UNLABELLED: In living systems the most frequent type of genetic mutation is the single nucleotide polymorphism (SNP). Non-synonymous SNPs (nsSNPs) or missense mutations arise in coding regions of a particular gene. nsSNPs result in a single amino acid substitution which may have effects on the structure and/or function of proteins. Spermatogenesis is a complex process where haploid spermatozoa are formed. The deleted in azoospermia like (DAZL) gene has a relationship with male infertility and dysfunction of DAZL may decrease the sperm count which leads to oligozoospermia or azoospermia. Variou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although the lifestyles and infection strategies of plant pathogens are diverse, a prevailing feature is the use of an arsenal of secreted proteins, known as effectors, which aid in microbial infection. In the case of eukaryotic filamentous pathogens, such as fungi and oomycetes, effector proteins are typically dissimilar, at the protein sequence level, to known protein families and functional domains. Consequently, we currently have a limited understanding of how fungal and oomycete effectors promote disease. Protein biochemistry and structural biology are two methods that can contribute grea
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many of the cellular abnormalities present in solid tumors are structural in nature and involve the proteins of the extracellular matrix (ECM). Periostin is a protein produced and secreted by the fibroblasts as a component of the ECM where it is involved in regulating intercellular adhesion. The expression of periostin has an important physiological role during embryogenesis and growth, namely at the level of bone, dental, and cardiac tissues. Many studies indicate that periostin plays an important role for tumor progression in various types of cancer, such as colon, lung, head and neck, breas
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Gram-negative bacterium Legionella pneumophila is the causative agent of Legionnaires' disease. During infection of eukaryotic cells, the bacterium releases about 300 different bacterial effector molecules that aid in the establishment of the Legionella-containing vacuole (LCV) among which SidC is one of these secreted proteins. However, apart from membrane lipid binding the function of SidC remains elusive. In order to characterize SidC further, we have determined the crystal structure of the N-terminal domain of SidC (amino acids 1-609, referred to as SidC-N) at 2.4Å resolution. SidC-N r
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hemostatic function of von Willebrand factor is downregulated by the metalloprotease ADAMTS13, which cleaves at a unique site normally buried in the A2 domain. Exposure of the proteolytic site is induced in the wild-type by shear stress as von Willebrand factor circulates in blood. Mutations in the A2 domain, which increase its susceptibility to cleavage, cause type 2A von Willebrand disease. In this study, molecular dynamics simulations suggest that the A2 domain unfolds under tensile force progressively through a series of steps. The simulation results also indicated that three type 2A m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This work reports the successful recombinant expression of human statherin in Escherichia coli, its purification and in vitro phosphorylation. Human statherin is a 43-residue peptide, secreted by parotid and submandibular glands and phosphorylated on serine 2 and 3. The codon-optimized statherin gene was synthesized and cloned into commercial pTYB11 plasmid to allow expression of statherin as a fusion protein with intein containing a chitin-binding domain. The plasmid was transformed into E. coli strains and cultured in Luria-Bertani medium, which gave productivity of soluble statherin fusion
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A form of autosomal dominant juvenile myoclonic epilepsy is caused by a nonconservative missense mutation, A322D, in the GABAA receptor alpha1 subunit M3 transmembrane helix. We reported previously that the A322D mutation reduced total and surface alpha1(A322D) subunit protein and that residual alpha1(A322D) subunit resided in the endoplasmic reticulum. Here, we demonstrate that the reduction in alpha1(A322D) expression results from rapid endoplasmic reticulum-associated degradation of the alpha1(A322D) subunit through the ubiquitin-proteasome system. We provide direct evidence that the alpha1
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phogrin/IA-2β and ICA512/IA-2 are two paralogs receptor-type protein-tyrosine phosphatases (RPTP) that localize in secretory granules of various neuroendocrine cells. In pancreatic islet β-cells, they participate in the regulation of insulin secretion, ensuring proper granulogenesis, and β-cell proliferation. The role of their cytoplasmic tail has been partially unveiled, while that of their luminal region remains unclear. To advance the understanding of its structure-function relationship, the X-ray structure of the mature ectodomain of phogrin (ME phogrin) at pH 7.4 and 4.6 has been solved a
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HIV cell entry and infection are driven by binding events to the CD4 and chemokine receptors with associated conformational change of the viral glycoprotein, gp120. Scyllatoxin miniprotein CD4 mimetics and a small molecule inhibitor of CD4 binding, NBD-556, also effectively induce gp120 conformational change. In this study we examine the fluctuation profile of gp120 in context of CD4, a miniprotein mimetic, and NBD-556 with the aim of understanding the effect of ligand binding on gp120 conformational dynamics. Analysis of molecular dynamics trajectories indicate that NBD-556 binding in the Phe
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our previous reports showed that cultured human cells secrete non-disulfide-bonded non-helical alpha1(IV) and alpha2(IV) chains under physiological conditions. In the present report we show that the alpha(IV) chains in non-helical form were reactive to lectin ABA (Agaricus bisporus agglutinin), whereas the alpha(IV) chains secreted in triple-helical form were not. These results indicate that ABA could be used to distinguish the two conformational isomers of type IV collagen polypeptides. An alpha1(IV) chain isolated from human placenta with an antibody-coupled column showed a positive reaction
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rme1p plays important roles in the control of meiosis and in cell cycle progression through binding to upstream regions of IME1 and CLN2 in Saccharomyces cerevisiae. Rme1p has three zinc finger segments, and two of them are atypical. To determine DNA binding domain of Rme1p, a series of Rme1p derivatives fused with maltose-binding protein were purified and characterized by gel mobility shift assay. We show that not only three zinc fingers, but also the neighboring C-terminal region is essential for DNA binding. Mutational analysis of this region revealed that basic residues Arg-287, Lys-290, a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To clarify the role of the lens capsule in cataract formation, changes in the protein conformational structure of immature cataractous lens capsules from patients with systemic hypertension or glaucoma have been investigated, as compared to normal lens capsules. The protein secondary structure and composition of these capsular samples were determined using Fourier transform infrared microspectroscopy with second-derivative, deconvolution and curve-fitting methods. We found that the composition of both random coil and beta-type (beta-sheet and beta-turn) structures in the immature cataractous h
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rifamycin antibiotic rifampin is important for the treatment of tuberculosis and infections caused by multidrug-resistant Staphylococcus aureus. Recent iterations of the rifampin core structure have resulted in new drugs and drug candidates for the treatment of a much broader range of infectious diseases. This expanded use of rifamycin antibiotics has the potential to select for increased resistance. One poorly characterized mechanism of resistance is through Arr enzymes that catalyze ADP-ribosylation of rifamycins. We find that genes encoding predicted Arr enzymes are widely distributed i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Iron-sulfur (Fe/S)-cluster-containing proteins constitute one of the largest protein classes, with varied functions that include electron transport, regulation of gene expression, substrate binding and activation, and radical generation. Consequently, the biosynthetic machinery for Fe/S clusters is evolutionarily conserved, and mutations in a variety of putative intermediate Fe/S cluster scaffold proteins can cause disease states, including multiple mitochondrial dysfunctions syndrome (MMDS), sideroblastic anemia, and mitochondrial encephalomyopathy. Herein, we have characterized the impact of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human apolipoprotein A-I (apoA-I)-derived amyloidosis can present with either wild-type (Wt) protein deposits in atherosclerotic plaques or as a hereditary form in which apoA-I variants deposit causing multiple organ failure. More than 15 single amino acid replacement amyloidogenic apoA-I variants have been described, but the molecular mechanisms involved in amyloid-associated pathology remain largely unknown. Here, we have investigated by fluorescence and biochemical approaches the stabilities and propensities to aggregate of two disease-associated apoA-I variants, apoA-IGly26Arg, associated
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vesicular stomatitis virus has an atypical membrane fusion glycoprotein (G) exhibiting a pH-dependent equilibrium between two forms at the virus surface. Membrane fusion is triggered during the transition from the high- to low-pH form. The structure of G in its low-pH form shows the classic hairpin conformation observed in all other fusion proteins in their postfusion conformation, in spite of a novel fold combining features of fusion proteins from classes I and II. The structure provides a framework for understanding the reversibility of the G conformational change. Unexpectedly, G is hom
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SC29EK is an electronically constrained α-helical peptide HIV-1 fusion inhibitor that is highly effective against both wild-type and enfuvirtide (T20)-resistant viruses. In this study, we focused on investigating the mechanism of HIV-1 resistance to SC29EK by two approaches. First, SC29EK-escaping HIV-1 variants were selected and characterized. Three mutant viruses, which possessed two (N43K/E49A) or three (Q39R/N43K/N126K and N43K/E49A/N126K) amino acid substitutions in the N- and C-terminal repeat regions of gp41 were identified as conferring high resistance to SC29EK and cross-resistance to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: As a molecular chaperone, acetylcholinesterase (AChE; EC 3.1.1.7) plays a critical role in the pathogenesis of Alzheimer's disease (AD). The peripheral anionic site (PAS) of AChE has been indicated as the amyloid-β (Aβ) binding domain. The goal of this study was to determine other motifs in AChE involved in Aβ aggregation and deposition.
METHODS AND RESULTS: The β-hairpin in monomeric Aβ is the key motif of nucleation-dependent Aβ self-aggregation. As AChE could induce Aβ aggregation and deposition, we searched AChE for β-hairpin structures. In A11-specific dot blot as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neuromyelitis optica (NMO) is an autoimmune demyelinating disease characterized by the presence of anti-aquaporin-4 (AQP4) antibodies in the patient sera. We recently reported that these autoantibodies are able to bind AQP4 when organized in the supramolecular structure called the orthogonal array of particles (OAP). To map the antigenic determinants, we produced a series of AQP4 mutants based on multiple alignment sequence analysis between AQP4 and other OAP-forming AQPs. Mutations were introduced in the three extracellular loops (A, C, and E), and the binding capacity of NMO sera was tested
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The putative function of the Parkinson's disease-related protein alpha-Synuclein (alphaS) is thought to involve membrane binding. Therefore, the interaction of alphaS with membranes composed of zwitterionic (POPC) and anionic (POPG) lipids was investigated through the mobility of spin labels attached to the protein. Differently labelled variants of alphaS were produced, containing a spin label at positions 9, 18 (both helix 1), 69, 90 (both helix 2), and 140 (C terminus). Protein binding to POPC/POPG vesicles for all but alphaS140 resulted in two mobility components with correlation times of 0
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования