A-type lamins provide a scaffold for tethering chromatin and protein complexes regulating nuclear structure and function. Interest in lamins increased after mutations in the LMNA gene were found to be associated with a variety of human disorders termed laminopathies. These include muscular dystrophy, cardiomyopathy, lipodystrophy, peripheral neuropathy and premature aging syndromes such as progeria. In addition, altered expression of A-type lamins is emerging as a contributing factor to tumorigenesis. How different alterations in a gene that is ubiquitously expressed can cause such an array of
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoplasmas evolved by a drastic reduction in genome size, but their genomes contain numerous repeated sequences with important roles in their evolution. We have established a bioinformatic strategy to detect the major recombination hot-spots in the genomes of Mycoplasma pneumoniae, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma urealyticum and Mycoplasma pulmonis. This allowed the identification of large numbers of potentially variable regions, as well as a comparison of the relative recombination potentials of different genomic regions. Different trends are perceptible among mycoplasmas, probably due to
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our recent studies have shown that regulation of uterine oxytocin (OT) binding involves at least two different mechanism: Estradiol (E2)-induced upregulation is accompanied by an increase in OT receptor (OTR) mRNA accumulation, implying that the E2 effect is mediated via increased OTR gene transcription and/or OTR mRNA stabilization. In contrast, P (P)-induced OTR down-regulation occurs via a novel non-genomic mechanism, involving a direct interaction of P with the OTR at the level of the cell membrane. We found that P specifically binds to the OTR and inhibits its ligand binding and signallin
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome projects have been established for 7 major groups of human parasitic infections: malaria, leishmaniasis, African trypanosomiasis, American trypanosomiasis, toxoplasmosis, schistosomiasis and filariasis. All except malaria and toxoplasmosis have come under the umbrella of the World Health Organization's Strategic Committee on Parasite Genome Analysis. The focus of this meeting of the Society was to review progress made in the Leishmania and African trypanosome genome projects. This paper introduces the genome projects and reviews briefly progress in pulsed-field gel karyotype mapping and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Chlamydia contains important obligate intracellular bacterial pathogens to humans and animals, including C. trachomatis and C. pneumoniae. Since 1998, when the first Chlamydia genome was published, our understanding of how these microbes interact, evolved and adapted to different intracellular host environments has been transformed due to the expansion of chlamydial genomes. This review explores the current state of knowledge in Chlamydia genomics and how whole genome sequencing has revolutionised our understanding of Chlamydia virulence, evolution, and phylogeny over the past two an…
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Elephants, the largest terrestrial mammals, have distinctive metabolic features that may explain their increased sensitivity to xenobiotics, including environmental pollutants and pharmaceuticals. While previous in silico studies have identified unique patterns in elephant cytochrome P450 (CYP), Phase I xenobiotic-metabolizing enzymes, much less is known about their Phase II enzyme systems. This study combines comparative genomic, phylogenetic, and transcriptomic analyses to thoroughly examine Phase I and Phase II xenobiotic-metabolizing enzymes in African (Loxodonta africana) and Asian elepha
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyclamen is an economically important ornamental plant widely cultivated for its diverse floral characteristics and adaptation to cool climates. Despite its horticultural significance, genomic resources for this species remain limited, hindering molecular studies and genomics-assisted breeding. Here, we report the first highly contiguous nuclear genome assembly of C. persicum generated using high-fidelity long-read sequencing. The assembled genome spans 1.48 Gb, consisting of 126 contigs with an N50 length of 52.3 Mb. Telomeric repeat analysis identified 8 contigs containing telomeric sequence…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precision oncology has expanded rapidly across the Asia-Pacific region, yet implementation remains heterogeneous because of differences in health-system organisation, reimbursement, molecular tumour board infrastructure, workforce capacity, and data integration. This structured narrative review with expert consultation compares precision oncology ecosystems in Japan, South Korea, China, and Australia to identify common challenges and implementation strategies across the patient pathway. Although each country has established distinctive genomic medicine programmes, major disparities persist in
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Multidrug-resistant (MDR) Klebsiella pneumoniae high-risk clones that produce carbapenemases and extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) are a major public health threat, limiting treatment options. This study aimed to determine the prevalence, clonal diversity, and molecular characteristics of MDR carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae (CPKP) and ESBL-producing Klebsiella pneumoniae isolates from community hospitals in Pretoria, South Africa.
METHODS: Whole genome sequencing and polymerase chain reaction assays were used to characterize sequence types, resistance genes, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Photobacterium damselae subsp. damselae (PDD), a halophilic, Gram-negative bacterium of the family Vibrionaceae, infects a wide range of aquatic organisms. PDD isolates originating from fish have been characterized in detail, but much less is known about those infecting invertebrates. Currently, only 3 complete PDD genomes isolated from Kuruma shrimp Penaeus (Marsupenaeus) japonicus from Japan are publicly available, severely limiting comparative studies of host adaptation. To address this, we present complete, plasmid-resolved genome assemblies of 4 novel PDD strains (TUMSAT-PD1, -PD2, -PD3,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitrogen acquisition and assimilation determine nitrogen availability for algal growth and metabolism; however, their gene-family organization across chlorophytes remains poorly resolved. We examined 10 gene families (NiR, NR, NRT, AMT, GS, GOGAT, GDH, ASN, CPS-L, and CPS-S) in 30 chlorophyte genome assemblies using family-specific sequence-based curation. The assemblies represented 26 biological species after taxonomic standardization and pseudoreplication control. One representative assembly per species defined the primary dataset (D1; n = 26), with BUSCO C ≥ 80% (D2; n = 22) and C ≥ 90% (D3
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To streamline the application of sequence-based DL methods in single-cell genomics, we established a two-layer CNN as our baseline model. We focus our benchmark on how data characteristics, hyperparameter optimization, and advanced model architectures impact performance across sequence-to-expression and sequence-to-regulation tasks. A key contribution of our study is the exploration of multi-task learning (MTL) frameworks for mitigate technical sparsity. We demonstrated that MTL significantly enhances the modeling of cellular heterogeneity, evaluating the effectiveness of task grouping and bal…
Письмо в редакциюПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glyoxalase 1 (Glo1) detoxifies reactive dicarbonyl compounds such as methylglyoxal, a precursor of advanced glycation end products (AGEs), w … ges independent of advanced glycation end products (AGEs). Transcriptomic profiling and integrative genomics identified female-biased transcription factors and genome-wide association study (GWAS)-linked metabolic genes as key mediators. These findings uncover novel, AGE-independent regulatory pathways linking Glo1 to metabolic disease risk and emphasize t …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leaf rust, caused by Puccinia hordei, is a major barley disease worldwide. Despite repeated shifts in virulence, contrasting reproductive histories, and emerging fungicide insensitivity, the genomic basis of its diversification and adaptation remains poorly understood. In this study, we generated haplotype-resolved, chromosome-level genome assemblies for two isolates with contrasting virulence and analyzed 41 Australian isolates collected over 54 yr (1966-2020), integrating comparative and population genomics, mating-type gene phylogenies, chromosome-specific k-mer profiling, genome-wide copy-…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer functional genomics enables high-throughput target discovery and mechanistic investigation, yet its application has remained largely confined to mouse models and established human cancer cell lines. Direct functional interrogation of heterogeneous primary tumors offers a powerful opportunity to evaluate therapeutic targets and uncover cancer dependencies or resistance mechanisms. Here, we developed an optimized CRISPR-based platform for functional genomics in patient-derived xenograft and primary acute myeloid leukemia (AML) samples harboring diverse pathogenic mutations. Integrated in …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Talaromyces is an important source of structurally diverse secondary metabolites, yet the conservation and diversification of its biosynthetic potential remain incompletely understood at the genus level. Here, we performed comparative genomic and biosynthetic analyses of 24 Talaromyces species to characterize biosynthetic gene cluster (BGC) diversity, gene cluster family (GCF) distribution, and potential relevance to antifungal natural-product discovery. Genome mining identified 1550 BGCs, ranging from 41 to 81 per species, with polyketide synthase (PKS), nonribosomal peptide synthet
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid expansion of metagenomic sequencing has generated vast repositories of viral sequence data that far outpace our capacity to interp … potential, and efforts toward forecasting emerging variants. These advances are transforming viral genomics from a largely descriptive discipline into one with increasing predictive capability. We also critically assess the major challenges that constrain current approaches, including the availability of high-quality and representative datasets, rigorous …
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Omics research is changing the way medicine develops new strategies for diagnosis, prevention, and treatment. With the surge of advanced machine learning models tailored for omicss analysis, recent research has shown improved results and pushed the progress towards personalized medicine. The dissection of multiple layers of genetic information has provided new insights into precision medicine, at the same time raising issues related to data abundance. Studies focusing on single-cell scale have upgraded the knowledge about gene expression, revealing the heterogeneity that governs the functionin
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many useful quantities in conservation genomics are point estimates that summarise genetic variation at the population or species level. This presents a challenge to the application of null hypothesis testing frameworks, which require some measure of uncertainty to test the authenticity of measured group differences. The jackknife is a convenient statistical resampling tool which sees regular use to this end: producing confidence intervals for point estimates. Unfortunately, the slightly obscure nature of the jackknife coupled with its superficial resemblance to the bootstrap has led to its mi…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inositol monophosphatase (IMP) is a key enzyme in the inositol signaling pathway and ascorbic acid (AsA) biosynthesis, playing crucial roles in plant growth, development, and abiotic stress responses. Sorghum (S. bicolor) is an important cereal crop with remarkable drought and salinity tolerance, yet a systematic analysis of the IMP gene family in sorghum has been lacking. In this study, we identified eight IMP genes (SbIMP-1-SbIMP-8) in the sorghum genome. Phylogenetic analysis classified them into six subfamilies, consistent with rice and maize, suggesting a common ancestral origin. Gene str
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования