RNA polymerase II transcripts accumulate within mammalian nuclei at distinct sites and exhibit varying morphology. Certain RNA species are organized in elongated structures, whereas others appear as dot-like concentrations. To analyze the status of the RNA within these accumulations, we investigated the composition of accumulations derived from Epstein-Barr virus (EBV) genes, human papilloma virus 18 (HPV18) open reading frames E6 and E7, as well as heat shock protein 89a (hsp89alpha) and 89beta (hsp89beta) genes. No differential distribution of exon and intron sequences within concentrations
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurodegenerative diseases are commonly classified as proteinopathies that are defined by the aggregation of a specific protein. Parkinson's disease (PD) and dementia with Lewy bodies (DLB) are classified as synucleinopathies since α-synuclein (α-syn)-containing inclusions histopathologically define these diseases. Unbiased biochemical analysis of PD and DLB patient material unexpectedly revealed novel pathological inclusions in the nucleus comprising adenosine-to-inosine (A-to-I)-edited mRNAs and NONO and SFPQ proteins. These inclusions showed no colocalization with Lewy bodies and accumulate
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In eukaryotes, the nucleocytoplasmic export of bulk poly(A)+-mRNAs through the nuclear pore complex is mediated by the ubiquitously expressed NXT1-NXF1 heterodimer. In humans, NXT1 has an X-chromosomal paralog, NXT2, which exhibits testis-enriched expression, suggesting a role in spermatogenesis. Here, we report the in vivo interaction of NXT2 with crucial components of the nuclear export machinery, including NXF1, the testis-specific NXF1 paralogs NXF2 and NXF3, and nuclear pore complex proteins. Binding to NXF2 and NXF3 is mediated by the NTF2-like domain of NXT2. By identifying infertile me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) chronically infects 296 million people worldwide, posing a major global health threat. Export of HBV RNAs from the nucleus to the cytoplasm is indispensable for viral protein translation and genome replication, however the mechanisms regulating this critical process remain largely elusive. Here, we identify a key host factor embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila-like 1 (ELAVL1) that binds HBV RNAs and controls their nuclear export. Using an unbiased quantitative proteomics screen, we demonstrate direct binding of ELAVL1 to the HBV pregenomic RNA (pgRNA). ELAVL1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A hallmark of Huntington's disease (HD) is a prolonged polyglutamine sequence in the huntingtin protein and, correspondingly, an expanded cytosine, adenine, and guanine (CAG) triplet repeat region in the mRNA. A majority of studies investigating disease pathology were concerned with toxic huntingtin protein, but the mRNA moved into focus due to its recruitment to RNA foci and emerging novel therapeutic approaches targeting the mRNA. A hallmark of CAG-RNA is that it forms a stable hairpin in vitro which seems to be crucial for specific protein interactions. Using in-cell folding experiments, we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the extracellular matrix (ECM), the glycosaminoglycan (GAG) hyaluronan (HA) has different physiological roles favouring hydration, elasticity and cell survival. Three different isoforms of HA synthases (HAS1, 2, and 3) are responsible for the production of HA. In several pathologies the upregulation of HAS enzymes leads to an abnormal HA accumulation causing cell dedifferentiation, proliferation and migration thus favouring cancer progression, fibrosis and vascular wall thickening. An intriguing new player in HAS2 gene expression regulation and HA production is the long non-coding RNA (lncR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Temozolomide (TMZ) is used in the treatment of glioblastoma (GBM). However, the primary obstacle remains the emergence of TMZ chemotherapy resistance. Non-POU domain-containing octamer-binding protein (NONO) and splicing factor proline/glutamine rich (SFPQ) are multifunctional nuclear proteins involved in genome stability and gene regulation. However, the specific role of NONO and SFPQ in TMZ resistance of GBM remains to be explored.
METHODS: RNA-binding protein immunoprecipitation-microarray and RNA microarray of TMZ-resistant and parental cells were performed for the gain of HSD
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The major spliceosome includes five small nuclear RNA (snRNAs), U1, U2, U4, U5 and U6, each of which is encoded by multiple genes. We recently showed that mutations in RNU4-2, the gene that encodes the U4-2 snRNA, cause one of the most prevalent monogenic neurodevelopmental disorders. Here, we report that recurrent germline mutations in RNU2-2 (previously known as pseudogene RNU2-2P), a 191-bp gene that encodes the U2-2 snRNA, are responsible for a related disorder. By genetic association, we identified recurrent de novo single-nucleotide mutations at nucleotide positions 4 and 35 of RNU2-2 in
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Axotomized optic axons of Xenopus laevis, in contrast to those of mammals, retain their ability to regenerate throughout life. To better understand the molecular basis for this successful regeneration, we focused on the role of an RNA-binding protein, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (hnRNP) K, because it is required for axonogenesis during development and because several of its RNA targets are under strong post-transcriptional control during regeneration. At 11 d after optic nerve crush, hnRNP K underwent significant translocation into the nucleus of retinal ganglion cells (RGCs), indi
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Аннотация не предоставлена источником. Откройте карточку для перехода к публикации.
Опубликованное исправлениеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many negative-sense RNA viruses, including the highly pathogenic Ebola virus (EBOV), use cytoplasmic inclusion bodies (IBs) for viral RNA synthesis. However, it remains unclear how viral mRNAs are exported from these IBs for subsequent translation. We recently demonstrated that the nuclear RNA export factor 1 (NXF1) is involved in a late step in viral protein expression, i.e., downstream of viral mRNA transcription, and proposed it to be involved in this mRNA export process. We now provide further evidence for this function by showing that NXF1 is not required for translation of viral mRNAs, t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aberrant alternative splicing plays critical role in aging and age-related diseases. Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs) reportedly regulate RNA splicing process. Whether and how hnRNPs contribute to age-related neurodegenerative diseases, especially Alzheimer's disease (AD), remain elusive.
METHODS: Immunoblotting and immunostaining were performed to determine expression patterns and cellular/subcellular localization of the long isoform of hnRNP D-like (L-DL), which is a hnRNP family member, in mouse hippocampus. Downregulation of L-DL in WT mice was achieved by AAV
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) are involved in numerous biological functions and pathological processes. However, the clinical significance of lncRNAs and their functions in liver fibrosis remain largely unclear. Methods: The transcript of lncRNA SCARNA10 in serum and liver samples from patients with advanced hepatic fibrosis, liver tissues from two fibrosis mouse models, and cultured hepatic stellate cells (HSCs) was determined by real-time RT-PCR. The effects of lentivirus-mediated knockdown or over-expression of SCARNA10 in liver fibrosis were examined in vitro and in vivo. Moreover, the ef
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nuclear reprogramming reinstates totipotency or pluripotency in somatic cells by changing their gene transcription profile. This technology is widely used in medicine, animal husbandry and other industries. However, certain deficiencies severely restrict the applications of this technology.
RESULTS: Using single-embryo RNA-seq, our study provides complete transcriptome blueprints of embryos generated by cumulus cell (CC) donor nuclear transfer (NT), embryos generated by mouse embryonic fibroblast (MEF) donor NT and in vivo embryos at each stage (zygote, 2-cell, 4-cell, 8-cell, mor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis virus (JEV)-specific RNAs (including 42S RNA) were synthesized in subcellular fractions prepared from infected C6/36 cells. This in vitro RNA synthesis essentially required Mg2+ and four ribonucleotides, and it was enhanced by K+. The amounts of RNA synthesized in vitro (in extracts from JEV-infected cells) increased as a function of time after infection. The RNA-synthetic activity in nuclear fractions was the highest among three kinds of subcellular fractions. Our data showed that nonstructural proteins NS3 and NS5 were membrane-associated proteins. In particular, NS3 wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nuclear speckles are nuclear bodies enriched with RNA-processing proteins. Highly transcribed genes and their nascent pre-mRNAs are organized around nuclear speckles, facilitating co-transcriptional RNA processing. However, the mechanisms underlying this spatial organization remain unclear. Here, we identified a class of Alu repeat-containing RNAs that are highly enriched in nuclear speckles. These RNAs interact with actively transcribed genes through their Alu elements, partially via R-loop formation. They also engage with nuclear speckle proteins, promoting their coalescence, phase separatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type I spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive disorder caused by the loss or mutation of the survival motor neuron 1 (SMN1) gene. The reduction in SMN protein levels in SMA leads to the degeneration of motor neurons and muscular atrophy. In this study, we analyzed the nuclear reorganization in human skeletal myofibers from a type I SMA patient carrying a deletion of exons 7 and 8 in the SMN1 gene and two SMN2 gene copies and showing reduced SMN protein levels in the muscle compared with those in control samples. The morphometric analysis of myofiber size revealed the coexisten
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ubiquitin-dependent proteasome system (UPS) is the major pathway responsible for selective nuclear and cytoplasmic protein degradation. Bortezomib, a boronic acid dipeptide, is a reversible 20S proteasome inhibitor used as novel anticancer drug, particularly in the treatment of multiple myeloma and certain lymphomas. Bortezomib-induced peripheral neuropathy (BIPN) is a widely recognized dose-limiting neurotoxicity of this proteasome inhibitor, which causes a significant negative impact on the quality of life. The pathogenic mechanisms underlying bortezomib neurotoxicity are little known. I
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) DNA structure and gene expression were analyzed in tissue specimens from oral hairy leukoplakia (HLP), a mucocutaneous lesion that develops in patients infected with human immunodeficiency virus (HIV). The structure of the terminal restriction enzyme fragments of EBV revealed that HLP is a permissive infection without a predominant, detectable population of EBV episomal DNA. In RNA preparations from this uniquely permissive infection, EBV replicative mRNAs could be identified by Northern analysis; however, the virally encoded small nuclear RNAs, the EBERs, were not det
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this issue of Neuron, Wu et al.1 show that nuclear speckle proteins are sequestered by both nuclear RNA foci and cytoplasmic dipeptide repeat aggregates in C9ORF72-ALS/FTD. Consequently, dysregulation of splicing induces widespread splicing alterations and contributes to neurodegeneration.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования