The determination of active-site protonation states is critical for a full mechanistic understanding of enzyme catalysis and inhibition. Here, we employ NMR crystallography-the integrated combination of solid-state NMR spectroscopy, X-ray diffraction, and first-principles computational chemistry-to determine the protonation states of the active site of Toho-1 β-lactamase in complex with the non-β-lactam inhibitor avibactam. We report two X-ray crystal structures of the Toho-1:avibactam complex, along with high-field solid-state NMR measurements that enable near-complete backbone and side-chain…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The antiepileptic activity of α-substituted acetamides, lactams, and cyclic imides has been known for over six decades. We recently proposed an α-substituted amide group as the minimum pharmacophore responsible for inhibition of neuronal nicotinic acetylcholine receptors by these compounds, with the implication that inhibition of these receptors in the brain might be the unifying mechanism of action for these classes of antiepileptic drugs. In order to realize the pharmacological potential of these orally administered drugs, the relevant aspects of solid-state chemistry and pharmaceutics (incl
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Modulation of the neuropeptide S (NPS) system has been linked to a variety of CNS disorders such as panic disorder, anxiety, sleeping disorders, asthma, obesity, PTSD, and substance abuse. In this study, a series of diphenyltetrahydro-1H-oxazolo[3,4-α]pyrazin-3(5H)-ones were synthesized and evaluated for antagonist activity at the neuropeptide S receptor. The absolute configuration was determined by chiral resolution of the key synthetic intermediate, followed by analysis of one of the individual enantiomers by X-ray crystallography. The R isomer was then converted to a biologically active com…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serial femtosecond crystallography (SFX) enables structural determination of biological macromolecules at room temperature using ultrashort X-ray pulses from an X-ray free-electron laser, thereby minimizing radiation damage and capturing dynamic structural changes. Efficient sample delivery is essential for collecting many diffraction patterns. The grease matrix injection method reduces sample consumption but may encounter nozzle clogging and unstable flow when the crystal size is large, the crystal density is high, or the viscosity of the crystallization buffer-grease mixture increases. Fixed…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The epidermal growth factor receptor (EGFR) is a transmembrane receptor tyrosine kinase that plays a central role in regulating cell growth, differentiation, and survival. In non-small cell lung cancer (NSCLC) and several other malignancies, activating mutations within the EGFR kinase domain lead to persistent receptor activation and uncontrolled downstream signalling. Over the past two decades, X-ray crystallographic studies and structural data deposited in the Protein Data Bank have significantly enhanced our understanding of EGFR activation mechanisms, mutation-driven conformational changes
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Serial crystallography for time-resolved structural studies of light-triggered reactions often employs high-viscosity jets to deliver crystals into an X-ray beam. A potential complication is that pump light can scatter within the jet to unintentionally irradiate yet-to-be-probed portions of the jet - a problem known as light contamination. Importantly, by transporting light out of the nominal interaction region, light scattering can reduce the effective irradiation energy density experienced by the diffracting crystal. This issue, which can even jeopardize an experiment, has proven rather cont…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Benzoxaborole is currently a scaffold of great relevance in medicinal chemistry. In 2016, it was reported to be a new and valuable chemotype for designing carbonic anhydrase (CA) inhibitors. Herein, using an in silico design, we report the synthesis and characterization of substituted 6-(1H-1,2,3-triazol-1-yl)benzoxaboroles. 6-Azidobenzoxaborole was described for the first time as a molecular platform to prepare libraries of inhibitors by a copper(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition via a click chemistry strategy. With inhibition constants below 30 nM, some derivatives, such as compound 20
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tetrasilyl-substituted distannene, (tBu2 HSi)2 Sn=Sn(SiHtBu2 )2 6, was synthesized by mild thermolysis (70 °C in hexane) of tris(di-tert-butyl-hydridosilyl)stannane 4. The X-ray crystallography structure of 6 reveals the following unusual structural properties: a planar geometry around both Sn atoms (Σ∡Sn=359.87°), a non-twisted Sn=Sn double bond, and the shortest Sn=Sn double bond of 2.599 Å among all acyclic distannenes. Thus, compound 6 is the first reported distannene having a structure closely analogous to a classic alkene. Reactions of 6 with CCl4 or with 2,3-dimethylbuta-1,3-diene t…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Abnormally O-glycosylated MUC1 tandem repeat glycopeptide epitopes expressed by multiple types of cancer have long been attractive targets for therapy in the race against genetic mutations of tumor cells. Glycopeptide signature-guided therapy might be a more promising avenue than mutation signature-guided therapy. Three O-glycosylated peptide motifs, PDTR, GSTA, and GVTS, exist in a tandem repeat HGVTSAPDTRPAPGSTAPPA, containing five O-glycosylation sites. The exact peptide and sugar residues involved in antibody binding are poorly defined. Co-crystal structures of glycopeptides and respective
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The flavivirus family contains several important human pathogens, such as Zika virus (ZIKV), dengue, West Nile, and Yellow Fever viruses, that collectively lead to a large, global disease burden. Currently, there are no approved medicines that can target these viruses. The sudden outbreak of ZIKV infections in 2015⁻2016 posed a serious threat to global public health. While the epidemic has receded, persistent reservoirs of ZIKV infection can cause reemergence. Here, we have used X-ray crystallography-based screening to discover two novel sites on ZIKV NS3 helicase that can bind drug-like fragm…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The clinical emergence of class Ib c-MET kinase inhibitors, most prominently represented by the FDA-approved capmatinib, has demonstrated th … ne -NH- of Met1160 and an acceptor nitrogen within substituent B. Overall, these findings provide a crystallography-based pharmacophoric framework for class Ib c-MET inhibitors and could support the better design of future analogues with improved activity profiles.
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-associated acute kidney injury (AKI) management remains an unmet clinical need. SIRT5 inhibition shows renoprotective effects, suggesting its therapeutic potential. Using the cocrystal structure of SIRT5-lead compound 1, we rationally designed novel nitroethylene inhibitors that engage both the substrate and NAD+ binding sites. The optimized inhibitor 56 (IC50 = 0.29 μM) produced significant improvements in renal function (BUN and SCr) and histopathological damage in two models of septic AKI mice. Further mechanistic studies showed that the renoprotective effects are linked to the suppr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Photosynthesis converts solar energy to chemical energy by splitting water molecules and carbon dioxide to produce oxygen and carbohydrates with an efficiency that engineers working on solar energy device can only dream of. Photosystem II (PSII) is the enzyme that catalyzes the light-driven oxidation of water that occurs during photosynthesis. This oxygen-producing reaction occurs in the Mn4Ca cluster found inside the enzyme's oxygen-evolving center (OEC). Even though the structure and mechanism of action of the OEC have been intensively investigated for many decades, questions still remain ab
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structural revision of aromadendrane diterpenoids and sesquiterpenoids derived from olibanum is reported. Boscartols Q-T (4-7), four new aromadendrane diterpenoids and sesquiterpenoids along with five previously described analogues (1-3, 8-9), were isolated from the gum resin of Boswellia sacra. Configurational revision assigned boscartols O, N, and P to compounds 1-3, respectively. Their structures were determined by the analysis of spectroscopic data, GIAO NMR/DP4+ analyses, ECD calculations, and a single-crystal X-ray diffraction study. Among these compounds, 1-3 and 6 showed moderate i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Frataxin is a 23 kDa mitochondrial iron-binding protein involved in the biogenesis of iron-sulfur (Fe-S) clusters. Deficiency in frataxin is … using the Turkish Light Source "Turkish DeLight" X-ray diffractometer and serial synchrotron X-ray crystallography, marking a significant step forward in understanding CyaY under near-physiological conditions.
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Polycrystalline double perovskite-type Sr2(Co1-xFex)TeO6 with various stoichiometric compositions (x = 0, 0.25, 0.5, 0.75, and 1) were synthesized by solid-state reactions in air. The crystal structures and phase transitions of this series at different temperature intervals were determined by X-ray powder diffraction, and from the obtained data the crystal structures were refined. It has been proven that for the compositions x = 0.25, 0.50, and 0.75, the phases crystallize at room temperature in the monoclinic space group I2/m. Down to 100 K, depending on the composition, these structures expe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We describe a 5-year-old boy with a unique congenital cataract caused by deposition of numerous birefringent, pleiochroic and macroscopically prismatic crystals. Crystal analysis with subsequent automatic Edman degradation and matrix-associated laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry have identified the crystal-forming protein as gammaD-crystallin (CRYGD) lacking the N-terminal methionine. Sequencing of the CRYGD gene has shown a heterozygous C-->A transversion in position 109 of the inferred cDNA (36R-->S transversion of the processed, N-terminal methionine-lacking CRYGD)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Directly inhibiting the Keap1-Nrf2 protein-protein interaction has been investigated as a promising strategy to activate Nrf2 for anti-inflammation. We previously reported a naphthalensulfonamide Keap1-Nrf2 inhibitor NXPZ-2, but have not determined the exact binding mode with Keap1. This symmetric naphthalenesulfonamide compound has relatively low solubility. Herein, we first determined a crystal complex (resolution: 2.3 Å) of human Keap1 Kelch domain with NXPZ-2. Further optimizations on the solvent exposed region obtained asymmetric naphthalenesulfonamides and three crystal structures of Kea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although experimental protein-structure determination usually targets known proteins, chains of unknown sequence are often encountered. They can be purified from natural sources, appear as an unexpected fragment of a well characterized protein or appear as a contaminant. Regardless of the source of the problem, the unknown protein always requires characterization. Here, an automated pipeline is presented for the identification of protein sequences from cryo-EM reconstructions and crystallographic data. The method's application to characterize the crystal structure of an unknown protein purifie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human aldehyde oxidase (hAOX1) is mainly present in the liver and has an emerging role in drug metabolism, since it accepts a wide range of molecules as substrates and inhibitors. Herein, we employed an integrative approach by combining NMR, X-ray crystallography, and enzyme inhibition kinetics to understand the inhibition modes of three hAOX1 inhibitors-thioridazine, benzamidine, and raloxifene. These integrative data indicate that thioridazine is a noncompetitive inhibitor, while benzamidine presents a mixed type of inhibition. Additionally, we describe the first crystal structure of hAOX1 i…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования