Our previous studies have shown that meningitic Escherichia coli can colonize the brain and cause neuroinflammation. Controlling the balance of inflammatory responses in the host central nervous system is particularly vital. Emerging evidence has shown the important regulatory roles of long non-coding RNAs (lncRNAs) in a wide range of biological and pathological processes. However, whether lncRNAs participate in the regulation of meningitic E. coli-mediated neuroinflammation remains unknown. In the present study, we characterized a cytoplasm-enriched antisense lncRNA DDIT4-AS1, which showed si
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Oxygen-induced retinopathy (OIR) is a robust animal model of human retinopathy of prematurity that readily allows changes in retinal gene and microRNA (miRNA) expression in response to fluctuations in oxygen levels to be studied. We sought to identify small non-coding RNA (ncRNA) genes that showed stable expression upon exposure to varying levels of oxygen, with different developmental stages and in different rat strains, to act as reference genes for normalizing miRNA expression in a rat model of OIR.
METHODS: Expression of five small ncRNAs (U6 snRNA, miR-16, U87, 4.5S RNA (H) "Var
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
messenger RNA (mRNA) vaccines are a key technology in combating existing and emerging infectious diseases. However, the inherent instability of mRNA and the nonspecificity of lipid nanoparticle-encapsulated (LNP) delivery systems result in the need for cold storage and a relatively short-duration immune response to mRNA vaccines. Herein, we develop a novel vaccine in the form of circRNAs encapsulated in LNPs, and the circular structure of the circRNAs enhances their stability. Lyophilization is considered the most effective method for the long-term preservation of RNA vaccines. However, this p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long noncoding RNAs (lncRNAs) are known to regulate DNA damage response (DDR) and genome stability in proliferative cells. However, it remains unknown whether lncRNAs are involved in these vital biological processes in post-mitotic neurons. Here, we report and characterize a lncRNA, termed Brain Specific DNA-damage Related lncRNA1 (BS-DRL1), in the central nervous system. BS-DRL1 is a brain-specific lncRNA and depletion of BS-DRL1 in neurons leads to impaired DDR upon etoposide treatment in vitro. Mechanistically, BS-DRL1 interacts with HMGB1, a chromatin protein that is important for genome s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 23S rRNA gene of Coxiella burnetii, the agent of Q fever in humans, contains an unusually high number of conserved, selfish genetic elements, including two group I introns, termed Cbu.L1917 (L1917) and Cbu.L1951 (L1951). To better understand the role that introns play in Coxiella's biology, we determined the intrinsic stability time periods (in vitro half-lives) of the encoded ribozymes to be ∼15 days for L1917 and ∼5 days for L1951, possibly due to differences in their sizes (551 and 1,559 bases, respectively), relative degrees of compactness of the respective RNA structures, and amounts
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A semi-nested polymerase chain reaction (PCR) was evaluated for detection of Japanese encephalitis (JE) virus in infected mosquitoes stored under simulated northern Australian summer conditions. The effect of silica gel, thymol, and a combination of the two on RNA stability and virus viability in dead mosquitoes were also examined. While JE virus RNA was relatively stable in mosquitoes held for up to 14 days after death, viable virus was not detected after day 1. Thymol vapor inhibited fungal contamination. Detection of single mosquitoes infected with JE virus in large pools of mosquitoes was …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer (PCa) is a common malignancy in men, closely associated with androgen receptor (AR) signaling, and often diagnosed with elevated prostate-specific antigen (PSA). While androgen deprivation therapy (ADT) is effective, resistance develops due to reactivation of AR signaling, driving disease progression. We aimed to explore the role of DDX17 in the progression of PCa through its interaction with SPOP. We hypothesized that DDX17 can stabilize the AR by inhibiting SPOP-mediated ubiquitination, thereby maintaining AR signaling which supports tumor growth and survival.
ME
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac hypertrophy is a result of cardiac response to excessive heart burden. The sustention of hypertrophic stress indicates a higher risk of cardiac failure or even sudden death. Despite the increasing research works on cardiac hypertrophy, there remains a considerable space left for further mechanism exploration. Long noncoding RNAs (lncRNAs) are a cluster of transcripts lacking in protein coding potential. Past decades have witnessed the increasing identification of their significant roles in cardiac hypertrophy. Small nucleolar RNA host gene 7 (SNHG7) has been identified as an oncogene i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Umbrella sampling is widely used to estimate biomolecular free energy landscapes and relative folding stabilities. Although equilibration is a critical component of umbrella sampling workflows, the impact of equilibration length on thermodynamic predictions remains poorly understood. Here, we investigate the effect of equilibration length on relative folding free energy predictions for four RNA hairpins with loop sequences GUGAAA, CUGGGA, GUAAUA, and UUAAUU with helical stems of three base pairs. Umbrella sampling simulations were performed using an end-to-end distance reaction coordinate span
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiac fibrosis is a key pathological process following in myocardial infarction (MI), involves excessive extracellular matrix deposition and scar formation, leading to increased ventricular stiffness and reduced compliance. Our team recently identified a highly conserved PIWI-interacting RNA, AB352916 (termed CRAPIR), critical for cardiac regeneration. However, its role in post-MI cardiac fibrosis remains unclear. In this study, we demonstrated that myofibroblast-specific overexpression of AB352916 significantly exacerbated post-MI cardiac function and fibrosis. Conversely, adeno-associated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N6-methyladenosine (m6A) is one of the important RNA modifications that affect RNA abundance and function and has also been implicated in viral infection. In this study, we identified a number of m6A modification sites within human T-cell leukemia virus type 1 (HTLV-1) RNAs, particularly in the RNA of the Tax oncogene. We demonstrated that YTH domain family member 2 (YTHDF2), a key m6A reader protein that binds m6A-modified RNAs and influences RNA metabolism, is required for HTLV-1 replication in both de novo and persistently infected cells. Mechanistically, YTHDF2 interacts with and stabilize
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A small plasmid-specified RNA (RNA I) inhibits formation of the RNA primer for CoIE1 DNA replication by binding to its precursor (RNA II). Binding is modulated by the plasmid-specified Rom protein. Both in the presence and absence of Rom, binding starts with interaction between loops of RNAs. To understand the mechanism of binding, we examined the interactions of pairs of single stem-loops that are complementary fragments of RNA I and RNA II. We found that these complementary single stem-loops bind to each other at their loops, forming an RNAase V1-sensitive structure. Rom protects the complex
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
At-home sampling can address obstacles to participation in transcriptomics research. We previously developed the homeRNA and homeRNAmax platforms; these custom-designed tubes containing RNA stabilizer interface with a blood tube compatible with upper-arm blood collection devices, allowing for blood collection and RNA stabilization to occur from a participant's home. In this work we introduce homeRNAdrop, an insert for a commercially available blood tube (BD Microtainer) that divides the tube into two compartments: the top compartment holds 200 μL blood and the bottom compartment holds ∼590 μL
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory responses require precise posttranscriptional control of gene expression, yet the contribution of circular RNAs (circRNAs) to this process remains poorly understood. Here, we performed circRNA sequencing in murine macrophages stimulated with lipopolysaccharide (LPS) and identified dynamic and stimulus-dependent changes in circRNA expression. Among 1,298 high-confidence circRNAs, 54 showed significant expression changes upon LPS stimulation. We focused on circNav1, which was downregulated upon LPS stimulation. Functional analyses revealed that circNav1 enhances LPS-induced Il6 expr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AlkB homolog 5 (ALKBH5) has been implicated in tumor progression, however, its specific role in angiogenesis in gastric cancer (GC) and the … and in vivo. The impact of ALKBH5 on the stability of lncRNA PVT1 and VEGFA RNAs was evaluated by mRNA stability assays, and interactions between ALKBH5 and these RNAs were validated using methylated RNA immunoprecipitation (MeRIP) assay. A significant positive correlation was observed among ALKBH5, lncRNA PVT1, and VEGFA expression in both The Cancer Genome A …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transthyretin amyloid cardiomyopathy (ATTR-CM) is a progressive and challenging disease characterized by deposition of misfolded transthyretin (TTR) protein in the myocardial interstitium. Until recently, treatment options for ATTR-CM were limited, with tafamidis emerging as the primary therapeutic agent targeting the stabilization of TTR tetramers to prevent amyloid fibril formation. However, advancements in understanding the underlying mechanisms of ATTR-CM have led to developing novel therapeutic strategies to address various aspects of the disease process. This review explores current ther
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ferroptosis is a distinct form of programmed cell death that differs from other pathways. It is characterized by iron-dependent lipid peroxi … eneous nuclear ribonucleoprotein U (HnRNPU) is a well-known RBP involved in RNA splicing, messenger RNA stability and chromatin organization. Elevated HnRNPU expression has been implicated in cancer progression and is associated with poor prognosis. However, the function and underlying mechanisms of HnRNPU in colon adenocarcinoma (COAD) remain poorly understood …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Long non-coding RNAs (lncRNAs) are thought to have various functions other than RNA silencing. We tried to evaluate the expression of lncRNA … of major disease-related cytokines. In addition, TSIX siRNA significantly reduced type I collagen mRNA stability, but not protein half-lives. Furthermore, we first investigated serum lncRNA levels in patients with SSc, and serum TSIX levels were significantly increased in SSc patients. TSIX is a new regulator of collagen expression which stabilizes the collage …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The collection and storage of clinical specimens are critical determinants of reliable and accurate diagnostic outcomes. Swabs are commonly utilized for specimen collection aimed at the detection and identification of microorganisms. In this study, the ∑-MM™ Molecular Medium (Medical Wire and Equipment), which rapidly inactivates microorganisms, including bacteria, mycobacteria, and viruses, was evaluated for its capacity to preserve the stability of SARS-CoV-2 for up to 90 days under various temperature conditions. A total of 42 newly collected SARS-CoV-2 positive samples were selected to eva
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
SARS-CoV-2 RNA dependent RNA polymerase (RdRp) serves as a highly promising antiviral drug target such as for a Remdesivir nucleotide analogue (RDV-TP or RTP). In this work, we mainly used alchemical all-atom simulations to characterize relative binding free energetics between the nucleotide analogue RTP and natural cognate substrate ATP upon initial binding and pre-catalytic insertion into the active site of SARS-CoV-2 RdRp. Natural non-cognate substrate dATP and mismatched GTP were also examined for computation control. We first identified significant differences in dynamical responses betwe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования