OBJECTIVE: To evaluate the utility of an automated insulated isothermal PCR (iiPCR) system for rapid and reliable on-site detection of African swine fever virus (ASFV) in swine biological samples.
SAMPLE: Lymph node, tissue homogenate, whole blood, serum, spleen, and tonsil samples collected from swine in North and South Vietnam.
PROCEDURES: Analytic sensitivity of the iiPCR system was determined by serial dilution and analysis of 2 samples (swine tissue homogenate and blood) predetermined to be positive for ASFV. Analytic specificity was assessed by analysis of 2 samples predetermined to be
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to identify key microRNAs (miRNAs), pathways, and target genes mediating Hirschsprung's disease (HSCR) pathogenesis and identify the diagnostic potential of miRNAs.
METHODS: The Gene Expression Omnibus database and reverse transcription-quantitative PCR were used to compare miRNA expression between ganglionic and aganglionic colon tissues of children with HSCR, and the TAM 2.0 database was used to identify colon tissue-specific miRNAs. The StarBase database, TargetScan database, luciferase reporter, and western blot assays were used to analyze miRNA-messenger RNA
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nocardia asteroides and Mycobacterium tuberculosis are worldwide-distributed bacteria. These infectious agents can cause many infections in humans, especially in immunocompromised individuals. Pulmonary infections are more common and have similar clinical symptoms. Proper diagnosis and treatment of these patients are important for accurate treatment and could be lifesaving.
METHODS: In this study, a multiplex real-time PCR assay was established for the simultaneous detection of the N. asteroides and M. tuberculosis. Both this homemade multiplex real time PCR and routine commercial
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ehrlichiosis, caused by Gram-negative bacteria of the genus Ehrlichia, is considered an emerging infectious disease due to the increasing number of reported cases. Symptoms are non-specific and occur within 1 to 2 weeks following the bite of an infected tick. Confirmatory laboratory diagnostic methods vary in sensitivity and specimen requirements, which can lead to delayed diagnosis. PCR testing serves as an efficient approach to Ehrlichia confirmation in the acute stage of illness. Published assays have been effectively used to detect human ehrlichiosis at limit of detections ranging from 10
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians2020eng
OBJECTIVE: It has been identified that endometrium specific microRNAs have different expression levels in endometrial tissues and maternal serum during endometrial cycle. The aim of this study was to analyze microRNA expression levels in recurrent implantation failure patients and healthy controls endometrial samples for enlightening the aetiopathogenesis of the disease. The second aim was to search for a potential noninvasive molecular biomarker in early diagnosis and treatment of Recurrent Implantation Failure (RIF) patients.
METHODS: Endometrium and serum samples in two different phases (P
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to investigate a methodology for discriminating viable and non-viable T. gondii oocysts in water. Analyses included two steps: (i) microscopic investigation with vital dyes; (ii) molecular investigation, using a real time PCR (qPCR), after parasite treatment (or not) with propidium monoazide (PMA). The method was called qPCR-PMA. Oocyst aliquots were incubated (15 min) at 25 ºC or 100 ºC and analyzed by microscopy, after trypan blue and neutral red staining. Microscopic investigation determined viable and non-viable oocysts. For the molecular investigation, both aliquots of oo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Worldwide, Leptospira infection poses an increasing public health problem. In 2008, leptospirosis was recognised as a re-emerging zoonosis o … ucted in Comilla, Bangladesh to determine the presence of pathogenic Leptospira species in rodents. Real-time Polymerase Chain Reaction (qPCR) and sequencing showed that 13.1% (61/465) of the trapped rodents were infected with pathogenic Leptospira. Sequencing of the qPCR products identified the presence of three species: Leptospira interrogans, Leptospira borgpetersenii, and Leptos …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Meningitis is one of the leading causes of death among patients living with the human immunodeficiency virus (HIV) in sub-Saharan Africa. Based on clinical presentations alone, the different types of meningitis may not be distinguished from each other, consequently accurate laboratory diagnosis is extremely essential. Viruses such as Enteroviruses (EV), Mumps virus (MuV) and Herpes Simplex Virus-1 (HSV-1) are implicated in cases of meningitis. We sought to detect and characterize viral aetiologies of meningitis among HIV-infected adults with the use of molecular tools.
RESULTS: As
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe infections of the spotted rose snapper Lutjanus guttatus resulting from dactylogyrid monogeneans present a risk to aquaculture. Currently, the diagnosis of this infection requires the morphological identification and manual quantification of parasites. Based on the characterization of the 28S rRNA gene of dactylogyrid species present in L. guttatus, specific primers were designed for real-time polymerase chain reaction (qPCR) using EvaGreen® chemistry. The standard curve method estimated the number of dactylogyrids accurately. A total of 85 gill samples from cage-cultured fish infected …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Suboptimal agreement between molecular assays for the detection of Acanthamoeba spp. in clinical specimens has been demonstrated, and poor assay sensitivity directly imperils the vision of those affected by amoebic keratitis (AK) through delayed diagnosis. We sought to develop and validate a single Taqman real time PCR assay targeting the Acanthamoeba 18S rRNA gene that could be used to enhance sensitivity and specificity when paired with reference assays.
METHODS: Biobanked DNA from surplus delinked AK clinical specimens and 10 ATCC strains of Acanthamoeba was extracted. Sequence
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We developed a real-time (rt)PCR assay based on TaqMan probe technology for the specific detection of canine adenovirus 1 (CAdV-1). The assay is able to detect three 50% tissue culture infectious dose/mL in CAdV-1-containing cell culture supernatant. Viral genomes were not amplified of canine adenovirus 2 or of several bovine, porcine, and avian adenoviruses. In silico analysis provided no indication of amplification of other heterologous genomes. The sensitivity of the real-time assay exceeded that of a conventional gel-based CAdV-1 PCR by a factor of 100. Following the integration of the nov
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Develop a method of differentiation of Y.pestis strains of different subspecies based on PCR with hybridization-fluorescent detection in real-time.
MATERIALS AND METHODS: DNA target search for differentiation of subspecies of plague causative agent was carried out by Mauve 2.3.1, Mega 5.0 and BLAST algorithm based on comparison of full-genome sequenc- es of Y.pestis strains. Primers and TAqMan probes were calculated for the DNA targets found, conditions of PCR with hybridization-fluorescent detection - optimized.
RESULTS: DNA targets carrying marker mutations for the caucasus, altai, gi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid hormones are involved in many developmental and physiological processes, including osmoregulation. The regulation of the thyroid system by environmental salinity in the euryhaline gilthead seabream (Sparus aurata) is still poorly characterized. To this end seabreams were exposed to four different environmental salinities (5, 15, 40 and 55ppt) for 14days, and plasma free thyroid hormones (fT3, fT4), outer ring deiodination and Na+/K+-ATPase activities in gills and kidney, as well as other osmoregulatory and metabolic parameters were measured. Low salinity conditions (5ppt) elicited a si
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Benthic Cyanobacteria produce toxic and odorous compounds similar to their planktonic counterparts, challenging the quality of drinking water supplies. The biofilm that benthic algae and other micro-organisms produce is a complex and protective matrix. Monitoring to determine the abundance and identification of Cyanobacteria, therefore, relies on molecular techniques, with the choice of DNA isolation technique critical. This study investigated which DNA extraction method is optimal for DNA recovery in order to guarantee the best DNA yield for PCR-based analysis of benthic Cyanobacteria.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this work was to identify reliable reference genes for expression studies in adult Haemonchus contortus. Eleven candidate genes were identified and the stability of their expression was assessed in adult males and females of two genetically divergent H. contortus isolates: drug-susceptible (ISE) and multi-drug-resistant (WR). Five genes with the most stable expression patterns were further assessed for suitability as reference genes in anthelmintic-treated H. contortus adults versus non-treated controls. We identified important differences in the expression of a number of candidate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative real-time PCR (qPCR) allows for highly sensitive, rapid, and reproducible quantification of mRNA: it has become an established technology for the quantification of gene expression with the 5' nuclease assay using TaqMan(®) probes. It is used for a broad range of applications, including quantification of gene expression, measuring RNA interference, biomarker discovery, pathogen detection, and drug target validation. When studying gene expression with qPCR, scientists usually investigate changes-increases or decreases-in the quantity of particular gene products or a set of gene prod
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present study was conducted to determine the prevalence of helminth eggs excreted in the faeces of stray cats, dogs and in soil samples. A total of 505 fresh samples of faeces (from 227 dogs and 152 cats) and soil were collected. The egg stage was detected via microscopy after the application of formalin-ether concentration technique. Genomic DNA was extracted from the samples containing hookworm eggs and used for further identification to the species level using real-time polymerase chain reaction coupled with high resolution melting analysis. Microscopic observation showed that the overa…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To establish a triplex TaqMan real-time PCR system containing internal amplification control (IAC) to detect cholera toxin gene ctxA and enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC)heat-labile enterotoxin gene elt.
METHODS: Primers and probes were designed based on the sequences of ctxA, elt and IAC. Both sensitivity and specificity were analyzed and interactions between different reactions were evaluated.
RESULTS: This system showed that the sensitivity of ctxA was 94 copies/reaction while the elt 79 copies/reaction and the amplification efficiency were 94.7% and 98.1%, respectively.
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current global spread of multi-resistant Gram-negatives, particularly extended spectrum β-lactamases expressing bacteria, increases the likelihood of inappropriate empiric treatment of critically ill patients with subsequently increased mortality. From a clinical perspective, fast detection of resistant pathogens would allow a pre-emptive correction of an initially inappropriate treatment. Here we present diagnostic amplification-sequencing approach as proof of principal based on the fast molecular detection and correct discrimination of CTX-M-β-lactamases, the most frequent ESBL family. T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Optimising DNA extraction from clinical samples for Burkholderia pseudomallei Type III secretion system real-time PCR in suspected melioidosis patients confirmed that urine and sputum are useful diagnostic samples. Direct testing on blood remains problematic; testing DNA extracted from plasma was superior to DNA from whole blood or buffy coat.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования