Understanding the environmental and management-related determinants of semen production is essential for optimizing artificial insemination programs in buffalo breeding. This study comprehensively evaluated the influence of major non-genetic factors and their interactions on semen quality and semen production traits in Mehsana buffalo bulls using one of the largest repeated-record field datasets reported for this breed. A total of 55,071 ejaculates collected from 244 bulls maintained at two organized semen stations in Gujarat, India, were analyzed. Semen volume, sperm concentration, initial sp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Increased expression of the epithelial-specific adhesion molecule integrin αvβ6 and the presence of anti-αvβ6 autoantibodies (V6 Ab) have been reported in ulcerative colitis (UC). However, the influence of single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in the ITGAV gene on antibody titers, as well as their association with relapse in patients with mild disease, have not been fully elucidated. This study aimed to clarify the impact of ITGAV gene polymorphisms on serum V6 Ab levels in patients with UC. As secondary objectives, we evaluated the association between these SNPs and 1-year rela
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coccidioidomycosis, also known as Valley Fever, is a fungal disease endemic to the Americas that kills hundreds annually, yet the host factors that lead to increased risk of life-threatening dissemination of coccidioidomycosis remain poorly understood. We assembled the largest comprehensively sequenced coccidioidomycosis cohort to date, comprising 795 individuals with laboratory confirmed coccidioidomycosis and clinical disease severity phenotyping, many with paired whole blood genomic and transcriptomic data. Individuals with greater than 50% African genetic ancestry have increased risk for d
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spinal Muscular Atrophy (SMA) is a phenotypically heterogenous disease. The Survival Motor Neuron 2 (SMN2) gene copy number can partially predict the clinical severity of SMA, with a single SMN2 copy generally associated with the most severe phenotypes. The aim of this retrospective observational study was to explore the spectrum of phenotypes associated with one SMN2 copy and the possible association with genotype and outcome.
METHODS: We conducted a retrospective observational study of individuals with genetically confirmed SMA (biallelic Survival Motor Neuron 1 [SMN1] variants)
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Novel β-lactam/β-lactamase inhibitor (BL/BLI) agents including ceftazidime-avibactam, ceftolozane-tazobactam, and imipenem-relebactam have expanded treatment options for multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa. However, resistance mechanisms beyond acquired metallo-β-lactamases (MBLs) remain incompletely defined. We investigated the genomic basis of BL/BLI nonsusceptibility in carbapenem-resistant P. aeruginosa isolates collected at a tertiary-care hospital in South Korea.
METHODS: Antimicrobial susceptibility testing was performed for 71 carbapenem-resistant P. aeruginosa blood
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is an autosomal dominant neurodevelopmental disorder caused by CTG repeat expansion in the DMPK gene. Although the clinical classification of DM1 is determined by the CTG repeat length in DMPK, conventional sizing relies on Southern blotting, which is a suboptimal method in prenatal and PGD contexts as it requires large amounts of genomic DNA. We here evaluated the utility of nanopore long read sequencing (LRS) for DM1 diagnosis in these contexts.
METHOD: LRS was performed with adaptive sampling or CRISPR/Cas9-mediated enrichment targeting DMPK. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Staphylococcus aureus is a microorganism associated with nosocomial infections, characterized by its high pathogenicity and antibiotic resistance, posing a critical risk in hospital environments. This study aimed to determine its presence, antibiotic susceptibility, and the detection of virulence, adhesion, and regulatory genes on hospital surfaces using phenotypic and molecular methods.
MATERIALS AND METHODS: A total of 200 surface samples were collected from a secondary-level hospital, including clinical wards, ICU, and emergency areas. S. aureus was isolated using phenotypic te
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Clinical autoimmune thyroid disease (AITD), presenting as either hypo- or hyperthyroidism, can occur at any age. Autoantibodies against thyroid peroxidase or thyroglobulin precede the onset of clinical AITD. We aimed to assess factors associated with AITD in children and determine if risk factors for AITD differ among the subset who have developed thyroid autoantibodies.
DESIGN: Prospective cohort study.
PATIENTS: The TEDDY Study is a cohort of 8676 children with increased genetic susceptibility for type 1 diabetes, followed to age 15 years.
MEASUREMENTS: Hypothyroidism and hyper
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) is a zoonotic foodborne pathogen responsible for different cases and outbreaks of severe enteric diseases in humans worldwide. Our group previously showed that Argentine O22:H8 isolates (155 and 182) interfere with the colonization of O157:H7 in an experimental infection bovine model. In this study, we applied a comparative genomic and genome-wide association study (GWAS) analysis to explore the differences between the genetic bases of O22:H8 and O157:H7 strains isolated from cattle. The whole-genome sequence of O22:H8 155 and 182 isolates was comp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Poultry is the primary source of Campylobacter infections and severe campylobacteriosis cases are treated with macrolides and fluoroquinolones. However, these drugs are less effective against antimicrobial-resistant strains. Here, we investigated the prevalence of phenotypic antimicrobial resistance and associated resistance genetic determinants in Campylobacter isolates collected from human clinical (N = 123) and meat (N = 80) sources in Pennsylvania in 2017 and 2018. Our goal was to assess potential differences in the prevalence of antimicrobial resistance in Campylobacter isolated from huma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The location of female-specific/linked loci identified in Siamese cobra (Naja kaouthia) previously has been determined through in silico chromosome mapping of the Indian cobra genome (N. naja) as a reference genome. In the present study, we used in silico chromosome mapping to identify sex-specific and linked loci in Siamese cobra. Many sex-specific and sex-linked loci were successfully mapped on the Z sex chromosome, with 227 of the 475 specific loci frequently mapped in a region covering 57 Mb and positioned at 38,992,675-95,561,177 bp of the Indian cobra genome (N. naja). This suggested the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate interindividual differences in cognitive terminal decline and identify determinants including functional, health, and genetic risk and protective factors, data from the Honolulu Heart Program/Honolulu-Asia Aging Study, a prospective cohort study of Japanese American men, were analyzed. The sample was recruited in 1965-1968 (ages 45-68 years). Longitudinal performance of cognitive abilities and mortality status were assessed from Exam 4 (1991-1993) through June 2014. Latent class analysis revealed 2 groups: maintainers retained relatively high levels of cognitive functioning unti
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A common genetic variant within the T cell receptor alpha (TCRA)-T cell receptor delta (TCRD) locus (rs2204985) has been recently found to associate with thymic function. Aim of this study was to investigate the potential impact of donor rs2204985 genotype on patient's outcome after unrelated hematopoietic stem cell transplantation (uHSCT). 2016 adult patients were retrospectively analyzed. rs2204985 genotyping was performed by next generation sequencing, p < 0.05 was considered significant and donor rs2204985 GG/AG genotypes were set as reference vs. the AA genotype. Multivariate analysis of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB) remains the leading cause of deaths from infectious disease worldwide. Nowadays, the tendency of Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) to spread between continents due to uncontrolled migration movements shows that TB is a global health problem. The number of studies for the detection of MTBC strains' epidemiological features in areas with TB spread risk using molecular-based methods such as spoligotyping and Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit (MIRU) Variable Number Tandem Repeats (VNTR) at the clonal level is insufficient. In this study, it was aimed to determine
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The frequency of infections associated with multidrug resistant A. baumannii has risen substantially in India. The use of next-generation sequencing (NGS) techniques combined with comparative genomics has great potential for tracking, monitoring, and ultimately controlling the spread of this troublesome pathogen. Here, we investigated the whole genome sequences of 47 A. baumannii from India.
METHODS: In brief, A. baumannii genomes were analyzed for the presence of antibiotic resistance genes (ARGs), virulence factors genes (VFGs), and mobile genetic elements (MGEs) using various
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli is an important cause of bloodstream infections (BSI), which is of concern given its high mortality and increasing worldwide prevalence. Finding bacterial genetic variants that might contribute to patient death is of interest to better understand infection progression and implement diagnostic methods that specifically look for those factors. E. coli samples isolated from patients with BSI are an ideal dataset to systematically search for those variants, as long as the influence of host factors such as comorbidities are taken into account. Here we performed a genome-wide associ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Environmental adaptation of Listeria monocytogenes is a complex process involving various mechanisms that can contribute to their survival in the environment, further spreading throughout the food chain and the development of listeriosis. The aim of this study was to analyze whole-genome sequencing data in a set of 270 strains of L. monocytogenes derived from human listeriosis cases and food and environmental sources in order to compare the prevalence and type of genetic determinants encoding cadmium, arsenic, and benzalkonium chloride resistance. Most of the detected genes of cadmium (27.8%),
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There is a limited understanding of the clinical and molecular factors associated with outcomes of hematopoietic cell transplantation (HCT) in patients with BCR-ABL-negative myeloproliferative neoplasms in blast phase (MPN-BP). Using the Center for International Blood and Marrow Transplant Research database, we evaluated HCT outcomes in 177 patients with MPN-BP. Ninety-five (54%) had sufficient DNA for targeted next-generation sequencing of 49 genes clinically relevant in hematologic malignancies. At 5 years, overall survival (OS), cumulative incidence of relapse, and nonrelapse mortality of t
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T. gondii (TOXO) infects over one billion people worldwide, yet the literature lacks a Genome Wide Association Study (GWAS) focused on genetic variants controlling the persistence of TOXO infection. To identify putative T. gondii susceptibility genes, we performed a GWAS using IgG seropositivity as the outcome variable in a discovery sample (n = 790) from an Ashkenazi dataset, and a second sample of predominately African Americans (The Grady Trauma Project, n = 285). We also performed a meta-analyses of the 2 cohorts. None of the SNPs in these analyses was statistically significant after Bonfe
СтатьяМетаанализПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The emergence and spread of resistance in Plasmodium falciparum malaria to artemisinin combination therapies in the Greater Mekong subregion poses a major threat to malaria control and elimination. The current study is part of a multi-country, open-label, randomised clinical trial (TRACII, 2015-18) evaluating the efficacy, safety, and tolerability of triple artemisinin combination therapies. A very high rate of treatment failure after treatment with dihydroartemisinin-piperaquine was observed in Thailand, Cambodia, and Vietnam. The immediate public health importance of our findings
СтатьяМногоцентровое исследованиеРандомизированное исследованиеResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.