When analyzing microscopic time-lapse observations, frame alignment is an essential task to visually understand the morphological and translation dynamics of cells and tissue. While in traditional single-sample microscopy, the region of interest (RoI) is fixed, multi-sample microscopy often uses a single microscope that scans multiple samples over a long period of time by laterally relocating the sample stage. Hence, the relocation of the optics induces a statistical RoI offset and can introduce jitter as well as drift, which results in a misaligned RoI for each sample's time-lapse observation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: In this current study, our main goal was to establish that EmbryoScope incubation environment is comparable to standard incubation.
METHODS: The development of sibling human zygotes was compared after culture in either a benchtop incubator (SI) or an EmbryoScope time-lapse incubator (ES). Between May 2015 to April 2016, a total of 581 normally fertilized 2PN, pronuclear-stage embryos, from 47 patients were allocated to culture in either a benchtop incubator (SI) or an EmbryoScope incubator (ES).
RESULTS: The development of embryos to cleavage (up to day 3) and blastocyst stages (day
Сравнительное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sperm abnormalities may negatively affect embryo development.
OBJECTIVES: To determine the influence of sperm abnormalities (mo … mined in 223 embryos obtained from conventional IVF only and cultured in a single-step medium using time-lapse imaging technology.
RESULTS: Time-lapse variables from the initial embryo development, such as time of pronuclei fading (tPNf) and time for two cells (t2), were those more strongly related with abnormalities of sperm motility, morphology, and DNA fragmenta …
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell resolution time-lapse microscopy of bacterial populations is a powerful tool for assessing cellular behavior and interaction dynamics. Realizing its full potential requires accurate image analysis: segmentation of individual cell objects, tracking of persistent cells from frame to frame, and connecting of mother cells to daughters during division events. Tracking is particularly challenging in densely packed populations or when cells move significantly; Leading software often struggles. To address this, we present TrackRefiner, a tool for refinement of bacillus cell tracking data.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Time-lapse microscopy imaging is a crucial technique in biomedical studies for observing cellular behavior over time, providing essential data on cell numbers, sizes, shapes, and interactions. Manual analysis of hundreds or thousands of cells is impractical, necessitating the development of automated cell segmentation approaches. Traditional image processing methods have made significant progress in this area, but the advent of deep learning methods, particularly those using U-Net-based networks, has further enhanced performance in medical and microscopy image segmentation. However, challenges
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cryopreservation of ovarian cortical tissue is an important option for female fertility preservation. This is particularly valuable for cancer patients who need to be treated urgently with chemotherapy, leaving no time for hormonal stimulation. The transfer of malignant cells in certain cancers remains as a potential risk after freezing, thawing and transplantation of ovarian tissue while isolation and in vitro growth (IVG) of follicles could be a safe alternate approach of female fertility protection.
METHODS: Ovarian cortex tissue was frozen, thawed and cultured for 8 days prior
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study evaluates ChromaLIVETM, a multichromatic, mix-and-read fluorescent marker developed for continuous live-cell imaging, in the context of embryology. The aim was to evaluate whether this marker is compatible with dynamic embryonic development up to the blastocyst stage, with minimal impact on embryo viability, integrity, or normal growth of mouse embryos at the 2-cell stage that were cultured to the blastocyst stage under time-lapse imaging conditions, either in the presence or absence of ChromaLIVETM. Results showed comparable blastocyst formation rates between ChromaLiveTM and the c…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Here, we present a protocol to quantify 3D invasion and nuclear deformation from time-lapse imaging of U251 glioblastoma spheroids embedded in Matrigel. We describe steps for computing a time-resolved radial invasion index through epifluorescence imaging and extracting per-nucleus deformation from 3D+time data using spinning-disk confocal microscopy with an optical flow-based pipeline. This adaptable protocol links nuclear mechanics to invasion. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to van Bodegraven et al.1.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Time-lapse systems have quickly become a common feature of in vitro fertilization laboratories all over the world. Since being introduced over a decade ago, the alleged benefits of time-lapse technology have continued to grow, from undisturbed culture conditions and round the clock, noninvasive observations to more recent computer-assisted selection of embryos through the development of algorithms. Despite the global uptake of time-lapse technology, its real impact on clinical outcomes is still controversial. This review aims to explore the different features offered by time-lapse technology,
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A prospective cohort study composed of 43 patients treated for unilateral mandibular fracture. The primary study variables were the post-traumatic IAN neurosensory score and the score after fracture reduction in two different groups on the basis of time lapse between presentation and treatment and displacement of mandible fracture. Appropriate descriptive and bivariate statistics were computed. The sample was analyzed over a one year period. It was observed that the recovery percentage (80%) was good in Group-A (n = 20) patients as compared to Group-B (n = 23) patients (43.47%) with significan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To analyze differences in ultra-widefield fluorescein angiography (UWFA) findings between dynamic and static images of eyes with diabetic retinopathy (DR).
METHODS: This cross-sectional study included 28 eyes of 28 patients with DR undergoing UWFA. A series of UWFA images acquired from each patient were converted into a time-lapse video and used as a dynamic image. A single, clear, arteriovenous phase image was chosen as a static image. Non-perfusion index (NPI) and its correlation with vascular abnormalities in different zones were compared between dynamic and static UWFA imaging.
RESU
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Galleria mellonella has emerged as an important host for the study of fungal virulence, insect immune responses, and the evaluation of antifungal agents. In this study, we investigated the dynamics of fungal infections in G. mellonella using Cryptococcus neoformans, a human pathogenic fungus. Since the analysis of infection dynamics requires a fine temporal resolution of larval death, we employed a photographic time-lapse technique that allowed us to simultaneously measure death by proxy of larval melanization and absence of movement. Larval mortality occurred in two phases, early and late, wh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cell intrinsic mechanisms directing peripheral nerve regeneration have remained largely understudied, thus limiting our understanding of … with fluorescent plasmid constructs to label subcellular structures, combined with high resolution time-lapse imaging has the potential to provide invaluable insight into how peripheral neurons coordinate their regenerative response, and which specific cellular structures are involved in this process. Here we describe a protocol that facilitates transfection and su …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To study whether a powerful, in-house, embryo-selection model can be developed for a specific in vitro fertilization (IVF) laboratory where embryos were already selected for transfer using general models.
DESIGN: In total, 12,944 fertilized oocytes were incubated in an EmbryoScope (Vitrolife, Göteborg, Sweden) at our laboratory. Embryos were selected for transfer or freezing using general models. There were 1,879 embryos with known implantation data (KID), of which 425 had positive KIDs. For the outcome, we set 3 endpoints for KID's definition: gestational sac, clinical pregnancy,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Contactless sample confinement would enable a whole host of new studies in developmental biology and neuroscience, in particular, when combined with long-term, wide-field optical imaging. To achieve this goal, we demonstrate a contactless acoustic gradient force trap for sample confinement in light sheet microscopy. Our approach allows the integration of real-time environmentally controlled experiments with wide-field low photo-toxic imaging, which we demonstrate on a variety of marine animal embryos and larvae. To illustrate the key advantages of our approach, we provide quantitative data for
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In vivo confocal microscopy (IVCM) is a widely used technique for imaging the cornea of the eye with a confocal scanning light ophthalmoscope. Cellular resolution and high contrast are achieved without invasive procedures, suiting the study of living humans. However, acquiring useful image data can be challenging due to the incessant motion of the eye, such that images are typically limited by noise and a restricted field of view. These factors affect the degree to which the same cells can be identified and tracked over time. To redress these shortcomings, here we present a data acquisition pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rapid antimicrobial susceptibility testing (AST) is essential for early and appropriate therapy. Methods with short detection time enabling same-day treatment optimisation are highly favourable. In this study, we evaluated the potential of a digital time-lapse microscope system, the oCelloScope system, to perform rapid AST. The oCelloScope system demonstrated a very high accuracy (96% overall agreement) when determining the resistance profiles of four reference strains, nine clinical isolates, including multi-drug-resistant isolates, and three positive blood cultures. AST of clinical isolates
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intravital multiphoton imaging enables the real-time visualization of distinct cell populations and also cellular dynamics in the ocular surface of transgenic mice expressing fluorescent proteins. In contrast to the relatively flat topography of skin tissue, the mouse cornea presents a steep curvature, which poses a challenge for peripheral imaging. Here, we demonstrate a time-lapse, single-cell resolution multiphoton microscopic imaging methodology that overcomes this limitation. Using distinct transgenic mouse strains, our approach allows for targeted visualization of diverse cell types incl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Image-based phenotypic screening has emerged as a powerful tool for revealing single-cell heterogeneity and dynamic phenotypic responses in … very and continuous monitoring of biochemical and morphological changes in living cells during 24 h time-lapse imaging with minimal photodamage. We outline a processing pipeline for longitudinal SRS images to extract chemical and morphological features of single live cells. Using this system, we showcase time-lapse SRS microscopy as a tool to map heterogeneous drug- …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Image-based phenotypic screening has emerged as a powerful tool for revealing single-cell heterogeneity and dynamic phenotypic responses in … y and continuous monitoring of biochemical and morphological changes in living cells during 24-hour time-lapse imaging with minimal photodamage. We outline a processing pipeline for longitudinal SRS images to extract chemical and morphological features of single live cells. Using this system, we showcase time-lapse SRS microscopy as a tool to map heterogenous drug-i …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования