Natural selection can drive organisms to strikingly similar adaptive solutions, but the underlying molecular mechanisms often remain unknown. Several amphibians have independently evolved highly adhesive skin secretions (glues) that support a highly effective antipredator defence mechanism. Here we demonstrate that the glue of the Madagascan tomato frog, Dyscophus guineti, relies on two interacting proteins: a highly derived member of a widespread glycoprotein family and a galectin. Identification of homologous proteins in other amphibians reveals that these proteins attained a function in ski
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular docking methodology explores the behavior of small molecules in the binding site of a target protein. As more protein structures are determined experimentally using X-ray crystallography or nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy, molecular docking is increasingly used as a tool in drug discovery. Docking against homology-modeled targets also becomes possible for proteins whose structures are not known. With the docking strategies, the druggability of the compounds and their specificity against a particular target can be calculated for further lead optimization processes. Molec
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rise of drug resistances in malaria necessitates the exploration of novel therapeutic strategies. Targeting epigenetic pathways could open new, promising treatment avenues. In this study, the focus is on the essential Bromodomain protein 1 (PfBDP1) of the malaria pathogen Plasmodium falciparum. Utilizing the pan-selective bromodomain inhibitor MPM6, a potent initial hit is identified and it is subsequently developed into a nanomolar binder. Through a combination of virtual docking, isothermal titration calorimetry, and X-ray crystallography, the molecular interactions of the new inhibitors
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The World Health Organization (WHO) proclaimed the monkeypox epidemic a "public health emergency of worldwide significance" recently. The monkeypox virus is a member of the same Orthopoxvirus genus as the smallpox virus. Although smallpox medications are advised against monkeypox, no monkeypox-specific drugs are currently available. In the event of such an outbreak, in-silico medication identification is a practical and efficient strategy. As a result, we report a computational drug repurposing analysis to discover medicines that may be potential inhibitors of thymidylate kinase, a critical mo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic sclerosis is an autoimmune disease that can result in lung fibrosis, and is strongly associated with the presence of serum anti-topoisomerase-I autoantibodies. A young man with genetic muscular dystrophy caused by titin-cap/telethonin (TCAP) gene mutation, developed a severe restrictive lung disease due to a fibrosing interstitial pneumonia secondary to systemic sclerosis with positive anti-topoisomerase-I antibodies. Using amino acid sequence alignment and protein structure modelling, we found that mutant telethonin exposes an amino acid sequence with significant homology to an immun
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persistence and replication of the gram-negative bacterium Legionella pneumophila in the human host cell depend on so-called effector proteins that target diverse cellular functions and modulate them in favor of the pathogen. We solved the crystal structure of the L. pneumophila effector protein MesI de novo to a resolution of 2.2 Å. The 34 kDa polypeptide chain folds into two distinct α-helical domains. The larger C-terminal domain shows similarity to tetratricopeptide repeat proteins. Using size-exclusion chromatography, we confirmed that MesI binds tightly to full-length SidI and that delet
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The BCL-2 family proteins constitute a critical control point in apoptosis. BCL-2 family proteins display structural homology to channel-forming bacterial toxins, such as colicins, transmembrane domain of diphtheria toxin, and the N-terminal domain of delta-endotoxin. By analogy, it has been hypothesized the BCL-2 family proteins would unfold and insert into the lipid bilayer upon membrane association. We applied the site-directed spin labeling method of electron paramagnetic resonance spectroscopy to the pro-apoptotic member BID. Here we show that helices 6-8 maintain an alpha-helical conform
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recombineering is an essential tool for molecular biologists, allowing for the facile and efficient manipulation of bacterial genomes directly in cells without the need for costly and laborious in vitro manipulations involving restriction enzymes. The main workhorses behind recombineering are bacteriophage proteins that promote the single-strand annealing (SSA) homologous recombination pathway to repair double-stranded DNA breaks. While there have been several reviews examining recombineering methods and applications, comparatively few have focused on the mechanisms of the proteins that are th
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To gain success in the evolutionary "arms race," venomous animals such as scorpions produce diverse neurotoxins selected to hit targets in the nervous system of prey. Scorpion α-toxins affect insect and/or mammalian voltage-gated sodium channels (Na(v)s) and thereby modify the excitability of muscle and nerve cells. Although more than 100 α-toxins are known and a number of them have been studied into detail, the molecular mechanism of their interaction with Na(v)s is still poorly understood. Here, we employ extensive molecular dynamics simulations and spatial mapping of hydrophobic/hydrophilic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibodies raised against denatured and native forms of bothrojaracin were used to analyze the immunological similarities compared to the structural and biological features of five C-type lectin proteins from snake venom (bothrojaracin, botrocetin, Factor IX/X binding protein (FIX/Xbp), convulxin and Bothrops jararaca lectin). Anti-denatured-bothrojaracin antibodies, which recognize mainly linear epitopes, cross-reacted with botrocetin, FIX/Xbp and convulxin, as expected for homologous proteins. On the other hand, anti-native-bothrojaracin antibodies, which mostly interact with conformational
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA of a flavivirus-tick-borne encephalitis virus (strain Sofjin) was subjected to reverse transcription and the DNA copy was transformed into double-stranded DNA by action of E. coli DNA-polymerase I (Klenow's fragment). This DNA was annealed with pBR322 plasmid. The recombinant plasmids were cloned in E. coli K802. The nucleotide sequence of the inserts of the clones coding for region of structural proteins C, pre-M, E and nonstructural protein ns1 was determined by the Maxam-Gilbert method. The nucleotide sequence of these regions is translatable into an amino acid sequence of proteins with
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Opisthorchis viverrini is the causative agent of human opisthorchiasis in Thailand and long lasting infection with the parasite has been correlated with the development of cholangiocarcinoma. In this work we have molecularly characterized the first member of a protein family carrying two DM9 repeats in this parasite (OvDM9-1). InterPro and other protein family databases describe the DM9 repeat as a protein domain of unknown function that has been first noted in Drosophila melanogaster. Two paralogous proteins have been partially characterized in the genus Fasciola, Fasciola hepatica TP16.5, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structural protein VP2 of infectious bursal disease virus (IBDV) spontaneously forms a dodecahedral T=1 subviral particle (SVP), and is a primary immunogen of the virus. In this study, the structure of IBDV SVP was determined in a cubic crystal and refined to 2.6A resolution. It contains 20 independent VP2 subunits in a crystallographic asymmetric unit. Each subunit is folded mainly into a shell domain and a protrusion domain, both with the Swiss-roll topology, plus a small helical base domain. Three VP2 subunits constitute a tight trimer, which is the building block of IBDV (sub)viral par
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this study was to examine STC-1's structure, function, and differential expression in large and miniature pigs. We cloned the Hezuo pig's coding sequence, compared its homology, and used bioinformatics to assess the structure. RT-qPCR and Western blot were used to detect the expression in ten tissues of Hezuo pig and Landrace pig. The results showed that Hezuo pig was most closely related to Capra hircus and most distantly related to Danio rerio. The protein STC-1 has a signal peptide and its secondary structure is dominated by the alpha helix. The mRNA expression in the spleen,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A method, so called "active hydrogen bond network" (AHBN), is proposed for site-directed mutations of hydrolytic enzymes. In an enzyme the AHBN consists of the active residues, functional residues, and conservative water molecules, which are connected by hydrogen bonds, forming a three dimensional network. In the catalysis hydrolytic reactions of hydrolytic enzymes AHBN is responsible for the transportation of protons and water molecules, and maintaining the active and dynamic structures of enzymes. The AHBN of pullulanase BNPulA324 from Bacillus naganoensis was constructed based on a homologo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: To identify the genetic mutation of a four-generation autosomal dominant congenital cataract family in China.
METHODS: Targeted region sequencing containing 778 genes associated with ocular diseases was performed to screen for the potential mutation, and Sanger sequencing was used to confirm the mutation. The homology model was constructed to identify the protein structural change, several online software were used to predict the mutation impact. CLUSTALW was used to perform multiple sequence alignment from different species.
RESULTS: A novel heterozygous mutation, GJA8 NM_005267
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With current drug treatments failing due to toxicity, low efficacy and resistance; leishmaniasis is a major global health challenge that desperately needs new validated drug targets. Inspired by activity of the natural chalcone 2',6'-dihydroxy-4'-methoxychalcone (DMC), the nitro-analogue, 3-nitro-2',4',6'- trimethoxychalcone (NAT22, 1c) was identified as potent broad spectrum antileishmanial drug lead. Structural modification provided an alkyne containing chemical probe that labelled a protein within the parasite that was confirmed as cytosolic tryparedoxin peroxidase (cTXNPx). Crucially, labe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neisseria meningtidis is responsible for causing meningococcal meningitis along with acute septicaemia in human beings. Functional genomics strategies proved cruciality of certain genes/proteins in Neisseria meningitidis pathogenesis. During the present studies, three important Neisseria meningitidis proteins i.e., Dead box RNA-Helicase, Polyribonucleotide nucleotidyl-transferase PNPase and Ribonuclease-III were targeted for homology modeling and protein-ligand docking studies not only to determine their three dimensional architectures but also to identify their potential novel inhibitors. The
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent years have seen an unprecedented rise in the incidence of multidrug-resistant (MDR) Gram-negative bacteria (GNBs) such as Acinetobacter and Klebsiella species. In view of the shortage of novel drugs in the pipeline, alternative strategies to prevent, and treat infections by GNBs are urgently needed. Previously, we have reported that the Candida albicans hypha-regulated protein Hyr1 shares striking three-dimensional structural homology with cell surface proteins of Acinetobacter baumannii. Moreover, active vaccination with rHyr1p-N or passive immunization with anti-Hyr1p polyclonal antib
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SNX10 is a member of the phox homology domain-containing family of phosphoinositide-binding proteins. Intracellularly, SNX10 localizes to endosomes where it mediates intracellular trafficking, endosome organization, and protein localization to the centrosome and cilium. It is highly expressed in bone and the gut where it participates in bone mineral and calcium homeostasis through the regulation of osteoclastic bone resorption and gastric acid secretion, respectively. Not surprisingly, patients harboring mutations in SNX10 mutation manifest a phenotype of autosomal recessive osteopetrosis or m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования