Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) is a vital molecular technique for biomarker detection; however, its clinical application is i … ns limited. Liquid biopsy biomarkers, including microRNA (miRNA), circulating free DNA (cfDNA), and circulating tumor DNA (ctDNA), are increasingly being explored. The integration of bioinformatics, omics analysis, and high-throughput technologies with qPCR is accelerating biomarker discovery. Furthermore, large-scale parallel sequencing is emerging as a potential alte …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Human papilloma virus positive (HPV+) OPSCC has a favorable prognosis compared to its HPV- carcinomas but a significant proportion of patients will experience disease recurrence and death. Enhancement of surveillance strategies after treatment for primary HPV + OPSCC is of great importance.
AREAS COVERED: The aim of this paper is to provide an updated synthesis of the current state of evidence on the surveillance of HPV+ OPSCC and provide guidance on future directions on this topic. Basic and clinical research efforts are directed on various aspects of surveillance, including bu
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Circulating cell-free DNA (cfDNA) has the potential to capture spatial genetic heterogeneity in myeloma (MM) patients. We assessed whether c … PFS (hazard ratio 6.4; 95% CI of ratio 1.9-22) and OS (hazard ratio 4.4; 95% CI of ratio 1.2-15.7). Circulating tumor DNA (ctDNA) was elevated in the HR group and ctDNA correlated strongly with GEP70 risk score (Spearman r = .69, P = .0027). cfDNA concentrations were significantly elevated between days 3-5 after chemotherapy before falling back to baseline levels. ctDN …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Up to now, the field of liquid biopsies has focused on circulating tumour DNA and cells, though extracellular vesicles (EVs) have been of increasing interest in recent years. Thus, reported sources of tumour-derived nucleic acids include leukocytes, platelets and apoptotic bodies (AB), as well as large (LEV) and small (SEV) EVs. Despite these competing claims, there has yet to be a standardized comparison of the tumour-derived DNA associated with different components of blood. To address this issue, we collected twenty-three blood samples from seventeen patients with pancreatic cancers of know
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Appendiceal cancer (AC) is a rare malignancy that often presents at advanced stages with significant histological variability in … d oncologic outcome including disease-specific (DSS) and progression-free (PFS) survival.
RESULTS: Circulating tumor DNA (ctDNA) from plasma cell-free DNA demonstrated high concordance with tumor genomic profiling, reaching 98.4% concordance [median, interquartile range (IQR) 13.5, 21.5] overall and 85.7% (IQR 64.6, 100) for therapeutically actionable level 1 mutation …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many studies have reported an increase in the level of circulating cell-free DNA (cfDNA) in the blood of patients with cancer. cfDNA mainly comes from tumor cells and, therefore, carries features of its genomic profile. Moreover, tumor-derived cfDNA can act like oncoviruses, entering the cells of vulnerable organs, transforming them and forming metastatic nodes. Another source of cfDNA is immune cells, including neutrophils that generate neutrophil extracellular traps (NETs). Despite the potential eliminative effect of NETs on tumors, in some cases, their excessive generation provokes tumor gr
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Circulating tumor DNA (ctDNA) has emerged as a clinically valuable biomarker for cancer detection, treatment monitoring, and minimal residual disease assessment. Despite its growing clinical utility, the biological mechanisms governing ctDNA release remain incompletely understood. The objective of this study was to investigate how chemotherapy-induced cytotoxicity and chemoresistance influence the kinetics and fragmentation patterns of cfDNA released by cancer cells in vitro.
METHODS: Human lung adenocarcinoma (A549) and esophageal adenocarcinoma (FLO-1, OE19) cell lines were used…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
As a kind of cell-free DNA in the bloodstream liberated from tumor cells, circulating tumor DNAs (ctDNAs) have been recognized as promising biomarkers in the field of early cancer diagnosis. However, robust, sensitive, and accurate detection of ctDNA in serum remains extremely challenging, especially toward the mutant KRAS gene, one of the most frequently mutated genes. Although DNA oligonucleotides as emerging practical signaling materials have been developed as sensitive and accurate tools, some intrinsic defects need to be overcome, such as fragility in complex biological environments. In t…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Supernatant pleural effusions (PE) have shown to be a valuable source for the detection of driver mutations in circulating tumor DNA (ctDNA). In this prospective study, the clinical value of ctDNA analysis in supernatant PE to support therapy selection and disease monitoring in lung cancer patients is assessed. Paired PE and plasma samples were collected from lung cancer patients before initiation of therapy (N = 2) and from EGFR positive patients during therapy (N = 3). Supernatant PE and plasma were tested for mutations in EGFR, KRAS and BRAF by droplet digital PCR. In PE of two patients wit…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neutrophil extracellular traps (NETs) are chromatin-protein complexes released by neutrophils that have dual roles in the tumor microenvironment (TME), participating in anti-tumor immunity and driving malignant progression by promoting tumor proliferation, metastasis, and immune escape. Radiotherapy (RT) exerts anticancer effects by inducing DNA damage and microenvironmental remodeling, but the inflammatory response it triggers can activate the formation of NETs, which exacerbate radioresistance by degrading the extracellular matrix, encapsulating circulating tumor cells, inhibiting CD8+ T-cel
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: LUME-Colon 1 (NCT02149108) was a global, placebo-controlled phase III study of nintedanib in advanced colorectal cancer (CRC). Pre-specified biomarker analyses investigated the association of CRC consensus molecular subtypes (CMS) and tumor genomic and circulating biomarkers with clinical outcomes.
MATERIALS AND METHODS: Archival tumor tissue, cell-free DNA (cfDNA), and plasma samples were collected for genomic, transcriptomic, and proteomic analyses to investigate potential associations between CRC CMS and other biomarkers with nintedanib response and clinical outcomes.
RESULT
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene expression is a defining determinant of tumor identity, behavior, and therapeutic response, yet remains challenging to measure noninvasively. Here, we introduce APEX (Associating Plasma Epigenomic features with eXpression), a framework for inferring expression from circulating cell-free chromatin. Trained on ~270,000 gene-sample pairs from matched tumor RNA-seq and plasma cfChIP-seq across multiple cancers and validated on >15 unseen cancer subtypes, APEX accurately infers cancer gene expression across a range of tumor fractions and outperforms existing plasma-based approaches by integrat
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liquid biopsy, an innovative method for early diagnosis of cancer, has changed the traditional method of diagnosing lung cancer and is considered a feasible auxiliary diagnostic tool. To date, various reports emphasize the need for non-small cell lung carcinoma (NSCLC), both with higher incidence and mortality and less effective treatments; thus, emphasizing the need for early detection of NSCLC for improved patient outcomes. Invasive tissue biopsy is a common diagnostic tool that is usually extracted from the primary tumor to indicate molecular composition. In comparison, liquid biopsy taken
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although multi-hit TP53 mutations correlate with rapid disease progression, treatment resistance, recurrence, and poor survival, their occurrence within an individual TP53 gene molecule (cbTP53) remains unexplored. Consequently, the impact of cbTP53 on protein conformation, transcriptional architecture, and oncogenicity is unknown. We show that cbTP53 with combined mutations (Y220C+R248Q+R282Q) does not drastically alter local stability or structural conformation, but significantly affects TP53 binding to DNA promoters comparing it to a single Y220C mutation. Functionally, cbTP53 promotes dive
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Although trimodal therapy is currently the standard organ-sparing approach for muscle-invasive bladder cancer (MIBC), its clinical … with biopsies, and urine cytology. In parallel, we performed longitudinal liquid biopsy analyses of circulating tumor DNA (ctDNA) and urinary tumor DNA (utDNA) using PredicineCARE assay.
RESULTS: The combination was overall tolerable, with no grade 4 treatment-related adverse events or deaths. Five patients (83.3 %) achieved a complete response and remained recurrence …
СтатьяКлиническое исследование II фазыПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: To investigate the genetic alterations of patients with prostate cancer (PCa) with and without intraductal carcinoma of the prostate (IDC-P).
PATIENTS AND METHODS: We performed targeted sequencing of plasma cell-free DNA on 161 patients with prostate adenocarcinoma (PAC) with IDC-P and 84 without IDC-P. Genomic alterations were compared between these two groups. The association between genetic alterations and patients' survival outcomes was also explored.
RESULTS: We identified that 29.8% (48/161) and 21.4% (18/84) of patients with and without IDC-P harboured genomic alterations
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer screening has been at the forefront of the war against cancer for decades. Yet professional organizations such as the U.S. Preventive Services Task Force (USPSTF) recommend cancer screening for only a handful of cancers (cervical, lung, colon, breast, prostate). Screening for other serious cancers (ovarian, pancreatic, etc.) is not recommended, at least for individuals with low/moderate risk. The discovery of circulating tumor DNA (ctDNA) as a non-invasive biomarker for diverse cancers prompted many companies to develop screening tests for one or more cancer types. Particularly, one tes…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE OF REVIEW: Malignant pleural effusion (MPE) is a common complication of advanced lung cancer and often represents the first sign of … ing.
RECENT FINDINGS: Recent studies highlight the diagnostic and molecular profiling potential of circulating tumor DNA (ctDNA), microRNAs, proteins, and metabolites detectable in pleural fluid. Advances in next-generation sequencing and liquid biopsy technologies have enabled noninvasive detection of actionable mutations (EGFR, ALK, KRAS, PD-L1), enhancing molecular …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Longitudinal plasma cell-free DNA profiling from the phase 3 Alliance A031201 trial revealed divergent resistance trajectories in metastatic castration-resistant prostate cancer. Rapid progressors harbored non-androgen receptor (AR) alterations suggesting intrinsic resistance, whereas delayed progressors showed progressive AR amplifications, structural rearrangements, and extrachromosomal DNA-associated evolution. These findings support biomarker-guided strategies targeting AR-dependent and AR-independent disease states. See related article by Valentín López et al., p. 2413.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования