AIMS: This study aimed to isolate and characterize autochthonous lactic acid bacteria (LAB) from naturally fermented yak milk (NFYM) in the western Sichuan Plateau, focusing on their ability to metabolize diverse prebiotic oligosaccharides and their potential as synbiotic starter cultures with probiotic properties.
METHODS AND RESULTS: Twenty LAB isolates representing eight species were obtained from eleven NFYM samples. Metabolic screening revealed strain- and species-specific utilization of seven prebiotic oligosaccharides. Leuconostoc pseudomesenteroides YT830 efficiently metabolized fruct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Precisely delineating the transcriptomic profiles of glandular epithelial (GE) cells in prostate cancer (PCa) remains a significant challenge primarily due to their diffuse and multifocal distribution. To address this, we employed spatial transcriptomics (ST) to analyze 12 PCa tissue samples from 10 patients, aiming to identify PCa progression-associated genes by analyzing expression patterns across histologically distinct regions. Transcriptomic classification via principal component analysis (PCA), uniform manifold approximation and projection (UMAP), and Louvain clustering revealed spatiall
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell omics is advancing our understanding of selective neuronal vulnerability in Alzheimer's disease (AD), revealing specific subtypes that are either susceptible or resilient to neurodegeneration. Using single-nucleus and spatial transcriptomics to compare neocortical regions affected early (prefrontal cortex and precuneus) or late (primary visual cortex) in AD, we identified a resilient excitatory population in layer 4 of the primary visual cortex expressing RORB, CUX2, and EYA4. Layer 4 neurons in association neocortex also remained relatively preserved as AD progressed and shared ov
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite their widespread use in opioid maintenance treatment and pain management, little is known about the intracellular effectors of methadone and buprenorphine and the transcriptional responses they induce. We therefore studied the acute effects of these two opioids in rats, comparing our observations with those for the reference molecule, morphine. We determined the analgesic ED50 of the three molecules in the tail flick test, to ensure that transcriptional effects were compared between doses of equivalent analgesic effect. We analysed changes in gene expression over time in three cerebral
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bone remodeling relies on balanced osteoclast and osteoblast activity, with dysregulated osteoclast differentiation contributing to pathologies like osteoporosis. While RANKL/M-CSF signaling and master regulators (NFATc1, c-Fos) are established, comprehensive temporal dynamics of gene networks governing progressive osteoclastogenesis stages remain poorly characterized. We employed an integrated approach combining RANKL-induced osteoclast differentiation from murine bone marrow-derived macrophages (BMMs) with rigorous functional validation (TRAP staining, podosome visualization via rhodamine-ph
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liver cirrhosis is a severe chronic disease that results from various etiological factors and leads to substantial morbidity and mortality. Alcoholic cirrhosis (AC) and non-AC (NAC) arise from prolonged and excessive consumption of alcohol and metabolic syndromes, respectively. Precise molecular mechanisms of AC and NAC are yet to be comprehensively understood for diagnostics and therapeutic advances to materialize. This study reports novel findings to this end by utilizing high-throughput RNA sequencing and microarray data from the Gene Expression Omnibus (GEO). We performed a meta-analysis o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene expression is influenced by chromatin architecture via controlled access of regulatory factors to DNA. To better understand gene regulation in the human dorsal root ganglion (hDRG) we used bulk and spatial transposase-accessible chromatin technology followed by sequencing (ATAC-seq). Using bulk ATAC-seq, we detected that in females diverse differentially accessible chromatin regions (DARs) mapped to the X chromosome and in males to autosomal genes. EGR1/3 and SP1/4 transcription factor binding motifs were abundant within DARs in females, and JUN, FOS and other AP-1 factors in males. To di
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptococcus neoformans, the causative agent of cryptococcosis, is the primary fungal pathogen that affects the immunocompromised individuals. Galectin-3 (Gal-3) is an animal lectin involved in both innate and adaptive immune responses. The present study aimed to evaluate the influence of Gal-3 on the C. neoformans infection. We performed histopathological and gene profile analysis of the innate antifungal immunity markers in the lungs, spleen, and brain of the wild-type (WT) and Gal-3 knockout (KO) mice during cryptococcosis. These findings suggest that Gal-3 absence does not cause significan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inhibition of ERK/MAPK pathway has been shown to decrease DNA methylation via down-regulation of DNA methyltransferases (DNMTs) in several studies suggesting that this pathway plays an important role in regulation of DNA methylation. We examined the relative expression level of seven important genes related to ERK/MAPK pathway and DNMTs (DNMT1, DNMT3a and DNMT3b) by quantitative real-time PCR in buffalo blastocysts produced by Hand-made cloning and compared it with that in blastocyst-stage embryos produced by in vitro fertilization (IVF). The expression level of six of seven genes related to E
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) is a chronic inflammatory joint disorder in which macrophages play crucial roles. Given macrophage heterogeneity, novel biomarkers are needed for timely diagnosis and severity assessment. This study aimed to identify macrophage-specific hub genes in RA and investigate their biological functions.
METHODS: Bulk and single-cell RNA-seq datasets were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO). Differentially expressed genes (DEGs) in RA synovial macrophages were identified from the GSE97779 dataset using the Limma R package. Gene Ontology (GO) and Kyot
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Previous studies have reported an association between telomere length and non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD). This study aimed to explore the involvement of alternative lengthening of telomere-related genes (ALTRGs) in the pathology of NAFLD, construct a risk signature, and evaluate both treatment and prognosis. Three NAFLD datasets (GSE48452, GSE89632, and GSE63067) were collected from the GEO database and merged into combined GEO datasets. ALTRGs were collected from GeneCards and PubMed databases. Differentially expressed genes (DEGs) were identified, and functional enrichment analysi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The AP1 transcription factor ΔFOSB, a splice variant of FOSB, accumulates in the brain in response to chronic insults such as exposure to drugs of abuse, depression, Alzheimer's disease and tardive dyskinesias, and mediates subsequent long-term neuroadaptations. ΔFOSB forms heterodimers with other AP1 transcription factors, e.g. JUND, that bind DNA under control of a putative cysteine-based redox switch. Here, we reveal the structural basis of the redox switch by determining a key missing crystal structure in a trio, the ΔFOSB/JUND bZIP domains in the reduced, DNA-free form. Screening a cystei
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ceftriaxone is an antibiotic that reliably attenuates the reinstatement of cocaine seeking after extinction while preventing the nucleus accumbens (NA) core glutamate efflux that drives reinstatement. However, when rats undergo abstinence without extinction, ceftriaxone attenuates context-primed cocaine seeking but NA core glutamate efflux still increases. Here, we sought to determine if the same would occur when cocaine seeking is prompted by both context and discrete cues (cue-induced seeking) after cocaine abstinence. Male rats self-administered intravenous cocaine accompanied by drug-assoc
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Type 2 diabetes mellitus (T2DM) is a metabolic disorder characterized by insulin resistance and impaired secretion, necessitating the identification of new markers to target its development and complications.
METHODS: This study conducted a genome-wide study on diabetes mellitus (type 2)-associated genes in Homo sapiens to better understand their role and explore their potential mechanisms. Twenty genes linked to type 2 diabetes were found in this study, and the various analyses, including chromosome localization, synteny analysis, physiochemical features, phylogenetic analysis, m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Campylobacter jejuni (C. jejuni), a commensal food-borne pathogen, poses severe threat to human health and poultry industry. N6-methyladenosine (m6A) mRNA modification is associated with innate immunity. However, the mechanism of m6A modification in C. jejuni chicken cecum inoculation remains unclear.
METHODS: Here, we characterized the cecal m6A modification landscape of chicken in the C. jejuni-resistant (R) and susceptible (S) groups using methylated RNA immunoprecipitation sequencing and RNA sequencing (RNA-seq), and further conducted the in vitro C. jejuni inflammatory mode
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Plastrum testudinis (PT) has been used in traditional Chinese medicine to treat bone diseases such as senile osteoporosis (SOP) for thousands of years. However, the underlying mechanisms remain largely unknown.
AIM OF THE STUDY: This study aims to investigate the possible molecular mechanism of PT in the treatment of SOP using an integrated strategy of network pharmacology and experimental validation.
MATERIALS AND METHODS: The compounds of PT and its targets were identified through the BATMAN-TCM database. The SOP-related targets were retrieved from the GeneC
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have exploited properties of photosensitizers to study an aspect of the packing of chromatin in the cell nucleus. The fluorescent photosensitizers mesotetra(3-hydroxyphenyl) porphyrin and Photofrin II were both localized in the nuclear membrane and other membrane structures, but could not be found inside the nuclei. Light exposure of cells at 1 degrees C in the presence of the sensitizers induced DNA double-strand breaks. The length distributions of DNA fragments were determined by pulsed field gel electrophoresis. Because DNA damage is produced mainly via singlet oxygen diffusing less than
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease (AD) is an increasing health and social problem worldwide with prevalent cholinergic cell involvement. To reveal the details of the exact mechanisms, further preclinical studies in animals are needed. Our aim was to create a mouse model that represents the progression of AD with easy cholinergic manipulation. The 3xTg-AD and ChAT-Cre strains were crossbred. After serial genotyping, a colony, homozygote for all four genes (PSEN1, APPSwe, tauP301L and Cre; 3xAD-ChAT-Cre) was established. The presence of amyloid-β (Aβ) plaques and phosphor-Tau (pTau) aggregates was confirmed b
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aims to prepare collagen peptides from bovine bone meal using a combination of heat pretreatment and enzymatic digestion, and to chelate them with calcium chloride to form peptide-calcium chelates. The effects of both on the proliferation and differentiation of osteoclasts were investigated using cellular experiments (RAW 264.7 cells).
RESULTS: Both bovine collagen peptides and their calcium chelates (BPs, HBPs, BPs-Ca, and HBPs-Ca) can significantly inhibit the RANKL-induced differentiation of RAW 264.7 cells into osteoclasts. The preheating treatment before enzymatic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) is a common liver disease highly associated with metabolic diseases and gut dysbiosis. Several clinical trials have confirmed that fructooligosaccharides (FOSs) are a viable alternative treatment for NAFLD. However, the mechanisms underlying the activities of FOSs remain unclear.
METHODS: In this study, the effects of FOSs were investigated with the use of two C57BL/6 J mouse models of NAFLD induced by a high-fat, high-cholesterol (HFHC) diet and a methionine- and choline-deficient (MCD) diet, respectively. The measured metabolic parameters
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования