Objective To identify the characteristic genes and immune infiltration in dilated cardiomyopathy (DCM) by bioinformatic analysis. Methods We identified differentially expressed genes (DEG) on two DCM gene expression data sets, and performed gene ontology (GO), disease ontology (DO), and gene set enrichment analysis (GSEA) functional enrichment to obtain potential pathways. Two machine learning algorithms including support vector machine recursive feature elimination (SVM-RFE) algorithm and Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) algorithm were used to determine diagnostic marke
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Acute myeloid leukemia (AML) is a common hematologic malignancy in adults. Recent studies investigating the potential pathogenesis of AML have significantly advanced our understanding of this disease. While cytogenetics and molecular abnormalities are crucial for confirming chemotherapy response and long-term outcomes, there are additional potential therapeutic targets and prognostic factors. The CAPN1 gene, which encodes a large subunit of the ubiquitous enzyme calpain, has not been extensively studied in hematological diseases. In this study, we used data from the TCGA public database to per
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The objective of this study is to investigate potential biomarkers of Crohn's disease (CD) and the pathological importance of infiltration of associated immune cells in disease development using machine learning.
METHODS: Three publicly accessible CD gene expression profiles were obtained from the GEO database. Inflammatory tissue samples were selected and differentiated between colonic and ileal tissues. To determine the differentially expressed genes (DEGs) between CD and healthy controls, the larger sample size was merged as a training unit. The function of DEGs was comprehended
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD) is a chronic inflammatory disorder of the gastrointestinal tract which is mediated by the inappropriate immune responses. This study was aimed to identify novel diagnostic biomarkers for diagnosis of IBD and explore the relationship between the diagnostic biomarkers and infiltrated immune cells. GSE38713, GSE53306, and GSE75214 downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database were split into training and testing sets. Differentially expressed genes (DEGs) were screened using the "limma" package. Gene Ontology (GO) and KEGG pathway enrichment analysis
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angina pectoris is amongst the most common diseases. There is a scarcity of effective treatments for this disease. As a result, there is a significant clinical and social interest in predicting and developing novel compounds to treat cardiovascular disorders. So, specific natural products have been screened in this study because they have protective effects against angiotensin-converting enzymes. When taken orally, natural products can help protect against or lessen the severity of angina and heart damage. Natural compounds inhibit regulatory enzymes for controlling Angina. For this, we used c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Late-onset Alzheimer's disease (LOAD) is a polygenic disorder with a long prodromal phase, making early diagnosis challenging. Twin studies estimate LOAD as 60-80% heritable, and while common genetic variants can account for 30% of this heritability, nearly 70% remains "missing". Polygenic risk scores (PRS) leverage combined effects of many loci to predict LOAD risk, but often lack sensitivity to preclinical disease changes, limiting clinical utility. Our group has built and published on a resilience phenotype to model better-than-expected cognition give amyloid pathology burden and hypothesiz
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Familial cases of early-onset osteoarthritis (OA) are rare although the exact prevalence is unknown. Early recognition of underlying OA-associated disorders is vital for targeted treatment, when available, and genetic counselling, in case of skeletal dysplasias. Currently, there is no clear guidance on how best to investigate families affected by early-onset OA.
METHODS: We investigated a family with multiple members affected by early-onset OA (age at onset ≤ 40 years). Clinical and demographic characteristics were collected, followed by laboratory investigations screening for a r
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the progression of acute lung injury (ALI), oxidative stress and inflammatory responses always promote each other. The datasets analyzed in this research were acquired from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. The Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA) and limma package were used to obtain the ALI-related genes (ALIRGs) and differentially expressed genes (DEGs), respectively. In total, two biological markers (Gch1 and Tnfaip3) related to oxidative stress were identified by machine learning algorithms, Receiver Operator Characteristic (ROC), and differential expressi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Asthma is a "common chronic disorder that affects the lungs causing variable and recurring symptoms like repeated episodes of wheezing, breathlessness, chest tightness and underlying inflammation. The interaction of these features of asthma determines the clinical manifestations and severity of asthma and the response to treatment" [cited from: National Heart, Lung, and Blood Institute. Expert Panel 3 Report. Guidelines for the Diagnosis and Management of Asthma 2007 (EPR-3). Available at: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK7232/ (accessed on January 3, 2023)]. As per the WHO, 262 million p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofibromatosis type 2 (NF2)-related vestibular schwannoma (NF2-VS) is a rare genetic disorder that results in bilateral acoustic neuromas. However, the exact pathogenesis of the disease is still unclear. This study aims to use bioinformatics analyses to identify potential hub genes and therapeutic. We retrieved the mRNA expression profiles (GSE108524 and GSE141801) of NF2-VS from the database, and selected the leading 25% genes with the most variance across samples for weighted correlation network analysis. Subsequently, we conducted gene ontology term and Kyoto Encyclopedia of Genes and Ge
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Psoriasis is an immune-mediated inflammatory skin disease with a complex etiology involving environmental and genetic factors. Psoriasis patients often require long-term treatment. Shanyaotianua decoction (STT), a typical traditional Chinese medicine prescription, positively affects psoriasis, although its molecular targets remain unknown. To elucidate its molecular mechanisms, a combination of network pharmacology, bioinformatics analysis, and drug similarity comparisons were employed. Participants were separated into 3 groups: non-lesional (NL), lesions after medication (LM), and psoriasis l
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ankylosing spondylitis (AS) and osteoporosis (OP) are both prevalent illnesses in spine surgery, with OP being a possible consequence of AS. However, the mechanism of AS-induced OP (AS-OP) remains unknown, limiting etiologic research and therapy of the illness. To mine targetable medicine for the prevention and treatment of AS-OP, this study analyzes public data sets using bioinformatics to identify genes and biological pathways relevant to AS-OP.
METHODS: First, text mining was used to identify common genes associated with AS and OP, after which functional analysis was carried ou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To identify different key genes and pathways between males and females by studying differentially expressed genes (DEGs).
METHODS: The gene expression data of GSE123568 were downloaded from GEO database, including osteonecrosis of the femoral head (ONFH) samples from 3 females and 7 males, and DEGs between different gender were identified with R software. Protein-protein interaction (PPI) network was constructed to further analyze the interactions between overlapping DEGs, and finally, GO, KEGG and gene set enrichment analysis (GSEA) were conducted for enrichment analysis.
RESULTS
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Testis development is a complex process involving multiple genes, and the molecular mechanisms underlying testis development in Opsariichthys bidens remain unclear. We performed transcriptome sequencing analysis on a total of 12 samples of testes from stages II, III, IV, and V of O. bidens and obtained a total of 79.52 Gb clean data, as well as 288,573 transcripts and 116,215 unigenes. Differential expression analysis showed that 22,857 differentially expressed genes (DEGs) were screened in six comparison groups (III vs. II, IV vs. II, V vs. II, IV vs. III, V vs. III, and V vs. IV). Kyoto Ency
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TATA box-binding protein-associated factor 12 (TAF12) has been identified as an oncogene in choroid plexus carcinoma, but its role in glioma is poorly understood because of a lack of previous studies. This study investigated the relationship of TAF12 expression with the clinicopathologic features of glioma cases, as well as its prognostic value and biological function, using large-scale databases and clinical samples. TAF12 mRNA expression and clinicopathologic characteristics of glioma cases were assessed in three public databases, and bioinformatics analyses were conducted to explore the pro
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The advancement in technology for various scientific experiments and the amount of raw data produced from that is enormous, thus giving rise to various subsets of biologists working with genome, proteome, transcriptome, expression, pathway, and so on. This has led to exponential growth in scientific literature which is becoming beyond the means of manual curation and annotation for extracting information of importance. Microarray data are expression data, analysis of which results in a set of up/downregulated lists of genes that are functionally annotated to ascertain the biological meaning of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The cell cycle-related proteins cyclin B1 (CCNB1) and cyclin B2 (CCNB2) are potentially involved in the underlying mechanisms of psoriasis. The present study aimed to explore this possibility using bioinformatics approaches.
METHODS: CCNB1 and CCNB2 protein levels were evaluated in 14 psoriasis patients and five healthy controls by enzyme-linked immunosorbent assays, and their mRNA levels were evaluated using data from four publicly available datasets (GSE53552, GSE41664, GSE14905, and GSE13355). Comparison of high- and low-expressing groups were performed to reveal CCNB1- and CCNB
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Many clinical studies have reported a relatively high incidence of osteoporosis and fragility fractures in patients with Cushing syndrome (CS). However, few papers have investigated osteoporosis and CS in terms of pathogenesis, so this study explores the association between the 2 and predicts upstream micro-ribonucleic acids (miRNAs) through bioinformatics, which provides potential targets for simultaneous pharmacological interventions in both diseases and also provides a basis for pathological screening.
METHODS: We used Genecards, Online Mendelian Inheritance in Man and Therapeu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aberrant DNA methylation patterns are of increasing interest in the study of psoriasis mechanisms. This study aims to screen potential diagnostic indicators affected by DNA methylation for psoriasis based on bioinformatics using multiple machine learning algorithms and to preliminarily explore its molecular mechanisms.
METHODS: GSE13355, GSE14905, and GSE73894 were collected from the gene expression omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) and differentially methylated region- (DMR-) genes between psoriasis and control samples were combined to obtain different
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We aim to identify the common genes, biological pathways, and treatment targets for primary Sjögren's syndrome patients with varying degrees of fatigue features. We select datasets about transcriptomic analyses of primary Sjögren's syndrome (pSS) patients with different degrees of fatigue features and normal controls in peripheral blood. We identify common differentially expressed genes (DEGs) to find shared pathways and treatment targets for pSS patients with fatigue and design a protein-protein interaction (PPI) network by some practical bioinformatic tools. And hub genes are detected based
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования