The expression changes of CD2-associated protein (CD2AP) can lead to kidney diseases with proteinuria, including nephrotic syndrome (NS). A … to a specific sequence in the CD2AP promoter. miR-939-5p was confirmed to reduce the recruitment of RNA polymerase II to the CD2AP promoter region by chromatin immunoprecipitation. These findings improve our understanding of the mechanism of miR-939-5p in NS and provide potential molecular therapeutic targets for NS.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Splicing factors are vital for the regulation of RNA splicing, but some have also been implicated in regulating transcription. The underlying molecular mechanisms of their involvement in transcriptional processes remain poorly understood.
RESULTS: Here, we describe a direct role of splicing factor RBM22 in coordinating multiple steps of RNA Polymerase II (RNAPII) transcription in human cells. The RBM22 protein widely occupies the RNAPII-transcribed gene locus in the nucleus. Loss of RBM22 promotes RNAPII pause release, reduces elongation velocity, and provokes transcriptional read…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Familial Dysautonomia (FD) is a rare disease caused by ELP1 exon 20 skipping. Here we clarify the role of RNA Polymerase II (RNAPII) and chromatin on this splicing event. A slow RNAPII mutant and chromatin-modifying chemicals that reduce the rate of RNAPII elongation induce exon skipping whereas chemicals that create a more relaxed chromatin exon inclusion. In the brain of a mouse transgenic for the human FD-ELP1 we observed on this gene an age-dependent decrease in the RNAPII density profile that was most pronounced on the alternative exon, a robust increase in the repressive marks H3K27me3 a…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Double-hit diffuse large B-cell lymphoma (DH-DLBCL) is an aggressive, and often refractory, type of B-cell non-Hodgkin lymphoma … = 5)] treated with 30 mg i.v. once weekly enitociclib. Enitociclib shows significant regulation of RNA polymerase II Ser2 phosphorylation in a MYC-amplified SU-DHL-4 cell line and depletion of MYC and antiapoptosis protein MCL1 in SU-DHL-4 and MYC-overexpressing SU-DHL-10 cell lines in vitro. Tumor growth inhibition reaching 0.5% of control treated SU-DHL-10 xenog …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Elongin complex was originally identified as an RNA polymerase II (RNAPII) elongation factor and subsequently as the substrate recognition component of a Cullin-RING E3 ubiquitin ligase. More recent evidence indicates that the Elongin ubiquitin ligase assembles with the Cockayne syndrome B helicase (CSB) in response to DNA damage and can target stalled polymerases for ubiquitylation and removal from the genome. In this report, we present evidence that the CSB-Elongin ubiquitin ligase pathway has roles beyond the DNA damage response in the activation of RNAPII-mediated transcription. We obs…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rrd1p (resistance to rapamycin deletion 1) has been previously implicated in controlling transcription of rapamycin-regulated genes in response to rapamycin treatment. Intriguingly, we show here that Rrd1p associates with the coding sequence of a galactose-inducible and rapamycin non-responsive GAL1 gene, and promotes the association of RNA polymerase II with GAL1 in the absence of rapamycin treatment following transcriptional induction. Consistently, nucleosomal disassembly at GAL1 is impaired in the absence of Rrd1p, and GAL1 transcription is reduced in the Δrrd1 strain. Likewise, Rrd1p asso…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chronic infection with hepatitis B virus (HBV) is widespread because of the limited availability of therapeutic treatments. Although previous reports have suggested that RNA interference has promise as a treatment for HBV infection, further studies of long-term and off-target drug effects on HBV, especially on drug-resistant strains of HBV, are needed. Therefore, seven vectors that express short hairpin RNAs (shRNAs), driven by the polymerase II promoter, pSilencer4.1/HBV, were constructed to target open reading frames (ORFs) of the HBV C and S genes from wild-type and drug-resista
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription of Adenovirus 2 DNA (Ad 2 DNA) by wheat germ RNA polymerase II in vitro satisfies criteria that have been used to establish that Escherichia coli or coliphage transcription in vitro is initiated at true promoters. (1) Wheat germ RNA polymerase forms highly stable complexes at specific sites on Ad 2 DNA, with a Kassoc of (4--5) X 10(10) M-1. (2) Electron microscopic visualization of enzyme bound to Ad 2 DNA reveals the location of eight strong binding sites, at least five of which appear to correspond to promoters that have been identified in studies of Ad 2 transcription in vivo …
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1alpha,25-dihydroxyvitamin D(3) was examined for its ability to affect the DNA-dependent RNA polymerases (nucleosidetriphosphate:RNA nucleotidyltransferase, EC 2.7.7.6) of rachitic chick intestinal cell nuclei in vivo. Nucleoplasmic (form II) RNA polymerase activity was stimulated 2-fold (P < 0.05) within 2-3 hr after an oral dose of 0.27 mug (0.65 nmol) of 1alpha,25-dihydroxyvitamin D(3) to rachitic chicks. The form II polymerase activity returned to control values by 5-9 hr after dosing with the sterol. In contrast, the nucleolar (form I) RNA polymerase was not increased within this period.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Meiotic transcription is a highly regulated process involving stage-specific chromatin remodeling and dynamic RNA polymerase II (RNAPII) activity. Nevertheless, our current understanding is largely based on classical model organisms, while many nonmodel mammals remain unexplored. This study investigates the transcriptional dynamics and chromatin features during meiotic prophase I in Nannospalax xanthodon, a subterranean blind mole rat species with extensive intraspecific karyotype variation.
MATERIALS AND METHODS: Using immunofluorescence, we analyzed synapsis and transcriptional …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpesviruses, including the oncogenic human pathogen Kaposi's Sarcoma-associated herpesvirus (KSHV), rely on cellular RNA Polymerase II (RNAPII) for expression of their protein-coding genes. Late in the lytic cycle, transcription initiation on a subset of KSHV genes depends on ORF24, a viral transcriptional activator that binds to viral late promoters through structural mimicry of a host transcription factor. Here, we present a structure of the N-terminal domain of ORF24, and show that it adopts a novel fold that facilitates direct binding of the RNAPII C-terminal domain (CTD). We further sho…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type (SCCOHT) is a rare, aggressive cancer affecting young women driven by inac … nt biotin identification revealed that wild-type SMARCA4, but not its pathogenic variants, promoted RNA polymerase II (Pol II) elongation by mediating the assembly of the polymerase-associated factor 1 complex. Thus, SMARCA4 loss increased Pol II pausing, resulting in elevated R-loops and BRCA1 redistribution. The suppression of BRCA1 activity sensitized SMARCA4-de …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To elucidate dynamic changes in native BCR-ABL and alternatively spliced tyrosine kinase inhibitor (TKI)-resistant but function-dead BCR-ABL … ar pseudo-splice site within intron8, which can be augmented by TKI treatment through inhibition of RNA polymerase II phosphorylation. No mutations were found in spliceosomal genes. Therefore, monitoring IS functional BCR-ABL extracting BCR-ABLIns35bp would lead us to a correct evaluation of MR status, thus determining the adequate therapeutic intervention.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
La Crosse encephalitis virus (LACV) is a mosquito-borne member of the negative-strand RNA virus family Bunyaviridae. We have previously show … on factor IRF-3. NSs expressed by rLACV, however, acts downstream of IRF-3 by specifically blocking RNA polymerase II-dependent transcription. Further investigations revealed that NSs induces proteasomal degradation of the mammalian RNA polymerase II subunit RPB1. NSs thereby selectively targets RPB1 molecules of elongating RNA polymerase II complexes, the so-calle …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dominant Co locus controls the columnar growth phenotype of apple (Malus × domestica) trees. Candidate gene MdCo31, encoding 2-oxoglutar … in transgenic apple plantlets. Yeast (Saccharomyces cerevisiae) two-hybrid screening identified the RNA polymerase II transcription subunit MdMED32 as putative interactor of MdCo31. Bimolecular fluorescence complementation, co-immunoprecipitation, and dual-luciferase reporter assays confirmed this interaction both in vivo and in vitro. Ectopic expression of MdMED32 …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Herpesvirus late promoters activate gene expression after viral DNA synthesis has begun. Alphaherpesviruses utilize a viral immediate-early protein to do this, whereas beta- and gammaherpesviruses primarily use a 6-member set of viral late-acting transcription factors (LTF) that are drawn to a TATT sequence in the late promoter. The betaherpesvirus, human cytomegalovirus (HCMV), produces three immediate-early 2 protein isoforms, IE2-86, IE2-60, IE2-40, late in infection, but whether they activate late viral promoters is unknown. Here, we quickly degrade the IE2 proteins in late infection using
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Runx1 binds the silencer and represses CD4 transcription in immature thymocytes. In this study, we found that Runx1 inhibits P-TEFb, which contains CycT1, CycT2, or CycK and Cdk9 and stimulates transcriptional elongation by RNA polymerase II (RNAPII) in eukaryotic cells. Indeed, its inhibitory domain, spanning positions 371 to 411, not only bound CycT1 but was required for silencing CD4 transcription in vivo. Our chromatin immunoprecipitation assays revealed that Runx1 inhibits the elongation but not initiation of transcription and that RNAPII is engaged at the CD4 promoter but is unable to el…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human general transcription factor TFIID is composed of the TATA-binding protein (TBP) and 13 TBP-associated factors (TAFs). In eukaryotic cells, TFIID is thought to nucleate RNA polymerase II (Pol II) preinitiation complex formation on all protein coding gene promoters and thus, be crucial for Pol II transcription. In a child with intellectual disability, mild microcephaly, corpus callosum agenesis and poor growth, we identified a homozygous splice-site mutation in TAF8 (NM_138572.2: c.781-1G > A). Our data indicate that the patient's mutation generates a frame shift and an unstable TAF8 …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Ecteinascidin 743 (Et743; trabectedin, Yondelis) has recently been approved in Europe for the treatment of soft tissue sarcomas and is undergoing clinical trials for other solid tumors. Et743 selectively targets cells proficient for TC-NER, which sets it apart from other DNA alkylating agents. In the present study, we examined the effects of Et743 on RNA Pol II.
EXPERIMENTAL DESIGN AND RESULTS: We report that Et743 induces the rapid and massive degradation of transcribing Pol II in various cancer cell lines and normal fibroblasts. Pol II degradation was abrogated by the proteasome in
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In addition to xeroderma pigmentosum, mutations in the human XPG gene cause early onset Cockayne syndrome (CS). Here, we provide evidence for the involvement of RAD2, the S. cerevisiae counterpart of XPG, in promoting efficient RNA polymerase II transcription. Inactivation of RAD26, the S. cerevisiae counterpart of the human CSB gene, also causes a deficiency in transcription, and a synergistic decline in transcription occurs in the absence of both the RAD2 and RAD26 genes. Growth is also retarded in the rad2 Delta and rad26 Delta single mutant strains, and a very severe growth inhibition is s…
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования