Archaea contain a variety of chromatin proteins consistent with the evolution of different genome packaging mechanisms. Among the two main kingdoms in the Archaea, Euryarchaeota synthesize histone homologs, whereas Crenarchaeota have not been shown to possess a chromatin protein conserved at the kingdom level. We report the identification of Cren7, a novel family of chromatin proteins highly conserved in the Crenarchaeota. A small, basic, methylated and abundant protein, Cren7 displays a higher affinity for double-stranded DNA than for single-stranded DNA, constrains negative DNA supercoils an
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Спящая красавица (SB) — первый транспозон ДНК, используемый для эффективного транспонирования в позвоночных клетках, открывая новые приложения для генной инженерии и генной терапии. Система передачи генов на основе транспозона содержит благоприятные особенности невирусных векторов и привлекательный профиль безопасности. Здесь мы использовали SB для разработки клеток HEK293 для оптимизации производства шимпанзе Аденовектора (chAD), относящегося к человеческому мастаденовирусу C. На сегодняшний день переносчики chAD применяются в нескольких клинических условиях для инфекционных заболеваний, посл
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effects of Candida albicans on sperm parameters and the outcome of infertility treatment are unclear. This report describes a lack of fertilization after assisted reproductive techniques and increased sperm DNA fragmentation in an infertile patient with male accessory gland infection due to Candida albicans. He had normal sperm parameters and, therefore, underwent conventional IVF for a female factor of infertility. No spermatozoa or only one spermatozoon per oocyte were found attached to the zona pellucida of the six mature oocytes retrieved. A new semen sample was then requested from the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poly Ether-Ether Ketone (PEEK) is used in modified atmosphere packaging (MAP) for fruit and vegetable preservation, but raises health concerns. This study investigated the effects of PEEK food migrations on liver cell mitochondrial damage. Food simulants (95% ethanol, 10% ethanol, and 4% acetic acid) were used for migration tests according to guideline recommendations, and liver cells were treated with PEEK food migrations for 24 h. Results showed decreased cell viability, increased reactive oxygen species (ROS), reduced mitochondrial membrane potential (MMP), mitochondrial DNA copy number (mt
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute inflammation, characterized by a rapid influx of neutrophils, is a protective response that can lead to chronic inflammatory diseases when left unresolved. We previously showed that secretion of LTB4-containing exosomes via nuclear envelope-derived multivesicular bodies is required for effective neutrophil infiltration during inflammation. Here we report that the co-secretion of these exosomes with nuclear DNA facilitates the resolution of the neutrophil infiltrate in a mouse skin model of sterile inflammation. Activated neutrophils exhibit rapid and repetitive DNA secretion as they migr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lyme disease is a tick-borne infection caused by the spirochete Borrelia (Borreliella) burgdorferi. Borrelia species have highly fragmented genomes composed of a linear chromosome and a constellation of linear and circular plasmids some of which are required throughout the enzootic cycle. Included in this plasmid repertoire by almost all Lyme disease spirochetes are the 32-kb circular plasmid cp32 prophages that are capable of lytic replication to produce infectious virions called ϕBB-1. While the B. burgdorferi genome contains evidence of horizontal transfer, the mechanisms of gene transfer b
ПрепринтСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lyme disease is a tick-borne infection caused by the spirochete Borrelia (Borreliella) burgdorferi. Borrelia species have highly fragmented genomes composed of a linear chromosome and a constellation of linear and circular plasmids some of which are required throughout the enzootic cycle. Included in this plasmid repertoire by almost all Lyme disease spirochetes are the 32-kb circular plasmid cp32 prophages that are capable of lytic replication to produce infectious virions called ϕBB-1. While the B. burgdorferi genome contains evidence of horizontal transfer, the mechanisms of gene transfer b
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophages drive pathogen evolution, yet the mechanisms governing phage susceptibility in native bacterial backgrounds, and their conseq … encoded defense factor that abrogates phage replication within its native host. AppA inhibits phage DNA packaging through functional mimicry of a terminase assembly interface, revealing a previously unrecognized mechanism of phage defense. AppA is expressed under conditions encountered during mammalian infection and suppresses phage expansion in the murine gut, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diverse microbes release membrane-bound extracellular vesicles from their outer surfaces into the surrounding environment. Vesicles are found in numerous habitats including the oceans, where they likely have a variety of functional roles in microbial ecosystems. Extracellular vesicles are known to contain a range of biomolecules including DNA, but the frequency with which DNA is packaged in vesicles is unknown. Here, we examine the quantity and distribution of DNA associated with vesicles released from five different bacteria. The average quantity of double-stranded DNA and size distribution o
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The assembly and maturation of viruses with icosahedral capsids must be coordinated with icosahedral symmetry. The icosahedral symmetry imposes also the restrictions on the cooperative specific interactions between genomic RNA/DNA and coat proteins that should be reflected in quasi-regular segmentation of viral genomic sequences. Combining discrete direct and double Fourier transforms, we studied the quasi-regular large-scale segmentation in genomic sequences of different ssRNA, ssDNA, and dsDNA viruses. The particular representatives included satellite tobacco mosaic virus (STMV) and the stra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteriophage T4 is a model for tailed viruses, the most abundant biological entities on Earth. During virion assembly, the DNA genome is tightly packed inside the head, which then attaches to tail via a portal-neck connector. Keeping this pressurized head leak-proof during these transactions is a challenge because even a few basepairs leakage could disrupt assembly, but the mechanisms are not understood. Here, we solved the structures of in vitro-assembled portal-neck complexes and found a double "genome-gate" in the neck that plugs the packaged head. The first gate is formed by gp14 hexamer,
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is an epigenetic modification that plays a pivotal role in major biological mechanisms, such as gene regulation, genomic imprinting, and genome stability. Different combinations of methylated cytosines for a given DNA locus generate different epialleles and alterations of these latter have been associated with several pathological conditions. Existing computational methods and statistical tests relevant to DNA methylation analysis are mostly based on the comparison of average CpG sites methylation levels and they often neglect non-CG methylation. Here, we present EpiStatProfile
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Male infertility affects approximately 7% of the male population. In about 40% of affected patients, the etiology remains unknown. Here, we report the cases of two infertile brothers who have a uniquely prevalent sperm phenotype with completely amorphous sperm heads. To investigate the mechanisms of familial teratozoospermia with amorphous sperm heads, chromatin condensation was assessed by aniline blue staining, western blot, sperm chromatin structure assay and atomic force microscopy in both the two brothers and 40 control fertile donors. Our results showed an abnormal condensation of chroma
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper focuses on the development and evolution, quality improvement and research progress in the rapidly emerging area of new detection technologies of special foods for use in space and to some extent aviation. The quality improvement aspects covered in this review ranged from the special food processing technology, sterilization treatment and product packaging to new detection technologies for quality assurance based on DNA microarray technology, sensor, imaging technology, carbon nanotubes and novel probe technology.
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus subtilis produces dormant, highly resistant endospores in response to extreme environmental stresses or starvation. These spores are capable of persisting in harsh environments for many years, even decades, without essential nutrients. Part of the reason that these spores can survive such extreme conditions is because their chromosomal DNA is well protected from environmental insults. The α/β-type small acid-soluble proteins (SASPs) coat the spore chromosome, which leads to condensation and protection from such insults. The histone-like protein HBsu has been implicated in the packagin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The timing of transcription and replication must be carefully regulated for heavily-transcribed genomes of double-stranded DNA viruses: transcription of immediate early/early genes must decline as replication ramps up from the same genome-ensuring efficient and timely replication of viral genomes followed by their packaging by structural proteins. To understand how the prototypic DNA virus Epstein-Barr virus tackles the logistical challenge of switching from transcription to DNA replication, we examined the proteome at viral replication forks. Specifically, to transition from transcription, th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously reported that particles resembling retroviral particles and possessing an RNA-directed DNA polymerase activity can be prepared from platelets. Furthermore, we and others have shown that these particles are present at higher levels in patients with essential thrombocythemia and polycythemia vera. We show here that these particles package RNA molecules that encode HERV-K-related pol genes. A subset of the RNA molecules that are packaged are likely to encode the RNA directed DNA polymerase activity and, because these RNAs possess long/full-length open reading frames for the rev
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpes simplex virus type 2 (HSV-2) is a common causative agent of genital tract infections. Moreover, HSV-2 and HIV infection can mutually increase the risk of acquiring another virus infection. Due to the high GC content and highly repetitive regions in HSV-2 genomes, only the genomes of four strains have been completely sequenced (HG52, 333, SD90e, and MS). Strain G is commonly used for HSV-2 research, but only a partial genome sequence has been assembled with Illumina sequencing reads. In the current study, we de novo assembled and annotated the complete genome of strain G using PacBio lon
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The blood-brain barrier (BBB) restricts the systemic delivery of messenger RNAs (mRNAs) into diseased neurons. Although leucocyte-derived extracellular vesicles (EVs) can cross the BBB at inflammatory sites, it is difficult to efficiently load long mRNAs into the EVs and to enhance their neuronal uptake. Here we show that the packaging of mRNA into leucocyte-derived EVs and the endocytosis of the EVs by neurons can be enhanced by engineering leucocytes to produce EVs that incorporate retrovirus-like mRNA-packaging capsids. We transfected immortalized and primary bone-marrow-derived leucocytes
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ModCRElib package provides various tools for the analysis and modelling of transcription factor (TF)-DNA and regulatory complex inter-protein interactions. It takes structural information on these interactions to predict TF-binding motifs, generate binding profiles along DNA sequences that score the binding affinity, predict TF-binding sites, and model the structure of higher order regulatory complexes. It is capable of working with a variety of input data formats and sources. The user may follow the analysis pipeline as outlined in the documentation or the user can make use of any of the
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования