AIMS: To develop a simple, rapid, reliable protocol producing consistent polymerase chain reaction (PCR) fingerprints of Pochonia chlamydosporia var. chlamydosporia biotypes for analysing different fungal isolates during co-infection of plants and nematodes.
METHODS AND RESULTS: DNA extracted from different P. chlamydosporia biotypes was fingerprinted using enterobacterial repetitive intragenic consensus (ERIC)-PCR. Four extraction methods (rapid alkaline lysis; microLYSIS-PLUS; DNeasy; FTA cards) gave consistent results within each protocol but these varied between protocols. Reproducible fi
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA N6-methyladenine (6mA) represents important epigenetic modifications, which are responsible for various cellular processes. The accurate identification of 6mA sites is one of the challenging tasks in genome analysis, which leads to an understanding of their biological functions. To date, several species-specific machine learning (ML)-based models have been proposed, but majority of them did not test their model to other species. Hence, their practical application to other plant species is quite limited. In this study, we explored 10 different feature encoding schemes, with the goal of capt
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Saraca asoca (Roxb.) Willd, commonly known as "Asoka" or "Ashoka," is one of the most important medicinal plants used in raw herbal trade in India. The bark extracts of the tree are used in the treatment of leucorrhea and other uterine disorders besides also having anti-inflammatory, anti-bacterial, anti-pyretic, anti-helminthic, and analgesic activity. The indiscriminate and rampant extraction of the wood to meet the ever-increasing market demand has led to a sharp decline in naturally occurring populations of the species in the country. Consequently, the species has recently been classified
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metal ions in the induction medium are essential ingredients allowing green plant regeneration. For instance, Cu(II) and Ag(I) ions may affect the mitochondrial electron transport chain, influencing the Yang cycle and synthesis of S-adenosyl-L-methionine, the prominent donor of the methylation group for all cellular compounds, including cytosines. If the ion concentrations are not balanced, they can interfere with the proper flow of electrons in the respiratory chain and ATP production. Under oxidative stress, methylated cytosines might be subjected to mutations impacting green plant regenerat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The major drawbacks of standard plant fluorescence in situ hybridization (FISH) designed for double-stranded DNA probes include requirement for experimentally determined heat denaturation of chromosomes at high temperatures and at least overnight hybridization. Consequently, processing with chromosomal preparations may easily result in heat-induced deterioration of chromosomal structural details, is time-consuming, and involves the use of toxic formamide and formaldehyde. Here, I have described a simple and appealing non-toxic procedure with ethylene carbonate (EC)-a formamide-substituting sol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study demonstrates that sunflower plants display integrated, multilevel responses to excessive lithium (Li) exposure. Li concentrations above 5 mM markedly impair germination, growth, and biomass accumulation. Li is preferentially accumulated in the shoots, showing high translocation and bioaccumulation factors, and disrupts mineral nutrient homeostasis, particularly potassium (K) and sodium (Na) uptake, while inducing oxidative stress. Although photosynthetic pigment contents decline, photosynthetic efficiency is largely maintained, except at 10 mM Li. Li treatment enhances superoxide an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The health effects associated with chronic low-dose, low-dose rate (LD-LDR) exposures to environmental radiation are uncertain. All dose-effect studies conducted outside controlled laboratory conditions are challenged by inherent complexities of ecological systems and difficulties quantifying dose to free-ranging organisms in natural environments. Consequently, the effects of chronic LD-LDR radiation exposures on wildlife health remain poorly understood and much debated. Here, samples from wild boar (Sus scrofa leucomystax) and rat snakes (Elaphe spp.) were collected between 2016 and 2018 acro
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The free antibiotic resistance genes (ARGs) content in water samples both inside (during treatment) and outside (after treatment) a wastewater treatment plant (WTP) is of great significance for evaluating the effect of treatment and environmental risks. In this work, a functional DNA hydrogel was packed in a three-dimensionally (3D)-printed tube as a fluorescence biosensor-integrated microextractor to directly extract and track free ARGs from water environments and biological samples. Combined with the strand displacement amplification reaction and the 3D-printed tube in respect of its spatial
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cauliflower mosaic virus 35S (35S) promoter has been extensively used for the constitutive expression of transgenes in dicotyledonous plants. The repetitive use of the same promoter is known to induce transgene inactivation due to promoter homology. As a way to circumvent this problem, we tested two different strategies for the development of synthetic promoters that are functionally equivalent but have a minimum sequence homology. Such promoters can be generated by (a) introducing known cis-elements in a novel or synthetic stretch of DNA or (b) "domain swapping," wherein domains of one pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Various DNA viruses are known to cause severe infectious diseases in both plants and mammals, including humans. For many of these infectious diseases, we have yet to find an effective prevention or treatment. Therefore, new methodologies for the prevention of virus infections in both agricultural crops and humans have been vigorously sought for a long time. One attractive approach to the prevention is inhibition of virus replication. We first inhibited virus replication by blocking binding of a viral replication protein, which initiates virus replication, to its replication origin, with using
Аннотация на английскомСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytosine methylation is one of epigenetic information marked on the DNA sequence. In plants, small interfering RNAs (siRNAs) target homologous genomic DNA sequences for cytosine methylation. This process, known as RNA-directed DNA methylation (RdDM), plays an important role in transposon control, regulation of gene expression and virus resistance. In this paper, we demonstrate that the C2 protein encoded by a geminivirus (beet severe curly top virus, BSCTV) mediated a decrease in DNA methylation of repeat regions in the promoters of ACD6, an upstream regulator of the salicylic acid defense pat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to biosynthesize silver nanoparticles using Elaeagnus angustifolia flower buds-an Iranian medicinal plant extract rich in bioactive phytochemicals and evaluate their antimicrobial potential through complementary broth microdilution (MIC/MBC) and agar well diffusion assays, alongside an assessment of their anticancer and biomolecular interaction properties. The synthesis leverages natural reducing and capping agents (phenols, flavonoids, tannins) to produce stable, spherical AgNPs (FEA@AgNPs), characterized by UV-vis (λ max = 439 nm), XRD (∼10 nm, face-centered cubic), FESEM, T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmaniasis is a disease caused by Leishmania parasites transmitted by phlebotomine sand flies (Diptera: Psychodidae). Human infections with different Leishmania species cause characteristic clinical manifestations; cutaneous or visceral leishmaniasis. Here we describe the development and application of a Miseq Next GenerationSequencing (NGS)-based Multi Detection Assay (MDA) designed to characterize metagenomics parameters pertinent to the sand fly vectors which may affect their vectorial capacity for Leishmania. For this purpose, we developed a MDA by which, DNA fragments were amplified th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Contamination of insect DNA for RAPD-PCR analysis can be a problem because many primers are non-specific and DNA from parasites or gut contents may be simultaneously extracted along with that of the insect. We measured the quantity of food ingested and assimilated by two sympatric populations of brown planthopper (BPH), Nilaparvata lugens, one from rice and the other from Leersia hexandra (Poaceae), a wetland forage grass, and we also investigated whether host plant DNA contaminates that of herbivore insects in extractions of whole insects. Ingestion and assimilation of food were reduced signi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Echinops macrochaetus is a medicinal plant that can be used to cure various diseases. In the present study, plant-mediated zinc oxide nanoparticles (ZnO-NPs) were synthesized using an aqueous leaf extract of the medicinal plant Heliotropium bacciferum and characterized using various techniques. E. macrochaetus was collected from the wild and identified using the internal transcribed spacer sequence of nrDNA (ITS-nrDNA), which showed the closeness to its related genus in a phylogenetic tree. The effect of synthesized biogenic ZnO-NPs was studied on E. macrochaetus in a growth chamber for growth
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: The three main aims of the study were the assessment of the genetic relationship between a deviating Erwinia amylovora strain isolated from Amelanchier sp. (Maloideae) grown in Canada and other strains from Maloideae and Rosoideae, the investigation of the variability of the PstI fragment of the pEA29 plasmid using restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis and the determination of the number of short-sequence DNA repeats (SSR) by DNA sequence analysis in representative strains.
METHODS AND RESULTS: Ninety-three strains obtained from 12 plant genera and different geographi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the expansion of molecular techniques, the historical collections have become widely used. Studying plant DNA using modern molecular techniques such as DNA sequencing plays an important role in understanding evolutionary relationships, identification through DNA barcoding, conservation status, and many other aspects of plant biology. Enormous herbarium collections are an important source of material especially for specimens from areas difficult to access or from taxa that are now extinct. The ability to utilize these specimens greatly enhances the research. However, the process of extract
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphorus (P) enters roots as inorganic phosphate (P(i)) derived from organic and inorganic P compounds in the soil. Nucleic acids can support plant growth as the sole source of P in axenic culture but are thought to be converted into P(i) by plant-derived nucleases and phosphatases prior to uptake. Here, we show that a nuclease-resistant analog of DNA is taken up by plant cells. Fluorescently labeled S-DNA of 25 bp, which is protected against enzymatic breakdown by its phosphorothioate backbone, was taken up and detected in root cells including root hairs and pollen tubes. These results indi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The multifunctional protein kinase CK2 is involved in several aspects of the DNA damage response (DDR) in mammals. To gain insight into the role of CK2 in plant genome maintenance, we studied the response to genotoxic agents of an Arabidopsis CK2 dominant-negative mutant (CK2mut plants). CK2mut plants were hypersensitive to a wide range of genotoxins that produce a variety of DNA lesions. However, they were able to activate the DDR after exposure to γ irradiation, as shown by accumulation of phosphorylated histone H2AX and up-regulation of sets of radio-modulated genes. Moreover, functional as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования