The acidic C-terminal peptides from Trypanosoma cruzi ribosomal P proteins are the major target of the antibody response in patients suffering Chagas chronic heart disease. It has been proposed that the disease is triggered by the cross-reaction of these antibodies with the second extra cellular loop of the beta1-adrenoreceptor, brought about by the molecular mimicry between the acidic C-terminal peptides and the receptor's loop. To improve the understanding of the structural basis of the autoimmune response against heart receptors, the 3-dimensional structure of the C-terminal peptides of Try
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Snake venoms are mixtures of enzymes and peptides which exert toxicological effects by targeting their substrates or receptors upon envenomation. Snake venom proteins widely affect vascular system including circulating blood cells, coagulation factors, and vascular wall components. Many of the toxic proteins have multiple targets. For example, some metalloproteinase domain-containing snake venom protein cleaves not only fibrinogen but also receptors on platelets. Also, it is frequent that toxins from different snake venom protein families are capable of binding to a common target on cells. Mos
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic cytochrome (cyt) c is a highly conserved mitochondrial protein central to cellular respiration, featuring a covalently attached heme with hexacoordinate iron whose redox potential is tuned by axial His/Met ligands and surrounding residues to support electron transport chain (ETC) function. We have identified a previously unrecognized lineage of eukaryotic cyt c homologs in Apicomplexa, a phylum of intracellular pathogens that includes Plasmodium falciparum malaria parasites. P. falciparum cyt c-2 (Pfcyt c-2) exemplifies this divergent lineage and displays heterogeneous heme coordina
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sucrose Non Fermenting1 (SNF1) constitutes a family of protein kinases conserved in eukaryotes, plants, and fungi. SNF1 has been known to play a crucial role in stress adaptation and metabolism, enabling organisms to respond to changing environmental conditions. Initially identified in yeast, SNF1 is essential for shifting from the primary carbon source, glucose, to secondary carbon sources like sucrose. Homologs of this protein family were identified in Leishmania major, a protozoan parasite and we aimed to determine their role in this parasite.
METHODS: In the present study, we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schizophrenia is a complex disorder influenced by genetic, neurobiological, and environmental factors, with increasing evidence implicating immune dysregulation. This study examined potential molecular mimicry between autoantigens associated with schizophrenia and proteins from Toxoplasma gondii, a parasite previously linked to the disorder. Amino acid sequences of schizophrenia-related autoantigens were retrieved from databases (AAgAtlas, PubMed), and homologous sequences were searched within the T. gondii proteome. Sequence identity was evaluated, and conserved B-cell epitopes were predicted
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thaumatin-like proteins (TLPs) are the products of a large, highly complex gene family involved in host defense. TLPs also belong to the pathogenesis-related family 5 (PR-5) of plant defense proteins. Most TLPs exhibit potential antifungal activities, and their accumulation in the plant is related to many physiological processes. In this study, a gene encoding TLP named permatin with an open reading frame of 678 bp encoding a protein of 225 amino acids with a calculated molecular mass of 23.5 kDa was cloned from naked oat leaves. Phylogenetic analysis revealed that permatin shares high homolog
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The existence of XAGE genes was first reported after database homology searches for PAGE-like sequences identified 3 XAGE EST clusters. One of these clusters, XAGE-1, has in later studies been identified as a cancer/testis-associated gene. Here, we report the expression profiles of all 3 reported XAGE genes, as well as several splice variants of XAGE-1, in normal human tissues, Ewing's sarcoma and melanocytic tumors. We also provide the genetic structure of the corresponding genes. Moreover, by searching the databases for XAGE homologues, we identified 3 additional GAGE-like genes. RT-PCR stud
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins with transmembrane domains are classified in different families based on their structure, amino acid homology, and function. In this study, we report the identification, sequence, and expression profile of a new member of the CD20/FcepsilonRIbeta family, CD20/FcepsilonRIbeta family member 4 (CFFM4). The CFFM4 gene contains seven exons and six introns and is transcribed into an mRNA encoding a 240-amino acid protein with four hydrophobic regions. The CFFM4 protein shares a high degree of homology with the other members of the family, especially in the hydrophobic regions where several
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cryptosporidiosis is an infectious disease caused by protozoan parasites of the Cryptosporidium genus. Infection is associated with mild to severe diarrhea that usually resolves spontaneously in healthy human adults, but may lead to severe complications in young children and in immunocompromised patients. The genome of C. parvum contains a gene, CUTA_CRYPI, that may play a role in regulating the intracellular concentration of copper, which is a toxic element in excess. Here, the crystal structure of this CutA1 protein, Cp-CutA1, is reported at 2.0 Å resolution. As observed for other CutA1 stru
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor suppressor protein breast cancer type 1 susceptibility protein (BRCA1) plays a central role in maintaining genome stability through its involvement in DNA damage repair, transcriptional regulation, and cell-cycle control. BRCA1 functions as an obligate heterodimer with its binding partner, the BRCA1-associated RING domain protein 1 (BARD1), to coordinate accurate DNA repair. While the structured N- and C-terminal domains of BRCA1 have been well-characterized, the large central region encoded largely by exon 11 that comprises ~ 80% of the protein, is intrinsically disordered, and rema
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histoplasmosis, due to the intracellular fungus Histoplasma capsulatum, can be diagnosed by demonstrating the presence of antibodies specific to the immunodominant M antigen. However, the role of this protein in the pathogenesis of histoplasmosis has not been elucidated. We sought to structurally and immunologically characterize the protein, determine yeast cell surface expression, and confirm catalase activity. A 3D-rendering of the M antigen by homology modeling revealed that the structures and domains closely resemble characterized fungal catalases. We generated monoclonal antibodies (mAbs)
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A protein receptor tyrosine kinase (RTK 6) has been isolated from a complementary DNA library of SKOV-3, an epithelial ovarian cancer cell line, using a polymerase chain reaction (PCR)-mediated approach. The primary structure of the predicted amino acid sequence of the protein shows a novel NH2-terminal region which has homology to a factor VIII-like domain. The juxtamembrane region is proline and glycine rich and is the longest for any known receptor kinase. The COOH-terminal catalytic domain has all of the canonical sequence motifs of a receptor tyrosine kinase with homology to the TRK-2H pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human phagocytes express a receptor termed complement receptor type 3 (CR3) that recognizes the complement protein fragment C3bi. We show here that CR3 recognizes a region of C3 that contains the sequence Arg-Gly-Asp (RGD). CR3 is down-modulated upon spreading of macrophages on surfaces coated with a synthetic 21-residue peptide from C3 (residues 1383-1403). This peptide was also attached to erythrocytes by coupling myristic acid to its amino terminus and allowing the myristoylated peptide to bind to erythrocytes through hydrophobic interactions. Erythrocytes coated with this RGD-containing se
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Obtaining reproducible and high-quality crystals is a prerequisite in X-ray crystallography to determine high resolution protein structures. Often, protein crystallization is sensitive to several factors leading to difficulties in their reproducibility and diffraction quality. A number of methods have been developed to improve crystallization. Here, we report on the strategies applied to overcome the challenges encountered during the crystallization and structure determination of a truncated soluble variant of OmamC (Rv1363c; OmamC129-261). OmamC is a homolog of mammalian cell entry (Mce) asso
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have isolated and determined the amino acid sequence of a novel peptide component from the venom of the Australian funnel-web spider Hadronyche versuta. This 68-residue toxin, ACTX-Hvf17, does not function like classical neurotoxins in modulating ion channel function as evidenced by its lack of insecticidal activity and its inability to affect vertebrate smooth or skeletal muscle contractility. The peptide shows significant sequence homology with mamba intestinal toxin 1 (MIT1) and to a lesser extent with a variety of colipases. The strong structural homology between MIT1 and porcine colipa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many neuropeptides have been widely conserved across species during evolution. Valuable insights may be gained by studying their biological activity in different species and identifying common functions. Standard basic local alignment search tool for proteins (BLASTP) searches often fail to detect homologous counterparts in distantly related species such as Drosophila and Caenorhabditis elegans, despite evidence for functional equivalents. This can be remedied by employing distant homology BLASTP with less stringent search parameters. Here, I describe the use of BLASTP searches with relaxed se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins contain small pockets that form due to imperfections in residue packing or the rotational and conformational movement of amino acids. In this work, we used the fluorescent probe 1-aminoanthracene (AMA) to detect a small ligand pocket in the hydrophobic core of human proliferating cell nuclear antigen (PCNA), which is a critical protein for DNA replication and repair. Fluorescence measurements of AMA reported that the core of PCNA had a dielectric constant (ε) of 4, which was very apolar and similar to cyclohexane (ε = 2). Protein mutagenesis, photoaffinity labeling, and molecular dyna
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
White spot syndrome virus (WSSV) is one of the deadliest crustacean pathogens, causing huge economic loss in global shrimp industry. WSSV encodes a thymidylate synthase (wTS) that is essential for DNA replication and viral proliferation, serving as a promising drug target against WSSV infections. To aid drug design, we solved wTS structures in complex with dUMP and dUMP/raltitrexed, at 2.28 Å and 1.43 Å resolutions, respectively. wTS forms a homodimer and each ligand-binding cavity is contributed by both monomers. In wTS-dUMP binary structure, the protein adopts an open conformation, with dUMP
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In eukaryotes, sulfate esters are degraded by sulfatases, which possess a unique Calpha-formylglycine residue in their active site. The defect in post-translational formation of the Calpha-formylglycine residue causes a severe lysosomal storage disorder in humans. Recently, FGE (formylglycine-generating enzyme) has been identified as the protein required for this specific modification. Using sequence comparisons, a protein homologous to FGE was found and denoted pFGE (paralog of FGE). pFGE binds a sulfatase-derived peptide bearing the FGE recognition motif, but it lacks formylglycine-generatin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Selective export of membrane proteins from the endoplasmic reticulum (ER) is fundamental for eukaryotic cell biology, yet how trafficking receptors coordinate cargo recognition with membrane adaptation and COPII recruitment remains unknown. Cornichon homolog (CNIH) proteins comprise a conserved family of trafficking receptors that mediate ER export of ion channels, G protein-coupled receptors (GPCRs), ATP-binding cassette (ABC) and solute carrier (SLC) transporters. Here, we determine cryo-electron microscopy structures of the prototypical cornichon receptor Erv14 bound to an SLC t
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования