Spider venoms are a rich source of novel pharmacologically and agrochemically interesting compounds that have received increased attention from pharmacologists and biochemists in recent years. The application of technologies derived from genomics and proteomics have led to the discovery of the enormous molecular diversity of those venoms, which consist mainly of peptides and proteins. The molecular diversity of spider peptides has been revealed by mass spectrometry and appears to be based on a limited set of structural scaffolds. Genetic analysis has led to a further understanding of the molec
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phosphoserine phosphatase (PSP) is a member of a large class of enzymes that catalyze phosphoester hydrolysis using a phosphoaspartate-enzyme intermediate. PSP is a likely regulator of the steady-state d-serine level in the brain, which is a critical co-agonist of the N-methyl-d-aspartate type of glutamate receptors. Here, we present high-resolution (1.5-1.9 A) structures of PSP from Methanococcus jannaschii, which define the open state prior to substrate binding, the complex with phosphoserine substrate bound (with a D to N mutation in the active site), and the complex with AlF3, a transition
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1H NMR and ligand-binding data were used to assess the role of residue Arg(E10) in ligand stabilization of several site-directed mutants, all carrying the His(E7) to Val substitution, obtained using a synthetic sperm whale myoglobin gene. Arg(E10) was previously found to form a hydrogen bond with the ligand in fluoro-, azido- and cyanomet derivatives of Aplysia limacina myoglobin, which lacks the distal His(E7) [Qin, J., La Mar, G. N., Ascoli, F., Bolognesi, M., & Brunori, M. (1992) J. Mol. Biol. 224, 891-897]. NMR analysis of the paramagnetically induced relaxation, hyperfine shift patterns,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stat3 signaling has been recognized as a potential therapeutic target of human ovarian cancer. The signaling is transducted through the peptide-medicated interaction of Stat3 with BET family members Brd2 and Brd4 -- 2 highly homologous proteins involved in differential downstream pathways. Here, we reported a successful design of peptide selectivity between the Brd2 and Brd4. The design resulted in 3 linear peptides SMSLQCXYLGVA, QSKVLTXSYWGA, and RQCNLGXLYMNY with high or moderate selectivity for Brd2 over Brd4 (S = 3.3-fold, 6.8-fold, and 4.2-fold, respectively) as compared with the native S
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our previous study reported that both glycoproteins gB and gH of the herpesvirus Marek's disease virus (MDV) contain eleven potential heptad repeat domains. These domains overlap with α-helix-enriched hydrophobic regions, including the gH-derived HR1 (gHH1) and HR3 (gHH3) and gB-derived HR1 (gBH1) regions, which demonstrate effective antiviral activity, with 50% inhibitory concentrations (IC(50)) of less than 12 µM. Plaque formation and chicken embryo infection assays confirmed these results. In this study, biochemical and biophysical analyses detected potential interactions between these pept
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in fibrillin-1 result in Marfan syndrome, which affects the cardiovascular, skeletal and ocular systems. The multiorgan involvement and wide spectrum of associated phenotypes highlights the complex pathogenesis underlying Marfan syndrome. To elucidate the genotype to phenotype correlations, we engineered four Marfan syndrome causing mutations into a fibrillin-1 fragment encoded by exons 18-25, a region known to interact with tropoelastin. Biophysical and biochemical approaches, including small angle x-ray scattering, analytical ultracentrifugation, and circular dichroism, were used t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alzheimer's disease, Parkinson's disease, cystic fibrosis, prion diseases, and many types of cancer are considered to be protein conformation diseases. Most of them are also known as amyloidogenic diseases due to the occurrence of pathological accumulation of insoluble aggregates with fibrillar conformation. Some neuroblastomas, carcinomas, and myelomas show an abnormal accumulation of the wild-type tumor suppressor protein p53 either in the cytoplasm or in the nucleus of the cell. Here we show that the wild-type p53 core domain (p53C) can form fibrillar aggregates after mild perturbation. Gen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many transmembrane (TM) proteins contain an amphipathic helix. These amphipathic helices can sense lipid composition, stabilize membrane curvature, and mediate protein-protein interactions. Here, we combined solid-state NMR spectroscopy (ssNMR) and molecular dynamics simulations to characterize the structure and membrane interactions of a minimal TM and amphipathic construct (residues 101-146) from Mycobacterium tuberculosis (Mtb) FtsL. Amino-acid-specific 15N-labeled oriented-sample ssNMR spectra in POPC/POPG (4:1 molar ratio) membranes uniquely defined the orientation of the TM helix (residu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many biological and biotechnological processes are controlled by protein-protein and protein-solvent interactions. In order to understand, predict, and optimize such processes, it is important to understand how solvents affect protein structure during protein-solvent interactions. In this study, all-atom molecular dynamics are used to investigate the structural dynamics and energetic properties of a C-terminal domain of the Rift Valley Fever Virus L protein solvated in glycerol and aqueous glycerol solutions in different concentrations by molecular weight. The Generalized Amber Force Field is
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gram-negative bacterium Moraxella catarrhalis infects humans exclusively, causing various respiratory tract diseases, including acute otitis media in children, septicaemia or meningitis in adults, and pneumonia in the elderly. To do so, M. catarrhalis expresses virulence factors facilitating its entry and survival in the host. Among them are the ubiquitous surface proteins (Usps): A1, A2, and A2H, which all belong to the trimeric autotransporter adhesin family. They bind extracellular matrix molecules and inhibit the classical and alternative pathways of the complement cascade by recruitin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The misfolding and aggregation of the presynaptic protein α-synuclein (AS) into amyloid fibrils is pathognomonic of Parkinson's disease, though the mechanism by which this structural conversion occurs is largely unknown. Soluble oligomeric species that accumulate as intermediates in the process of fibril formation are thought to be highly cytotoxic. Recent studies indicate that oligomer-to-fibril AS transition plays a key role in cell toxicity and progression of neurodegeneration. We previously demonstrated that a subgroup of oligomeric AS species are ordered assemblies possessing a well-defin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Reproducible immobilization of peptides and proteins on microsphere surfaces is a critical factor for optimal sensitivity and selectivity in bead-based assays. However, peptides with unusually large numbers of lysine residues-whose amines are targeted in the most common microsphere immobilization chemistries-may be particularly challenging to use in bead-based arrays, as they may lose activity through multipoint attachments and incorrect presentation. For this reason, it is imperative to achieve site-directed attachment chemistry, such that a single site of attachment provides reproducibly ori
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The type III secretion system (T3SS) is required for the virulence of many gram-negative bacterial human pathogens. It is composed of several structural proteins, forming the secretion needle and its basis, the basal body. In Chlamydia spp., the T3SS inner membrane ring (IM-ring) of the basal body is formed by the periplasmic part of CdsD (outer ring) and CdsJ (inner ring). Here we describe the crystal structure of the C-terminal, periplasmic part of CdsD, not including the last 60 residues. Two crystal forms were obtained, grown in three different crystallization conditions. In both crystal f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several widespread and severe degenerative diseases are characterized by the deposition of amyloid protein aggregates in affected tissues. While there is great interest in the complete description of the aggregation pathway of the proteins involved, a molecular level understanding is hindered by the complexity of the self-assembly process. In particular, the early stages of aggregation, where dynamic, heterogeneous and often toxic intermediates are populated, are resistant to high-resolution structural characterization. Fluorescence spectroscopy is a powerful and versatile tool for such analys
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
'In dopaminergic neurons, alpha-synuclein (alphaS) partitions between a disordered cytosolic state and a lipid-bound state. Binding of alphaS to membrane phospholipids is implicated in its functional role in synaptic regulation, but also impacts fibril formation associated with Parkinson's disease. We describe here a solution NMR study in which alphaS is added to small unilamellar vesicles of a composition mimicking synaptic vesicles; the results provide evidence for multiple distinct phospholipid-binding modes of alphaS. Exchange between the free state and the lipid-bound alphaS state, and be
СтатьяResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-synuclein is a small cytosolic protein involved in the pathogenesis of Parkinson's disease and other neurodegenerative disorders. Recent studies suggested a lipid-related function for this brain-enriched protein. Since the brain carries a high level of docosahexaenoic acid (DHA) and since the extent of alpha-synuclein gene expression increases in response to DHA intake, we have investigated the interaction of alpha-synuclein with this essential omega-3 fatty acid. We show that alpha-synuclein allows DHA to be present in a soluble rather than micellar form. Upon interaction with DHA, the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ro52, one of the major autoantigens in the rheumatic disease Sjögren's syndrome (SS), belongs to the tripartite motif (TRIM) or RING-B-box-coiled-coil (RBCC) protein family, thus comprising an N-terminal RING, followed by a B-box and a coiled-coil region. Several different proteomic functions have been suggested for Ro52, including DNA binding, protein interactions and Zn(2+)-binding. To analyze the presence and/or absence of these functions and, in particular, map those to different subregions, the modular composition of the Ro52 protein was experimentally characterized. Two structured parts
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presynaptic protein alpha-synuclein has been implicated in both neuronal plasticity and neurodegenerative disease, but its normal function remains unclear. We described the induction of an amphipathic alpha-helix at the N terminus (exons 2-4) of alpha-synuclein upon exposure to phospholipid vesicles, and hypothesized that lipid-binding might serve as a functional switch by stabilizing alpha-synuclein in an active (alpha-helical) conformation. Others have shown that alpha and beta-synucleins inhibit phospholipase D (PLD), an enzyme involved in lipid-mediated signaling cascades and vesicle t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 'protein only' hypothesis states that a modified form of normal prion protein triggers infectious neurodegenerative diseases, such as bovine spongiform encephalopathy (BSE), or Creutzfeldt-Jakob disease (CJD) in humans. Prion proteins are thought to exist in two different conformations: the 'benign' PrPcform, and the infectious 'scrapie form', PrPsc. Knowledge of the three-dimensional structure of PrPc is essential for understanding the transition to PrPsc. The nuclear magnetic resonance (NMR) structure of the autonomously folding PrP domain comprising residues 121-231 (ref. 6) contains a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The sirtuin (SIRT) family, particularly SIRT1, plays a pivotal role in cell metabolism, inflammation, and aging through its NAD+-dependent deacetylase activity. SIRT1 modulates signaling pathways by targeting numerous regulatory proteins and transcription factors (TFs). Among these is the forkhead TF FOXO1, which plays a key role in regulating genes associated with inflammation (TNF-α), oxidative stress, and glucose and lipid metabolism (G6Pase and PPARG). SIRT1 additionally regulates other important TFs involved in inflammation and cancer, such as HIF-1α, HIF-2α, and p53, all of which are dir
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования