Peptide N-glycanase removes N-linked oligosaccharides from misfolded glycoproteins as part of the endoplasmic reticulum-associated degradation pathway. This process involves the formation of a tight complex of peptide N-glycanase with Rad23 in yeast and the orthologous HR23 proteins in mammals. In addition to its function in endoplasmic reticulum-associated degradation, HR23 is also involved in DNA repair, where it plays an important role in damage recognition in complex with the xeroderma pigmentosum group C protein. To characterize the dual role of HR23, we have determined the high resolutio
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human group III secreted phospholipase A(2) (sPLA(2)-III) consists of a central group III sPLA(2) domain flanked by unique N- and C-terminal domains. We found that the sPLA(2) domain alone was sufficient for its catalytic activity and for its prostaglandin E(2) (PGE(2))-generating functions in various cell types. In several if not all cell types, the N- and C-terminal domains of sPLA(2)-III were proteolytically removed, leading to the production of the form containing only the sPLA(2) domain, which could be further N-glycosylated at two consensus sites. Immunohistochemistry demonstrated that s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two cDNA sequences representing putative allelic variants of the Phanerochaete chrysosporium cbhII gene were isolated by hybridization to th … sequences showed that all of the residues important for the formation of the extended loops of the catalytic domain and those residues that are involved in the catalytic action of the T. reesei enzyme are also present in the P. chrysosporium equivalent. The profiles of cbh gene expression in P. chrysosporium reveal that while cbhI.1 and cbhI.2 could be coregulate …
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human-restricted pathogen Neisseria gonorrhoeae encodes a single N-acetylmuramyl-l-alanine amidase involved in cell separation (AmiC), as compared with three largely redundant cell separation amidases found in Escherichia coli (AmiA, AmiB, and AmiC). Deletion of amiC from N. gonorrhoeae results in severely impaired cell separation and altered peptidoglycan (PG) fragment release, but little else is known about how AmiC functions in gonococci. Here, we demonstrated that gonococcal AmiC can act on macromolecular PG to liberate cross-linked and non-cross-linked peptides indicative of amidase a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fibrillarin is the key methyltransferase associated with the C/D class of small nuclear ribonucleoproteins (snRNPs) and participates in the preliminary step of pre-ribosomal rRNA processing. This molecule is found in the fibrillar regions of the eukaryotic nucleolus and is involved in methylation of the 2'-O atom of ribose in rRNA. Human fibrillarin contains an N-terminal GAR domain, a central RNA-binding domain comprising an RNP-2-like superfamily consensus sequence and a catalytic C-terminal helical domain. Here, Aeropyrum pernix fibrillarin is described, which is homologous to the C-termina
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cGMP-binding cGMP-specific phosphodiesterase (PDE-5) contains distinct catalytic and allosteric binding sites, and each is cGMP-specific. Cyclic nucleotide phosphodiesterase inhibitors, such as 3-isobutyl-1-methylxanthine (IBMX), are believed to compete with cyclic nucleotides at the catalytic sites of these enzymes, but the portion of PDE-5 that accounts for interaction of either of these inhibitors of the substrates themselves with the catalytic domain of the enzymes has not been identified. IBMX was derivatized to yield the photoaffinity probe 8([3-125I,-4-azido]-benzyl)-IBMX, which is …
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tankyrases (TNKS1/2) are multi-domain poly(ADP-ribose) polymerases that regulate Wnt/β-catenin signaling and broader cellular programs through both catalytic activity and extensive protein-protein interaction (PPI) networks. While most tankyrase-directed drug discovery has focused on inhibiting the PARP catalytic site, an emerging alternative is to target tankyrase stability by disrupting its interaction with the deubiquitinase USP25. USP25 functions as a positive regulator of tankyrase abundance by counteracting ubiquitin-dependent turnover; consequently, blocking the TNKS-USP25 PPI can reduc
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endothelial nitric oxide synthase (eNOS) produces nitric oxide (NO), a key molecule for maintaining vascular health. While phosphorylation is a well-established regulatory mechanism of eNOS activity, the functional contribution of conserved lysine residues to electron transfer and catalytic coupling remains less clearly defined. In this study, we examined two conserved lysines in eNOS, Lys609 located within the autoinhibitory (AI) region and Lys733 positioned within the FMN-FNR hinge, by substituting them with arginine to preserve positive charge while altering side-chain geometry. Biochemical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in the cyclin-dependent kinase-like 5 gene (CDKL5) have been described in girls with Rett-like features and early-onset epileptic … tion patients. The CDKL5 gene encodes a serine threonine kinase protein which is characterized by a catalytic domain and a long C-terminal extension involved in the regulation of the catalytic activity of CDKL5 and in the sub-nuclear localization of the protein. To our knowledge, more than 70 different point mutations have been described including missense mutatio …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs) are essential for decoding the genetic code by accurately attaching amino acids to their corresponding tR … conditions, revealed that l-Ile facilitates RMA binding to the tRNAIle CCA-end binding site in the catalytic domain by increasing hydrophobic stacking interactions between RMA and active site residues. Consequently, RMA not only directly competes with tRNAIle for binding to the catalytic domain but also disrupts its interactions with the editing domain by blockin …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Matrix metalloproteinases (MMPs) are a family of zinc-dependent endopeptidases that degrade various proteins in the extracellular matrix (ECM). Typically, MMPs have a propeptide sequence, a catalytic metalloproteinase domain with catalytic zinc, a hinge region or linker peptide, and a hemopexin domain. MMPs are commonly classified on the basis of their substrates and the organization of their structural domains into collagenases, gelatinases, stromelysins, matrilysins, membrane-type (MT)-MMPs, and other MMPs. MMPs are secreted by many cells including fibroblasts, vascular smooth muscle (VSM),
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rifampin (RIF) is a first-line drug used for the treatment of tuberculosis and other bacterial infections. Various RIF resistance mechanisms have been reported, and recently an RIF-inactivation enzyme, RIF phosphotransferase (RPH), was reported to phosphorylate RIF at its C21 hydroxyl at the cost of ATP. However, the underlying molecular mechanism remained unknown. Here, we solve the structures of RPH from Listeria monocytogenes (LmRPH) in different conformations. LmRPH comprises three domains: an ATP-binding domain (AD), an RIF-binding domain (RD), and a catalytic His-containing domain (HD).
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have cloned a new human matrix metalloproteinase (MMP-28, epilysin) from human keratinocyte and testis cDNA libraries. Like most MMPs, epilysin contains a signal sequence, a prodomain with a PRCGVTD sequence, a zinc-binding catalytic domain with an HEIGHTLGLTH sequence, and a hemopexin-like domain. In addition, epilysin has a furin activation sequence (RRKKR) but has no transmembrane sequence. The exon-intron organization and splicing pattern of epilysin differ from that of other MMP genes. It has only 8 exons, and 5 exons are spliced at sites not used by other MMPs. Another novel feature o…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To understand the manner in which biological macromolecules interact with each other, we need not only structural information, but also deta … otein (three alternative approaches), (iii) accelerated nucleotide exchange reaction of RhoA by the catalytic domains of p190RhoGEF, and (iv) intrinsic and stimulated GTP-hydrolysis reaction by the catalytic domain of p50RhoGAP.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histone deacetylase 6 (HDAC6) is a class IIb histone deacetylase that regulates diverse cytosolic acetylation through its two catalytic deacetylase domains and a C-terminal zinc finger ubiquitin-binding domain (ZnF-UBD). This ZnF-UBD mediates key protein-protein interactions (PPIs) that couple deacetylation and ubiquitin-dependent degradation. While most HDAC6 inhibitors target the catalytic domains, the ZnF-UBD represents an underexplored target. Here, we validate previously reported small-molecule inhibitors of the HDAC6 ZnF-UBD/ubiquitin interaction and describe novel N-alkyl moieties based…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The monocytic leukemia zinc finger (MOZ) gene encodes a large multidomain protein that contains, besides other domains, 2 coactivation domains for the transcription factor Runx1/acute myeloid leukemia 1 and a histone acetyl transferase (HAT) catalytic domain. Recent studies have demonstrated the critical requirement for the complete MOZ protein in hematopoietic stem cell development and maintenance. However, the specific function of the HAT activity of MOZ remains unknown, as it has been shown that MOZ HAT activity is not required either for its role as Runx1 coactivator or for the leukemic tr…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lafora disease (progressive myoclonus epilepsy of Lafora type) is an autosomal recessive neurodegenerative disorder resulting from defects in the EPM2A gene. EPM2A encodes a 331-amino acid protein containing a carboxyl-terminal phosphatase catalytic domain. We demonstrate that the EPM2A gene product also contains an amino-terminal carbohydrate binding domain (CBD) and that the CBD is critical for association with glycogen both in vitro and in vivo. The CBD domain localizes the phosphatase to specific subcellular compartments that correspond to the expression pattern of glycogen processing enzy…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In 2002, sperm-specific phospholipase C zeta1 (PLCZ1) was discovered and through these 20 years, it has been established as the predominant … PLCZ1 is the smallest PLC in size, comprising four N-terminal EF-hand domains, followed by X and Y catalytic domains, which are separated by the XY-linker, and ending with a C-terminal C2 domain. The EF hands are responsible for the high Ca2+ sensitivity of PLCZ1. The X and Y catalytic domains are responsible for the catalysis of the phosphatidylinositol-4,5-bisp …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rhodanese domains are abundant structural modules that catalyze the transfer of a sulfur atom from thiolsulfates to cyanide via formation of a covalent persulfide intermediate that is bound to an essential conserved cysteine residue. In this study, the three-dimensional structure of the rhodanese domain of YgaP from Escherichia coli was determined using solution NMR. A typical rhodanese domain fold was observed, as expected from the high homology with the catalytic domain of other sulfur transferases. The initial sulfur-transfer step and formation of the rhodanese persulfide intermediate were …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Botulinum neurotoxin type A (BoNT/A) is the potent disease agent in botulism, a potential biological weapon and an effective therapeutic drug for involuntary muscle disorders. The crystal structure of the entire 1,285 amino acid di-chain neurotoxin was determined at 3.3 A resolution. The structure reveals that the translocation domain contains a central pair of alpha-helices 105 A long and a approximately 50 residue loop or belt that wraps around the catalytic domain. This belt partially occludes a large channel leading to a buried, negative active site--a feature that calls for radically diff…
СтатьяПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования