OBJECTIVE: To investigate the prevalence of Cryptosporidium infection and the distribution of parasite species and genotypes among HIV-positive individuals in Jiangxi Province.
METHODS: HIV-positive individuals' sociodemographic and clinical data were collected from three AIDS designated hospitals in Jiangxi Province from January 2022 to March 2023. Subjects' stool samples were collected, and genomic DNA was extracted from stool samples. Nested PCR assay was performed based on the small subunit ribosomal RNA (SSU rRNA) gene of Cryptosporidium, and Cryptosporidium gp60 gene was amplified in st
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple copies of a gene may lead to difficulty in the interpretation of typing results because polymorphism of the copies may wrongly lead to the conclusion that different types are present in a specimen. To determine the copy number per genome of the nuclear rDNA and beta-tubulin genes analyzed for the typing of Pneumocystis carinii f. sp. hominis, we developed a strategy based on the use of the same multicompetitor molecule in two different quantitative-competitive PCRs, one for the gene under study and the other for a reference single copy gene, allowing direct comparison of the results o
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ureaplasma diversum has been associated with different clinical manifestations including bovine vulvitis, endometritis, salpingitis, spontaneous abortion and infertility. Because the isolation of this ureaplasma from clinical samples is difficult, there is a need for improved detection methods. We developed a PCR assay based on amplification of a region of the gene encoding 16S rRNA. The specificity of the amplification was verified by sequence analysis. Female bovine vaginal swabs (n=168) were collected and the presence of U. diversum evaluated by both culture methods and by the PCR assay. Cu
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To delineate the genomic and cellular features of CCNE1 amplification across gynecologic cancer types using large-scale multi-omics data and assess its relevance for patient stratification and therapeutic targeting. METHODS: We analyzed genomic and transcriptomic data from 12,845 patients with gynecological cancers curated from the cBioPortal database, including ovarian, endometrial, and cervical carcinomas. CCNE1 amplification rates, cooccurring genomic alterations, and pathway enrichment were evaluated. Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptomic data from cerv
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acquired chromosomal aberrations, including gene copy number alterations, are involved in the development and progression of human malignancies. SOX2, a transcription factor-coding gene located at 3q26.33, is known to be recurrently and specifically amplified in squamous cell carcinomas of the lung, the esophagus, and the oral cavity. In these organs, the SOX2 protein plays an important role in tumorigenesis and tumor survival. The aim of this study was to determine whether SOX2 amplification is also found in squamous cell carcinomas in other organs commonly affected by this tumor entity. In a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia pneumoniae has been associated with chronic conditions such as atherosclerosis and coronary heart disease but the precise role of this intracellular bacteria in the pathogenesis of these diseases is not well defined. Several techniques have been developed for detection of C. pneumoniae in atheromatous lesions, however it remains unclear whether persistent forms of the organism and/or actively replicating bacteria contribute to associated pathology. The aim of this study was to utilize nucleic acid sequence based amplification (NASBA) technology together with a highly sensitive aequor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Long-tailed and pig-tailed macaque monkeys are natural hosts of Plasmodium knowlesi, which has been identified as a fifth malaria parasite infecting humans. In this study, we investigated possible infection by this Plasmodium parasite in macaque monkeys using a combination of polymerase chain reaction amplification and sequencing.
METHODS: Forty-five blood samples were obtained in 2010 from macaques in northern Myanmar near Yunnan Province of China and investigated for possible infection with Plasmodium species using a nested polymerase chain reaction method for amplification of 1
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Specific amplification of a DNA segment of the human ZFY gene by polymerase chain reaction (PCR) was carried out for detection of Y-chromosome specific sequences. When male DNA was used as template for amplification, a single and discrete 530 bp ethidium bromide staining band was observed in agarose gel. Female DNA produced no band. This technique was successfully used in prenatal sexing and for detecting ZFY DNA sequences in five XX males, an XY female, and a female patient with Turner syndrome having mosaicism involving a minute marker chromosome.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics (ST) has emerged as a powerful approach for profiling gene expression in spatial tissue context; yet, its quantitative accuracy remains substantially compromised by amplification bias introduced during the complex library preparation process. These biases arise at multiple stages and accumulate throughout the experimental workflow, distorting transcript abundance, reducing detection sensitivity, and ultimately confounding downstream spatial analyses. This review systematically analyzes amplification bias in ST. We examine how input templates, oligonucleotide components
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High-level MET gene amplification is a rare but potentially actionable alteration in gastric cancer. Previous phase III trials of MET-targeted therapies enrolled broadly MET-positive populations without prospective selection for high-level MET amplification, and no MET-directed therapy is currently established for this disease. Here, we report a 74-year-old woman with heavily pretreated metastatic gastric adenocarcinoma harboring high-level MET amplification (copy number 21) identified by comprehensive genomic profiling. Following expert panel review, the patient received capmatinib through th…
СтатьяКлинический случайОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
"Burkitt-like lymphoma with 11q aberration" is a new provisional entity in the latest revision of lymphoma's World Health Organization classification described as carrying the specific 11q-gain/loss aberration and lacking MYC rearrangement. Morphologically, phenotypically and by gene and microRNA expression profiling these lymphomas resemble Burkitt lymphoma. The 11q-gain/loss was also found in post-transplant patients with molecular Burkitt lymphoma signature without MYC rearrangement. Recent reports describe aggressive lymphomas with coexistence of 11q-gain/loss and MYC rearrangement. In thi
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of this study was to develop polymerase chain reaction (PCR) assays for detection of Baylisascaris procyonis eggs and larvae in fecal, environmental, and tissue samples. We have optimized conventional and real-time PCR assays for B. procyonis using the mitochondrial cytochrome oxidase 2 gene as the target for amplification. The lower limit of detection of the parasite genomic DNA was 10 pg in the conventional PCR and 100 fg in the real-time PCR. In both PCR assays, specific amplification of a 146 bp product was achieved with DNA extracted from a single in vitro hatched B. procyon
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The key role of p53 and Rb alterations in human osteosarcoma is clear. For example, osteosarcoma is common in individuals inheriting mutant p53 or Rb genes. Osteosarcoma in dogs is similar to humans by histology, site, gender ratio and several other biological parameters. To study whether this similarity extends to the molecular level, 21 canine osteosarcomas were analyzed for alterations of p53, Rb and MDM2. MDM2 is a normal cell protein which antagonizes p53, amplification is seen in some human sarcomas. The gross structure of the p53, Rb and MDM2 genes was examined by Southern blotting. No
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-nucleotide mutations (SNMs) in the bacterial genome may cause antibiotic resistance. The visualization of SNMs can indicate antibiotic resistance phenotypes at the single-cell level but remains challenging. Herein, we proposed an in situ allele-specific isothermal amplification proceeded inside cells, allowing us to image bacterial genes with single-nucleotide resolution. The primer for loop-mediated isothermal amplification (LAMP) was designed with artificial mismatch bases to serve as an allele-specific probe, endowing LAMP to specifically amplify genes with SNMs. Due to the high ampl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To develop a new method to detect and type adenoviruses directly from conjunctival scrapings using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) with adenovirus (ad) type specific primer.
METHODS: Using primers specific for the gene of ad1, ad3, ad4, ad8, ad19 and ad37, heat denatured adenovirus DNA was amplified by the LAMP and polymerase chain reaction (PCR). Alkaline lysed adenovirus prototype and conjunctival scrapings were also used directly as templates.
RESULTS: Type specific primers amplified ad genes of the corresponding ad prototype specifically. The specific amplification
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Theileria orientalis, the causative agent of oriental theileriosis is a globally distributed protozoan parasite affecting livestock. Rapid and accurate parasite detection is crucial for effective disease management and evaluating therapeutic interventions. The high prevalence of T. orientalis in Kerala, a south Indian state demanded the development of a sensitive field tool for specific detection. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a rapid and highly sensitive nucleic acid amplification technique conducted under isothermal conditions. In this study, a LAMP assay was developed tar
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is a major public health problem and one of leading cancer related death all over the world. One of the prognostic parameters that play a role in different types of cancer is HER2. However, the role of HER2 in CRC and its relation with clinicopathological features and survival is conflicting. We hypothesize that HER2 has different patterns of expression in CRC which may affect the prognosis of patients.
MATERIAL & METHODS: We studied sixty specimens of colorectal carcinoma for HER2 immunohistochemistry and gene amplification and correlate it with clinicopat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given the Ebola outbreak in West Africa and the risks of spread to other regions, a rapid, sensitive and simple method for the detection of the Ebola virus (EBOV) is of great significance for the prevention and control of Ebola. We developed a simple colorimetric isothermal multiple self-matching initiated amplification (IMSA) for rapid detection of the Zaire subtype of the Ebola virus (EBOV-Z). This method employed six primers that recognized seven sites of the EBOV-Z nucleoprotein gene for amplification of nucleic acids under isothermal conditions at 63 degrees C for 1 h. Amplification produ
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Coxsackie B viruses (genus, Enterovirus; family, Picornaviridae) can cause aseptic meningitis, encephalitis, pleurodynia, and fa … e reagents in a single tube with reverse transcriptase and Bst DNA polymerase at 63°C. Detection of gene amplification could be accomplished by agarose gel electrophoresis and the monitoring of gene amplification can also be visualised with the naked eye by using SYBR green I fluorescent dye.
RESULTS: A total of 40 samples comprising 31 positive samples and 9 negat …
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective of the present study was to evaluate the correlation between HER-2 gene amplification and HER-2 protein overexpression in endometrial carcinoma using fluorescence in situ hybridization (FISH) and immunohistochemistry (IHC). We also analyzed chromosome 17 aneusomy and the association between these biological parameters and conventional clinicopathological variables. FISH analysis was performed on 73 selected paraffin-embedded sections from endometrial carcinomas which previously had HER-2 status determined immunohistochemically using monoclonal antibodies (MoAb) 300G9 and CB11. Us…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования