Nicotinamide adenine dinucleotide-dependent formate dehydrogenase from Candida boidinii was immobilized in a 1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine/cholesterol floating lipid bilayer on the gold surface as a biocatalyst for electrochemical CO2 reduction. We report that, in contrast to common belief, the enzyme can catalyze the electrochemical reduction of CO2 to formate without the cofactor protonated nicotinamide adenine dinucleotide. The electrochemical data indicate that the enzyme-catalyzed reduction of CO2 is diffusion-controlled and is a reversible reaction. The orientation and conf
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemical modifications of RNA have key roles in many biological processes1-3. N7-methylguanosine (m7G) is required for integrity and stability of a large subset of tRNAs4-7. The methyltransferase 1-WD repeat-containing protein 4 (METTL1-WDR4) complex is the methyltransferase that modifies G46 in the variable loop of certain tRNAs, and its dysregulation drives tumorigenesis in numerous cancer types8-14. Mutations in WDR4 cause human developmental phenotypes including microcephaly15-17. How METTL1-WDR4 modifies tRNA substrates and is regulated remains elusive18. Here we show, through structural
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serine hydroxymethyltransferase (SHMT) is a pyridoxal phosphate (PLP)-dependent enzyme that catalyzes the reversible conversion of serine and tetrahydrofolate (THF) to glycine and 5,10-methylene THF. SHMT is a folate pathway enzyme and is therefore of considerable medical interest due to its role as an important intervention point for antimalarial, anticancer, and antibacterial treatments. Despite considerable experimental effort, the precise reaction mechanism of SHMT remains unclear. In this study, we explore the mechanism of SHMT to determine the roles of active site residues and the nature
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A highly sensitive electrochemical biosensor based on the synthetized L-Cysteine-Ag(I) coordination polymer (L-Cys-Ag(I) CP), which looks like a protein-mimicking nanowire, was constructed to detect acetylcholinesterase (AChE) activity and screen its inhibitors. This sensing strategy involves the reaction of acetylcholine chloride (ACh) with acetylcholinesterase (AChE) to form choline that is in turn catalytically oxidized by choline oxidase (ChOx) to produce hydrogen peroxide (H2O2), thus L-Cys-Ag(I) CP possesses the electro-catalytic property to H2O2 reduction. Herein, the protein-mimicking
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adaptive immunity is shaped by a selection of peptides presented on major histocompatibility complex class I (MHC I) molecules. The chaperones Tapasin (Tsn) and TAP-binding protein-related (TAPBPR) facilitate MHC I peptide loading and high-affinity epitope selection. Despite the pivotal role of Tsn and TAPBPR in controlling the hierarchical immune response, their catalytic mechanism remains unknown. Here, we present the x-ray structure of the TAPBPR-MHC I complex, which delineates the central step of catalysis. TAPBPR functions as peptide selector by remodeling the MHC I α2-1-helix region, sta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 1,125-bp mabB gene encoding 5-aminosalicylate (5ASA) 1,2-dioxygenase, a nonheme iron dioxygenase in the bicupin family that catalyzes the cleavage of the 5ASA aromatic ring to form cis-4-amino-6-carboxy-2-oxohexa-3,5-dienoate in the biodegradation of 3-aminobenzoate, was cloned from Comamonas sp. strain QT12 and characterized. The deduced amino acid sequence of the enzyme has low sequence identity with that of other reported ring-cleaving dioxygenases. MabB was heterologously expressed in Escherichia coli cells and purified as a His-tagged enzyme. The optimum pH and temperature for MabB ar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Streptomyces coelicolor CR1 (ScCR1) has been shown to be a promising biocatalyst for the synthesis of an atorvastatin precursor, ethyl-(S)-4-chloro-3-hydroxybutyrate [(S)-CHBE]. However, limitations of ScCR1 observed for practical application include low activity and poor stability. In this work, protein engineering was employed to improve the catalytic efficiency and stability of ScCR1. First, the crystal structure of ScCR1 complexed with NADH and cosubstrate 2-propanol was solved, and the specific activity of ScCR1 was increased from 38.8 U/mg to 168 U/mg (ScCR1I158V/P168S) by structure-guid
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acinetobacter baumannii, which is emerging as a multidrug-resistant nosocomial pathogen, causes a number of diseases, including pneumonia, bacteremia, meningitis, and skin infections. With ATP hydrolysis, the D-alanine-D-alanine ligase (DDL) catalyzes the synthesis of D-alanyl-D-alanine, which is an essential component of bacterial peptidoglycan. In this study, we determined the crystal structure of DDL from A. baumannii (AbDDL) at a resolution of 2.2 Å. The asymmetric unit contained six protomers of AbDDL. Five protomers had a closed conformation in the central domain, while one protomer had
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Getting access to authentic human drug metabolites is an important issue during the drug discovery and development process. Employing recombinant microorganisms as whole-cell biocatalysts constitutes an elegant alternative to organic synthesis to produce these compounds. The present work aimed for the generation of an efficient whole-cell catalyst based on the flavin monooxygenase isoform 2 (FMO2), which is part of the human phase I metabolism.
RESULTS: We show for the first time the functional expression of human FMO2 in E. coli. Truncations of the C-terminal membrane anchor regi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein kinase inhibitors are an important class of therapeutics. In addition, selective kinase inhibitors can often reveal unexpected biological insights, augmenting genetic approaches and playing a decisive role in preclinical target validation studies. Nevertheless, developing protein kinase inhibitors with sufficient selectivity and pharmacodynamic potency presents significant challenges. Targeting noncatalytic cysteines with covalent inhibitors is a powerful approach to address both challenges simultaneously. Here, we describe our efforts to design irreversible and reversible electrophili
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Catalytic reactions of enzyme labels in enzyme-linked immunosorbent assays require a long incubation period to obtain high signal amplification. We present herein a simple immunosensing scheme in which the incubation period is minimized without a large increase in the detection limit. This scheme is based on electrochemical-enzymatic (EN) redox cycling using glucose oxidase (GOx) as an enzyme label, Ru(NH3)6(3+) as a redox mediator, and glucose as an enzyme substrate. Fast electron mediation of Ru(NH3)6(3+) between the electrode and the GOx label attached to the electrode allows high signal am
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An iterative combinatorial mutagenesis (ICM) strategy was used to engineer deacetoxycephalosporin C synthase of Streptomyces clavuligerus (scDAOCS) for improved activity toward penicillin G. Seven mutational sites were repeatedly combined onto a starter mutant (C155Y Y184H V275I C281Y) of scDAOCS. Eleven improved combinatorial mutants were identified from 24 mutants in four rounds of ICM.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thioredoxin glutathione reductase from Schistosoma mansoni (SmTGR) catalyzes the reduction of both thioredoxin and glutathione disulfides (GSSG), thus playing a crucial role in maintaining redox homeostasis in the parasite. In line with this role, previous studies have demonstrated that SmTGR is a promising drug target for schistosomiasis. To aid in the development of efficacious drugs that target SmTGR, it is essential to understand the catalytic mechanism of SmTGR. SmTGR is a dimeric flavoprotein in the glutathione reductase family and has a head-to-tail arrangement of its monomers; each sub
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
(S)-selective ω-transaminases (S-ωTAs) are PLP-dependent enzymes widely employed in biocatalysis for the stereoselective amination of prochiral ketones, yielding enantiopure (S)-amines. Although their stereochemical preference is well established, the structural basis of keto-acceptor recognition and active-site flexibility remains poorly understood. Here, we present a 1.96 Å crystal structure of a marine S-ωTA OM-S25 in complex with PLP and pyruvate (PYR). The enzyme exhibits four protomer in one asymmetric unit, yet electron density reveals pronounced conformational heterogeneity in PYR bind…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Inflammatory bowel disease (IBD) is a prevalent inflammatory disorder, and the abnormal expression of nitric oxide (NO) produced by biocatalysis of iNOS enzyme in mitochondria is directly associated with the occurrence and progression of IBD. Activatable fluorescent probes offer promising tools for early diagnosis of IBD, however, inadequate biodistribution and limited targeting properties of these probes in vivo severely impede accurate diagnosis of IBD and real-time evaluation of inflammatory levels in situ. Therefore, it is necessary to design a highly efficient fluorescent prob…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The crude anthocyanin extract isolated from cranberry (Vaccinium macrocarpon Aiton) was enzymatically acylated with fatty acids of varying chain lengths using Novozyme 435 (Candida antarctica lipase B immobilized on acrylic resin). After optimization, the highest acylation rates of 65.72% and 70.64% for cyanidin-3-O-galactoside and peonidin-3-O-galactoside, respectively, were obtained by acylating with octanoic acid under the conditions of lipase dosage of 10 mg/mL, molar ratio of 1:418, at 50 °C for 30 h in 2-methyl-2-butanol. Acylated anthocyanins with high purity (>97%) were obtained throug
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA interference (RNAi) pathway regulates gene expression and viral defense and has been harnessed in therapeutic solutions to inhibit otherwise undruggable proteins by preventing translation. Dicer initiates RNAi by generating cleaved RNA products that bind to a target mRNA to promote gene silencing. Mutations to the Dicer catalytic domain cause DICER1 syndrome, which increases the risk of cancers, including early childhood variants. However, the catalytic mechanism remains poorly defined due to the lack of structural data for Dicer bound to a substrate (or substrate mimic) in the presenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study systematically compared the enzymatic hydrolysis of corn starch granules by porcine pancreas α-amylase (PA, endo-acting), maltogenic α-amylase (MA, multifunctional), glucan 1,4-α-maltotriohydrolase (AMTS, multifunctional), and amyloglucosidase (AMG, exo-acting). Multiscale structural analysis revealed that enzymatic hydrolysis produced distinct pore-cavity structures, ranging from large cavities (PA, MA) to increased pore number with moderate cavity (AMTS) and minimal cavity formation (AMG), following a consistent "inside-out" pattern of initial amorphous region hydrolysis followed
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N-3 Polyunsaturated fatty acids (PUFAs) in acylglycerol form offer physiological functions and high bioavailability, attracting industrial interest. This study evaluated six carriers for immobilizing free Candida cylindraceav lipase AY "Amano" 400SD and Candida antarctica lipase A (CAL-A) to prepare n-3 PUFA-rich acylglycerols via a two-step enzymatic hydrolysis. Macroporous resin NKA-9 showed optimal immobilization performance, with the adsorption protein loading of 129.23 mg/g (AY "Amano" 400SD) and 107.33 mg/g (CAL-A). The optimized process was applied to fish oil, algae oil, and tuna oil w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lipase B from Candida antarctica immobilized on octyl (via interfacial activation) and octyl-vinyl sulfone (covalently attached) agarose beads via different immobilization protocols was submitted to amination and/or glutaraldehyde modifications. The catalytic performance of the resulting biocatalysts significantly varied across different substrates: using octyl-CALB with the double modification, activity increased 3.5 fold versus triacetin and decreased by 5 % using R-methyl mandelate, while using the covalent biocatalyst, activity increase by 2.2 or 20 %, respectively. Similarly, the stabilit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования