We have previously shown that a non-structural protein 1 (NS1)-binding monoclonal antibody, termed as 2H6, can significantly reduce influenza A virus (IAV) replication when expressed intracellularly. In this study, we further showed that 2H6 binds stronger to the NS1 of H5N1 than A/Puerto Rico/8/1934(H1N1) because of an amino acid difference at residue 48. A crystal structure of 2H6 fragment antigen-binding (Fab) has also been solved and docked onto the NS1 structure to reveal the contacts between specific residues at the interface of antibody-antigen complex. In one of the models, the predict
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis is a neglected tropical disease responsible for the death of more than 300,000 people every year. The disease is caused by intravascular parasitic platyhelminths called schistosomes. Treatment and control of schistosomiasis rely on a single drug, praziquantel, and concern exists over the possible emergence of resistance to this drug. The recent completion of the genome sequences of the three main worm species that cause schistosomiasis in humans has raised hope for the development of new interventions to treat the disease. RNA interference (RNAi), a mechanism by which gene-spec
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A mouse- and human-brain-abundant, nuclear factor (NF)-кB-regulated, micro RNA-146a (miRNA-146a) is an important modulator of the innate immune response and inflammatory signaling in specific immunological and brain cell types. Levels of miRNA-146a are induced in human brain cells challenged with at least five different species of single- or double-stranded DNA or RNA neurotrophic viruses, suggesting a broad role for miRNA-146a in the brain's innate immune response and antiviral immunity. Upregulated miRNA-146a is also observed in pro-inflammatory cytokine-, Aβ42 peptide- and neurotoxic metal-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chitinases of pathogens have been proposed as potential targets of vaccines or specific inhibitors. We studied the genomic organization, transcript levels, developmental expression, and biological function of chitinases in the rodent filarial nematode Acanthocheilonema viteae, a model organism for human-pathogenic filarial worms. Characterization of nine genomic clones from an A. viteae phage library and Southern blot experiments revealed the existence of three different chitinase genes, two of which could theoretically yield functional transcripts. The deduced proteins of these genes had the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicases are ubiquitous molecular motor proteins that have an important role in the metabolism of nucleic acids. The gene encoding a helicase was cloned from the human malaria parasite Plasmodium falciparum. The polypeptide of 398 amino acid residues has a molecular mass of 45 kDa, contains striking homology to eukaryotic translation initiation factor 4A (eIF4A) and all the conserved domains of the DEAD-box family. The recombinantly expressed and homogeneous P. falciparum protein PfH45 is an ATP-dependent DNA and RNA helicase, with ATPase and ATP-binding activities. PfH45 is a unique bipolar
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Our recent findings demonstrated that the Epstein-Barr virus-encoding small nonpolyadenylated RNA (EBER) confers resistance to various apoptotic stimuli and contributes to the maintenance of malignant phenotypes in Burkitt's lymphoma. In this study we investigated the role of EBER in the human epithelial Intestine 407 cell line, which is known to be susceptible to Fas (Apo1/CD95)-mediated apoptosis. Fas, a member of the tumor necrosis factor receptor family, transduces extracellular signals to the apoptotic cellular machinery, leading to cell death. Transfection of the EBER gene into Intestine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Subacute sclerosing panencephalitis (SSPE), a very rare but lethal disease caused by measles viruses (MV) persisting in the human central nervous system (CNS) is characterized by lack of viral budding, reduced expression of the viral envelope proteins and spread of MV genomes through the CNS despite massive immune responses. The five major MV genes from several SSPE cases were cloned and sequenced, the two transmembrane envelope glycoproteins hemagglutinin (H) and fusion protein (F) were expressed and their maturation, cellular localization and functionality analyzed. We conclude that 1) mutat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Varicella-zoster virus (VZV), a double-stranded DNA virus, causes varicella, establishes lifelong latency in ganglionic neurons, and reactivates later in life to cause herpes zoster, commonly associated with chronic pain. The VZV genome is densely packed and produces multitudes of overlapping transcripts deriving from both strands. While 71 distinct open reading frames (ORFs) have thus far been experimentally defined, the full coding potential of VZV remains unknown. Here, we integrated multiple short-read RNA sequencing approaches with long-read direct RNA sequencing on RNA isolated from VZV-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
G-quadruplexes (G4s) are four-stranded alternative secondary structures formed by guanine-rich nucleic acids and are prevalent across the human genome. G4s are enzymatically resolved by specialized helicases. Previous in vitro studies showed that DEAH-box helicase 36 (DHX36/G4R1/RHAU) has the highest specificity and affinity for G4 structures. Here, by mapping genome-wide DNA double-strand breaks (DSBs), we demonstrate that knockout of DHX36 helicase increases DSB enrichment at G4 sites and that the presence of the G4 motif is a significant mediator of genome instability at regulatory regions.
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABSTRACT: Viral infections are associated with early pregnancy loss and later gestational complications, including preeclampsia and fetal growth restriction. While viral components, including viral double-stranded RNA (dsRNA), have been shown to affect placental trophoblast function, how these components may affect maternal endometrial function is less understood. Endometrial stromal cells make up the bulk of the human endometrium, and they undergo a specialized hormone-driven differentiation process termed decidualization, monthly in preparation for pregnancy. We have previously shown that th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A detailed understanding of the mechanisms that underlie antibiotic killing is important for the derivation of new classes of antibiotics and clinically useful adjuvants for current antimicrobial therapies. Our efforts to understand why DinB (DNA polymerase IV) overproduction is cytotoxic to Escherichia coli led to the unexpected insight that oxidation of guanine to 8-oxo-guanine in the nucleotide pool underlies much of the cell death caused by both DinB overproduction and bactericidal antibiotics. We propose a model in which the cytotoxicity of beta-lactams and quinolones predominantly result
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenovirus (AdV) 'virus-associated' RNAs (VA RNAs) are exceptionally abundant (up to 10(8)copies/cell), heterogeneous, non-coding RNA transcripts (∼ 150-200 nucleotides). The predominant species, VA RNAI, is best recognized for its essential function in relieving the cellular anti-viral blockade of protein synthesis through inhibition of the double-stranded RNA-activated protein kinase (PKR). More recent evidence has revealed that VA RNAs also interfere with several other host cell processes, in part by virtue of the high level to which they accumulate. Following transcription by cellular RNA
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Potent inhibition of endogenous gene expression by RNA interference has been achieved by using sequence-specific posttranscriptional gene silencing through the action of small interfering RNA molecules (siRNA). In these reports, the natural function of genes could be deduced through the ensuing loss of function. Based on the extraordinary effectiveness in silencing endogenous genes, we wondered whether siRNA could be applied against viral replication in a hepatitis B virus (HBV) model using HBV-specific siRNA. To test this idea, HepG2 2.2.15, a human hepatoblastoma cell line that constitutivel
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolutionarily conserved RAD-51 protein is essential for homologous recombination in the germ line as well as homologous repair of DNA double-strand breaks in all eukaryotic cells. In the nematode Caenorhabditis elegans, the rad-51 gene is transcribed into messenger RNAs potentially coding three alternative protein isoforms. Null rad-51 alleles display embryonic lethality, severe defects in chromosome structure, and high levels of germ line apoptosis. To dissect its functions, we genetically modified the C. elegans rad-51 gene by clustered regularly interspaced short palindromic repeats/Ca
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parasitic diseases, caused by a diverse array of parasites, remain a substantial threat to global health. Toll-like receptor 3 (TLR3) represents a pivotal element in the innate immune system, distinguished by an ability to signal via the TIR-domain-containing adapter-inducing interferon-β (TRIF)-dependent pathway upon detecting pathogen-derived double-stranded RNA (dsRNA), exosomal RNA (exoRNA), and long non-coding RNA (lncRNA). Predominantly localized on endosomal membranes, TLR3 is extensively expressed in neurons, immune cells, fibroblasts, and epithelial cells. Upon activation, TLR3 engage
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenosine (A) to inosine (I) RNA editing is a hydrolytic deamination reaction catalyzed by the adenosine deaminase (ADAR) enzyme acting on double-stranded RNA. This posttranscriptional process diversifies a plethora of transcripts, including coding and noncoding RNAs. Interestingly, few studies have been carried out to determine the role of RNA editing in vascular disease. The aim of this study was to determine the potential role of ADARs in congenital heart disease. Strong downregulation of ADAR2 and increase in ADAR1 expression was observed in blood samples from congenital heart disease (CHD
Клиническое исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PACT (Protein kinase, interferon-inducible double stranded RNA dependent activator) and its murine ortholog RAX (PKR-associated protein X) were originally identified as a protein activator for the dsRNA-dependent, interferon-inducible protein kinase (PKR). Endogenous PACT/RAX activates PKR in response to diverse stress signals such as serum starvation, and peroxide or arsenite treatment. PACT/RAX heterodimerized with PKR and activated it with its third motif in the absence of dsRNA. The activation of PKR leads to enhanced eIF2α phosphorylation followed by apoptosis or inhibition of growth. Bes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The interactions of selected antibiotics with the trans-acting antigenomic delta ribozyme were mapped. Ribozyme with two oligonucleotide substrates was used, one uncleavable with deoxycytidine at the cleavage site, mimicking the initial state of ribozyme, and the other with an all-RNA substrate mimicking, after cleavage, the product state. Mapping was performed with a set of RNA structural probing methods: Pb(2+) -induced cleavage, nuclease digestion, and the selective 2'-hydroxyl acylation analyzed by primer extension (SHAPE) approach. The experimental results combined with molecular modeling
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intrahepatic cholangiocarcinoma (ICC) poses a significant clinical challenge due to its insidious onset, aggressive biological behavior, and propensity for early metastasis, contributing to a dismal 5-y survival rate of less than 10%. Despite advances in understanding the dynamic changes in gene regulatory networks and chromatin landscapes during tumorigenesis, the functional interplay between RNA epitranscriptomic modifications and nuclear events in ICC remains poorly elucidated. Here, we identify N-acetyltransferase 10 (NAT10), the writer for N4-acetylcytidine (ac4C) mRNA modification, as a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mycoviruses are widely present in all major groups of fungi but those in entomopathogenic Metarhizium spp. remain understudied. In this investigation, a novel double-stranded (ds) RNA virus is isolated from Metarhizium majus and named Metarhizium majus partitivirus 1 (MmPV1). The complete genome sequence of MmPV1 comprises two monocistronic dsRNA segments (dsRNA 1 and dsRNA 2), which encode an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and a capsid protein (CP), respectively. MmPV1 is classified as a new member of the genus Gammapartitivirus in the family Partitiviridae based on phylogenetic analysis
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования