OBJECTIVE: To determine the frequency of use of various psychoactive drugs among medical students in an urban setting, and to assess the risk category and intervention needs.
METHODS: The descriptive cross-sectional study was conducted from January to June 2018 at four medical education institutions of Karachi; 2 each randomly selected from registered public and private sectors. From the clinical classes of each institution, fourth year was randomly chosen by lottery method. Data was collected using the Alcohol, Smoking and Substance Involvement Screening Test version 3.0. Data was analysed u
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Liver-specific protein genes have multiple cis-/trans-acting elements, but those accountable for hepatocytic differentiation are unclear. An AT-rich core sequence (AT motif) is essential as a cis-acting element for the hepatic transcription. Homologous proteins hepatocyte nuclear factor-1 (HNF-1) and variant HNF-1 (vHNF-1) bind to this motif. The ratio of HNF-1 to vHNF-1 mRNA was examined in various liver tissues with respect to their differentiation.
METHODS: The competitive reverse transcriptional polymerase chain reaction was employed to amplify HNF-1 and vHNF-1 mRNA simul
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) is the most common aggressive lymphoma and remains highly heterogeneous in prognosis. Palmitoylation, an important post-translational modification, has been implicated in tumor biology, but its role in DLBCL, particularly in relation to the immune microenvironment, remains unclear.
METHODS: Transcriptomic and clinical data from 706 patients with DLBCL were obtained from the Gene Expression Omnibus database. Prognosis-associated palmitoylation-related genes were identified by differential expression and univariate Cox regression analyses. An op
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Colon cancer is one of the most prevalent malignant tumors. Accurate evaluation of patient prognosis and optimization of treatment strategies continue to be major research focuses in colon cancer. Based on The Cancer Genome Atlas (TCGA) database, this study is the first to comprehensively analyze the expression, biological roles, and prognosis of itaconate and Hallmark pathway-related genes in colon cancer using bulk transcriptomics, single-cell transcriptomics, and spatial transcriptomics data. Through strict screening in 448 colon cancer patients from TCGA database (training set) and 7 colon
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sidedness influences colorectal cancer (CRC) prognosis and treatment response, yet the mechanism dictating differential EGFR inhibitor (EGFRI) sensitivity is unclear. This study investigated the tumor microenvironment (TME) in relation to EGFRI eligibility-clinically defined by factors such as tumor sidedness (e.g., left-sided), RAS/BRAF wild-type status, and microsatellite stability (MSS)-using integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), with bulk RNA-seq and spatial transcriptomics validation. We found cancer cell features reflected EGFRI eligibility more strongly than sidedness. EGFR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tumor microenvironment (TME) plays a crucial role in cancer progression, metastasis, and treatment response. Recent advances in single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) and spatial transcriptomics (ST) have provided valuable insights into the cellular diversity and spatial organization of the TME. However, prioritizing clinically relevant cellular subpopulations in spatial contexts using high-dimensional and sparse data remains a challenge. METHODS: We introduce TiRank, a novel framework designed to prioritize clinically relevant spatial niches. TiRank incorporates a relative express
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Male patients were twice as likely to develop gastric cancer (GC) compared to females, partly due to the protective effect of estrogen. However, the proportion of females increased in the young GC patients.
AIMS: The study was designed to explore comprehensive molecular profiles of younger female GC patients, as well as develop a prognostic gene model for female GC patients.
MATERIALS&METHODS: Gene expression and clinical data of GC and nontumor patients were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Gene Ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (K
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hallmarks of cancer describe stepwise changes in cellular functions and molecular pathways of tumour cells that undergo malignant progression. Although 14 hallmarks have been proposed, their manifestation at the molecular level across different tumour types remains incompletely understood. Here, we hypothesised that hallmark-associated transcriptomic signatures reflect the contrasting biological behaviours of a pair of a benign and a malignant tumour. To this end, we compared the two most common canine perianal tumours, the highly malignant apocrine gland anal sac adenocarcinoma (AGASAC) a
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic cancer (PC) is a highly aggressive malignancy of the digestive system, with an extremely poor prognosis. The mitochondrial unfolded protein response (UPRmt) can maintain mitochondrial homeostasis and promote tumor progression and chemotherapy resistance. Nevertheless, the functions of UPRmt-related genes (MRGs) in PC remain undefined.
METHODS: Gene expression data were obtained from TCGA, GEO, and CPTAC databases. Consensus clustering was performed based on MRGs, with subsequent evaluation of immune infiltration patterns across clusters. Prognostic MRGs were identified
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is characterized by genetic variation, epigenetic alterations, microenvironmental imbalance, and metabolic reprogramming. Currently, abnormalities amino acid metabolism has been shown to play an important role in the occurrence and progression of CRC.
METHODS: AUCell, UCell, singscore, ssGSEA and AddModuleScore algorithms were used to determine the pattern of tryptophan metabolism in CRC at the cellular level. Differential expression and correlation analyses were performed to identify core candidate genes associated with upregulation of metabolic activity.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nasopharyngeal carcinoma (NPC) is associated with aberrant cellular metabolism and interactions between tumor and stromal cells. This study aims to elucidate the role of glycerophospholipid metabolism in NPC, particularly focusing on the interplay between malignant epithelial cells and fibroblasts.
METHODS: We employed a multi-omics approach integrating single-cell transcriptomics, 10x spatial transcriptomics, and spatial metabolomics to analyze the gene expression and metabolite profiles in NPC tissues. Differential metabolite abundance and gene expression were evaluated to ident
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Early liver metastasis is a major factor contributing to the poor prognosis of pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC). Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) can analyze the heterogeneity between the primary tumor and metastatic lesions, but its wide clinical application is limited by costs, tissue requirements, and analytical complexity. In contrast, H&E-stained sections are more commonly available. However, it is not clear whether the risk signals derived from images can truly reflect the biological characteristics related to metastasis. We integrated the single-cell RNA sequencing data (GS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Compared with transplanted tumors, autochthonous tumors are difficult to cure using experimental radiation therapy in mice. Here we analyzed differences in immune-related gene expression profiles between mouse fibrosarcomas subcutaneously induced by 3-methylcholanthrene (3MC) and their corresponding transplanted tumors. The immune genes examined were Pd1, Pdl1, Pdl2, Cd3d, Cd8a, Cd8b, Ifnγ, Itga2, Gzmb, and Foxp3. Among 12 tumors, one was non-transplantable and showed a benign phenotype with an abundance of DX5+ natural killer cells and CD8+ T cells together with increased IFNγ expression and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Papillary thyroid carcinoma (PTC) is the most prevalent thyroid malignancy and its incidence continues to rise. Although prognosis is generally favorable, overdiagnosis, overtreatment, and occasional lethal complications persist. To clarify the micro-environmental basis of PTC metastasis, we integrated single-cell RNA-seq from tumor (T), peritumoral thyroid (PT) and lymph-node (LN) tissues with bulk transcriptomes. Metastatic (M) and non-metastatic (NM) cases were compared, and machine-learning models were built to predict lymph-node status and outcome. Our atlas delineates highly heterogeneou
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Glycosylation and inflammation are pivotal in tumor progression, yet the specific glycosyltransferases bridging these processes remain poorly defined. This study investigated Exostosin-1 (EXT1), a key enzyme in heparan sulfate (HS) biosynthesis, as a mechanistic bridge connecting inflammation, stromal remodeling, and immune evasion-driven cancers. Methods: We used a multi-omics approach including Least Absolute Shrinkage and Selection Operator (LASSO) Cox regression on The Cancer Genome Atlas (TCGA) pan-cancer cohorts, transcriptomics, survival, single-cell RNA sequencing (scRNA-se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence highlights the critical role of metabolic pathways in breast cancer (BC) progression. Here, we developed a butyrate metabolism-specific gene (BMRG) signature to predict clinical outcomes and immunotherapy responses in BC, providing a novel pathway-focused prognostic tool. Using data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO), we identified 102 butyrate metabolism-related differentially expressed genes (DEGs) through the intersection of DEGs, WGCNA-derived key module genes, and BMRGs. Univariate Cox followed by least absolute shrinkage and selection
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive subtype with high malignancy and poor prognosis. Immunotherapy is a promising treatment for TNBC patient. Although T cell-mediated tumor killing related genes (TTKRGs) play critical roles in antitumor immunity, their prognostic value and potential function in TNBC is still unclear.
METHODS: Transcriptomic data from TCGA-BRCA and TTKRGs were curated to determine the prognostic genes in TNBC and a prognostic model was further established. GSE135565 dataset was used to validate the prognostic model. Furthermore, the differences be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The lack of reliable screening biomarkers for prostate cancer (PC) diagnosis makes tissue biopsy the gold-standard strategy. However, its frequent inconclusive results often lead to repeated procedures, increasing patient burden and healthcare costs. In this context, machine learning (ML) presents a novel approach for identifying gene signatures associated with tumor presence, offering a promising avenue for improved PC detection. Therefore, the present study explored the diagnostic potential of an ML-based gene signature and its applicability in tissue and plasma samples. METHODS:
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic reprogramming is central to cancer biology, enabling tumor cells to sustain rapid proliferation, resist stress, and adapt to therapy. However, these alterations are highly heterogeneous across cancer types, and current treatments rarely exploit subtype-specific metabolic vulnerabilities. To address this gap, we developed a unified bioinformatics framework that integrates transcriptomic profiling (UALCAN), drug-gene interactions (DGIdb), gene-disease associations (Open Targets), pathway enrichment (Enrichr), and protein-protein interaction networks (STRING/Cytoscape). This pipeline wa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) features a complex tumor immune microenvironment (TIME) where natural killer cell exhaustion (NKEX) facilitates immune evasion. Its regulatory networks and prognostic value remain insufficiently understood.
METHODS: We integrated single-cell (GSE149614) and bulk RNA-seq (TCGA-LIHC) data. Following Seurat-based clustering, we utilized CellChat and pySCENIC for communication and transcription factor analysis. NKEX-associated modules were identified via gene set variation analysis and weighted gene co-expression network analysis. A prognostic signature
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования