OBJECTIVE AND METHODS: We report a girl presenting with a polymalformation syndrome. Despite a normal karyotype on peripheral lymphocytes and the unavailability of cultured fibroblasts, a tetrasomy 12p was identified on pulmonary DNA extracted from a postmortem biopsy, by use of comparative genomic hybridization (CGH) and confirmed by CGH array. The clinical picture of our patient was consistent, but not specific of the diagnosis of Pallister-Killian syndrome. She presented with the association of antenatal polyhydramnios, craniofacial dysmorphic features, skeletal abnormalities, and a congeni…
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Although the reference human genome sequence was declared finished in 2003, some regions of the genome remain incomplete due to their complex architecture. One such region, 1q21.1-q21.2, is of increasing interest due to its relevance to human disease and evolution. Elucidation of the exact variants behind these associations has been hampered by the repetitive nature of the region and its incomplete assembly. This region also contains 238 of the 270 human DUF1220 protein domains, which are implicated in human brain evolution and neurodevelopment. Additionally, examinations of this p
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Polyploidization is one of the major evolutionary forces in grasses (Poaceae), yet the genomic relationships between polyploid species across different continents remain poorly understood. Here, we aim to determine whether phylogenetically distinct South American allohexaploid fescues, Festuca ulochaeta Steud. (subg. Subulatae) and F. fimbriata Ness. (subg. Mallopetalon) retain a shared ancestral (pivotal) genome with the broad-leaved Eurasian fescues of subg. Schedonorus.
METHODS: We used comparative cytogenetics (genomic in situ hybridization) coupled with flow cytometr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metaphase karyotype analysis of fetal cells obtained by amniocentesis or chorionic villus sampling is the current standard for prenatal cytogenetic diagnosis, particularly for the detection of trisomy 21. We previously demonstrated that large quantities of cell-free fetal DNA (cffDNA) are easily extracted from amniotic fluid (AF). In this study, we explored potential clinical applications of AF cffDNA by testing its ability to hybridize to DNA microarrays for comparative genomic hybridization (CGH) analysis. cffDNA isolated from 11 male fetuses showed significantly increased hybridization sign…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Potocki-Shaffer syndrome (PSS) is a contiguous gene deletion syndrome that results from haploinsufficiency of at least two genes within the … ed individuals, fluorescence in situ hybridization (FISH), microsatellite analyses, and array-based comparative genomic hybridization (array CGH). We then compared the deletion sizes and clinical features between affected individuals. The full spectrum of PSS manifests when deletions are at least 2.1 Mb in size, spanning from D11S1393 to D11S1385/D11S1319 (44.6-46.7 Mb from the 11 …
Клинический случайСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atypical enteropathogenic Escherichia coli (aEPEC) are one of the most frequent intestinal E. coli pathotypes isolated from diarrheal patients in Brazil. Isolates of aEPEC contain the locus of enterocyte effacement, but lack the genes of the bundle-forming pilus of typical EPEC, and the Shiga toxin of enterohemorrhagic E. coli (EHEC). The objective of this study was to evaluate the phylogeny and the gene content of Brazilian aEPEC genomes compared to a global aEPEC collection.
METHODOLOGY: Single nucleotide polymorphism (SNP)-based phylogenomic analysis was used to compare 106 seq
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Genetic instability plays an important role in ovarian carcinogenesis. We investigated the level of telomere shortening and genomic … rols were laser capture microdissected from formalin-fixed, paraffin-embedded sections, analyzed by comparative genomic hybridization (array CGH) and for telomere length (using quantitative real-time PCR based on the Cawthon's method). TOD and STICs were defined by morphologic scores and immunohistochemical expressions of p53, Ki67, and γH2AX.
RESULTS: TOD showed marked telomere …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The virulence determinants of uropathogenic Escherichia coli have been studied extensively over the years, but relatively little is known about what differentiates isolates causing various types of urinary tract infections. In this study, we compared the genomic profiles of 45 strains from a range of different clinical backgrounds, i.e., urosepsis, pyelonephritis, cystitis, and asymptomatic bacteriuria (ABU), using comparative genomic hybridization analysis. A microarray based on 31 complete E. coli sequences was used. It emerged that there is little correlation between the genotypes of the st…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: 22q11.2 deletion syndrome (22q11.2DS) is a microdeletion syndrome exhibiting significant clinical phenotype variability. This study aimed to investigate the clinical features, immune profiles, and cognitive abilities of 22q11.2DS patients receiving treatment at MacKay Memorial Hospital in Taipei, Taiwan. Methods: This is a cross-sectional analysis between January 2001 and December 2022. We recruited 27 patients with 22q11.2DS using fluorescence in situ hybridization (FISH), multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) and array comparative genomic hybridization (aCGH). O…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trisomies of 12q23q24 have been described rarely in literature. Only a few case-reports have been published so far almost exclusively reporting on neonates or young infants. We present a 16-year-old patient with a trisomy of 12q23.3q24.3. Full phenotypic evaluation at this age comprised: severe growth retardation, developmental delay, intellectual disability and characteristic facial dysmorphisms. Initially, in the proband an insertion was cytogenetically mapped at chromosome 16: der(16)dir ins(16; 12)(q12.1; q24.11q24.31). The mother appeared carrier of a balanced insertion. Subsequent SNP-ar
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing use of molecular tools in genetic diagnosis has produced a surge in the detection of genomic imbalances. Among the growing number of newly discovered chromosome alterations are the interstitial deletions 14q21-q23. In previous reports of this deletion, the patients appear to share ocular defects, pituitary alterations and hand/foot anomalies. Here, we present a 12-year-old girl with dysmorphic face, choanal atresia, gastroesophageal reflux, and moderate developmental delay, in whom an interstitial deletion 14q22.3-q23.2 was detected using a 180k array comparative genome hybridiz
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interstitial deletions of the long arm of chromosome 6 represent a rare genomic disorder. Variable phenotypes has been reported in patients … syndrome have been lacking until recently, when patients can be characterized with microarray-based comparative genomic hybridization. Description of additional patients with interstitial 6q deletions will help to delineate candidate genes associated with particular phenotypes.
Клинический случайСтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pierre Robin sequence (PRS) can occur as a component of campomelic dysplasia (CD) and acampomelic CD (ACD) caused by dysfunction or dysregulation of SOX9, although it can also take place as an isolated form. Recently, genomic alterations in the far upstream and the far downstream region of SOX9 have been identified in patients with isolated PRS. Here, we report on a male patient with PRS and a heterozygous genomic rearrangement in the 5' region of SOX9. Clinical analysis revealed PRS-compatible craniofacial anomalies, mild hypoplasia of the left scapula, and normal male external genitalia. Mol
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus neoformans is a haploid environmental organism and the major cause of fungal meningoencephalitis in AIDS patients. Fluconazole (FLC), a triazole, is widely used for the maintenance therapy of cryptococcosis. Heteroresistance to FLC, an adaptive mode of azole resistance, was associated with FLC therapy failure cases but the mechanism underlying the resistance was unknown. We used comparative genome hybridization and quantitative real-time PCR in order to show that C. neoformans adapts to high concentrations of FLC by duplication of multiple chromosomes. Formation of disomic chromos
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Deletions of chromosome 19 have rarely been reported, with the exception of some patients with deletion 19q13.2 and Blackfan-Diamond syndrome due to haploinsufficiency of the RPS19 gene. Such a paucity of patients might be due to the difficulty in detecting a small rearrangement on this chromosome that lacks a distinct banding pattern. Array comparative genomic hybridisation (CGH) has become a powerful tool for the detection of microdeletions and microduplications at high resolution in patients with syndromic mental retardation.
METHODS AND RESULTS: Using array CGH, this study ide
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytogenetics has determined the incidence and prognostic significance of chromosomal abnormalities in acute lymphoblastic leukaemia (ALL). The development of fluorescence in situ hybridization (FISH) and array technologies has led to the discovery of novel aberrations. Five 'hot topics' are presented in which cytogenetics and related techniques have been instrumental in understanding the role of genetics in leukaemogenesis: (i) genetic changes are integral to the biology of T-cell ALL; (ii) intrachromosomal amplification of chromosome 21 is a new recurrent abnormality in precursor-B ALL (BCP-A
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunohistochemistry and recent molecular technologies progressively guided access to personalized anti-tumoral therapies. We explored the feasibility, efficacy, and the impact of molecular profiling in patients with advanced brain tumors. This multicentric prospective trial ProfiLER enrolled patients with primary brain tumors, who have been pre-treated with at least one line of anti-cancer treatment, and for whom molecular profiles had been achieved using next-generation sequencing and/or comparative genomic hybridization on fresh or archived samples from tumor, relapse, or biopsies. A molecu…
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 65 patients, who had unexplained ocular developmental anomalies (ODAs) with at least one other birth defect and/or intellectual disability, we performed oligonucleotide comparative genome hybridisation-based microarray analysis (array-CGH; 105A or 180K, Agilent Technologies). In four patients, array-CGH identified clinically relevant deletions encompassing a gene known to be involved in ocular development (FOXC1 or OTX2). In four other patients, we found three pathogenic deletions not classically associated with abnormal ocular morphogenesis, namely, del(17)(p13.3p13.3), del(10)(p14p15.3),
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Type A1 Clostridium botulinum strains are a group of Gram-positive, spore-forming anaerobic bacteria that produce a genetically, … he region encoding the heavy chain between Allergan strain and ATCC 3502 and UMASS strains. Second, comparative genomic hybridization (CGH) demonstrated that the UMASS strain and a strain expected to be derived from ATCC 3502 in the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) laboratory (ATCC 3502*) differed in gene content compared to the ATCC 3502 genome sequence published …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Populations of the food- and waterborne pathogen Escherichia coli O157:H7 are comprised of two major lineages. Recent studies have shown that specific genotypes within these lineages differ substantially in the frequencies with which they are associated with human clinical disease. While the nucleotide sequences of the genomes of lineage I strains E. coli O157 Sakai and EDL9333 have been determined, much less is known about the genomes of lineage II strains. In this study, suppression subtractive hybridization (SSH) was used to identify genomic features that define lineage II populations. Thre
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.