Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder. However, cell type-dependent transcriptional regulatory programs responsible for PD pathogenesis remain elusive. Here, we establish transcriptomic and epigenomic landscapes of the substantia nigra by profiling 113,207 nuclei obtained from healthy controls and patients with PD. Our multiomics data integration provides cell type annotation of 128,724 cis-regulatory elements (cREs) and uncovers cell type-specific dysregulations in cREs with a strong transcriptional influence on genes implicated in PD. The establishment of high-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epigenomic abnormality of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) has rarely been investigated due to its strong heterogeneity. Here, we used single-cell multiomics sequencing to simultaneously analyze the DNA methylome, chromatin accessibility and transcriptome in individual tumor cells of PDAC patients. We identified normal epithelial cells in the tumor lesion, which have euploid genomes, normal patterns of DNA methylation, and chromatin accessibility. Using all these normal epithelial cells as controls, we determined that DNA demethylation in the cancer genome was strongly enriched in h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic memory is an essential process of life that governs the inheritance of predestined functional characteristics of normal cells and the newly acquired properties of cells affected by cancer and other diseases from parental to progeny cells. Unraveling the molecular basis of epigenetic memory dictated by protein and RNA factors in conjunction with epigenetic marks that are erased and re-established during embryogenesis/development during the formation of somatic, stem and disease cells will have far reaching implications to our understanding of embryogenesis/development and various dis
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigated the genetic and epigenetic mechanisms underlying the comorbidity of five substance dependence diagnoses (SDs; alcohol, AD; cannabis, CaD; cocaine, CoD; opioid, OD; tobacco, TD). A latent class analysis (LCA) was performed on 22,668 individuals from six cohorts to identify comorbid DSM-IV SD patterns. In subsets of this sample, we tested SD-latent classes with respect to polygenic overlap of psychiatric and psychosocial traits in 7659 individuals of European descent and epigenome-wide changes in 886 individuals of African, European, and Admixed-American descents. The LCA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antipsychotic medications are essential when treating schizophrenia spectrum and other psychotic disorders, but the efficacy and tolerability of these medications vary from person to person. This interindividual variation is likely mediated, at least in part, by epigenomic processes that have yet to be fully elucidated. Herein, we systematically identified and evaluated 65 studies that examine the influence of antipsychotic drugs on epigenomic changes, including global methylation (9 studies), genome-wide methylation (22 studies), candidate gene methylation (16 studies), and histone modificati
СтатьяСистематический обзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study investigated the genetic and epigenetic mechanisms underlying the comorbidity patterns of five substance dependence diagnoses (SDs; alcohol, AD; cannabis, CaD; cocaine, CoD; opioid, OD; tobacco, TD).
METHODS: A latent class analysis (LCA) was performed on 31,197 individuals (average age 42±11 years; 49% females) from six cohorts to identify comorbid DSM-IV SD patterns. In subsets of this sample, we tested SD-latent classes with respect to polygenic burden of psychiatric and behavioral traits and epigenome-wide changes in three population groups.
RESULTS: An LCA identifi
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Altered DNA methylation (DNAm) may be one pathway through which early-life adversity (ELA) contributes to adverse mental and physical health outcomes. This study investigated whether the presence versus absence of ELA experiences reflecting the dimensions of threat and deprivation were associated with epigenome-wide DNAm cross-sectionally and longitudinally in a community-based sample of children and adolescents.
METHODS: In 113 youths aged 8-16 years with wide variability in ELA, we examined associations of abuse (physical, sexual, emotional; indicating threat-related experiences
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: HIV-positive individuals are at higher risk than healthy persons for aging-related diseases, including myocardial infarction and non-AIDS defining cancers. Recent evidence suggests that HIV infection may modulate changes in the host cell epigenome, and these changes represent a potential mechanism through which HIV infection accelerates aging. We assessed the difference in DNA methylation (DNAm) age, an aging marker involving multiple age-related cytosine-guanine dinucleotide (CpG) sites, among antiretroviral treatment (ART)-naive HIV-positive and HIV-negative individuals in a cohor
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Peripheral blood monocytes (PBMs) play multiple and critical roles in the immune response, and abnormalities in PBMs have been linked to a variety of human disorders. However, the DNA methylation landscape in PBMs is largely unknown. In this study, we characterized epigenome-wide DNA methylation profiles in purified PBMs.
MATERIALS & METHODS: PBMs were isolated from freshly collected peripheral blood from 18 unrelated healthy postmenopausal Caucasian females. Epigenome-wide DNA methylation profiles (the methylome) were characterized by using methylated DNA immunoprecipitation combined wi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin B12 (cobalamin, cbl) is a cofactor of methionine synthase (MTR) in the synthesis of methionine, the precursor of the universal methyl donor S-Adenosylmethionine (SAM), which is involved in epigenomic regulatory mechanisms. We have established a neuronal cell model with stable expression of a transcobalamin-oleosin chimer and subsequent decreased cellular availability of vitamin B12, which produces reduced proliferation, increased apoptosis and accelerated differentiation through PP2A, NGF and TACE pathways. Anti-transcobalamin antibody or impaired transcobalamin receptor expression pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fragile X Syndrome (FXS) remains the leading inherited cause of intellectual disability (ID), yet the classic CGG repeat expansion on the Fr … tal trajectories. A significant focus is placed on cutting-edge technologies, including single-cell epigenomics and CRISPR/dCas9-mediated epigenetic editing, which are transforming our ability to quantify 'epigenetic load.' Furthermore, we discuss the integration of machine learning algorithms to analyze multi-omics data, offering a pathway toward personalize …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aging brain accumulates increased variability of gene expression over time, in part due to environmental and lifestyle factors that influence an individual's biologic processes underlying healthy and diseased age-related pathology. Targeted by such external factors is the epigenome, a collection of chemical marks on DNA and histone proteins that can change dynamically in response to stimuli and can alter transcriptional machinery to regulate gene expression and protein synthesis. Recent work has revealed epigenetic mechanisms - such as DNA methylation, histone posttranslational modificatio
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance to androgen receptor (AR)-targeted therapies remains a major clinical challenge in the treatment of castration-resistant prostate cancer (CRPC). Emerging evidence suggests that Enzalutamide resistance is not solely due to the loss of AR dependency but can also arise from epigenomic reprogramming of the AR cistrome toward noncanonical gene networks. Recent studies have revealed that this reprogramming is mediated by previously unrecognized coactivators, including CXXC5, TET2, and EZH2, which cooperate with AR to establish a transcriptional landscape that supports lineage plasticity a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adipose tissue is essential for maintaining glucose and lipid homeostasis in mammals. However, epigenomic mechanisms underlying adipose tissue function remain largely unclear. Here, we identify the histone chaperone HIRA as an epigenomic regulator of adipose tissue function. Adipose tissue-specific knockout of Hira in mice impairs insulin sensitivity and restrains adipose tissue expansion during high-fat diet-induced obesity. Mechanistically, HIRA is required for the expression of Adipoq, encoding the adipokine adiponectin, and lipid metabolism genes in adipose tissue. Genomic mapping reveals
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer is marked by profound molecular and microenvironmental heterogeneity that limits therapeutic progress. Here, we present a 15-layer multi-omics atlas that integrates genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, multiple post-translational modifications (PTMs), protein-protein interactions, metabolomics, and microbiome profiles from 159 primary gastric adenocarcinomas and 30 matched normal adjacent tissues. Using cell-state deconvolution, we define tumor ecotypes that refine genomic and histological subtypes by capturing distinct tumor microenvironment architectures linked …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The global rise in addictive drug use has become a major public health concern, increasingly linked to the development of depression-a psychiatric disorder affecting over 300 million people worldwide. Emerging evidence indicates that chronic exposure to addictive substances can induce or exacerbate depressive symptoms through reward circuitry alterations, neuroinflammation, altered hypothalamic pituitary adrenal axis function, and mitochondrial dysfunction, thereby establishing a neurobiological milieu that favors drug induced depressive states. This review summarizes how epigenetic mechanisms
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anti-neutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis (AAV) is an autoimmune disease characterized by autoantibodies against neutrophil cytoplasmic antigens such as myeloperoxidase (MPO) and proteinase 3 (PR3). AAV affects small blood vessels, leading to systemic inflammation and multiorgan damage. Recent advances in multi-omics analyses, including genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, and metabolomics, have significantly improved our understanding of AAV complex pathophysiology. Genome-wide association studies (GWASs) have revealed robust genetic associations, especially wi…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The cervicovaginal microbiome plays a critical role in women's health with microbial communities dominated by Lactobacillus species considered optimal. In contrast, the depletion of lactobacilli and the presence of a diverse array of strict and facultative anaerobes, such as Gardnerella vaginalis, have been linked with adverse reproductive outcomes. Despite these associations, the molecular mechanisms by which host-microbial interactions modulate cervical and vaginal epithelial function remains poorly understood.
RESULTS: In this study, we used RNA sequencing to characterize the t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microglia, the major population of brain-resident macrophages, are now recognized as a heterogeneous population comprising several cell subtypes with different (so far mostly supposed) functions in health and disease. A number of studies have performed molecular characterization of these different microglial activation states over the last years making use of "omics" technologies, that is transcriptomics, proteomics and, less frequently, epigenomics profiling. These approaches offer the possibility to identify disease mechanisms, discover novel diagnostic biomarkers, and develop new therapeuti…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurocristopathies such as CHARGE syndrome result from aberrant neural crest development. A large proportion of CHARGE cases are attributed to pathogenic variants in the gene encoding CHD7, chromodomain helicase DNA binding protein 7, which remodels chromatin. While the role for CHD7 in neural crest development is well documented, how this factor is specifically up-regulated in neural crest cells is not understood. Here, we use epigenomic profiling of chick and human neural crest to identify a cohort of enhancers regulating Chd7 expression in neural crest cells and other tissues. We functional
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования