BACKGROUND: Proteomic phenotyping can provide insights into rejection pathophysiology, novel biomarkers, and therapeutic targets.
METHODS: Within the prospective, multicenter Genomic Research Alliance for Transplantation study, 181 proteins were evaluated from blood drawn at the time of endomyocardial biopsy; protein fold change, logistic regression, and pathway analyses were conducted, with protein discovery adjusted for a 5% false discovery rate.
RESULTS: Among 104 adult heart transplant patients (31% female sex, 53% Black race, median age 52 y), 74 had no rejection, 18 developed acute cel
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lysine deacetylase inhibitors (KDACis) are approved drugs for cutaneous T cell lymphoma (CTCL), peripheral T cell lymphoma (PTCL), and multi … e molecular mechanisms underlying KDACi action in cells and can be interactively explored online in ProteomicsDB.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis caused by Schistosoma mekongi is one of the causative agents of human blood fluke infection in the lower Mekong River. Tradi … ore infection and at intervals of 1, 2, 4, and 8 weeks post-infection using mass spectrometry-based proteomics. Proteomics analysis revealed 13 up- and only one down-regulated mouse protein consistently found across all time points. Additionally, two S. mekongi uncharacterized proteins were detected throughout the infection period. Using a peptidomics approa …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmania infantum belongs to the L. donovani complex, which includes species associated with visceral leishmaniasis. Traditionally, antimonial compounds have served as the primary antiparasitic treatment for all clinical forms of leishmaniasis. However, the global spread of resistance to these compounds has posed a significant challenge in the treatment in some regions. In this study, we aimed to investigate resistance to trivalent sodium stibogluconate in vitro using promastigotes from a wild strain of L. infantum. We compared the growth rates and proteomic profiles of wild-type and resista
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometry has emerged as a mainstream technique for label-free proteomics. However, proteomic coverage for trace samples is constrained by adsorption loss during repeated elution at sample pretreatment. Here, we demonstrated superparamagnetic composite nanoparticles functionalized with molecular glues (MGs) to enrich proteins in trace human biofluid. We showed high protein binding (>95 %) and recovery (≈90 %) rates by anchor-nanoparticles. We further proposed a Streamlined Workflow based on Anchor-nanoparticles for Proteomics (SWAP) method that enabled unbiased protein capture, protein…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The bacterial pathogen Staphylococcus aureus harbors numerous virulence factors that impact infection severity. Beyond virulen … itro expression level of virulence factors can be correlated with infection severity using targeted proteomics, a method that may be adapted to other bacterial pathogens.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RATIONALE: Proteomics and metabolomics are widely used in the study of diabetes, but rarely in prediabetes research. This study aimed to explore the mechanisms of early-onset type 2 diabetes mellitus (T2DM) by analyzing proteomic changes at different stages of glucose metabolism.
METHODS: A total of 40 individuals undergoing routine physical health examinations between December 2016 and April 2017 were enrolled. Subjects were divided into four groups based on fasting blood glucose (FPG) levels: FPG < 5.6 mmol/L (group A); FPG ≥ 5.6 mmol/L and <6.1 mmol/L (group B); FPG ≥ 6.1 mmol/L and <7.0 m…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current demand for early intervention, prevention, and treatment of late onset Alzheimer's disease (LOAD) warrants deeper understanding of the underlying molecular processes which could contribute to biomarker and drug target discovery. Utilizing high-throughput proteomic measurements in serum from a prospective population-based cohort of older adults (n=5,294), we identified 303 unique proteins associated with incident LOAD (median follow-up 12.8 years). Over 40% of these proteins were associated with LOAD independently of APOE-ε4 carrier status. These proteins were implicated in neuronal
ПрепринтСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gamma coronavirus infectious bronchitis virus (IBV) is known to cause an acute and highly contagious infectious disease in poultry. Here, this study aimed to investigate the impact of virulent or avirulent IBV infection on the avian host by conducting proteomics with data-independent acquisition mass spectrometry (DIA-MS) in the kidneys of IBV-infected chickens. The results revealed 267, 489, and 510 differentially expressed proteins (DEPs) in the chicken kidneys at 3, 5, and 7 days postinfection (dpi), respectively, when infected with the GD17/04 strain, which is a highly nephrogenic stra…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) pathology develops many years before the onset of cognitive symptoms. Two pathological processes-aggregation of the amyloid-β (Aβ) peptide into plaques and the microtubule protein tau into neurofibrillary tangles (NFTs)-are hallmarks of the disease. However, other pathological brain processes are thought to be key disease mediators of Aβ plaque and NFT pathology. How these additional pathologies evolve over the course of the disease is currently unknown. Here we show that proteomic measurements in autosomal dominant AD cerebrospinal fluid (CSF) linked to brain protein
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mass spectrometry-based proteomics is a key player in research efforts to characterize aberrant epigenetic alterations, including histone post-translational modifications and DNA methylation. Data generated by this approach complements and enrich datasets generated by genomic, epigenetic and transcriptomics approaches. These combined datasets can provide much-needed information on various mechanisms responsible for drug resistance, the discovery and validation of potential biomarkers for different diseases, the identification of signaling pathways, and genes and enzymes to be targeted by futur…
Полный текст найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
One of the chief objectives in mass spectrometry-based peptide identification in proteomics is the statistical validation of top-scoring peptide-spectrum matches (PSMs) in the form of false discovery rate (FDR) estimation. Existing methods construct a null model that captures the characteristics of incorrect target PSMs to estimate the FDR, most often with the help of decoys. Decoy-based methods, however, increase the computational cost and rely on the difficult-to-verify assumption that decoy PSMs constitute a sufficient and representative sample of the population of possible incorrect target…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: COVID-19 remains a major public health challenge, requiring the development of tools to improve diagnosis and inform therapeutic decisions. As dysregulated inflammation and coagulation responses have been implicated in the pathophysiology of COVID-19 and sepsis, we studied their plasma proteome profiles to delineate similarities from specific features.
METHODS: We measured 276 plasma proteins involved in Inflammation, organ damage, immune response and coagulation in healthy controls, COVID-19 patients during acute and convalescence phase, and sepsis patients; the latter included (
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloidosis is a group of rare pathologies characterized by abnormal folding and deposition of susceptible proteins in tissues and organs. Diagnosis of amyloidosis often relies on immunohistochemistry of formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) patient samples; however, dependency on antibodies for protein staining is one of the major pitfalls of this approach, especially for the detection of rare amyloidosis types. In recent years, mass spectrometry-based proteomics has emerged as a promising alternative for adequate detection and amyloid typing, despite the fact that preparing FFPE samples fo…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-associated acute kidney injury (SA-AKI) is a severe and life-threatening condition with high morbidity and mortality among emergency patients, and it poses a significant risk of chronic renal failure. Clinical treatments for SA-AKI remain reactive and non-specific, lacking effective diagnostic biomarkers or treatment targets. In this study, we established an SA-AKI mouse model using lipopolysaccharide (LPS) and performed proteomics and metabolomics analyses. A variety of bioinformatic analyses, including gene set enrichment analysis (GSEA), weighted gene co-expression network analysis (…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metronidazole (MTZ) is a clinically important antimicrobial agent that is active against both bacterial and protozoan organisms. MTZ has been used extensively for more than 60 years and until now resistance has been rare. However, a recent and dramatic increase in the number of MTZ resistant bacteria and protozoa is of great concern since there are few alternative drugs with a similarly broad activity spectrum. To identify key factors and mechanisms underlying MTZ resistance, we utilized the protozoan parasite Giardia intestinalis, which is commonly treated with MTZ. We characterized two in vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES/HYPOTHESIS: Compare proteomic profiles of rabbit vocal folds (VFs) injected with micronized cross-linked jellyfish collagen "collagen Type 0" (MX-JC) against two clinical products for injection medialization laryngoplasty (IL).
STUDY DESIGN: Animal model.
METHODS: Left recurrent laryngeal nerve sectioning and IL were performed in New Zealand White rabbits (N = 6/group). Group 1 received (MX-JC) and adipose-derived stem cells (ADSCs), Group 2, MX-JC alone; Group 3, cross-linked hyaluronic acid; and Group 4, micronized acellular dermis. Animals were sacrificed at 4 and 12 weeks. Pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The imbalance in polyunsaturated fatty acid (PUFA) composition in human food is ubiquitous and closely related to obesity and cardiovascular diseases. The development of n-3 PUFA-enriched poultry products is of great significance for optimizing fatty acid composition. This study aimed to improve our understanding of the effects of dietary linseed oil on hepatic metabolism using untargeted metabolomics and 4D label-free proteome analysis. A total of 91 metabolites and 63 proteins showed differences in abundance in duck livers between the high linseed oil and control groups. Pathway analysis rev
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although phospholipase A2 group VI (PLA2G6) is involved in oncogenesis in several human tumors, its expression and role in cutaneous malignant melanoma (CMM) pathogenesis remains unclear. Here, by using the Oncomine and CCLE online database, immunohistochemistry, RT-qPCR, and western blotting analysis, we revealed that PLA2G6 was markedly up-regulated in CMM tissues compared to nevus tissues, as well as remarkably increased in vitro in SK-MEL-28 and M14 melanoma cell lines compared to human melanocytes. In vivo, PLA2G6 was also elevated in nine melanoma tissues compared to adjacent tissues. To
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования