic diseases can lead to hyperthyroidism. We describe a patient with molar pregnancy who had secondary hyperthyroidism prepared rapidly by plasmapheresis for surgery. The clinical picture improved dramatically after the first plasmapheresis. Three subsequent plasmapheresis provided a 75.1% decrease in serum free T3 concentrations and 63.9% free T4 concentrations and recovery after evacuation. This is t
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: The ATP-binding cassette subfamily A member 3 (ABCA3) protein plays a vital role in surfactant homeostasis. Mutations in the ABCA3 gene lead to the development of interstitial lung disease. In the most severe manifestation, mutations can lead to a fatal respiratory distress syndrome in neonates. ABCA3 belongs to the same ATP-binding cassette transporter superfamily as the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR), the gene that causes cystic fibrosis.
OBJECTIVE: To classify ABCA3 mutations in a manner similar to CFTR mutations in order to take advantage of recent
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 70 kDa heat shock proteins (Hsp70s) are highly conserved in evolution, leading to striking similarities in structure and composition between eukaryotic Hsp70s and their homologs in prokaryotes. The eukaryotic Hsp70 like the DnaK (Escherichia coli equivalent Hsp70) protein, consist of three functionally distinct domains: an N-terminal 44-kDa ATPase portion, an 18-kDa peptide-binding domain and a C-terminal 10-kDa fragment. Previously, the amino acid sequence of eukaryotic (the brine shrimp Artemia franciscana) Hsp70 and DnaK proteins were shown to share a high degree of homology, particular
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify the Moraxella bovis cytotoxin gene.
PROCEDURE: Hemolytic and nonhemolytic strains of M. bovis were compared by use of western blotting to identify proteins unique to hemolytic strains. Oligonucleotide primers, designed on the basis of amino acid sequences of 2 tryptic peptides derived from 1 such protein and conserved regions of the C and B genes from members of the repeats in the structural toxin (RTX) family of bacterial toxins, were used to amplify cytotoxin-specific genes from M. bovis genomic DNA. Recombinant proteins were expressed, and antisera against these prot
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to propose a reliable model for Brucella porin topology, several structure prediction methods were evaluated in their ability to predict porin topology. Four porins of known structure were selected as test-cases and their secondary structure delineated. The specificity and sensitivity of 11 methods were separately evaluated. Our critical assessment shows that some secondary structure prediction methods (PHD, Dsc, Sopma) originally designed to predict globular protein structure are useful on porin topology prediction. The overall best prediction is obtained by combining these three "ge
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ebola virus (EBOV) is a filamentous, enveloped, non-segmented, negative-strand ribonucleic acid (RNA) virus which belongs to family Filoviridae. Ebola virus includes different glycoproteins each of which plays their roles in different aspects of viral life cycle. In this study secreted glycoprotein (Q7T9E0) of Ebola virus was acquired from Uniprot. The formation of alpha helix and beta sheets of secondary structures were predicted through online servers. Higher flexibility and disordered regions of proteins were determined through RONN, GLOBPLOT and DISSEMBLE. Three dimensional (3D) structure
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ACAD9 (acyl-CoA dehydrogenase 9) is an essential factor for the mitochondrial respiratory chain complex I assembly. ACAD9, a member of acyl-CoA dehydrogenase family, has high homology with VLCAD (very long-chain acyl-CoA dehydrogenase) and harbors a homodimer structure. Recently, patients with ACAD9 deficiency have been described with a wide clinical spectrum ranging from severe lethal form to moderate form with exercise intolerance.We report here a prenatal presentation with intrauterine growth retardation and cardiomegaly, with a fatal outcome shortly after birth. Compound heterozygous mutat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PIII snake venom metalloproteases (SVMPs) are metalloproteases structurally related to ADAMs (a disintegrin and metalloprotease human family of proteins). Berythractivase and jararhagin are PIII SVMPs with 69% homology that have different hemostatic properties. In order to clarify these differences and further characterize the biological effects of these proteins, we have analyzed the effect of both proteases on human umbilical-vein endothelial cell functions. We found that both proteins enhanced nitric oxide generation, prostacyclin production and interleukin-8 release. Berythractivase but no
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Feline infectious peritonitis (FIP) is difficult to diagnose in clinical practice and has a high mortality rate, which underscores the need for reliable and standardized diagnostic tools. The nucleocapsid (N) protein, a major viral structural component, is a preferred target for serological and pathological assays because it is highly abundant in infected cells and has strong immunogenicity. RESULTS: In this study, a monoclonal antibody, designated mAb 4F3, was generated by immunizing mice with purified recombinant FIPV N protein fused with a His tag (His-N) and screening hybridoma
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования