PURPOSE: To develop a new method to detect and type adenoviruses directly from conjunctival scrapings using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) with adenovirus (ad) type specific primer.
METHODS: Using primers specific for the gene of ad1, ad3, ad4, ad8, ad19 and ad37, heat denatured adenovirus DNA was amplified by the LAMP and polymerase chain reaction (PCR). Alkaline lysed adenovirus prototype and conjunctival scrapings were also used directly as templates.
RESULTS: Type specific primers amplified ad genes of the corresponding ad prototype specifically. The specific amplification
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella spp.is capable of causing disease in a range of animal hosts, and human brucellosis is regarded as a life-threating disease. A novel isothermal amplification technique, termed multiple cross displacement amplification (MCDA), was employed for detecting all Brucella species strains. Brucella-MCDA targets the Bscp31 gene (Brucella species-specific gene) to specifically design a set of 10 primers. The Brucella-MCDA can be coupled with nanoparticles-based lateral flow biosensor (LFB) for highly specific, simple, rapid, and visual detection of Brucella-specific amplicons. Using the protoco
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Investigating the correlation between the genotype and spinal muscular atrophy(SMA) clinical phenotype.
METHODS: Neuronal apoptosis inhibitory protein(NAIP) gene analysis was performed by PCR amplification of exon 5 in 13 unrelated SMA patients with deletions of SMN gene.
RESULTS: Two Type-I patients(2 M5, 40%) lacked the NAIP exon 5.
CONCLUSION: The results suggest a possible correlation between NAIP gene deletion and the disease severity of SMA.
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The HOXB13/IL17RB gene expression biomarker has been shown to predict response to adjuvant and extended endocrine therapy in pat … signatures, and clinical outcome data in the TGGA and METABRIC breast cancer cohorts. Genomic-based gene amplification data was validated with tri-colored fluorescence in situ hybridization.
RESULTS: In the TCGA breast cancer cohort, HOXB13 gene expression was significantly higher in HER2+ versus HER2- breast cancers, and its expression was also significantly highe …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent developments in genomic technologies have resulted in increased understanding of pathogenic mechanisms and emphasized the importance of central survival pathways. Here, we use a novel bioinformatic based integrative genomic profiling approach to elucidate conserved mechanisms of lymphomagenesis in the three commonest non-Hodgkin's lymphoma (NHL) entities: diffuse large B-cell lymphoma, follicular lymphoma, and B-cell chronic lymphocytic leukemia. By integrating genome-wide DNA copy number analysis and transcriptome profiling of tumor cohorts, we identified genetic lesions present in eac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recurrent chromosomal aberrations in hematopoietic tumors target genes involved in pathogenesis. Their identification and functional characterization are therefore important for the establishment of rational therapies. Here, we investigated genomic amplification at 7q22 in the T-cell lymphoma cell line SU-DHL-1 belonging to the subtype of anaplastic large-cell lymphoma (ALCL). Cytogenetic analysis mapped this amplicon to 86-95 Mb. Copy-number determination quantified the amplification level at 5- to 6-fold. Expression analysis of genes located within this region identified cyclin-dependent kin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Intermediate-risk neuroblastoma patients older than 18 months, with non-MYCN amplified, International Neuroblastoma Risk Group Stag … ubset, and correlated results with patient survival.
RESULTS: Among 98 tumors, 9/98 (9.2%) had oncogene amplifications (CDK4/MDM2/TERT coamplification (n = 1), CDK4/MDM2 coamplification (n = 4), CDK4 (n = 2), TERT (n = 1), and MYC (n = 1)), while 63/98 (64.3%) had typical segmental chromosomal aberrations (tSCAs). Patients with tumors with oncogene amplification ha …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the present study 28 Trueperella pyogenes strains isolated from various origins could successfully be identified with a newly designed loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay based on gene cpn60 encoding chaperonin. No cross reaction could be observed with control strains representing four species of genus Trueperella and seven species of closely related genus Arcanobacterium. The present cpn60 LAMP assay might allow a reliable and low cost identification of T. pyogenes also in laboratories with less specified equipment.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infections caused by Chlamydia trachomatis are among the most common bacterial sexually transmitted infections in the world with an estimated 50 million new cases occurring each year. Since the prevalence of chlamydial infections range from 3%-5% among asymptomatic men and women to 20%-25% among adolescents attending sexually transmitted disease (STD) clinics, widespread screening for this infection has been recommended. With the advent of DNA amplification technology, several assays have become commercially available which have high sensitivity and specificity, and can utilise convenient, non
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Through the technical advances in molecular biology during the past decade, important new insights into the fundamental chromosomal changes … triction enzyme digestion of DNA, molecular cloning of genes, and mapping of chromosomal deletions. Gene amplification and rearrangements are discussed through review of recent work on the N-myc gene in neuroblastoma and the epidermal growth factor receptor (EGFR) gene in glioblastoma. The molecular cloning of the gli gene from a glioblastoma illustrates the powerfu …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To perform genetic analysis, prenatal diagnosis and preimplantation genetic diagnosis (PGD) in a family with a rare deletional β- thalassemia.
METHODS: Hematological parameters of the peripheral blood collected from all the family members were analyzed by whole blood cell analysis and capillary zone electrophoresis (CZE). Polymerase chain reaction-reverse dot blot (PCR-RDB) was used to identify 17 common β- thalassemia gene mutations, the multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) and gap-polymerase chain reaction (gap-PCR) were used to identify β- globin gene cluster
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The majority of pneumococcal isolates can be identified by the conventional methods based on phenotypic characteristics. Occasionally, however, the differentiation of alpha-hemolytic streptococci from pneumococci, especially those isolated from nasopharynx, is problematic due to the discrepant results obtained by the conventional identification methods. Several gene technological methods based on the amplification of genes encoding pneumococcal virulence factors, such as pneumolysin (ply) and autolysin, have been used as additional identification methods. Recent studies have shown that especia
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rett syndrome (RTT) is a developmental disorder with an early onset and X-linked dominant inheritance pattern. It is first recognized in infancy and is seen almost always in girls, but it may be seen in boys on rare occasions. Typical RTT is caused by de novo mutations of the gene MECP2 (OMIM*300005), and atypical forms of RTT can be caused by mutations of the CDKL5 (OMIM*300203) and FOXG1 (OMIM*164874) genes.
METHODS: Approximately 5% of the mutations detected in MECP2 are large rearrangements that range from exons to the entire gene. Here, we have characterized the deletions det
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluorescent in situ hybridization (FISH) assays to detect gene amplification such as HER2 or MET in tumors are used for prognosis evaluation and selection of targeted therapies. Although FISH guidelines recommended 4~6 μm FFPE sections, many laboratories use 2~3 μm sections, which is a common practice for H&E staining and immunohistochemistry. A former study concluded that section thickness did not affect FISH results. We found, however, that thinner FFPE sections may lead to false negative results for gene amplification. A mathematic model was constructed and cell-line based controls with kno…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudohypoparathyroidism 1b (PHP 1b) is characterized by specific resistance of target tissues to PTH, but no mutations in the PTH/PTH-related peptide (PTHrP) receptor gene have been identified. To investigate the basis for defective PTH signaling, we used polymorphic markers in or near the genes encoding PTH and its receptors to perform linkage analysis between these loci and PHP 1b. Two multiplex PHP 1b families (families M and K) were informative for an intragenic polymorphism in exon 13 of the PTH/PTHrP receptor gene detected by PCR amplification and resolved by denaturing gradient gel ele
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic neurogenic tumors, including schwannoma and neurofibroma, are rare, and their genetic aberrances have not been defined. The present study aimed at investigating the genomic alterations of pancreatic schwannoma and neurofibroma. Two patients with pancreatic schwannoma and 1 patient with neurofibroma, who underwent surgical resection at the First Affiliated Hospital, Sun Yat-sen University between June 2016 and April 2019, were recruited into the study. Their tumor tissues were analyzed by exome sequencing and genome sequencing. Exome sequencing revealed a MUTYH likely pathogenic germ
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe the use of rolling circle amplification and long-distance inverse polymerase chain reaction (LD-PCR) to identify chromosomal breakpoints and fusion genes in cancer cells carrying acquired translocations. This approach produced enough template for 100 inverse PCR reaction from as little as 20 ng of patient DNA, consequently enabling the use of up to 500 times less patient DNA compared to standard inverse PCR. The method is based on identifying restriction sites in a putative breakpoint area in a cancer-specific translocation, followed by circularization and amplification of the rest
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aggressive adult T-cell leukemia/lymphoma (ATLL) such as acute and lymphoma types are fatal diseases with poor prognosis. Although these 2 subtypes feature different clinicopathologic characteristics, no detailed comparative analyses of genomic/genetic alterations have been reported. We performed array-based comparative genomic hybridization for 17 acute and 49 lymphoma cases as well as real-time quantitative polymerase chain reaction (PCR) to identify the target genes of recurrently amplified regions. Comparison of the genome profiles of acute and lymphoma types revealed that the lymphoma typ
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intestinal microbiota, a barrier to the establishment of pathogenic bacteria, is also an important reservoir of opportunistic pathogens. It plays a key role in the process of resistance-genes dissemination, commonly carried by specialized genetic elements, like plasmids, phages, and conjugative transposons. We obtained from strains of enterobacteria, isolated from faeces of newborns in a university hospital nursery, indication of phenotypical gentamicin resistance amplification (frequencies of 10(-3) to 10(-5), compatible with transposition frequencies). Southern blotting assays showed str
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.