In this work, we have examined the amide-I characteristics of three β-peptide oligomers in typical helical conformations (two in 14-helix and one in 12/10-helix), solvated in water, methanol, and chloroform, respectively. Local-mode frequencies and their distributions were computed using a molecular-mechanics force field based frequency map that was constructed on the basis of molecular dynamics simulations. The local-mode frequencies were found to be determined primarily by peptide backbone and side chain, rather by solvent, suggesting their local structural sensitivities. Intermode vibration
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic autoimmune disease and one of the most prevalent complex inflammatory disorders. Capparis spinosa L. (C. spinosa) is recognized for its diverse medicinal properties. Traditionally, the plant has been employed to alleviateconditions such as paralysis, gastrointestinal infections, rheumatism, diabetes, anemia, pain, and eye infections. This study aimed to investigate the potential interactions and predicted pharmacological relevance of major compounds identified in the essential oil of C. spinosa leaves using computational approaches.
METHODS:
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Despite continuous efforts of the international community to reduce the impact of malaria on developing countries, no significant progress has been made in the recent years and the discovery of new drugs is more than ever needed. Out of the many proteins involved in the metabolic activities of the Plasmodium parasite, some are promising targets to carry out rational drug discovery.
MOTIVATION: Recent years have witnessed the emergence of grids, which are highly distributed computing infrastructures particularly well fitted for embarrassingly parallel computations like docking. In
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sulfonamides are a classic group of chemotherapeutic drugs with a broad spectrum of pharmacological action, including anticancer activity. In this work, reversed-phase high-performance liquid chromatography and biomimetic chromatography were applied to characterize the lipophilicity of sulfonamide derivatives with proven anticancer activities against human colon cancer. Chromatographically determined lipophilicity parameters were compared with obtained logP, employing various computational approaches. Similarities and dissimilarities between experimental and computational logP were studied usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A dearomatization-dislocation-coupling cascade rapidly transforms aromatic isocyanides into highly functionalized cyclohexadienes. The facile cascade installs an exceptional degree of molecular complexity: three carbon-carbon bonds, two quaternary stereocenters, and three orthogonal functionalities, a cyclohexadiene, a nitrile, and an isocyanide. The tolerance of arylisocyanides makes the method among the mildest dearomatizations ever reported, typically occurring within minutes at -78 °C. Experimental and computational analyses implicate an electron transfer-initiated mechanism involving an u
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The FTIR and Laser-Raman spectra of paraldehyde have been recorded in the regions 4000-400 cm(-1) and 3500-250 cm(-1) respectively. Molecular electronic energy, geometrical structure, harmonic vibrational spectra, infrared intensities and Raman scattering activities have been computed at the HF/6-31G(d,p) and B3LYP/6-31G(d,p) levels of theory. The results were compared with experimental values with the help of scaling procedures. The observed wave numbers in FTIR and Laser-Raman spectra were analyzed and assigned to different normal modes of the molecule. Most of the modes have wave numbers in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular docking is among the most widely used techniques in structure-based drug discovery and has become integral to natural-product research. Despite substantial advances in computational algorithms and artificial intelligence, the methodological quality of published docking studies on natural compounds remains highly variable, and generally accepted methodological guidelines have yet to be established. This review critically evaluates current approaches to molecular docking of natural compounds, examines the specific features of different natural-product classes and protein targets, and o
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycetoma is a neglected tropical disease characterised by chronic, granulomatous inflammation of the subcutaneous tissues, often leading to disfigurement, disability, and significant socioeconomic burdens. Caused by a diverse array of bacterial and fungal pathogens, eumycetoma is predominantly driven by Madurella mycetomatis, and current treatment strategies are limited and often ineffective. Conventional antifungal therapies, such as itraconazole, require prolonged administration, frequently combined with surgical interventions, yet cure rates remain suboptimal, and recurrence is common. The
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Моринга олифера — это богатое питательными веществами лекарственное растение, признанное его широким спектральным терапевтическим потенциалом. Однако конкретные биоактивные метаболиты и их молекулярные механизмы лечения и профилактики этих заболеваний по-прежнему недостаточно изучены. В настоящем исследовании показано, как метаболиты моринги взаимодействуют с конкретными молекулярными целями, связанными с различными заболеваниями, и изучен их потенциал как естественных терапевтических агентов в борьбе с этими заболеваниями. Как сообщалось в предыдущих исследованиях, в ходе исследования была со
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF THE REVIEW: Novel imaging approaches, such as quantitative computed tomography (CT), magnetic resonance imaging (MRI), and molecular imaging, are being applied to interstitial lung diseases to provide prognostic, functional, and molecular information. Here, we review such imaging approaches and their applicability to systemic sclerosis-associated interstitial lung disease (SSc-ILD).
RECENT FINDINGS: Quantitative CT can be used to quantify the radiographic response to SSc-ILD therapy. Due to advances in MRI sequence development, MRI can detect the presence of SSc-ILD with high accur
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It is noteworthy that a wide array of plants and nutraceuticals are effectively utilized in the treatment of various cancers, demonstrating potent effects on different cancer targets with fewer side effects. Notably, estrogen alpha has been identified as a crucial factor in breast cancer cell proliferation. Agents that can antagonize its action hold promise as potential drug leads for the treatment of breast cancer.
OBJECTIVE: This study aims to discover and identify the potential inhibitors against the most influential ERα receptor by the computational approach of 134 phytochemic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chemical and physical computing systems promise information processing in performance regimes inaccessible to conventional electronics. However, they are typically constrained by static hardware architectures that limit adaptability and computational richness. Here, we introduce a reconfigurable microfluidic platform where soft hydrogel structures are 3D-printed and erased in situ to dynamically reshape the physical environment in which chemical computation occurs. By treating microfluidic geometry as an active, programmable element rather than a passive container, we demonstrate hardware-reco
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Computation is increasingly being used to try to accelerate the discovery of new materials. One specific example of this is porous molecular materials, specifically porous organic cages, where the porosity of the materials predominantly comes from the internal cavities of the molecules themselves. The computational discovery of novel structures with useful properties is currently hindered by the difficulty in transitioning from a computational prediction to synthetic realization. Attempts at experimental validation are often time-consuming, expensive, and frequently, the key bottleneck of mate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Extra-gastrointestinal anisakidosis is rare. We herein report an Anisakis pegreffii infection in a patient with hepatic anisakidosis diagnosed based on its molecular identification. A 71-year-old male patient had a hepatic tumor presenting as a low-density area of 20 mm in diameter in segment 6 of the liver on abdominal ultrasonography, computed tomography, and magnetic resonance imaging. The surgically resected pathological specimen revealed a necrotizing eosinophilic granuloma containing nematode larvae, possibly an Anisakis larva. Molecular and phylogenetic analysis demonstrated Anisakis la
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modern computational approaches and machine learning techniques accelerate the invention of new drugs. Generative models can discover novel molecular structures within hours, while conventional drug discovery pipelines require months of work. In this article, we propose a new generative architecture, entangled conditional adversarial autoencoder, that generates molecular structures based on various properties, such as activity against a specific protein, solubility, or ease of synthesis. We apply the proposed model to generate a novel inhibitor of Janus kinase 3, implicated in rheumatoid arthr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular dynamics simulations model chemical reactions as continuous changes in molecular structure over time instead of static minima and transition states. This perspective argues that time-dependent structural change is a crucial, but often overlooked, mechanistic feature as many reactions simply do not follow a single, equilibrated minimum-energy path. We highlight examples where traditional transition state theory fails, typically cases involving short-lived intermediates, nonequilibrium solvation, momentum-controlled selectivity, post-transition state bifurcations, and "hidden" dynamic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methamphetamine addiction remains a significant global health concern, yet its molecular mechanisms remain incompletely understood. Methamphetamine and its major metabolite, 4-hydroxyamphetamine (4HAMP), can readily cross the blood-brain barrier; however, their interactions with the Mu opioid receptor (MOR) remain unexplored. In this study, molecular docking, molecular dynamics simulations, principal component analysis, free energy landscape mapping, and advanced free energy calculations, including MM/GBSA and adaptive biasing free energy (ABFE) methods were employed, to examine the binding in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Retinol-binding protein 4 (RBP4) is a key transporter of all-trans-retinol (vitamin A), circulating in blood as either holo-RBP4 (retinol-bound) or apo-RBP4 (retinol-free). Dysregulated RBP4 levels, particularly an imbalance between apo- and holo-RBP4, have been implicated in a range of metabolic and cardiovascular diseases. Current detection methods such as ELISA and Western blot lack the specificity to distinguish these two forms. Here, we present an aptamer-based biosensing strategy that overcomes this limitation by using selected single aptamer sequences for the precise and selective quant
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chikungunya virus (CHIKV) poses a significant public health threat with no approved antivirals. The viral non-structural proteins nsP2 (a cysteine protease) and nsP4 (an RNA-dependent RNA polymerase) are essential for viral replication and represent attractive drug targets. We evaluated fifteen benzopyran derivatives as dual-targeting inhibitors using integrated computational approaches, including molecular docking, 100 ns all-atom molecular dynamics simulations, MM-GBSA binding free energy calculations, and DFT quantum chemical analysis. Four compounds emerged as lead candidates: 3b and 3e fo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies have highlighted the 1,3,4-oxadiazole scaffold as an important pharmacophore present in numerous biologically active molecules and therapeutic agents. In continuation of our interest in biologically active heterocyclic compounds, we report the synthesis of a series of novel 2,5-di(aryl/heteroaryl)-1,3,4-oxadiazoles using molecular iodine (1.0 equiv.) under basic conditions. The synthesized compounds were evaluated for in vitro anticancer and antifungal activities together with comprehensive computational investigations. Cytotoxicity studies against normal HEK-293 cells and the c
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.