Background: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is an urgent medical problem in osteomyelitis. The YycFG two-component regulatory system (TCS) allows bacteria to adapt rapidly to physical, chemical, and biological stresses. The recombinant plasmid shuttle vector was used to overexpress an antisense RNA (asRNA) to inhibit target gene expression by sequence-specific double-stranded RNA complex degradation. In the current study, antisense yycG RNA (ASyycG)-overexpression MRSA clinical isolates were constructed. Methods: Bacterial growth was monitored, and biofilm biomass was determ
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We built a system to guide decisions regarding the amount of genomic sequencing required to develop diagnostic DNA signatures, which are short sequences that are sufficient to uniquely identify a viral species. We used our existing DNA diagnostic signature prediction pipeline, which selects regions of a target species genome that are conserved among strains of the target (for reliability, to prevent false negatives) and unique relative to other species (for specificity, to avoid false positives). We performed simulations, based on existing sequence data, to assess the number of genome sequence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor cells release extracellular vesicles (EVs) that can function as mediators of intercellular communication in the tumor microenvironment. EVs contain a host of bioactive cargo, including membrane, cytosolic, and nuclear proteins, in addition to noncoding RNAs, other RNA types, and double-stranded DNA fragments. These shed vesicles may deposit paracrine information and can also be taken up by stromal cells, causing the recipient cells to undergo phenotypic changes that profoundly impact diverse facets of cancer progression. For example, this unique form of cellular cross talk helps conditio
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis virus is absolutely dependent on their host cells and has evolved various strategies to manipulate the cellular secretory pathways for viral replication. However, how cellular secretory pathways are hijacked, and the origin of the viral vesicles remains elusive during JEV replication. Here we show how JEV manipulates multiple components of the cellular secretory pathway, including autophagic machinery, to generate a superior environment for genome replication. We utilized double-strand RNA antibodies to label JEV RNA complex seeking the viral replication compartments and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Base editing (BE), the precise installation of single-nucleotide changes in DNA or RNA without inducing double-strand breaks, holds substantial therapeutic promise for correcting single-nucleotide variants, which constitute more than half of the known pathogenic genetic variants. Recent advances have improved base editor specificity, efficiency, and delivery, enabling clinically oriented procedures. Clinically, BE has shown early success or strong translational promise in sickle cell disease, β-thalassemia, leukemia (via CAR T and epitope engineering), hypercholesterolemia (PCSK9 and ANGPTL3),
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PRMT5 is expressed at high levels in many cancers, where it regulates diverse cellular pathways that contribute to oncogenesis. Here, we have defined a new role for PRMT5 in regulating and coordinating the interplay between the innate and adaptive immune response. This occurs, in part, through the influence of PRMT5 and E2F1 on RNA splicing and the presence of retained introns (RIs). We found that RIs have a propensity to form double-stranded RNAs that contribute to the innate response. Furthermore, many RIs contain non-canonical open-reading frames (ncORFs), which can be translated and then p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) constitutes 90% of head and neck cancers. HNSCC development is linked to chronic inflammation, while established HNSCC tumors are often immune suppressive. However, both occur through mechanisms that are not fully understood. The cytosolic double-stranded DNA sensor absent in melanoma 2 (AIM2) is an inflammasome-forming protein that also has inflammasome-distinct roles in restricting tumorigenesis by limited PI3K signaling. Here, we used an experimental mouse model of HNSCC, involving treatment of wild-type (WT) and Aim2-/- mice with the carcinogen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CRISPR-Cas12 family encompasses diverse RNA-guided nucleases with both DNA- and RNA-targeting subtypes. They can trigger antiviral activities through either direct elimination of invading nucleic acids or activating broad collateral cleavage to induce abortive infection. Here, we report a novel type V CRISPR effector BaCas12a3 that causes growth inhibition through a unique tRNA-cleavage mechanism. Plasmid interference and western blot assays showed that BaCas12a3 induces host growth arrest without DNA damage response, suggestive of the absence of double-strand DNA breaks. Indeed, biochemic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Toll-like receptor 3 (TLR3), one pattern recognition receptor activated by viral and endogenous RNA, has been recently reported to regulate ischemia/reperfusion (I/R) injury in various organs. However, the role of TLR3 in the development of intestinal I/R injury remains unclear. The aim of this study is to evaluate the effects of extracellular RNAs/TLR3 signaling in intestinal I/R injury. An intestinal I/R injury model was established with superior mesenteric artery occlusion both in wild-type and TLR3 knockout (KO, -/-) mice, and MODE-K cells were subjected to hypoxia/reoxygenation (H/R) to m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related hearing loss (ARHL) is one of the most common causes of hearing impairment in older adults. However, the cellular and molecular mechanisms underlying ARHL remain unclear. Chromatin and genomic instability, including DNA damage, heterochromatin loss, and telomere attrition, are hallmarks of aging. In the present study, we investigated DNA damage levels, chromatin accessibility, telomere length, and telomerase changes in vitro and in vivo mouse models of ARHL. To further explore changes in outer hair cells (OHCs), one of the prominent auditory sensory cells in the cochlea, we constru
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
An estimated 220 million people worldwide are chronically exposed to inorganic arsenic (iAs) primarily as a result of drinking iAs-contaminated water. Chronic iAs exposure is associated with a plethora of human diseases including skin lesions and multi-organ cancers. iAs is a known clastogen, inducing DNA double strand breaks (DSBs) in both exposed human populations and in vitro. However, iAs does not directly interact with DNA, suggesting that other mechanisms, such as inhibition of DNA repair and DNA Damage Response (DDR) signaling, may be responsible for iAs-induced clastogenesis. Recent RN
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although viruses infect various organs and are associated with diseases, there may be many unidentified pathogenic viruses. The recent development of next-generation sequencing technologies has facilitated the establishment of an environmental viral metagenomic approach targeting the intracellular viral genome. However, an efficient method for the detection of a viral genome derived from an RNA virus in animal or human samples has not been established. Here, we established a method for the efficient detection of RNA viruses in human clinical samples. We then tested the efficiency of the method
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The concepts underlying the antisense approach to disease therapy are discussed, and potential applications are examined. Antisense therapeutic agents bind to DNA or RNA sequences, blocking the synthesis of cellular proteins with unparalleled specificity. Transcription and translation are the two processes with which the agents interfere. There are three major classes of antisense agents: antisense sequences, commonly called antisense oligonucleotides; antigene sequences; and ribozymes. Antisense sequences are derivatives of nucleic acids that hybridize cytosolic messenger RNA (mRNA) sense str
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA interference has become the tool of choice to analyse the loss-of-function of individual genes and has been exploited to identify complex regulatory pathways following genomic screening. RNAi has both admirers and detractors, but is undeniably a technique with great potential, which has come a long way in the short time since its discovery. RNAi utilises cellular machinery associated with the processing of naturally occurring micro RNA (miRNAs). Effective use of RNAi requires detailed knowledge of the individual steps and the proteins involved, as well as the similarities and distinctions
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To preserve genome stability, the repair of DNA double-strand breaks (DSBs) that can be caused by exposure to ionizing radiation and certain anticancer drugs is of paramount importance. Recently, it became evident that various DNA-RNA helicases play a pivotal role in homologous recombination (HR) repair and non-homologous end joining, which are the two principal DSB repair machineries in mammalian cells. In a previous study, we reported that DHX9, which belongs to the DExH-box helicase family, is involved in HR repair. However, the regulatory mechanisms governing the function of DHX9 remains e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Large insert gene editing in ex vivo, primary human T cells represents an important approach for engineering next-generation cellular immunotherapies. While CRISPR-based editing is well-established for small genetic modifications, large insert knock-in remains a technical bottleneck. This review examines current strategies for achieving efficient, precise and safe integration of large genetic elements. We compare delivery methods for CRISPR components, highlighting electroporation of Cas9 ribonucleoproteins as the most efficient but often cytotoxic approach; emerging alternatives such as cell-
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracellular pathogens represent a serious threat to human health. Although the biology and the virulence factors involved in intracellular bacterial infection are relatively well documented, little is known about the host factors involved in the infection process. This situation is mainly due to the difficulty of conducting extensive genetic analyses in the targeted host cells and points to the need for developing genetic systems to model the infection process. Here, we describe a method (amenable to high-throughput analysis) that allows for the study of host factors involved in intracellula
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA-mediated interference (RNAi) has emerged recently as one of the most powerful functional genomics tools. RNAi has been particularly effective in the nematode worm C. elegans where RNAi has been used to analyse the loss-of-function phenotypes of almost all predicted genes. In this review, we illustrate how RNAi has been used to analyse gene function in C. elegans as well as pointing to some future directions for using RNAi to examine genetic interactions in a systematic manner.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intervertebral disc degeneration (IVDD) is a significant contributor to chronic low back pain and disability worldwide, yet effective treatment options remain limited. Through integrative analysis of single-cell RNA-seq data from intervertebral discs (IVDs), we have firstly uncovered that the aberrant accumulation of R-Loops-a type of triple-stranded nucleic acid structure-can result in the cytoplasmic accumulation of double-stranded DNA (dsDNA) and activate cGAS/STING signaling and induce cellular senescence in nucleus pulposus cells (NPCs) during IVDD. Restoring the R-Loop state significantl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The recently discovered exchange protein directly activated by cAMP (EPAC), compared with protein kinase A (PKA), is a fairly new family of cAMP effectors. Soon after the discovery, EPAC has shown its significance in many diseases including its emerging role in infectious diseases. In a recent study, we demonstrated that EPAC, but not PKA, is a promising therapeutic target to regulate respiratory syncytial virus (RSV) replication and its associated inflammation. In mammals, there are two isoforms of EPAC-EPAC1 and EPAC2. Unlike other viruses, including Middle East respiratory syndrome coronavi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования