Dynamic epigenetic changes guide retinal progenitor cells (RPCs) toward diverse neuronal subtypes and Müller glia during retinal development. However, the epigenetic mechanisms that maintain RPC proliferative and neurogenic potential throughout the final stages of retinal cell genesis remain poorly understood. Here, we integrate RNA sequencing and assay for transposase-accessible chromatin sequencing (ATAC-seq) to investigate how mouse RPC progenitor competence is regulated. Our analysis reveals conserved chromatin accessibility and gene expression profiles in mouse RPCs throughout retinal cel…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cardiovascular diseases (CVDs) remain a leading cause of morbidity and mortality worldwide, yet the epigenetic mechanisms that connect stress signals to durable transcriptional remodeling are incompletely understood. The BRG1/BRM-associated factor (BAF) chromatin remodeling complexes, mammalian members of the SWItch/sucrose non-fermentable (SWI/SNF) family, regulate chromatin accessibility by repositioning nucleosomes and by cooperating with transcription factors and histone-modifying enzymes. Recent structural and functional studies classify mammalian BAF complexes into three major subtypes i…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Linker histone H1 variants play critical, yet distinct, roles in chromatin organization and gene regulation. However, their specificity in cancer cells is not well understood. Our previous studies have shown that acute myeloid leukemia (AML) patients who were H3K27me3HIST1-positive exhibited lower H1.3 expression and a favorable outcome. These results imply that the H1.3 linker histone may play an unknown role in AML progression. In this study, we investigated the function of the H1.3 variant in AML cells. Through chromatin mapping and transcriptomic analyses, we revealed that H1.3 was enriche…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ischemic stroke triggers massive transcriptional reprogramming, yet how the brain's higher-order chromatin architecture orchestrates this response remains unknown. We mapped the spatiotemporal reorganization of the genome in the mouse peri-infarct cerebral cortex following transient middle cerebral artery occlusion at 6h and 24h of reperfusion. By integrating high-resolution Hi-C data with transcriptomic and cis-regulatory landscapes, we show that stroke induces a hierarchical rewiring of genome architecture across compartments, domains, and loops. Early A to B compartment shifts were largely …
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human SMCHD1 (Structural Maintenance of Chromosomes Flexible Hinge Domain Containing 1) is a chromatin architectural protein linked to heterochromatin repression. Loss of function mutations of SMCHD1 cause facioscapulohumeral muscular dystrophy type 2 (FSHD2) through activation of the DUX4 homeobox transcription factor gene. However, it is unknown how SMCHD1 may regulate myogenic transcription independently of DUX4. Here, we show that SMCHD1 safeguards enhancer organization within the three-dimensional (3D) genome in human myoblasts. Loss of SMCHD1 leads to widespread gains in chromatin access…
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic damage is an early effect of altered cell function and tumorigenesis. Analysis of epigenetic alterations in genetic damage in the context of environmental heavy metal-induced cytotoxicity highlights the importance of environment-epigenetics-genetics interactions. The mechanism through which circular RNA (circRNA), an important molecule in epigenetics, regulates cadmium (Cd)-induced DNA damage is unknown. Herein, we report that circRNA circZNF462 regulates chromatin accessibility and inhibits DNA damage after Cd exposure. Downregulation of circZNF462 was associated with DNA damage in a …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The efficiency of intracytoplasmic sperm injection (ICSI) in cattle remains limited, particularly when sex-sorted spermatozoa are used, partly due to insufficient chromatin decondensation associated with the highly compact protamine structure of bovine sperm. This study evaluated thioglycolic acid (TGA) as an alternative reducing agent to dithiothreitol (DTT) to promote controlled chromatin decondensation while preserving sperm DNA integrity and improving ICSI outcomes. Sex-sorted and conventional bovine spermatozoa were treated with different TGA concentrations (0.5-5 mM), and sperm functiona…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular senescence is a fundamental biological process contributing to aging, often accompanied by extensive chromatin remodeling. Dynamic alterations of three-dimensional (3D) genomic spatial structure, driven by chromatin reorganization, play a critical role in cell fate determination, but their relevance in therapy-induced senescence (TIS) remains underexplored. Here, we perform an integrative multi-omics analysis of Hi-C, ATAC-seq, CUT&RUN, and RNA-seq in primary human fibroblasts undergoing TIS induced by ionizing radiation (RAD) or bleomycin (BLEO). We show that TIS leads to global chro…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Telomeres, coated by the shelterin complex, prevent end-to-end fusions and aberrant DNA repair, yet how telomere-binding proteins coordinate chromatin remodeling during the DNA damage response remains unclear. Here we show that the telomeric protein TRF1 is phosphorylated at serine 11 (S11) in response to DNA double-strand breaks, a modification that enhances cellular resistance to DNA damage. We found that CDK2 directly mediates this phosphorylation, which triggers recruitment of the histone methyltransferase SETD5 to telomeric chromatin. SETD5-dependent deposition of H3 trimethylation at lys…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Naive CD4+ T cells interpret cytokine cues to commit to T helper lineages. Here, we examined the impact of cytokines on the Ets1-Fli1 locus, which encodes paralogous transcription factors essential for T cell effector responses. Epigenomic and chromatin interaction profiling in double-positive (DP) thymocytes defined a T cell super-enhancer and a CTCF-bound boundary. Chromatin tracing at single-allele resolution revealed concurrent multi-way interactions among Ets1, Fli1, and the super-enhancer coupled to transcription. Deleting the CTCF boundary decompacted the locus without altering Ets1 exp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin D signaling has recognized roles in female reproductive physiology, but its effects at the chromatin level in endometrial stromal cells are still unclear. Here, we investigated how the active form of vitamin D, 1α,25-dihydroxyvitamin D3, or calcitriol, influences the accessible chromatin landscape of human endometrial stromal cells. Assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq) was performed on human telomerase reverse transcriptase (hTERT)-immortalized human endometrial stromal cell line (T-HESC) treated with either a vehicle or 1,25(OH)2D3. Ligand treatment i…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
5-Azacytidine (5-azaC) is a DNA hypomethylating agent clinically used in myeloid malignancies. As a ribonucleoside analogue, 5-azaC incorporates more readily into nascent RNA than DNA. Here, we demonstrate that RNA 5-methylcytosine (m5C) depletion by 5-azaC treatment, particularly at early time points, is sufficient to induce leukemia cell death. In contrast to its DNA demethylation function, the RNA-dependent effects of 5-azaC lead to transcriptional repression, disrupting genes involved in cell-cycle regulation and DNA repair. Mechanistically, depletion of m5C by 5-azaC in chromatin-associat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anti-silencing function 1A (ASF1A) is an evolutionarily conserved histone H3/H4 chaperone that mediates nucleosome assembly, DNA replication and DNA damage repair. Beyond these canonical biological functions, aberrant ASF1A expression facilitates disease progression by triggering epigenetic dysregulation in multiple malignant tumors (including leukemia, breast, liver and gastrointestinal cancers) and non-neoplastic disorders (such as atherosclerosis and embryonic developmental defects). Its context-dependent biological effects are mediated via oncogenic signaling cascades and crosstalk between
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hutchinson‑Gilford progeria syndrome (HGPS) is a rare premature aging disorder caused by mutations in the LMNA gene. High mobility group A1 (HMGA1) exhibits differential expression patterns across aging models. However, its roles and mechanisms in aging remain unclear. Here, we show a positive correlation between HMGA1 and the heterochromatin protein HP1β in multiple tissues of LmnaG609G/G609G, a classic genetic mouse model of HGPS to recapitulate typical premature aging features, and naturally aging mice, and HP1β was decreased in Hmga1-/- mice. We further demonstrate that HMGA1 mitigates HGP…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microglia, the brain's resident immune cells, rely on histone modifications and chromatin remodeling to sculpt their identity across the trajectory from development through aging. Recent studies have identified enhancer rewiring and metabolic-epigenetic coupling-exemplified by histone lactylation-as central drivers of microglial plasticity. Disruption of this regulatory balance drives the transition from homeostatic microglia toward disease-associated microglia (DAM) in Alzheimer's and Parkinson's diseases. This Review examines emerging concepts such as trained innate immunity, state-specific …
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Tic disorders and Tourette syndrome are neurodevelopmental disorders arising from interplay between genetic and environmental factors. Gene regulation, via chromatin and other epigenetic mechanisms, may provide a key link between gene-environment interactions, yet remains under-investigated in tic disorders.
METHODS: We performed bulk RNA sequencing of peripheral blood from 28 children with tic disorders (19 with Tourette syndrome, aged 6-16, median age 10 years, 18 (64%) males) compared to 20 matched healthy controls (aged 1-25, median age 11 years, 13 (65%) males). Differentia…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: To describe the genotypic and phenotypic profile of chromatin remodeling complex (CRC)-related neurological disorders.
METHODS: We retrospectively analyzed the clinical characteristics and the genetic spectrum of children with variants in CRC genes.
RESULTS: Fifty patients were included. The genotype spectrum involved genes encoding the CHD complex (CHD2, CHD3, CHD4, CHD7, CHD8), the BAF complex (SMARCA2, ARID1B, ARID2, ACTB), and the ISWI complex (BPTF). The predominant phenotypes were global developmental delay/intellectual disability (GDD/ID) (76.0%, 38/50) and epilepsy (64.0%, 32/50…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
[This corrects the article DOI: 10.3389/fimmu.2026.1796580.].
Опубликованное исправлениеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pseudorabies virus (PRV) is a major swine pathogen that causes substantial economic losses. The dynamic remodeling of host cell chromatin plays a pivotal role during viral infections. However, the epigenetic mechanisms underlying PRV-host interactions remain unclear.
METHODS: This study integrates ATAC-seq and RNA-seq to investigate the dynamic changes in host chromatin accessibility and gene transcription during PRV infection. The accessible chromatin regions were analyzed for enrichment in genomic features and transcription factor binding motifs. RNA-seq data were used to identi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования