BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) continues to pose a significant clinical challenge due to its high mortality rate and limited treatment efficacy. The role of disulfidptosis, a recently discovered mode of regulatory cell death, in pancreatic cancer progression and tumor immunity remains poorly understood.
METHODS: We developed and validated a disulfidptosis-related prognostic signature based on 13 pivotal genes. Integrated multi-omics approaches, incorporating bulk and single-cell transcriptomics, spatial transcriptomics, and functional assays, were employed to investigate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neoadjuvant chemoradiotherapy (nCRT) is the main treatment for Locally Advanced Rectal Cancer (LARC). The response to nCRT varies from a complete response to no response. The impact of the B cells in this process is poorly understood. This study aimed to characterize the B cells types associated with response or resistance to nCRT. We applied the "Scissor" algorithm to integrate single-cell RNA-seq data with bulk transcriptome data from colorectal cancer samples, thereby identifying B cell subpopulations associated with nCRT response and exploring the clinical significance of B cell-related ch
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma (HCC) poses a significant global health challenge, and its complex and diverse pathogenesis requires further in-depth investigation. With the development of bioinformatics, omics sequencing has become an indispensable detection tool for dissecting the complex molecular characteristics of diseases. We analyzed the transcriptomic and proteomic data from TCGA-LIHC and identified a prognosis-related gene, EPPK1. Subsequently, validation by single-cell sequencing revealed that EPPK1 is specifically highly expressed in HCC cells. Further combined analysis of immune infiltrat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While platelets are well-documented contributors to tumorigenesis, their role in multiple myeloma (MM) progression and risk stratification remains underexplored. To assess platelet function in MM and verify the prognostic value of platelet-related genes(PRGs) in patients with multiple myeloma, further providing new ideas for the development of MM. We combined the clinical assessment of platelet activation in MM patients with functional co-culture experiments using MM cell lines (RPMI8226, MM.1 S) to investigate platelet-driven tumor progression. Additionally, an integrated analysis of bulk (GS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer (BC) is a common malignant tumor with high incidence and mortality rates. Mitophagy refers to a selective form of autophagy that is believed to be closely related to the occurrence and progression of BC. Identifying the mitophagy-related sites associated with BC can help us gain a deeper understanding of the underlying mechanisms of BC, laying the foundation for early diagnosis and effective treatment of BC.
METHOD: RNA-seq expression data of BC were obtained from the GEO and TCGA databases. Differentially expressed genes were intersected with mitophagy-related genes
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), the most common and lethal subtype of renal cell carcinoma, exhibits marked intratumoral heterogeneity and complicates clinical management. Although long noncoding RNAs (lncRNAs) regulate diverse cellular processes, their landscape and biomarker potential in ccRCC remain poorly defined. Here we performed single-nucleus and bulk transcriptomic, proteomic, and metabolomic analyses on a cohort of 100 ccRCC patients. The expression pattern of lncRNAs were described based on metacells. Malignant cells displayed broader but lower lncRNA expression, likely ref
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triaptosis, an emerging form of cell death, remains poorly characterized in terms of its heterogeneity within clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). Utilizing single-cell transcriptomics, we delineate a landscape of triaptosis heterogeneity and identify monocytes and macrophages as exhibiting the highest triaptosis activity, which further increases upon terminal differentiation. These high-activity cells also demonstrate enhanced pro-angiogenic signaling toward endothelial cells. Within epithelial cells, subpopulations with the strongest triaptosis activity are located at the late differenti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The interplay between genotype and phenotype in shaping spatial heterogeneity and metastatic evolution in triple-negative breast cancer (TNBC) remains poorly understood.
METHODS: Here, we developed a pathology-guided geospatial genomic and transcriptomic sequencing workflow (pGeo-G&T-seq) and applied it to TNBC specimens from primary tumors and matched metastatic sites. Using laser capture microdissection (LCM) we isolated mRNA and gDNA for whole-exome sequencing, whole-genome sequencing and whole-transcriptome sequencing to analyze spatial genomic heterogeneity and transcriptomic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BackgroundThe abnormal expression patterns of genes associated with cell cycle control are essential contributors to the initiation and progression of bladder cancer (BC).MethodsIn this research, transcriptomic profiles sourced from The Cancer Genome Atlas (TCGA) were examined to pinpoint cell cycle-related genes with significant expression differences between early-stage (I-II) and advanced-stage (III-IV) BC. The identified BC samples were then randomly split into training and validation groups. A prognostic model containing nine key genes was subsequently constructed from the training datase
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The tumor microenvironment (TME) in osteosarcoma, shaped by damage-associated molecular patterns (DAMPs) released during immunogenic cell death (ICD)-a process that elicits robust immune responses-critically modulates antitumor immunity, particularly in this aggressive malignancy. Despite the recognized importance of DAMPs in various cancers, including osteosarcoma, comprehensive research into their impact specifically within osteosarcoma remains limited. This study aims to elucidate the impact of DAMPs on immune cell infiltration and antitumor immunity in osteosarcoma by identifyi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chordoma, a rare sarcoma of notochordal origin, exhibits slow growth and local aggressiveness. While copy-number (CN) events are recognized as key chordoma drivers, no comprehensive classification, based on CN, has yet been developed. Here, we establish a robust, reproducible genomic subtyping of chordoma, based on CN events. Two independent skull base chordoma cohorts (N = 32, N = 71) were analyzed, utilizing distinct analytical platforms, DNA methylation microarrays and whole-genome sequencing, both controlled for B-allele frequencies. Samples were clustered using unsupervised hierarchical m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ObjectiveDisulfidptosis, a newly discovered mechanism of cell death, may play a significant role in cancer initiation, progression, and prognosis. However, studies on the prognostic role of Disulfidptosis-Related Genes (DRGs) across cancers remain limited. This study aims to systematically explore the prognostic value of DRGs in various cancer types by constructing a prognosis model based on DRGs and analyzing their associations with tumor biological characteristics.MethodsThis was a pan-cancer bioinformatics study combined with in vitro qRT-PCR validation. Public transcriptomic and clinical d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Cribriform acinar adenocarcinoma (AAC), intraductal carcinoma of the prostate (IDC-P), atypical intraductal proliferation (AIP), and ductal adenocarcinoma (DAC) are linked to poor outcomes in prostate cancer. We analyzed their gene expression using spatial transcriptomics.
MATERIALS AND METHODS: A tissue microarray of 18 formalin-fixed paraffin-embedded cores from 17 prostatectomies was profiled for expression of 18,676 messenger RNAs using the Bruker GeoMx Digital Spatial Profiler platform. In total, 53 areas of interest were selected based on hematoxylin and eosin staining, PIN 4 i
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondria-related genes play a crucial role in driving tumour cell progression, but little is known about their molecular mechanisms and biological pathways. This study conducted a comprehensive analysis of the mitochondrial key gene LACTB2 in digestive tract tumours and explored a novel early blood-based diagnostic model for gastric cancer (GC).
METHODS: This study analyzed LACTB2 expression, biological pathways, and immune regulation in a large cohort of 10,581 samples. IHC staining was performed using 236 internal GC samples. Multi-omics data were integrated for comprehensiv
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Portal vein tumor thrombosis (PVTT) and portal hypertension are major contributors to gastrointestinal bleeding in hepatocellular carcinoma (HCC), yet the molecular programs linking vascular pathology, immune dysregulation, and bleeding risk remain incompletely defined.
METHODS: Bulk transcriptomic datasets related to PVTT (GSE77509 and GSE69164) and noncirrhotic portal hypertension (GSE77627) were analyzed using differential expression and weighted gene coexpression network analysis to identify robust disease-associated genes. A six-gene core signature was derived by intersecting
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Colorectal cancer (CRC) remains one of the most diagnosed malignancies worldwide and continues to rank among the leading causes of cancer-related death. Cancer progression involves dynamic transcriptional and immunological changes, and although many key molecular alterations driving CRC progression have been described, stage-specific differences remain poorly understood. This study aimed to characterize transcriptomic changes in Hispanics living in Puerto Rico (PRH) to identify relevant pathways, target genes, and stage-specific immune and molecular signatures.
METHODS: We condu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: There is few research on which genes play an important role in tumors without lymph metastasis. This study aimed to identify candidate molecular alterations preferentially associated with N0-stage LUSC.
METHODS: we conducted a comprehensive bioinformatics analysis using publicly available The Cancer Genome Atlas (TCGA) data. Differentially expressed genes (DEGs) were identified separately by comparing N0 tumors and N+ tumors with normal lung tissues. Genes dysregulated in both N0 and N+ tumors were excluded to identify candidate N0-associated genes PPI networks were constructed using
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD4+CD25+FOXP3+ regulatory T cells (Treg) are highly activated in tumors and promote disease progression. Specific, universal targeting of these effector Treg cells is limited by the lack of a conserved signature across human cancers and information on their origin. Here we combine analysis of single-cell RNA-sequencing datasets with spectral flow cytometry and identify a core signature of 88 genes consistently upregulated in intratumoral Treg cells among 9 epithelial cancers. We describe 4 Treg cell subsets - CCR7+ quiescent, CCR8+ effector, CD161+ and intermediate, with distinct tissue distr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Lung adenocarcinoma (LUAD) is the most common subtype of non-small-cell lung cancer and is one of the leading causes of cancer-related deaths globally. Despite current developments, reliable biomarkers for effective diagnosis, prognosis, and patient stratification are still lacking. Methods: We analyzed publicly available TCGA-LUAD and GEO datasets using integrative bioinformatics approaches, including differential gene expression, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), survival modeling, mutation profiling, immune cell infiltration scores, machine learning, and bulk
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In breast cancer, the behavior of genes linked to the immune system and their interaction with the tumor's microenvironment suggest new paths for tailored therapies. Utilizing the TCGA-BRCA cohort, we established a robust overall survival prediction model through LASSO regression and Gaussian mixture model based on risk group. We found that low-risk patients responded better to chemotherapy. Single-cell analysis further confirmed expression patterns of signature genes in both healthy and malignant breast samples. Our study, the first to use immunohistochemistry (IHC) to assess EPHB6 expression
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования