BACKGROUND AND OBJECTIVES: The pro-inflammatory cytokine interleukin (IL)-1 has been suggested to play a role in atherosclerosis. Several genetic polymorphisms have been described in the genes of the IL-1 cluster and associations with coronary artery disease (CAD) have been reported, although with contrasting results.
DESIGN AND METHODS: The associations of a variable number tandem repeat (86 bp) polymorphism in intron 2 of interleukin-1 receptor antagonist (IL1-RA) and of the 511 C/T polymorphism of IL-1b with the risk of CAD were studied. Three hundred and thirty-five case (CAD+) patients w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In order to get insight in the formation of isochromosomes we analysed different supernumerary euchromatic short arm isochromosomes for the parent and cell stage of origin. After cytogenetic detection and confirmation by fluorescence-in-situ hybridization we performed short tandem repeat typing in a child with i(9p), three with i(12p) and three with i(18p). The extra chromosomes were monocentric in each case, the i(9p) and i(12p) constitutions were found in mosaic with normal cell lines. Our results and those of other groups indicate a strong role of maternal meiosis in isochromosome formation
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While rare, highly penetrant variants in APP, PSEN1 and PSEN2 are associated with early-onset Alzheimer's disease, especially its familial form, the disease in general is shaped by a complex interplay of various genetic factors. Both common and rare variants across numerous loci, which were identified mainly during large genome-wide association studies, contribute to disease risk, phenotypic heterogeneity and progression in both early- and late-onset forms. This review synthesizes current understanding of the genetic architecture of Alzheimer's disease in the era of next-generation sequencing,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tay-Sachs disease is a fatal neurodegenerative disorder caused by HEXA mutations inactivating the metabolic enzyme HexA. The most common mutation is c.1278insTATC, a tandem 4-bp duplication disrupting HEXA expression by frameshift. In an engineered cell model, we explore the use of CRISPR-Cas9 for therapeutic editing of c.1278insTATC. Within genomic microduplications, the microhomology-mediated end joining (MMEJ) pathway is favored to repair double-stranded breaks with collateral deletion of one repeat. Protospacer adjacent motif (PAM) constraints on Cas9 endonuclease activity prevented cleava
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Brucella abortus and B. melitensis have been reported in several studies in animals in Zimbabwe but the extent of the disease remains poorly known. Thus, characterizing the circulating strains is a critical first step in understanding brucellosis in the country. In this study we used an array of molecular assays including AMOS-PCR, Bruce-ladder, multiple locus variable number tandem repeats analysis (MLVA) and single nucleotide polymorphisms from whole genome sequencing (WGS-SNP) to characterize Brucella isolates to the species, biovar, and individual strain level. Sixteen Brucella strains iso
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In September 2017, a cluster of monophasic Salmonella Typhimurium isolates was identified at the National Reference Laboratory for Enteropathogenic Bacteria in Norway. We investigated the cluster to identify the source and implement control measures. We defined a case as a person with laboratory-confirmed salmonellosis with the outbreak strain multiple locus variable-number tandem repeat analysis type. We conducted descriptive epidemiological and environmental investigations and performed whole genome sequencing (WGS) with core and accessory genome multilocus sequence typing of all isolates fr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatic mutations are postzygotic mutations which may lead to mosaicism, the presence of cells with genetic differences in an organism. Their role in cancer is well established, but detailed investigation in health and other diseases has only been recently possible. This has been empowered by the improvements of sequencing techniques, including single-cell sequencing, which can still be error-prone but is rapidly improving. Mosaicism appears relatively common in the human body, including the normal brain, probably arising in early development, but also potentially during ageing. In this review
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae strains have been described as causing disease in both humans and animals and as being present worldwide. Icterohaemorrhagiae and Copenhageni serovars are known to cause severe disease in their hosts, and zoonotic outbreaks have been described. The genetic similarity among the strains of these serovars is known. However, it has not yet been demonstrated whether major clonal subpopulation in humans, strain Fiocruz L1-130-like, can circulate among other hosts.
METHODOLOGY: We performed genetic characterization of Brazilian serogroup
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Determination of the degree of phylogenetic relationship of Yersinia pestis strains iso- lated from the territories of natural foci of plague from the Caucasus using VNTR-typing by 25 loci (MLVA25).
MATERIALS AND METHODS: 26 strains of Y pestis from Russian natural foci of the Caucasus were used in the study. 25 loci of tandem repeats in Y pestis genome by Le Fleche scheme were used for execution of multi-locus VNTR-analysis. Deciphering of nucleotide sequences was carried out in automatic sequencer ABI 3130 Genetic Analyser. Analysis of confinement of clusters to certain territories, ob
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TMC1 encodes a protein required for the normal function of mechanically activated channels that enable sensory transduction in auditory and vestibular hair cells. TMC1 protein is localized at the tips of the hair cell stereocilia, the site of conventional mechanotransduction. In many populations, loss-of-function recessive mutations of TMC1 are associated with profound deafness across all frequencies tested. In six families reported here, variable moderate-to-severe or moderate-to-profound hearing loss co-segregated with STR (short tandem repeats) markers at the TMC1 locus DFNB7/11. Massively
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glaucoma is the second leading cause of blindness, affecting ~65 million people worldwide. We identified and ascertained a large cohort of inbred families with multiple individuals manifesting cardinal symptoms of primary congenital glaucoma (PCG) to investigate the etiology of the disease at a molecular level. Ophthalmic examinations, including slit-lamp microscopy and applanation tonometry, were performed to characterize the causal phenotype and confirm that affected individuals fulfilled the diagnostic criteria for PCG. Subsequently, exclusion analysis was completed with fluorescently label
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rather species-poor oviparous gyrodactylids are restricted to South America. It was suggested that they have a basal position within the otherwise viviparous Gyrodactylidae. Accordingly, it was proposed that the species-rich viviparous gyrodactylids diversified and dispersed from there.
METHODS: The mitochondrial genome of Aglaiogyrodactylus forficulatus was bioinformatically assembled from next-generation illumina MiSeq sequencing reads, annotated, and compared to previously published mitochondrial genomes of other monogenoidean flatworm species.
RESULTS: The mitochondrial g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We investigated a Q fever outbreak with human patients showing high fever, respiratory tract symptoms, headache and retrosternal pain in southern Hungary in the spring and summer of 2013. Seventy human cases were confirmed by analysing their serum and blood samples with micro-immunofluorescence test and real-time PCR. The source of infection was a merino sheep flock of 450 ewes, in which 44.6% (25/56) seropositivity was detected by enzyme-linked immunosorbent assay. Coxiella burnetii DNA was detected by real-time PCR in the milk of four of 20 individuals and in two thirds (41/65) of the manure
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
McKusick-Kaufman syndrome is a human developmental anomaly syndrome comprising mesoaxial or postaxial polydactyly, congenital heart disease and hydrometrocolpos. This syndrome is diagnosed most frequently in the Old Order Amish population and is inherited in an autosomal recessive pattern with reduced penetrance and variable expressivity. Homozygosity mapping and linkage analyses were conducted using two pedigrees derived from a larger pedigree published in 1978. The PedHunter software query system was used on the Amish Genealogy Database to correct the previous pedigree, derive a minimal pedi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The molecular diagnosis of autosomal dominant tubulointerstitial kidney disease due to MUC1 variants (ADTKD-MUC1) using high-throughput (short-read) sequencing methods remains challenging due to the presence of a coding long variable-number tandem repeat (VNTR) region wherein most known pathogenic variants are located.
METHODS: Here, we used targeted amplicon long-read sequencing to study the MUC1 VNTR in a retrospective cohort study of 78 individuals. Using a bioinformatic pipeline including newly developed specialized software, VNTRtools, we reconstructed patient-specific comp
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sturgeons are archaic fishes phylogenetically distinct from Teleosts. They represent an important niche for aquaculture, particularly for the production of caviar and high quality fillets, while many natural populations in various world areas are today threatened by extinction. Knowledge of the sturgeon genome is limited, as it is the case of many other species of interest for fishery, aquaculture and conservation. Sequences from non-normalized libraries of skin and spleen of the American sturgeon (A. transmontanus) produced in our laboratories were analysed via a bioinformatic procedure, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DUX gene family encodes transcription factors with paired homeodomains. It has critical roles in embryogenesis and disease, including facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD) and cancer. This study conducts a comparative analysis of the DUX gene family-DUXA, DUXB (including DUXBL), and DUXC (including DUX4 and Dux)-across placental mammals, highlighting their structural diversity within macrosatellite repeat contexts. Using long-read genomes, we explore gene distribution, array patterns, and phylogenetic relationships in various vertebrate species. Our analysis reveals that DUXA and D
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Resistance of the human malaria parasites, Plasmodium falciparum, to artemisinins is now fully established in Southeast Asia and is gradually emerging in Sub-Saharan Africa. Although nonsynonymous SNPs in the pfk13 Kelch-repeat propeller (KREP) domain are clearly associated with artemisinin resistance, their functional relevance requires cooperation with other genetic factors/alterations of the P. falciparum genome, collectively referred to as genetic background. Here we provide experimental evidence that P. falciparum cyclophilin 19B (PfCYP19B) may represent one putative factor in this geneti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Mucopolysaccharidoses (MPS) are group of inherited metabolic diseases caused by the deficiency of enzymes required to degrade glycosaminoglycans (GAGs) in the lysosomes. GAGs are sulfated polysaccharides involving repeating disaccharides, uronic acid and hexosamines including chondroitin sulfate (CS), dermatan sulfate (DS), heparan sulfate (HS) and keratan sulfate (KS). Hyaluronan is excluded in terms of being non-sulfated in the GAG family. Different types of mutations have been identified as the causative agent in all types of MPS. Herein, we planned to investigate the pathogenic mutatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this study was to compare the antigenicity and the immunogenicity of five constructs of a peptide, including the peptide in single copy, a tandem repeat containing three copies, a copolymer with glutaraldehyde and two constructs based on the MAP (Multiple Antigenic Peptide) model, one containing two copies (MAP-2) and the other, eight copies of the peptide (MAP-8). The peptide used in this test was the 115-131 sequence derived from the rSm28-GST antigen of Schistosoma mansoni. All constructs were recognized by rSm28-GST specific antibodies in solid phase immunoassays. However, the b
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.